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[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
李红霞 刘楠楠 浦天宁 魏可鹏 俞菊华 李建林 唐永凯
机体生长主要受到促生长激素释放激素—生长激素—胰岛素样生长因子(GHRH-GH-IGFs)生长轴调控,类胰岛素生长因子IGF-Ⅰ是生长激素(GH)发挥生物学功能的重要传导因子。实验特异性扩增了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)IGF-Ⅰa基因的5个外显子和3个内含子(内含子1、内含子3和内含子4)。通过比对10尾建鲤的序列,共找到SNPs位点8个。使用PCR-RFLP方法检测了5个家系共372尾建鲤的内含子1_C175G,12个家系共987尾的内含子1_A993G和内含子4_A511C 3个位点。内含子1_C175G雌雄个体均以GG型频率为最高,分别是0.44和0.43;...
[期刊] 华北农学报
[作者]
魏可鹏 俞菊华 李红霞 李建林 唐永凯 夏正龙
旨为查找建鲤(Cyprinus carpio var.jian)胰岛素样生长因子结合蛋白1(Insulin-like growth factor binding pro-teins 1,IGFBP1)基因上与增重相关的SNP位点。利用基因克隆,Clustal W比较8个个体的DNA序列,筛选SNP位点。并采用PCR-RFLP方法检测了其中2个位点(1b-E1-A210G,1b-E3-C108T)在913尾建鲤(♂469,♀444)中的基因型分布。成功分离得到了建鲤IGFBP1的2条DNA序列,并在1a、1b上分别找到7个和24个SNPs位点,其中,1a外显子上有2个,1b外显子上有4个。检测的...
关键词：
建鲤 IGFBP1 SNP 增重 相关性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
俞菊华 李红霞 李建林 唐永凯 董在杰
GHS-R基因在哺乳类为候选的肥胖和生长数量性状位点。本实验使用RT-PCR及PCR的方法,从建鲤(Cyprinus carpio var.jian)分离到2个jlGHS-R1s,称为jlGHS-R1a和jlGHS-R1b(分别简称1a和1b)。jlGHS-R1s的阅读框编码360个氨基酸,两者间相似性高达96%;另外还存在2个jlGHS-R1s的转录变体(分别简称1a'和1b'),选择性切割了翻译起始碱基后第490-680 nt的191 bp片段,该片段两端碱基分别为gt-ag,这种选择性切割导致翻译提前终止,仅翻译184个氨基酸,包括前面3个半跨膜区,这与已报道的罗非鱼等的保留内含子的转录...
[期刊] 水产学报
[作者]
俞菊华 李红霞 李建林 唐永凯 夏正龙 董在杰
为获得与建鲤增重相关的分子标记进行建鲤分子育种,实验在建鲤心肌型脂肪酸结合蛋白(FABP)基因上筛选了与增重相关的SNP位点。首先使用PCR扩增到2个建鲤FABP3基因,jlFABP3a和3b基因,两个基因均有4个外显子和3个内含子组成,3a和3b阅读框相似性为93%,编码133个氨基酸,相似性为94%,内含子长度和序列存在着明显差异。jlFABP3的系统进化和传统的分类地位一致。通过序列比对,在3a和3b上分别找到26和25个SNP位点。构建PCR-RFLP法检测了其中3个SNPs在建鲤群体中的分布,并与增重进行相关分析,结果显示,C30G与检测群体雌、雄鱼鱼种阶段和雌鱼成鱼阶段增重显著相关...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
唐永凯 俞菊华 徐跑 李建林 李红霞 任洪涛
采用同源克隆法从吉富罗非鱼血液DNA中分离出GH基因。GH含有5个内含子,阅读框长615 bp,编码204个氨基酸。通过随机测序法,在GH的外显子6处找到1个SNPs位点(A/G)。通过PCR–RFLP检测吉富罗非鱼群体内GH的SNPs,同时将其增重性状与SNPs进行相关分析,结果显示,在雌鱼中,GG型和GA型个体增重高于AA型个体,但差异不显著;在雄鱼中,AA型个体增重显著高于GG型个体(P<0.05)。
关键词：
吉富罗非鱼 生长激素 多态位点 增重
[期刊] 中国水产科学
[作者]
胡雪松 于淼 李池陶 贾智英 石连玉
利用PCR结合测序方法,在鲤(Cyprinus carpio)类胰岛素生长因子-I(insulin-like growth factor-I,IGF-I)基因内含子1和内含子2中各鉴定1个微卫星多态性位点,分别命名为intron1189和intron2310,这两个位点均以4碱基为重复单元。以黑龙江鲤(Cyprinus cario haematopterus,YL)(n=263)、德国镜鲤选育系(Cyprinus carpio L.mirror,JL)(n=229),及荷包红鲤抗寒品系(Cyprinus carpio var.wuyuanensis,HL)(n=255)为研究对象,评估了这两个...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
魏笑笑 王宝维 王雷 杨志刚 贾晓晖 王亚超 于世浩 荆丽珍 岳斌
采用PCR-RFLP技术对琅琊鸡胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)5′非编码区PstⅠ酶切位点的多态性与生长发育的相关性进行分析.结果表明,琅琊鸡该位点存在2种等位基因(A和B),基因频率分别为61.7%和38.3%,其中A等位基因是有利基因.AA型个体活重、半净膛重和脂肪含量极显著高于BB型(P<0.01),其屠体重、全净膛重、腿肌重和胸肌重显著大于AB型和BB型(P<0.05),其剪切力和失水率也高于BB型(P<0.05,P<0.01).结果表明:等位基因A对琅琊鸡的肌肉产量和品质具有正效应.
关键词：
琅琊鸡 IGF-Ⅰ 产肉性能
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
黄生强 柳小春 蒋隽 马乐
以大白猪、长白猪和杜洛克3个猪种共327头为试验材料,对2,4-dienoyl-CoA reductase 1(DECR1)基因第6至第10外显子区域进行SNPs筛选,分析SNP突变位点的遗传多态性;采用比较基因组方法,根据人DECR1基因全长序列设计引物,筛选猪DECR1基因的SNP,经PCR-SSCP技术和测序检测,发现Exon6和Exon8区域各存在1个SNP突变位点(C/T,C/G),但Exon6区域的SNP突变是无义突变,而Exon8的是错义突变;在对Exon8 SNP的遗传结构分析中,3个猪种中均检测到CC、CG、GG 3种基因型,说明猪群在该位点均具有丰富的遗传多态性。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
王强 王志跃 杨海明 陈五湖 杨建刚
以新扬州鸡胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)基因作为控制其生长、发育性状的候选基因,通过对IGF-Ⅰ基因主要部分序列进行PCR-SSCP检测,发现了2个多态位点.测序结果表明,IGF-Ⅰ基因存在2个突变位点:插入(G)和(G→C).分析多态位点与0-12周龄鸡生长发育性状的关联性,结果表明:插入(G)突变基因型中,2周龄鸡体重BB型与AB型差异显著(P<0.05),但AA型与AB型和BB型差异均不显著,而(G→C)突变各基因型间没有显著差异;插入(G)突变位点对0-12周龄鸡的龙骨长、胫骨长均没有显著影响,而(G→C)突变位点仅在鸡6周龄时表现出与龙骨长、胫骨长间的差异显著性.
[期刊] 华北农学报
[作者]
王华 魏玉兵 童建伟 张明军 王建福 王欣荣 成述儒
为从分子水平研究甘肃境内典型养殖模式下甘肃高山细毛羊、小尾寒羊、藏羊、蒙古羊和滩羊５个绵羊品种的ＰＲＫＡＧ３基因多态性与屠宰性能和肉品质的相关性，探讨以ＰＲＫＡＧ３为候选基因，提高绵羊屠宰性能和肉品质的可能性。采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ技术对５个绵羊品种的ＰＲＫＡＧ３基因外显子４，５和内含子４多态性进行检测，并就ＰＲＫＡＧ３基因多态性与９月龄屠宰性能和肉品质进行相关性分析。结果表明，在ＰＲＫＡＧ３基因２ ６８９ ｂＰ处发生了Ａ＞Ｇ的突变，位于第４内含子第２３ ｂＰ处，表现出３种基因型，ＡＡ、Ａｂ和ｂｂ。纯合度（Ｈｏ）分别为０．６７，０．６９，０．７６，０．６９，０．５９，杂合度（Ｈｅ）分别为０．３３．．．
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
林长光 刘亚轩 吴悌霖 林金玉 郭长明 朱志明
采集395头核心群的种猪耳样,采用PCR-SNaPshot方法检测长白猪和大白猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因内含子3的位点多态性,并分析各基因型与生长性状的相关性.结果表明,长白和大白猪中均存在3种基因型,大白猪3种基因型分布为:AA>GA>GG,长白猪3种基因型分布为:GA>AA>GG.大白和长白猪的A等位基因频率分别为0.710、0.541,G等位基因频率分别为0.290、0.459.AA基因型个体比GA和GG基因型个体生长速度快,等位基因A对猪的生长具有正效应,同时背膘厚变薄.3种基因型个体在达100 kg活体背膘厚及其估计育种值(EBV)的大小为:GG>GA>AA.因此,在种猪选...
[期刊] 华北农学报
[作者]
宋姗姗 刘宗岳 丛波 刘琳玲 宋兴超 彭英华
为了研究胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)基因外显子2和外显子11的单核苷酸多态性,分析该基因变异与水貂生长性状的关联性,以红眼白水貂、金州黑水貂和咖啡水貂共计235个样本的血液基因组DNA为模板,采用PCR产物克隆和Sanger测序技术,筛查IGF-1R基因SNP位点,将差异位点与不同种群的水貂生长性状进行关联分析。结果表明,红眼白、金州黑水貂的外显子2和外显子11上检测到2个SNPs:c. 207G> A和c. 1782G> A;咖啡水貂在外显子2上检测到2个SNPs:c. 207G> A和c. 218T> A,在外显子11检测到1个SNPs:c. 1782G> A。c. 207G> A和c. 1782G> A都属于无义突变。c. 218T> A位点属于有义突变,氨基酸发生改变,脯氨酸变为精氨酸。关联分析表明:c. 207G> A与金州黑水貂和咖啡水貂体长性状显著相关(P A与咖啡水貂的体长和体质量显著相关(P A位点GG基因型是水貂体长的优势基因型;合并基因型GGGA和GGAA可能是影响金州黑水貂体长体质量的有利基因型,认为IGF-1R基因可能是影响水貂生长性状的候选基因。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
郭新梅 董冰 葛兆鹏 裴玉贺 赵美爱 宋希云
【目的】本研究针对玉米淀粉合成相关基因sbe1和bt2获得SNPs位点并设计引物,进行HRM-PCR分型,根据结果找到相关基因对玉米淀粉合成方面的调控机理,从而为玉米育种的遗传改良和分子设计育种提供理论参考。【方法】本文提取普通玉米H21和紫糯96-619的基因组DNA后进行PCR扩增,测序并拼接出玉米淀粉合成相关基因bt2,sbe1的全长序列。【结果】进行亲本间序列比对,找到了20个SNPs位点,通过高分辨率熔解曲线(HRM),成功对171个高世代回交群体的SNPs位点分型。【结论】运用试验分析,总结了
[期刊] 水产学报
[作者]
刘浩 白俊杰 李胜杰 樊佳佳 全迎春
ｇｈｒｅｌｉｎ是脊椎动物的一种脑肠肽，有促进摄食的功能，并能促进生长激素（ｇｈ）释放，参与能量平衡调控和糖类代谢。为探索ｇｈｒｅｌｉｎ基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性，针对大口黑鲈ｇｈｒｅｌｉｎ基因的启动子序列，实验采用直接测序法获得了２个ＳｎＰＳ位点：Ｓ１（Ａ－６４２Ｃ）和Ｓ２（Ａ－６３９Ｃ）。随机选取同批繁殖、同塘养殖的大口黑鲈采用ＳｎＡ ＰＳｈｏｔ方法进行ＳｎＰＳ位点检测和分型。结果显示，实验群体在ｇｈｒｅｌｉｎ基因２个ＳｎＰＳ位点上基本处于哈温平衡，Ｓ１和Ｓ２共组成５种双倍型（Ｄ１、Ｄ２、Ｄ３、Ｄ４和Ｄ５）。基因型与生长性状的相关性分析结果表明，Ｓ１位点ＡＣ型个体在体高与全长上显著．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
丁燕玲 王鹏飞 杨朝云 张岩峰 周小南 史远刚 康晓龙
【目的】探究IGF2第2外显子多态位点与秦川牛、西门塔尔牛、安格斯牛及新疆褐牛4种品种牛群体的多态性及与生长性状的相关性，为肉牛遗传改良提供依据。【方法】以秦川牛等4个肉牛品种共91头为研究对象，利用PCR-RFLPs技术分析IGF2基因第2外显子多态性，并将IGF2的基因型与生长性状进行相关分析。【结果】IGF2基因第2外显子多态性在不同牛品种中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05），且均属于中度多态（0.25
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