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[期刊] 水产学报
[作者]
鲁翠云 耿龙武 李超 程磊 孙效文 徐伟
大鳞鲃作为水产引进种,受建群数量较小的影响其遗传资源相对有限,因此在育种实践中有效地保护和利用现有的基因资源显得尤为重要。实验用24个微卫星标记分析了大鳞鲃养殖群体的遗传结构,在随机采样的96个个体中共检测到74个等位基因,各标记等位基因数为2～5个,片段大小为109～367 bp,有效等位基因数(Ne)为1.144 5～4.626 4,观测杂合度(Ho)为0.135 4～1.000 0,期望杂合度(He)为0.126 9～0.788 1,标记的多态信息含量(PIC)为0.118 3～0.749 0,平均为0.428 1。统计结果显示,大鳞鲃养殖群体处于中度多态水平;经χ2检验估计Hardy-...
关键词：
大鳞鲃 微卫星标记 遗传结构 相关性
[期刊] 淡水渔业
[作者]
顾颖 鲁翠云 张芹 李超 屈长义 王兆平 程磊 孙效文 冯建新
用３５个镜鲤微卫星ＱＴＬ标记评估了豫选黄河鲤（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ Ｃａｒｐｉｏ ｖａｒ．ｈａｅｍａＴｏｐＴｅｒｕｓ）群体的遗传结构，并评估了不同基因型与生长性状（体重、体长、体高和体厚）的相关性，筛选了在群体中具有性状优势的基因型。３５个微卫星标记在２８８个豫选黄河鲤个体中的扩增结果显示，各标记等位基因数为３～１３，平均每个标记６．８２８ ６个；平均有效等位基因数为４．５２０ ８；平均观测杂合度为０．６０３ ０；平均期望杂合度为０．７０１ ９；平均多态信息含量为０．６６５ ６，群体整体处于高度多态水平（ｐｉＣ＞０．５）。利用ｓｐｓｓ１９．０的ＧＬｍ模型分析标记与性状的相关性，共１７个微卫星标记与．．．
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
邹杰 马爱军 赵艳飞 何伟国 王婷 岳亮 刘大勇 郭正龙
针对3个暗纹东方鲀养殖群体,采用21对微卫星引物对其遗传多样性进行分析,成功扩增出具有一定多态性片段的微卫星位点共19个。共得到125个等位基因,每位点等位基因数为3-11,平均值为6.58,有效等位基因数为1.7-7.8,平均值为4.5,平均观测杂合度为0.156-1.000,平均期望杂合度为0.399-0.876,平均多态信息含量(PIC)为0.353-0.858。广州、上海、江苏3个群体的PIC由小到大依次为0.588、0.633、0.655,三群体间遗传分化指数分别为0.048、0.062、0.076,平均值为0.081,表明三群体间发生了小程度的遗传分化。三群体间的遗传距离和UPGA...
关键词：
暗纹东方鲀 养殖群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
章芸 俞丹娜 杜卫国 郑荣泉 杨光
利用8个微卫星标记对7个乌龟养殖群体进行了遗传多样性和遗传结构的检测。结果显示,7个养殖群体都表现出较高的多态性,8个位点共检测出130个等位基因,范围在9～26,平均16.25;其多态信息含量(PIC)范围为0.57～0.92,平均值为0.71;观测杂合度(HO)和期望杂合度(HE)分别为0.30～0.87和0.60～0.93。分子变异方差分析(AMOVA)结果表明,遗传变异5.91%来自群体间,84.29%来自群体内部,两两群体间FST值在0.0143～0.1127,其中57.14%的两两群体间无分化,42.86%的两两群体间出现了中等程度的分化。哈迪-温伯格平衡检测表明,8个位点中有5个...
关键词：
乌龟 遗传多样性 微卫星
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
李伟强 陈刚 马骞 黄建盛 施钢 潘传豪 周晖 谢瑞涛 张健东 汤保贵
利用12个微卫星标记对北海(BH)、陵水(LS)、硇洲(NZ)、徐闻(XW)和三亚(SY) 5个军曹鱼(Rachycentron canadum)养殖群体进行遗传多样性分析。结果显示,12对微卫星引物在5个军曹鱼养殖群体中共检测到129个等位基因。各养殖群体的平均等位基因数为3.833～6.750,平均有效等位基因数为2.284～3.645,平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.481～0.635和0.533～0.681,平均多态信息含量为0.463～0.630;哈迪-温伯格平衡检测结果显示,各群体在多个微卫星位点上均显著偏离平衡(P<0.05);军曹鱼养殖群体间的遗传分化指数(F_(st))为0.055～0.150,遗传距离(D)为0.240～0.635,其中,BH和NZ的F_(st)最大(0.150),D最远(0.635);AMOVA分析表明,军曹鱼养殖群体的84%遗传变异来自于个体之间;基于Nei′s遗传距离构建的UPGMA系统进化树显示,BH和SY聚为一支,LS和XW聚为一支,两支聚为一支后与NZ聚为一支。研究结果将为军曹鱼种质资源保护和改良等提供科学的数据参考。
关键词：
军曹鱼 养殖群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李春艳 丁君 常亚青 孙效文
采用新型生物素-磁珠吸附微卫星与同位素杂交相结合的方法筛选出15对微卫星引物,并对大连地区3个虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)养殖群体(黑石礁海区、小长山岛海区、广鹿岛海区)的遗传结构进行分析。获得175个阳性克隆并测序,得到160个含微卫星的序列,其中完美型,非完美型和混合型分别占42.69%(73)、46.20%(79)和11.11%(19),经筛选得到15个微卫星标记。虾夷扇贝3个群体的有效等位基因数在1.0000～8.8573之间;期望杂合度在0.0211～0.9111之间;观测杂合度在0.0000～0.8778之间。表明这几个群体遗传多样性水平较高。群体间遗...
关键词：
虾夷扇贝 微卫星 养殖群体 遗传结构
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
邵长伟 廖小林 田永胜 陈松林
采用微卫星标记分析技术,用5个多态性的微卫星标记对来自3个不同国家(中国、日本和韩国)的牙鲆养殖群体进行了遗传多样性研究。研究结果表明,3个牙鲆群体平均等位基因在4.8～5.6之间,平均观测杂合度(H0)在0.3917～0.5643之间,平均期望杂合度(HE)在0.5981～0.6264之间。有多个位点在不同的群体中偏离哈代-温伯格平衡。遗传距离分析表明,中国群体与日本群体遗传距离最近,韩国群体与日本群体遗传距离最远。分子方差分析(AMOVA)表明,群体内遗传变异与群体间遗传变异分别占总遗传变异的92.44%和7.56%,固定系数(Fst)为0.0752(P<0.001),表明牙鲆3个养殖群体...
关键词：
牙鲆 养殖群体 微卫星标记 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
张荣良 王卫军 冯艳微 杨建敏 唐海田 纪仁平
为了监测长牡蛎（Ｃｒａｓｓｏｓｔｒｅａ ｇｉｇａｓ）在选育过程中的遗传变异、分析选育对其遗传结构的影响，本研究以选育目标为壳宽快速生长的长牡蛎为实验材料，利用微卫星（ｓｉｍｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎＣｅ ｒｅｐｅａｔｓ）标记技术，对长牡蛎基础群体（ｐ０）和连续两代选育群体（Ｆ１和Ｆ２）进行遗传多样性评估。结果发现，所有微卫星位点在３个群体中都表现出了较高的多态性，ｐ０、Ｆ１和Ｆ２代群体的平均等位基因数分别为１６．５、１２．２和１２．８；ｐ０、Ｆ１和Ｆ２代群体多态性信息含量（ｐｉＣ）的平均数值分别为０．９０６８、０．８９８２和０．８８３６。所有群体１０个位点的观测杂合度值（Ｈｏ）均小于期望杂合度值（Ｈ．．．
关键词：
长牡蛎 微卫星 遗传结构 遗传多样性
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
于悦 庞美霞 俞小牧 童金苟 沈建忠
利用１０个高度多态的微卫星标记对采自长江、赣江、鄱阳湖湖口和都昌水域的４个鲢野生群体遗传结构进行分析。检测到１４８个等位基因，每个微卫星位点的等位基因数５～２４，有效等位基因数６．４～７．１，平均观测杂合度Ｈｏ为０．８０２～０．８２１，平均期望杂合度Ｈｅ为０．８１７～０．８３９，表明这４个鲢群体遗传多样性较高。鲢群体间的遗传相似系数为０．９２２ ２～０．９４４ １，遗传距离为０．０５７ ６～０．０８１ ０，固定系数Ｆｓｔ值为－０．０１２ ３５～０．００５ ２８，表明这４个鲢群体间遗传一致性高，遗传距离小，群体遗传分化不显著。ＡＭｏＶＡ结果显示遗传变异主要来自群体内，基因流分析认为长江、赣江、鄱．．．
关键词：
鲢 遗传结构 微卫星 长江 赣江 鄱阳湖
[期刊] 淡水渔业
[作者]
李燕平 覃川杰 吕云云 龚全 王均 颉江 文正勇
为研究14个不同养殖群体的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)遗传多样性及遗传结构，采用8对多态性微卫星引物对14个群体的209尾个体进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示：14个群体的平均等位基因数在8～10之间，平均有效等位基因在5.160～6.882之间，平均观测杂合度在0.633～0.717之间，平均期望杂合度在0.358～0.749之间，平均多态信息含量在0.594～0.681之间，均大于0.5。分子方差分析结果表明：3.69%的遗传变异来自群体间，3.93%来自群体内个体间，92.38%来自所有个体间，变异来源主要来自个体间，其中RB群体和WH群体的遗传分化最大(F_(st)=0.116),ZL群体和XB群体的遗传分化最小(F_(st)=-0.009)。基于遗传距离构建了UPGMA系统树，发现14个群体共分为5个聚类支，HJ、YZ、YH、YB 4个群体聚为一支，HQ和LG单独各自聚为一支，LZ和RB 2个群体聚为一支，DB、ZJ、WH、XH、XB和ZL 6个群体聚为一支。基于贝叶斯的Structure聚类分析同样支持14个黄颡鱼群体可分为5个聚类支，与聚类树的结果吻合。14个黄颡鱼群体的遗传多样性均处于高度多态水平，遗传分化处于低等分化水平。
[期刊] 水产学报
[作者]
梁业松 张维炜 宋飞彪 张娴 刘伊凡 刘晓春 林浩然 骆剑
遗传多样性下降被认为是水产生物经济性状降低的常见原因。虎龙杂交斑作为养殖规模最大的石斑鱼品种，近年来病害增多。为了探究是否由于群体遗传多样性的改变而影响虎龙杂交斑的养殖性状，本研究选用27个EST-SSRs标记，对苗种主产区6个虎龙杂交斑群体进行了遗传多样性和群体遗传结构分析。结果显示，6个群体其平均等位基因数(N_(a))为6.666 7～8.555 6，平均有效等位基因数(N_(e))为 3.511 6～3.959 0，平均观测杂合度0.764 6～0.794 3，平均期望杂合度（H_(e)）0.709 1～ 0.750 4，平均多态性信息含量（PIC）0.662 2～0.706 4。分子方差分析（AMOVA）结果显示，5.70%的遗传变异来自群体间，0.00%来自群体内个体间，94.3%来自所有个体间。主坐标分析（PCoA）也显示差异主要来源于个体。群体间F_(ST)(遗传分化指数)、遗传距离及聚类分析显示，HB和XC群体先聚为一支，再与WT群体聚为一支，GC和QT群体聚成一支，FP群体为独立一支。遗传结构分析显示，所有样本被分为5（K=5）个理论群体，HB群体由FP、WT、XC、GC群体集合而成。研究表明，杂交石斑鱼群体仍具有较高的遗传多样性，具有清晰的分群，杂交品种受亲本近交影响而出现衰退的可能性不高；病原生物的变异和养殖管理不规范可能是导致病害频发的原因。本研究为石斑鱼种质管理和病害防控提供理论依据。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
李先仁 李思发 唐首杰 蔡完其
利用18对微卫星引物对尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)国内外8个养殖群体进行遗传差异分析。结果表明:(1)8个群体的平均等位基因数(Na)为3.61~5.11,平均有效等位基因数(Ne)为2.81~3.76,平均观察杂合度(Ho)为0.861 1~0.925 0,平均期望杂合度(He)为0.603 9~0.697 7,平均多态信息含量(PIC)为0.522 9~0.637 3。表明这8个养殖群体具有丰富的遗传变异。(2)在对8个群体的遗传距离和遗传相似度进行估算基础上所作聚类分析表明,8个群体分为两大支,3个"吉富"群体明显聚为一支,其他5个群体聚为一支,反映了这8个群...
关键词：
尼罗罗非鱼 微卫星 遗传差异
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
刘云国 陈松林 李八方
应用10对微卫星引物对中国牙鲆一个养殖群体的30个个体进行了群体遗传结构分析。结果显示,微卫星标记比其他标记具有更高的多态性,10个微卫星座位的等位基因数在4～10之间,有效等位基因数在2.23～5.82之间,平均等位基因数为7.6,群体平均杂合度为0.6960,Hardy-wein-berg遗传偏离指数的平均值为0.1774。
关键词：
牙鲆 养殖群体 遗传变异 微卫星标记
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
潘传燕 臧云鹏 廖梅杰 王印庚 荣小军 张正 李彬 陈贵平
采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)方法构建了仿刺参基因组富集CA微卫星序列的基因组短片段文库,筛选得到118条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型共83个,占70.4%;非完美型共30个;占25.4%;复合型标记5个,占4.2%。选取其中20条微卫星序列设计引物进行多态性检测,并利用这20对引物对采自中国、韩国(西海岸及东海岸)、俄罗斯和日本沿海的野生仿刺参以及美国沿海的具疣拟刺参进行遗传多样性水平和遗传结构分析。结果表明,所设计的20对引物的扩增产物均具有多态性,其中16个位点为高度多态(PI...
[期刊] 水产学报
[作者]
耿慧君 周遵春 董颖 赫崇波 邹林林
利用28对微卫星DNA分子标记对中间球海胆的1个野生和1个养殖群体进行了遗传多样性分析。结果表明:在28个基因座中,共检测到91个等位基因,每个基因座位检测到的等位基因数为2~6个,2个群体的平均等位基因数均为3.071 4,平均有效等位基因数分别为2.231 9、2.227 1,平均观察杂合度分别为0.523 4、0.536 5,平均期望杂合度为0.486 8、0.499 3,平均多态信息含量为0.447 7、0.439 6,群体间的多态性差异不显著。2个群体间的遗传相似系数为0.758 7,遗传距离为0.276 2。经Hardy-Weinberg平衡的卡方检验,有50%的位点显著偏离Har...
关键词：
中间球海胆 微卫星 遗传多样性
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