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[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
邢小黑 姜卫红
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
孔会利 王超 肖亮 李文成
高G+C含量模板进行PCR扩增时,往往通过添加增强剂如甘油、DMSO、甲酰胺等来提高扩增效率,但是目前研究单个增强剂对PCR影响的较多,而研究增强剂组合的不多,而且关于增强剂对聚合酶保真度的影响的研究也不够充分。本研究通过正交试验对不同增强剂组合的效应进行了探讨,建立了3个对高G+C含量模板进行PCR扩增的高效缓冲液体系,并且对其中2个进行研究发现它们可以提高Taq聚合酶扩增的保真度,因而具有较广的应用前景。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
于晓英 吴铁明 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南
为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获得高分子量基因组 DNA和 AFL P指纹图谱 ,其中以幼叶的 DNA产量和品质最好 ,CTAB法提取的 DNA纯度较高且程序简单
关键词：
萱草 扩增片段长度多态性 脱氧核糖核酸
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
王波 唐冬生 蒋泓 洪亚辉 萧浪涛 周天鸿
为了探索利用PCR简单扩增高GC含量的长重复序列的方法,经反复摸索后选用LAPCR法即LAPCRTaq酶结合GC缓冲液Ⅱ来扩增奶牛高GC含量的长片段重复序列,成功获得了全长2538bp,GC含量为65.7%的DNA序列,其中ITS1的GC含量高达80%.探索了克隆复杂DNA序列时引物设计的特别规则、反应体系的改进、DNA聚合酶的选用等措施.
[期刊] 林业科学研究
[作者]
孟现东 陈益泰
从SDS、CTAB、高盐低pH值3种方法中选择了CTAB法作为枫香适合的DNA提取方法,同时构建了枫香DNA的PCR扩增程序,并从Mg++浓度、Taq酶用量、dNTP浓度、引物浓度、DNA模板用量等方面优化了PCR扩增程序。
关键词：
枫香 DNA提取 PCR扩增程序
[期刊] 淡水渔业
[作者]
卢俊 陆宏达 岳蒙蒙 操艮萍
以患鲤疱疹病毒２型（Ｃｙｐｒｉｎｉｄ ｈｅｒｐｅｓｖｉｒｕｓ ２，Ｃｙ ｈｖ－２）疾病的异育银鲫（Ｃａｒａｓｓｉｕｓ ａｕｒａｔｕｓ ｇｉｂｅｌｉｏ）肾脏为实验材料，采用－２０℃冷冻、１００％乙醇、ｄａｆａｎｏ＇ｓ液、１０％福尔马林、Ｚｅｎｋｅｒ＇ｓ液、Ｍüｌｌｅｒ＇ｓ液、２．５％戊二醛、ｈｅｌｌｙ＇ｓ液、ＭｏｓｓＭａｎ＇ｓ液、ｂｏｕｉｎ＇ｓ液和Ｃａｒｎｏｙ＇ｓ液不同方法进行保存，通过微量分光光度计检测和琼脂糖凝胶电泳探讨不同保存方法对病毒ｄｎａ提取效果、常规ｐＣｒ扩增效果和巢式ｐＣｒ扩增效果的影响。结果表明：从病鱼肾脏中提取ｄｎａ时，除１００％乙醇保存方法与－２０℃冷冻保存组一样可以提取高质．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
康强 周鑫 罗燕 田青 程建国 赵位
【目的】探索从林麝粪便中提取基因组ＤＮＡ并进行物种鉴定的可行性，为林麝野外调查工作以及分子粪便学在林麝保护中的应用提供科学依据。【方法】采集林麝粪便，采用改良的ＣＴＡＢ抽提基因组ＤＮＡ；按常规ＰＣＲ法对ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因进行扩增测序后，用ＤＮＡｍＡＮ ６．０软件进行系统发育分析；在不同温度存放不同时间，研究林麝粪便基因组ＤＮＡ的提取与ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因ＰＣＲ扩增的时效性。【结果】以提取的基因组ＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ扩增均能特异性地扩增出ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因。系统发育分析结果表明：所扩增产物为林麝的ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
巫伟峰 陈孝丑 陈发兴 黄晓慧 陈春 张毅智 汪长水
[目的]DNA条形码技术是分子鉴定的最新进展之一,为了研究中国兰的DNA条形码技术,实现中国兰的快速鉴定。[方法]该文通过电泳成像技术、BLASTN核苷酸相似序列检验等分析方法,对一种中国兰ITS、ITS2、psbA-trnH、rbcL、matK等常用DNA条形码标准序列PCR扩增的方法进行了可行性检验。[结果]该方法可以在中国兰中有效扩增ITS2、psbA-trnH、rbcL、matK等条形码序列,并通过双向测序获得序列信息,ITS标准序列由于引物存在非特异性扩增,需要重新设计合适的引物。[结论]利用该方法,可以有效获得中国兰中ITS2、psbA-trnH、rbcL、matK等几种常见DNA条形标准序列,并大大简化了PCR反应操作步骤,为进一步研究中国兰的DNA条形码技术提供了参考和借鉴。
关键词：
DNA条形码 国兰 PCR扩增 分子诊断
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
刘耘 熊家军 杨利国
Bassam银染法和Sanguinetti银染法是AFLP标记最常用的检测方法。本研究比较这2种方法银染的AFLP条带再扩增效果的差异,发现Bassam法银染的AFLP片段再扩增效率达到100%,而用同样的PCR条件,Sanguinetti法银染的AFLP片段不能被扩增,限制了Sanguinetti法在AFLP标记分析中的应用。为提高Sanguinetti法银染的AFLP片段再扩增效率,对Sanguinetti法银染的AFLP片段回收和再扩增条件进行了改进。通过增加Sanguinetti法显色后的胶板漂洗次数、延长漂洗时间、改变AFLP条带浸泡溶液、增加浸泡液体积和增加PCR循环次数,成功地将...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
赵金艳 刘榜 王文君 张宇 张庆德
以大白猪背最长肌、脾脏、耳组织为材料,用碱裂解法和酚-氯仿法分别提取猪基因组DNA,用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增检测DNA的产量和质量,结果发现2种方法提取的DNA产量没有明显差异。通过猪MC4R、TEF-1基因特异引物进行PCR扩增均能得到目的条带。碱裂解法提取的DNA原液稀释5倍、10倍后作为模板均获得了较为稳定的扩增产物。该结果表明,简单、快速、无毒的碱裂解法适用于动物定性PCR检测时DNA的提取。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
阳桂丹 张巨源 陈雯莉
以ＳｙｎｅｃｈｏｃｙＳｔｉＳ Ｓｐ．Ｓｔｒａｉｎ ｐｃｃ ６８０３为实验菌株，设计改良制备定量ｐｃｒ模板的方法；同时，对ＳｙｎｅｃｈｏｃｙＳｔｉＳ Ｓｐ．Ｓｔｒａｉｎ ｐｃｃ ６８０３总ｒｎａ的ｔｒｉｚｏｌ抽提法进行优化。结果显示，利用改良方法抽提得到的ｒｎａ结构更完整；同时，利用改良方法制备的模板可以用于后续定量ｐｃｒ实验；其中，只有高表达量基因适用于半定量ｐｃｒ，低表达量基因则需要实时荧光定量ｐｃｒ检测。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
徐建堂 祁建民 林培清 张高阳 陶爱芬 方平平
为研究红麻叶片叶绿体DNA(cpDNA)非编码区的序列特征,采用改良CTAB方法提取红麻总DNA,以8份红麻光钝感突变体及其4份近缘种基因组DNA为模板,应用8对植物cpDNA通用引物对红麻cpDNA非编码区序列进行PCR扩增,优化cpDNA非编码序列PCR的扩增条件,应用4种限制性内切酶(EcoRⅠ、HindⅢ、TaqⅠ、AulⅠ)酶切扩增片段.结果表明:所筛选的通用引物适用于红麻cpDNA非编码序列扩增,扩增产物经1.5%琼脂糖电泳检测,片段大小为400-2000 bp,共扩增cpDNA片段大小约13000 bp.将PCR扩增产物进行酶切,每个片段均有相同的酶切位点,只有cp4引物对cpD...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
何玮玲 胡序建 程欣 黄明 周光宏
【目的】建立含有扩增内标(IAC,Internal amplification control)的用于食品中猪肉和鸡肉成分鉴别的Taqman探针实时荧光PCR检测方法。【方法】分别基于猪的beta actin基因和鸡的transforming growth factor基因设计引物和探针;考察引物和探针的特异性与灵敏度;设计并构建扩增内标,优化体系中扩增内标浓度,建立内标实时荧光PCR体系;使用该检测体系对鲜肉和熟肉来源的DNA模板进行检测评价;应用该体系对市售38份样本进行盲样检测。【结果】含有扩增内标的Taqman探针实时荧光PCR体系能有效地进行食品中猪肉和鸡肉成分的快速检测,非目标物种...
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
吕淑霞 祝儒刚 刘月萍 张喆 胡英
建立扩增内标存在下同时检测副溶血弧菌tlh基因和trh基因的多重PCR方法。以细菌16SrDNA片段为扩增内标对照(internal amplification control,IAC),副溶血弧菌不耐热溶血毒素(thermolabile hemolysin,TLH)基因tlh和相对耐热直接溶血毒素(thermostable related hemolysin,TRH)基因trh为检测基因,设计引物,并优化多重PCR体系。特异性及灵敏度试验结果表明:该多重PCR体系检测致病性副溶血弧菌表现出极好的特异性。纯培养条件下,扩增内标存在时tlh基因和致病基因trh的检测灵敏度分别为1.3×102 c...
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