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[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
陈惠端 陈美霞 蔡金月 徐鲜钧 方平平 徐建堂 陶爱芬 牛小平 祁建民
以36个黄麻野生种和栽培种为材料,对其基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析.结果表明:从50对引物中筛选出扩增带型好、品种间带型差异明显、易于识别的34对多态性引物,共扩增出1845条多态性条带,平均每对引物扩增出51.25条,最后从中筛选出14对核心引物构建了36个黄麻品种的DNA指纹图谱,每个品种均有各自特异的DNA指纹,可为黄麻种质资源分子身份证绘制提供依据.
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
李怀志 张峻 李翔 陈火英
利用SRAP技术对36份茄子栽培品种进行了分子鉴定。结果表明:选用25对引物组合对其基因组DNA进行PCR扩增,共获得566条扩增带,其中多态性谱带102条,平均每个引物组合扩增出4.08条多态性条带;品种间‘望哈茄’与‘本溪早紫茄’遗传相似系数最大,为0.986,‘辐射1号’与‘沪紫长茄’间遗传相似系数为0.581。同时使用8对引物组合构建了36个品种的指纹图谱,其中引物FC8ME10可以把‘闽长茄’与其他茄子品种完全区分开。引物SA1OD3可以把‘敦和茄’和‘苏大青茄’同其他茄子品种区分开来。表明:SRAP标记技术能较好地从分子水平揭示出茄子品种的遗传多样性,并能有效应用于茄子品种指纹图谱...
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘丹丹 逯晓萍 张瑞霞 温莹 薛春雷 杨凯 任锐 王亚男 韩平安
利用SRAP分子标记技术构建了22份高丹草品种的指纹图谱。该指纹图谱可以准确区分供试的所有22个高丹草品种,置信概率达到99.9 999%,为高丹草品种划分提供了基础。利用筛选出的19个多态性较好的SRAP引物组合对22个高丹草品种进行遗传多样性分析鉴定,共扩增出450个位点,其中多态性位点369个;平均每个引物组合产生23.6个位点和19.4个多态性位点,平均多态性水平为82.2%。通过采用UPGMA方法进行聚类分析,遗传相似系数在0.66～0.94之间,以遗传相似系数0.674为阈值,可将供试材料分为2个类群。
关键词：
高丹草 指纹图谱 遗传多样性 SRAP
[期刊] 西南农业学报
[作者]
房超 杨志荣 刘独臣 刘小俊 梁根云 杨宏 李跃建
利用SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism)分子标记技术构建茄子分子遗传连锁图,作图群体为255-4-4(Sola-num melongena L. sub sp. ovigerumSalis)与巴-3(S. melongena L. sub sp. melongena)杂交产生的118个F2单株。从88对引物中筛选多态性较好的33对引物组合进行群体检测,多态性频率为37.5%,共检测到40个多态性位点,平均每个引物组合产生1.21个多态性条带。对40个标记用Mapmanager构建连锁群,将24个SRAP标记位点进入4个连锁群,总长度为381...
关键词：
茄子 SRAP 分子标记 遗传连锁图
[期刊] 西南农业学报
[作者]
赵科 孙淑霞 李靖 涂美艳 王玲利 何成勇 徐子鸿 江国良 宋海岩 陈栋
【目的】丰富枇杷种质资源鉴定方法，为其发掘和利用提供理论依据。【方法】利用277对EST-SSR标记和1对果肉颜色相关InDel标记，对52份国内外枇杷种质资源和本研究团队创制的杂交后代进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。【结果】筛选出扩增带型清晰、稳定性和重复性好的9对引物，每对引物扩增条带为2～5条，平均85条；多态性条带比率为40.00%～100.00%，平均71.55%；多态性信息含量（PIC）为0.250～0.999，平均0.685。遗传多样性分析显示，52份枇杷种质资源和创制的杂交后代的平均相似系数为0.791；果肉颜色一致或地理分布相近的枇杷种质资源被聚类到相近的分类单元，并且可以准确地将西班牙、日本枇杷种质资源与其他种质资源进行区分。此外，本研究还构建了52份枇杷种质资源的DNA指纹图谱和色块矩阵。【结论】丰富了枇杷种质资源鉴定的分子标记，为今后发掘分子标记紧密连锁的功能基因或片段提供了理论依据。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
陈晖 陈美霞 陶爱芬 张广庆 徐建堂 祁建民 方平平
【目的】构建黄麻遗传连锁图谱,定位质量性状基因,为今后有关黄麻基因组结构、重要农艺性状QTL定位、分子标记辅助育种和基因克隆等研究工作奠定基础。【方法】以甜麻(黄麻野生种)和宽叶长果(黄麻栽培品种)为杂交亲本,构建了187个F2单株作为作图群体,利用513对SRAP引物进行遗传图谱构建,并对3个质量性状基因(托叶色、叶柄色、叶缘色)进行了定位。【结果】122个SRAP多态性标记位点和这3个形态学标记被定位在该图谱上,初步构建的长果种黄麻遗传连锁图谱全长2 231.9 cM,包含10个连锁群,每个连锁群有2—38个标记位点,2个标记间平均间距为17.86 cM。【结论】该图谱上的标记位点均匀分布...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱
【目的】采用SSR标记构建2008年中国3大棉区8个棉花主产省份32份棉花主栽品种的DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析。【方法】从214对候选引物中筛选出36对多态性高、稳定性好且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,构建棉花主栽品种DNA指纹图谱。【结果】36对SSR引物在32份材料中共扩增出142种多态性基因型,每对引物的基因型从2—11种不等,平均每对引物扩增出3.94种基因型。9对引物在10个品种上具有特征带型。最少采用5对引物进行组合鉴定即可将32个棉花品种完全区分开。NTSYS-pc V 2.10软件分析表明,长江流域棉区品种间遗传差异最大,新疆棉区次之,黄河流域棉区最小。常规品种...
[期刊] 草业科学
[作者]
张俊超 谢文刚 赵旭红 张宗瑜 赵永强 王彦荣
本研究利用EST-SSR分子标记,对国内的52份老芒麦(Elymus sibiricus)材料进行遗传多样性的研究,并构建了7个老芒麦品种及栽培材料的DNA指纹图谱。20对EST-SSR引物共产生204个条带,平均每对引物扩增出10.2条带,176(86.27%)条带为多态性条带,表明供试材料具有较高水平的多态性。同时,引物Elw404和Elw195构建的指纹图谱较为容易地将品种和栽培材料与其他材料区别开。分子方差分析(AMOVA)表明,老芒麦地理区域内(73.94%)的遗传变异远高于地理区域间(26.0
[期刊] 华北农学报
[作者]
陈浩东 肖才升 李庠 匡政成 王为 李育强
为解决长江流域缺乏适合短季棉材料分子分析的SSR引物问题及加强对引进短季棉材料遗传信息的了解,以从中国农业科学院棉花研究所引进的15份短季棉品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,从214对候选SSR引物中筛选出稳定性好、多态性高、基本覆盖棉花26条染色体的68对引物,对15份材料的基因组DNA进行了PCR扩增,共检测出178个有效等位位点,平均每对引物检测到2.62个;引物多态性信息含量(PIC)值介于0.244 9~0.906 1,平均0.693 8。品种指纹分析结果显示,在15份材料中,12份材料可采用特征引物进行一次性区分,其他材料需采用引物组合来实...
关键词：
短季棉 SSR 指纹图谱 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
徐宗大 赵兰勇 张玲 杨志莹
【目的】从分子水平分析玫瑰的遗传多样性和亲缘关系,并建立玫瑰品种的指纹图谱,为杂交育种、品种分类和品种鉴定提供理论依据。【方法】采用相关序列扩增多态性(SRAP)技术对玫瑰46个品种和4份野生种质进行遗传多样性分析和品种指纹图谱的构建。【结果】15对引物共扩增出264个位点,其中227个为多态性位点,多态性比率为85.98%,说明玫瑰的遗传多样性较为丰富。50份材料的遗传相似系数(GS)为0.6012—0.9852,平均值为0.7835;平均Nei’s遗传多样性指数(H)为0.2665,平均Shannon信息指数(I)为0.4033;4份野生玫瑰种质的H=0.1225,I=0.1787,显著低...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
刘国霞 张全芳 杨雪 谭晴晴 胡悦 范阳阳 姚川 崔刚 步迅 陈雪燕 刘炳福
为对草莓品种进行分子鉴定，从59对SSR引物中筛选出18对多态性好的引物，采用毛细管电泳检测方法对84份八倍体草莓品种进行标记分析，检测每个标记等位变异大小，并进行初步遗传分析。将每个引物对84份草莓扩增的带型按照一定原则进行数字标注，为了简化编码，引物P1～P18分别编号为字母A～R,将引物编号与相应的带型编码进行组合得到该样品在特定引物的扩增产物编码，按照18对引物顺序串联这些编码形成该品种的DNA指纹图谱。结果表明：18对SSR引物共扩增得到多态性条带150个，不同引物扩增到多态性条带数4～17个，共检测到377个带型；各引物的多态性信息含量(PIC)值为0.494～0.908,平均值为0.738;利用18对SSR引物共构建了84个草莓品种的DNA指纹图谱。聚类分析结果表明：在遗传相似系数为0.99时能将所有品种区分开，一些来源相同的品种被优先聚在一起。综上，本研究成功构建84个草莓品种的DNA指纹图谱，这些品种遗传关系较近。
关键词：
草莓 SSR DNA指纹图谱 遗传分析
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘娟 廖康 曼苏尔·那斯尔 孙琪 刘欢 贾杨
【目的】从ISSR分子标记水平分析新疆主栽杏品种(系)的遗传多样性和亲缘关系,构建新疆杏品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为杂交育种、品种鉴定和品种分类提供理论依据。【方法】从供试样品中选取表型差异较大的6份材料对100个ISSR引物进行筛选,最终筛选出条带清晰、主带明显、多态性丰富、能够稳定重复且对品种具有较高鉴别力的ISSR特征引物,对48个新疆杏品种(系)进行扩增,采用POPGENE version 1.32软件计算多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),及各材料间的Nei’s遗传相似系数(...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
殷丽琴 彭云强 付绍红 杨进 陈涛 黄敏 余勤 韦献雅 牛应泽
本试验从７０条ＩＳＳＲ引物中筛选出１５条多态性好的ＩＳＳＲ引物，对１０份原产自云南的彩色马铃薯材料进行遗传多样性分析和ＩＳＳＲ指纹图谱构建。结果表明，１５条引物共扩增到１０１条清晰条带，８９个多态性条带，多态性条带百分率为８９．２４％，引物平均多态性位点５．９３，平均多态性信息量０．８２３。聚类分析可将１０份彩色马铃薯划分为４类，其中Ｓ０３－２６７７和Ｓ０３－２６８５的遗传相似系数最大，而紫云１号和Ｓ０６－２７７的遗传相似系数最小。同时筛选到１条核心引物ＡＷ６７７７６，绘制了１０份彩色马铃薯品种的指纹图谱。结果表明ＩＳＳＲ标记能够较准确地按亲缘关系划分彩色马铃薯品种，可为我国彩色马铃薯的品种选．．．
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
董胜君 王新鑫 张皓凯 陈建华 刘权钢 徐豪
东北杏（Armeniaca mandshurica）是东北地区极具经济开发前景的树种，具有重要的生态、经济、社会价值，应用SSR分子标记技术，采用101对扩增条带清晰、多态性高的引物，对61份东北杏野生种质进行PCR扩增，以分析东北杏的遗传多样性，并采用引物组合法构建东北杏的SSR指纹图谱，旨在为东北杏种质资源的鉴定评价、保育研究及合理开发利用提供科学依据。结果表明：101个位点的平均观测等位基因（Na）和有效等位基因的所占比值分别为9.6436和55.13%；平均观测杂合度（Ho）和平均期望杂合度（He）分别为0.2155和0.7711;Shannon’s信息指数（I）和多态性信息含量（PIC）分别为1.7533和0.7316，表明东北杏种质资源具有丰富的遗传多样性。10个种源的遗传多样性差异显著，其中，辽宁省沈阳市的遗传多样性最高，而辽宁省丹东市的遗传多样性最低。聚类结果表明，在遗传相似系数0.842处可以将东北杏种质分为4类(A类、B类、C类、D类)；在遗传距离0.250处可以将东北杏的不同种源分为3类(P1类、P2类、P3类)，均反映了地理种源对东北杏的分类结果占据主导地位。地理距离与遗传距离呈显著相关（p<0.05），表明东北杏种质存在地理隔离现象。采用3对SSR引物（L46、P58H、L28H）构建了东北杏种质的SSR指纹图谱，为东北杏种质资源的分子鉴定提供了重要方法。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
廖梅杰 王锦锦 李彬 王印庚 荣小军 张正 范瑞用
为分析中、韩、俄沿海刺参(Apostichopus japonicus)种质遗传结构，本研究采用SSR指纹图谱技术对中国青岛、烟台，韩国浦项、群山、木浦，俄罗斯符拉迪沃斯托克的8个不同地理种群的刺参群体进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果显示，13个微卫星座位的平均观察杂合度(H_(o))和平均期望杂合度(H_(e))分别为0.47和0.80。13个位点的多态信息含量(PIC)为0.465(AJ06)～ 0.909(AJ09)，除AJ06为中度多态性(0.25
关键词：
刺参 SSR标记 遗传多样性 指纹图谱
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