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[期刊] 华北农学报
[作者]
刘永财 孟林 张国芳 毛培春 张德罡
利用ISSR标记对15份新麦草(Psathyrostachys juncea)种质资源进行遗传多样性检测。为获得稳定的新麦草ISSR反应体系,对反应条件中的dNTP、Taq酶浓度、引物浓度、Mg2+浓度等因子进行了优化,建立起的最佳反应体系为:25μL的反应体系中含有dNTP 2.5μL、Taq酶0.2μL、Primers 1μL、Mg2+1.5μL、2.5μL 10×Buffer、2μL模板DNA和ddH2O 15.3μL。ISSR标记结果显示,筛选出的重复性好、谱带清晰的ISSR引物8条,共获得84个扩增位点,其中多态性位点72个,多态性比率(PPB)为85.7%。通过遗传相似系数(GS)...
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
柴晓娟 郭玮龙 陈慧 王俊荣 谢德志 金水虎
为研究蔺草Juncus effusus种质资源遗传多样性,采用简单序列重复区间扩增多态性(inter-simple sequence repeats,ISSR)分子标记技术对来自不同区域的36份蔺草种质资源进行遗传多样性分析,并探讨它们的亲缘关系。结果显示:72对ISSR引物中共筛选出23对引物能扩增出稳定清晰条带;36份蔺草种质的基因组DNA共扩增出148条带,其中130条多态性条带,多态性比率达87.84%。应用NTSYSpc 2.1软件分析显示,36份蔺草种质材料间的遗传相似系数(genetic s
[期刊] 草业科学
[作者]
曾令霜 张晨晨 张敬 徐彬
多年生黑麦草(Lolium perenne)是广泛栽培利用的优质牧草、草坪草。为研究多年生黑麦草种质资源的遗传多样性，选用简单重复序列(SSR)分子标记技术对10份多年生黑麦草自主选育品系和75份来自于23个不同国家的种质资源进行了分析。结果表明，26对引物扩增出的多态性条带有91条，占总条带数的69.5%。每个SSR位点的多态性信息含量(PIC)为0.156～0.722，平均为0.455。85份供试材料的遗传相似性指数为0.700～0.900,NTSYS聚类分析结果显示，在遗传相似系数(GS)为0.738时，85份材料被划分为五大类；同时，综合聚类分析及Structure群体遗传结构分析表明，供试材料的遗传关系与其地理来源无明显的关联性。研究结果将为多年生黑麦草种质资源评价利用及育种提供理论基础。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
肖炳光 杨本超
【目的】分析烟草种质的遗传多样性水平,揭示不同烟草类型间的遗传关系,为充分发掘、利用种质提供依据。【方法】对包括不同烟草类型的119份种质进行了ISSR分析,估算其遗传相似系数,利用UPGMA法作聚类图。【结果】利用21个ISSR引物共扩增出672条带,全部为多态性带,其中116条为普通烟草特有带。普通烟草种质间的遗传相似系数变化范围为0.779～0.945,其中烤烟种质间遗传相似系数变化范围在0.812～0.933之间;不同烟草类型基本可聚为相应的亚类或小类,引进烤烟品种与国内品种并未聚为各自类别。普通烟草与其它烟草种间遗传相似系数较小;普通烟草与其假定祖先种N.sylvestris聚为一类...
关键词：
烟草 ISSR 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
聂琼 刘仁祥
利用SSR和ISSR标记分析23份烟草种质遗传多样性。结果表明:8个SSR引物和8个ISSR引物分别检测到66个和113个多态性位点。不同烟草种质之间的遗传相异系数在0.3259~0.8588(SSR)或0.1369~0.8161(ISSR)。以SSR、ISSR标记分别聚类以及两种标记混合聚类均在0.63处将23个材料分为4类:2个类群和2个独立个类Coker147、Val16或G140,一类群以红花大金元为基础聚类,另一类群以NC82为基础聚类。两种标记的结果相似,均可用来进行烟草种质资源的遗传多样性分析。
关键词：
烟草 SSR ISSR 聚类分析
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
张铭真 李晓辉 王袁 邢雪霞 徐世晓 杨铁钊
从２００对ＳＳＲ引物中筛选出６９对条带清晰、多态性强的引物，对８０份烟草种质资源材料（来自多个国家和地区）的全基因组ＤＮＡ进行扩增，采用荧光ＡＢＩ–３５００ ｘｌ遗传分析仪进行多态性检测，结果 ６９对引物在烟草种质材料中共检测出５０３个多态性条带，平均每对引物可检测到的等位变异数为７．９１个，观测杂合度（Ｈｏ）平均值为０．２７６ ４，预期杂合度（Ｈｅ）平均值为０．５７４ ７。ＳＨＡＮＮｏＮ’Ｓ信息指数Ｉ为１．０８２ ６；ＮｅＩ’Ｓ多样性指数Ｈ为０．５７１ １、遗传分化系数ＦＳｔ为０．１４１ ６，基因流Ｎｍ为１．５１５ ３，遗传相似系数为０．５５～０．９０。说明８０份烟草种质的遗传多样性相对丰富．．．
关键词：
烟草 种质资源 简单序列重复 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
梁景霞 祁建民 方平平 王涛 陈顺辉 周东新 陶爱芬 梁康迳 吴为人
【目的】深化烟草种质资源遗传多样性研究,为种质利用改良烟草提供科学依据。【方法】应用ISSR分子标记方法,以烟草属6个种共96份有代表性的种质为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。【结果】(1)从90个ISSR引物中筛选出18个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得314条稳定的条带,其中多态性条带299条(占95.2%)。(2)应用Nei-Li相似系数法估算了96份材料间的遗传相似系数(GS),其GS在0.28～0.97之间,遗传多样性丰富。其中普通烟草栽培品种间的GS在0.62～0.98之间,平均为0.78,品种间的遗传基础相对狭窄,普通烟草栽培种与野生种及黄花烟的GS在0.28～...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
徐志婷 许玲玲 薛龙海
【目的】附球菌（Epicoccum）引起的叶斑病在多花黑麦草上普遍发生，本文研究西南不同地理来源附球菌菌株的遗传差异性和亲缘关系。【方法】以贵州花溪、重庆南川和合川、云南曲靖、四川崇州5个地区获得的37株代表性Epicoccum菌株为材料，利用真菌基因组DNA提取试剂盒提取供试菌株的基因组DNA；用35条ISSR引物对不同地理来源的8株菌株进行预扩增，之后选用其中扩增条带数多的引物对所有参试菌株进行扩增，将数据整理成0、1矩阵，利用NTSYSpc（Version2.10e）、PopGene（Version 1.32）和GenAIEx6.51软件分别进行聚类分析和主成分分析。【结果】35条ISSR引物中，有6条多态性丰富，条带清晰；供试6条引物共扩增出63条多态性条带，多态性比例为100%。菌株间的遗传相似系数为0.3100～0.9300。当遗传相似系数为0.4180时，37株Epicoccum被划分为5个类群。5个居群的平均遗传一致度（I_(N)）和平均遗传距离（D）分别为0.9168和0.0871，37株供试菌株的平均基因多样性指数（H）和Shannon’s信息指数（I）分别为0.3628和0.5388，均高于5个居群的平均值（0.3121和0.4606），相对应的遗传分化系数（Gst）为0.1289，基因流值（Nm）为3.3794。【结论】从聚类分析结果可知ISSR类群划分与菌种分类之间存在一定相关性，不同地理来源的菌株之间遗传相似性较高；主成分分析（PCoA）结果表明遗传多样性与菌株的地理来源不存在明显相关性。
关键词：
多花黑麦草 附球菌 ISSR 遗传多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘丹丹 逯晓萍 张瑞霞 温莹 薛春雷 杨凯 任锐 王亚男 韩平安
利用SRAP分子标记技术构建了22份高丹草品种的指纹图谱。该指纹图谱可以准确区分供试的所有22个高丹草品种,置信概率达到99.9 999%,为高丹草品种划分提供了基础。利用筛选出的19个多态性较好的SRAP引物组合对22个高丹草品种进行遗传多样性分析鉴定,共扩增出450个位点,其中多态性位点369个;平均每个引物组合产生23.6个位点和19.4个多态性位点,平均多态性水平为82.2%。通过采用UPGMA方法进行聚类分析,遗传相似系数在0.66～0.94之间,以遗传相似系数0.674为阈值,可将供试材料分为2个类群。
关键词：
高丹草 指纹图谱 遗传多样性 SRAP
[期刊] 中国农业科学
[作者]
杨友才 周清明 尹晗琪 朱列书
【目的】揭示烟草种质资源的遗传多样性及亲缘关系。【方法】选用4对AFLP选择性扩增引物(EcoRI+3/MseI+3)对48份烟草材料的基因组DNA进行选择性扩增。【结果】共获得321条扩增带,其中174条具有多态性,平均多态检出率为54.2%。对AFLP扩增结果采用UPGMA法进行聚类分析,可以将48份烟草资源分为两大类群,即黄花烟草群和普通烟草群,普通烟草可进一步分为4组;48份材料的遗传距离变幅在1.41～11.0之间。【结论】AFLP标记技术能较好地从分子水平揭示中国烟草种质资源的遗传背景、亲缘关系及演化规律。
关键词：
烟草 遗传多样性 亲缘关系 AFLP
[期刊] 西南农业学报
[作者]
聂琼 黄锡才 蒙剑波 李希金 刘仁祥
为从分子水平上揭示烟草种质资源的遗传背景和亲缘关系,采用SRAP分子标记方法,对烟草属5个种共134份种质进行了遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:从228对SRAP引物中筛选出15对多态性、稳定性好的引物,15对引物在134个材料上共获得241条多态性条带,多态性比例为81.7%。134份材料间的遗传距离为0.0213～0.5802,遗传多样性较丰富。在遗传相似系数为0.57时,被聚为5个大类群,相同栽培类型的烟草并未明显的聚为一类。可较好地从分子水平反映这些烟草品种(系)间的遗传背景和亲缘关系。
关键词：
烟草 种质资源 SRAP 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
侯永翠 颜泽洪 兰秀锦 魏育明 郑有良
利用RAMP和ISSR两种标记分别对60份大麦种质资源遗传多样性进行了检测。结果发现,两种标记都能揭示材料间较高的遗传多样性,其中ISSR标记多态性又高于RAMP标记。在RAMP分析中,每个引物可扩增出1～10条DNA片段,平均为5.27条;22个RAMP引物共扩增出116条DNA片段,其中98条具有多态性,多态性比率(PPB)为84.48%;平均多态信息量(PIC)为0.277;每个位点有效等位基因数(Ne)为1.602;材料间遗传相似系数GS变化范围为0.551～0.965,平均值为0.830。在ISSR分析中,每个引物可获得1～10条DNA片段,平均为5.95条;19个ISSR引物共扩增...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王一伊 向秋燕 阎文昭 蒲志刚 邢小军 刘东阳 冯俊彦
本研究以国内外８３份主栽烟草品种为研究材料，利用ＴＲＡＰ分子标记技术扫描，对其遗传多样性及品种间的遗传关系进行分析。结果表明，４２对ＴＲＡＰ引物组合在８３份烟草种质中共扩增出２７１条清晰、稳定条带，其中１５５条条带具有明显多态性，平均多态性为５７．２％。每对引物可扩增产生２～１２条清晰条带，其中多态性条带数为１～７条，平均每对引物可产生多态性条带３．６９条。遗传相似性分析显示，８３个烟草种质间的遗传相似系数处于０．４１２到０．９０４之间；聚类分析结果显示，当遗传相似度（ＧＳ）为０．６８时，可将８３份烟草品种分为４大类。本研究结果表明，ＴＲＡＰ标记技术能有效地发现供试烟草材料的ＤＮＡ遗传多态性，．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
毛培春 孟林 田小霞
应用ISSR分子标记技术,对收集自我国北方4省区的20份马蔺种质材料进行遗传多样性分析,结果显示,利用筛选出的多态性强、重复性好的14条ISSR引物,共扩增出303条带,其中241条带呈多态性,多态性位点百分率为77.29%。遗传相似系数(GS)为0.340 2～0.824 7,分布幅度较广,遗传多样性丰富。利用非加权算术平均法(UPGMA)进行聚类,当GS为0.587 6时,可将20份马蔺种质材料划分为3个类群。主成分分析(PCA)的结果与UPGMA聚类分析结果一致,表明20份马蔺种质材料的遗传距离与其野生分布的地理距离存在较密切相关关系。
关键词：
马蔺 ISSR 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李超 罗淑萍 曾斌 李疆 李刚
【目的】通过ISSR标记技术,对新疆核桃种质资源的遗传多样性及遗传结构进行分析,为该资源的保护与利用提供理论依据和技术支持。【方法】采用ISSR标记对5个居群和1个栽培类型共163份样品进行遗传多样性分析。【结果】用13条引物对163份样品进行扩增,共检测扩增位点117个,其中多态性位点98个。在物种水平上,多态性位点百分率(PPL)为83.76%,Nei’s基因多样性(H)为0.3010,Shannon信息指数(I)为0.4182;在居群水平上,多态性位点百分率平均为68.36%,Nei’s基因多样性(H)平均为0.1265,Shannon信息指数(I)平均为0.1651。基于Nei’s遗传...
关键词：
核桃 种质资源 遗传多样性 ISSR
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