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[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
贾智英 池喜峰 李池陶 张玉勇 石连玉
利用AFLP技术对2007年、2008年所采集的我国北方网箱养殖中出现爆发性死亡的德国镜鲤的死亡个体和存活个体分子样品进行遗传结构分析,以期对德国镜鲤群体内二者遗传变异进行快速而准确的评价。研究结果表明,(1)8对引物组合共扩增出289个条带,其中多态位点比例为47.40%,每对引物多态位点比例为18.8%~56.3%。(2)死亡和存活个体在两年采集样品中的遗传相似性系数分别为0.981 8和0.986 2,遗传分化系数分别为0.037 4和0.037 9,表明死亡个体和成活个体遗传分化程度较低。(3)在两年采集样品中死亡个体平均多态位点比例均低于存活个体,平均杂合度在2007年采集的样品中死...
关键词:
德国镜鲤 抗病性能 遗传变异 抗病育种
[期刊] 水产学报
[作者]
胡雪松 李池陶 马波 石连玉
利用10个多态微卫星标记对我国北方不同地区3个德国镜鲤(Cyprinus carpioL.mirror)群体(绥化,BL;哈尔滨,BZ;天津,TJ)的遗传多样性及群体间的亲缘关系进行研究。结果显示,3个养殖群体在10个位点上表现出较高的多态性,其中9个位点表现为高度多态(PIC>0.5);平均杂合度为0.629 3;10个位点共检测出144个等位基因;BL与TJ群体的总体变异水平高于BZ群体。Nei氏DA遗传距离分析显示,BL与TJ群体的遗传距离最近,而与BZ群体的遗传距离最远;群体间遗传分化微弱(Fst=0.031 5),群体内变异占总变异的96.85%,3个群体各自特有的等位基因频率普遍较...
关键词:
德国镜鲤 微卫星 遗传变异
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李盛文 贾智英 柏盈盈 李池陶 石连玉
应用35对多态性较高的微卫星标记对鲤新品种——松浦红镜鲤(Cyprinus carpio var.songpu red mirror carp)的保种群体进行了遗传结构研究。结果显示,在91尾松浦红镜鲤个体中,共检测到140个等位基因,每个位点等位基因数3~6个,平均有效等位基因数为3.042 6;期望杂合度范围为0.375 0~0.827 4,均值为0.649 3;多态信息含量范围为0.396~0.912,均值为0.586 9;哈迪-温伯格平衡检验结果表明群体处于不平衡状态;平均固定系数为-0.026,说明该群体存在杂合子过剩现象;瓶颈效应分析表明,群体已经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计...
关键词:
松浦红镜鲤 微卫星 群体遗传结构 保种
[期刊] 海洋渔业
[作者]
纪达 杨玉梅 姚俊杰 王益海 张书海
为探究鲤(Cyprinus carpio)养殖群体遗传多样性与遗传分化现状,基于线粒体DNA Cyt b基因,采用PCR扩增与直接测序法,对贵州7个鲤养殖群体进行遗传多样性及遗传结构分析评价。结果显示,152尾个体共界定了16种单倍型,7个养殖群体整体单倍型多样性指数(H_(d))、核苷酸多样性指数(P_(i))分别为0.792、0.00323。单倍型网络图(Network)显示,7个养殖群体间没有形成明显的谱系结构和地理结构。AMOVA分析结果显示,群体间和群体内变异分别占41.63039%和 58.36961%,遗传变异系数F_(ST)为0.41630,达到极显著差异(P<0.0001)。基因流N_(m)值显示,除松浦镜鲤与松浦红镜鲤群体,金背鲤与建鲤群体N_(m)值分别为2.238、4.805外,其余种群间N_(m)值均
[期刊] 淡水渔业
[作者]
鲁翠云 杜雪松 郑先虎 李超 程磊 孙志鹏 孙效文 陈忠
为了评估金边鲤(Cyprinus carpio var.Jinbian)群体的遗传组成,制定合理的繁殖配组策略,本研究用24个QTL标记分析了金边鲤亲本群体的遗传结构及雌、雄个体间遗传距离。结果显示:在192尾样本中共检测到184个等位基因,群体平均等位基因数(N_o)、有效等位基因数(N_e)、观测杂合度(H_o)、期望杂合度(H_e)和多态信息含量(PIC)分别为7.667、3.941、0.590、0.707和0.670,表明群体处于高度多态水平(PIC≥0.5),具备进一步选育优良品种的遗传潜力。经Bonferroni校正的Hardy-Weinberg平衡检验显示,金边鲤群体有10个位点显著或极显著偏离平衡,多数位点表现为杂合子缺失。在此基础上统计了金边鲤雌、雄个体间的遗传距离在0.1231~1.8563之间,遗传距离呈正态分布,且中间值位于0.7~0.9,占38.36%,结合聚类图将192个个体划分为3个繁殖组,组间呈现出显著的遗传分化,交叉配组能够有效避免近亲繁殖。研究结果为金边鲤选育、繁殖配组及持续利用提供参考。
[期刊] 水产学报
[作者]
孙效文 鲁翠云 匡友谊 金万昆 沈俊宝 朱晓东 李大宇 马海涛 于冬梅
利用扩增效果好、在群体中具有多态性的28个微卫星标记,检测国家换新良种场的镜鲤繁殖群体和黑龙江水产研究所松浦实验场的镜鲤繁殖群体的遗传组成,计算了两个群体的有效等位基因数,期望杂合度和多态信息含量等遗传参数,换新与松浦两个群体的有效等位基因数分别为2.874和3.102,期望杂合度分别是0.565和0.603,多态信息含量分别是0.534和0.568;遗传结构分析研究结果表明这两个群体的多样性较高,信息含量丰富,具有进一步筛选出优良品种的遗传基础。但连锁不平衡分析表明这两个群体在较大的选择压力下,已严重偏离Hardy-Weniberg平衡,要保持群体的优良性状相关的遗传基础,应该在进一步的选种...
关键词:
镜鲤 繁殖群体 遗传结构 基因型
[期刊] 水产学报
[作者]
朱其建 戴习林 邹卫丽 蒋飞 苏建 过正乾 王海洋 丁福江
为深入了解罗氏沼虾抗病选育群体的抗病力和遗传信息,通过人工注射溶藻弧菌感染16个罗氏沼虾选育群体,并利用微卫星分子标记对选育群体进行遗传结构分析。结果显示,16个选育群体抗溶藻弧菌感染能力存在明显差别,并从中鉴定出抗病力强的群体3个(SCR11-6、SCR11-11和SCR11-16),其在感染溶藻弧菌感染后的成活率达80%;抗病力比较强的群体7个;抗病力一般的群体4个,成活率为65%~70%;抗病力差的群体2个,成活率为35%~50%。8对微卫星引物共检测到53个等位基因,每对引物的等位基因数为5~9个,平均为6.625个,多态信息含量(PIC)为0.629 4~0.829 4,平均为0.7...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
梁利群 冯国军 常玉梅 汪海燕
采用7个微卫星标记,研究了鲤(Cyprinus carpio)、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系(Cyprinus carpio var.wananensis)三个群体的遗传变异。结果显示,鲤野生群体、高寒鲤、荷包红鲤抗寒品系的平均杂合度分别为0.276、0.147、0.0952,平均无偏倚杂合度期望值为0.431、0.355、0.305。鲤野生群体的杂合度明显高于其他两个养殖品种,说明其较其他两个养殖品种的遗传多样性丰富。
[期刊] 水产学报
[作者]
岳志芹 王伟继 孔杰 戴继勋
利用AFLP技术对连续4年选育的中国对虾抗白斑病毒群体进行了遗传分析,并比较了不同的数据处理方法对遗传学参数的影响。7个EcoRⅠ/MseⅠ引物组合共产生350个位点,其中202个为多态位点。4代群体的多态位点比例分别为:39.4286%,41.4286%,33.4286%,39.1429%,Nei基因多样性指数分别为:0.1197,0.1259,0.1133,0.1249;4代群体的Shannon多样性指数分别为0.1831,0.1917,0.1702,0.1896。遗传多样性水平除了第3代群体标本明显较低外,其它3代甚为接近,维持在一个恒定的水平。比较了Nei分析、Shannon信息指数分...
关键词:
中国对虾 AFLP 遗传变异 抗病群体
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张志伟 韩曜平 仲霞铭 张志勇 曹哲明 吴婷婷
采用新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)对草鱼(Ctenopharyngodon idella)1个野生群体(来自邗江草鱼国家级原种场)和2个人工繁殖群体(分别来自淡水中心良种场和无锡前洲水产良种场)进行遗传多样性分析,从不同引物组合中筛选出8组条带清晰、多态性丰富的引物组合,每个引物组检测到的位点数为12~21个,在3个草鱼群体中共检测到120个位点,其中多态性位点有92个,多态位点比例为76.67%,显示了较高的多态性。野生群体与2个人工繁殖群体多态位点比例分别为67.62%、59.81%、53.33%,平均杂合度分别为0....
[期刊] 中国水产科学
[作者]
王冬群 李太武 苏秀榕
于2001年4月,在浙江象山港虾塘和象山外海滩涂分别采集100个缢蛏(SinonovaculaconstrictaLamarck)样品,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,分析了2个群体各38个样本的EST、ADH、MDH、IDH、ME、LDH、GDH、SOD、SDH、ATP等10种同工酶,分别记录了30、29个基因位点。其中s MDH 1、SDH、s ME、ATP 1、ATP 2等5个位点为多态位点。象山野生缢蛏群体的多态位点比例(17 24%)和群体平均杂合度观察值(0 0377)都明显高于养殖群体(16 67%,0 0314)。结果表明,与其他贝类比较缢蛏象山养殖和象山野生群体拥有较低的遗传变异...
关键词:
缢蛏 同工酶 遗传变异
[期刊] 水产学报
[作者]
宋娜 都基隆 王志勇 张庆文 高天翔
香鱼是分布于中国、日本和朝鲜的一种珍稀名贵经济鱼类,本实验比较分析了香鱼养殖和野生群体的遗传多样性。研究结果显示,在长度为445 bp的控制区部分序列上,鳌山卫养殖群体的单倍型多样度h(0.198 4±0.092 4)和核苷酸多样度π(0.000 8±0.000 9)显著低于东张水库野生群体(h=0.810 5±0.067;π=0.002 6±0.002 0),两群体产生了较大的遗传分化(F st=0.447,P=0);单倍型邻接关系树的拓扑结构简单,未呈现明显的地理谱系结构,日本香鱼个体与中国香鱼亲缘关系较远;东张群体的历史动态分析结果表明其可能经历过近期的群体扩张事件。无论是养殖群体还是野...
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾智英 李飞 李池陶 石连玉
松浦鲤作为鲤鱼的一个培育品种,在我国北方地区的鱼类养殖实践中占有重要地位,为了促进该品种优良性状的稳定保持和种质资源的可持续利用,本研究应用29对多态性较高的微卫星标记对松浦鲤保种群体进行了遗传结构研究。结果显示:在194尾松浦鲤个体中,共检测到166个等位基因,平均有效等位基因数为5.724 1,平均多态信息含量为0.584 9,平均期望杂合度为0.572 2;哈迪-温伯格平衡检验结果群体处于不平衡状态;瓶颈效应分析表明,群体已经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计算有效群体大小为69.8。该研究表明人工选择压力对松浦鲤保种群体造成了较大影响,虽然其仍具有较丰富的遗传多样性,但由于经历了瓶颈效...
关键词:
松浦鲤 保种 微卫星 遗传结构
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
陈艳翠 高天翔 陈四清 张岩
采用水平凝胶电泳技术对红鳍东方鲀养殖群体进行了同工酶分析。本实验采用肌肉和肝脏两种组织,分析了8种酶,检测到9个位点,在0.99水平上,PGM*和IDHP*表现为多态,MPI*、LDH*、AAT*、SOD*、MDH-1*、MDH-2*和G3PDH*均为单态,多态位点比例为0.2222,平均预期杂合度为0.0998,实际观测杂合度为0.0467,平均有效等位基因数目为1.1840,PGM*位点的遗传偏离指数为-0.0707,杂合子缺失,IDHP*位点无杂合子,遗传偏离指数为-1。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
谷伟 王炳谦 赵吉伟 贾钟贺
自2004年至2009年历经两个世代研究了5个虹鳟(Oncorhynchous mykiss Walbaum)品系的相对繁殖力、绝对繁殖力与形态学指标的关系及其遗传进展。结果显示:美国加州、美国道氏、挪威品系的繁殖力指标好于丹麦和渤海品系。各品系绝对繁殖力与体长呈幂函数关系,即F=7.2071L1.6099(R2=0.6479,P<0.01)。绝对繁殖力随着卵径的增加而呈增加趋势,但卵径达到(0.4±0.1)cm时这一规律不明显。5个品系子一代优势选育系(G1优势选育系)与基础种群相比较,绝对繁殖...
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