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[期刊] 西南农业学报
[作者]
宋风雅 梁鹏 何其光 高青 宋洁 缪卫国 郑服丛
采用PCR-RFLP技术分析一年内不同深度橡胶林土壤真菌区系的变化。结果表明,随着时间和土壤深度的变化,真菌18S r DNA的PCR-RFLP图谱存在着一定的差异。相同时间不同取样深度的土壤样品酶切产生的强亮带略有差异,同时,随土壤深度的增加,橡胶土样酶切条带相似性整体增大,说明自然状态下橡胶林土壤的真菌多样性受到土壤垂直分布的影响,优势真菌种群随土壤深度的变化略有差异。而对于不同时间相同取样深度的橡胶林土壤,土壤样品酶切后产生的强亮带有所变化,但3种取样深度下的变化趋势基本相同,1-12月份橡胶土样酶切条带相似性各不相同,表明在自然状态下,橡胶林土壤中真菌多样性会随着时间变化而变化。一些优...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
赵勇 李武 周志华 潘迎捷 赵立平
在一块农田里于一个月内连续采集5次土样,提取土样微生物总DNA,应用PCR RFLP及PCR TGGE技术监测土壤微生物的动态变化。结果表明,细菌16SrDNA和真菌18SrDNA的PCR RFLP图谱在5个采样时间点上基本一致;细菌的PCR TGGE图谱平均有40条带,其相似性在90%以上,真菌的平均有20条带,其相似性在70%以上。说明这块农田土壤细菌区系短期内变化不大,而真菌区系存在较小幅度的动态变化,并且细菌多样性远远高于真菌多样性。比较两种分子生物学方法的结果表明,PCR TGGE技术比PCR RFLP技术更能精确地反映土壤微生物的动态变化,并且能同时快速地对多个样品进行有效区分。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
魏亚情 吴志祥 杨川 兰国玉
【目的】橡胶林是海南重要的森林植被之一，探究海南岛橡胶林土壤细菌群落多样性的季节变化特征及其环境驱动因子，为天然橡胶产业的可持续发展提供科学依据。【方法】使用Illumina Miseq高通量测序法对海南岛橡胶林旱季和雨季的土壤细菌的α、β多样性和群落结构组成及与环境因子的关系进行了分析。【结果】1）共检测到细菌41门、108纲、247目、465科、876属。细菌群落中，优势菌门依次为变形菌门(Proteobacteria)(33.28%)、酸杆菌门(Acidobacteria)(19.27%)、绿弯菌门(Chloroflexi)(13.63%)、放线菌门(Actinobacteria)(12.41%)。2）橡胶林雨季土壤细菌丰富度和多样性均高于旱季，基于Bray–Curtis距离的PCoA分析表明，不同季节土壤细菌群落β多样性差异显著(P=0.001),PERMANOVA分析结果表明，季节变化解释了细菌群落组成差异的2.48%(R~2=0.024 8,P=0.001)。3）细菌多样性与环境因子的线性分析结果表明，细菌α多样性与pH值、全钾(TK)、有效钾(AK)、温度(Tem)、土壤含水量(WC)、降雨(Pre)显著相关(pH:R~2=0.43,P
关键词：
橡胶林 土壤细菌 多样性 季节变化
[期刊] 西南农业学报
[作者]
贾定洪 郑林用 郭勇 王波 甘炳成 黄忠乾 彭卫红
采用ITS PCR-RFLP方法对5个野生木耳属菌株进行分析,并以7个黑木耳栽培菌株和1个毛木耳菌株为参照。通过6个限制性内切酶消化共获得20条清晰易辨的多态性DNA条带,使用NTSYSpc2.1生物软件对DNA条带信息进行分析,结果显示:13个木耳属菌株的遗传相似系数变异范围为0.500~1.000,遗传相似系数变化较大;13个供试菌株在相似系数为0.547时聚在一起,在0.721时聚为3个类群;实验结果支持Auhm、Au5931和Au59641为黑木耳属菌株;Audx菌株鉴定为毛木耳属菌株。研究结果表明ITS PCR-RFLP技术可为区别黑木耳和毛木耳菌株提供重要信息。
关键词：
黑木耳 毛木耳 遗传鉴定
[期刊] 林业科学
[作者]
陆俊锟 陈俊 康丽华 杨振德
Phosphate-dissolving bacteria isolated from rhizosphere of mangrove were characterized by 16S rDNA PCR-RFLP and 16S rDNA sequence to describe the genetic diversity and phylogeny. The dendrogram of 16S rDNA PCR-RFLP revealed the 24 isolated stains were assembled at 59% similarity level. The strains w...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈永川 刘忠妹 许木果 黎小清 丁华平 杨春霞 李春丽
【目的】研究不同品系橡胶树在西双版纳不同生态区种植对土壤氮的影响及其土壤氮变化与橡胶树生长的关系。【方法】分别采集了西双版纳州景洪、勐腊、勐海3个植胶区土壤、橡胶树叶片,并分析了不同割龄RRIM600、GT1、云研-774橡胶树土壤中不同形态氮和橡胶树叶片氮分布特征及关系。【结果】西双版纳州3个植胶地区中不同品系橡胶林土壤中氮的变化差异较大,景洪橡胶林土壤中全氮含量最高,勐腊、勐海相对较低;橡胶林土壤铵态氮和硝态氮较低,硝态氮变异最大;GT1品系橡胶林土壤中全氮含量较高,RRIM600、云研-774相对较低。土壤中全氮含量随割龄的增加而升高,碱解氮、铵态氮、硝态氮随割龄和品系不同而变化,并且土壤铵态氮和硝态氮以低割龄橡胶园相对较高,老割龄橡胶园相对较低;橡胶树叶全氮以景洪最高,勐腊、勐海相对较低,且随割龄的增加而降低。橡胶林保护带土壤全氮、碱解氮、铵态氮与橡胶树叶全氮含量呈显著正相关,而硝态氮与橡胶树叶全氮含量呈极显著正相关;种植带铵态氮和硝态氮与橡胶树叶片氮呈显著正相关。【结论】橡胶树及土壤氮含量随橡胶树品系、割龄、生长环境而变化,不同割龄、不同品系橡胶树对土壤氮具有显著的影响。
关键词：
橡胶树 割龄 土壤 氮 空间变化
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
曹东伟 蔡宇良 杨娟 赵桂仿
采用三因素五水平正交组合设计,探讨了野生中国樱桃的PCR-RFLP扩增条件及限制性内切酶酶切反应体系,并用PCR-RFLP技术对中国樱桃进行了分子亲缘地理学研究。结果表明,利用42种引物/酶组合,在13个中国樱桃居群中检测出多态位点比率为99.48%;在所有酶切片段中,发现了5种cpDNA单倍型(H1、H2、H3、H4、H5);根据单倍型的地理分布格局,将所研究的中国樱桃居群划分为4个地理单元,地理单元间的基因分化系数(GST)值为0.397,cpDNA基因流(Nm)为0.758;中国樱桃cpDNA总的遗传多样性(Ht)为0.166,地理单元内的cpD-NA遗传多样性(Hs)为0.005。分析...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
倪学勤 Joshua Gong Hai Yu Shayan Sharif 曾东
【目的】研究蛋鸡MHC(Major Histocompatibility Complex,主要组织相容性复合物)基因对不同周龄和不同部位肠道细菌种群结构的影响。【方法】使用基于16S rDNA的PCR-DGGE技术,结合特异性和共性条带割胶回收DNA进行克隆和测序,对2,4,6和8周龄商品蛋鸡和15I5系蛋鸡嗉囊、十二指肠、空肠、回肠和盲肠内含物细菌群落的结构和多样性进行比较,鉴定8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员。【结果】商品蛋鸡和15I5系蛋鸡盲肠细菌的多样性最高,其次是回肠和空肠,嗉囊和十二指肠的细菌多样性比较低,且随着蛋鸡周龄增加,各肠段细菌多样性呈上升趋势,MHC基因对细菌多样性无显...
关键词：
肠道菌群 MHC 变性梯度凝胶电泳 蛋鸡
[期刊] 西南农业学报
[作者]
张金莲 黄振瑞 车江旅 谭裕模 王维赞 李冬萍 龙艳艳 卢文祥 李松 陈廷速
为了探讨在酸性赤红壤条件下,大田甘蔗接种丛枝菌根(AM)真菌菌剂对甘蔗根际土壤丛枝菌根真菌种群以及对甘蔗生长的影响,进行酸性赤红壤大田甘蔗接种AM菌剂的试验,初步分析其对根际土壤理化性质、AM真菌种群结构及其对甘蔗生长的效应。结果表明:施AM菌剂能促进甘蔗根系对养分的吸收,特别是对钾的吸收;提高土壤的p H值。原土壤存在4种不同类型的土著AM真菌:A.sp.1、A.sp.2、G.sp.4和G.sp.5,施用AM菌剂和化肥分别影响G.sp.5和A.sp.2种群。此外,凡施复合肥的处理,在根系中检测到较多的DSE有隔菌丝和微菌核。大田甘蔗施用AM菌剂,能增加甘蔗有效茎数,提高产量。
关键词：
甘蔗 大田 AM菌剂 根际土壤 AM种群
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
杨红 姜慧明 吕国忠 刘志恒 张志博
为了解辽宁省花卉根际土壤真菌的种群分布特点,2011和2012年的5~10月间在辽宁省凌源、开原、大洼、庄河、东港、熊岳、辽中7个主要设施花卉种植基地采集土壤样品140份,通过采用稀释平板法和土壤颗粒平板法进行土壤真菌的分离和培养,共分离和鉴定出20属31种真菌,其中接合菌3属4种、子囊菌1属2种、无性型真菌16属25种。分离到的部分真菌种类是重要植物病原菌,如Fusarium moniliforme、Fusarium solani和Verticillium dahliae。结果表明:青霉属Penicillium、曲霉属Aspergillus、木霉属Trichoderm和镰孢菌属Fusariu...
关键词：
花卉 真菌 形态鉴定 辽宁
[期刊] 西南农业学报
[作者]
赵春梅 王文斌 Didier Lesueur 张永发 薛欣欣 罗雪华 李晓波
【目的】研究海南不同母质发育橡胶林土壤理化性状和土壤微生物量分布特征，分析不同母质之间肥力差异，探究影响橡胶林土壤肥力的环境影响因素，旨在为海南不同土壤条件下橡胶林施肥管理和土壤质量提升提供参考。【方法】以海南四大成土母质（花岗岩、玄武岩、变质岩和浅海沉积物）土壤为研究对象，通过调查取样和相关性分析、冗余分析等统计方法，对不同母质条件下橡胶林土壤含水量、有机碳等13项理化指标和微生物碳等微生物指标及两者之间的相关性进行了研究。【结果】不同母质发育橡胶林土壤在物理性状、化学成分、微生物量等方面均存在显著差异，整体上玄武岩理化指标和微生物量含量最高，其理化性状与微生物特征优于其他3种母质。主成分分析表明，不同母质土壤肥力综合得分分别为1.90（玄武岩）、1.88（浅海沉积物）、1.59（变质岩）、-5.37（花岗岩），影响土壤肥力的主要因素是微生物量氮（MBN）、微生物量碳（MBC）、含水量、土壤温度、有效氮等指标。冗余分析表明，土壤微生物与土壤理化性状之间具有极显著差异，影响微生物量含量的主要理化因子为土壤含水量、pH、全钾、土壤温度、全磷、有效氮等。【结论】说明橡胶林土壤微生物和土壤理化性质之间关系密切，并且不同母质土壤肥力的影响因素有所不同，因此在橡胶林土壤质量评价与管理等研究过程中，应充分考虑不同母质与其他耕作条件下土壤微生物和理化性状的变化特征及其耦合关系。
关键词：
母质 理化性状 微生物生物量 相关性
[期刊] 华北农学报
[作者]
付静 刘堰凤 梅眉 黄永红
在前期研究发现,韭菜处理可以减轻香蕉枯萎病和根结线虫病害的发生,推测韭菜中含有能抑制病原菌及致死根结线虫的生防菌。对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌的种群结构及多样性进行比较分析,以期为分离鉴定韭菜中抑菌和杀根结线虫的生防真菌提供理论依据。通过Illumina平台对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌样品中的18S rRNA序列进行测序,并进行生物信息学分析。结果表明:从韭菜根际土壤、根系、叶片中获得348 484高质量序列和123个操作分类单元(OTU)。根际真菌的Chao、ACE、Shannon指数显著高于内生真菌(叶片和根系),而Simpson指数则显著小于内生真菌。根际真菌群落主要由子囊菌门(Ascomycota)(67. 20%)和担子菌门(Basidiomycota)(24.44%) 2个菌门组成;而内生真菌主要由子囊菌门组成,在叶片和根系中含量分别为91. 39%和96. 60%。在检测到的5个菌门中,内生真菌中子囊菌门显著高于根际土壤,其他菌门则显著低于根际土壤。叶片和根系中内生真菌稍有不同,但是差异并不显著。该研究表明,韭菜根际真菌和内生真菌的种群结构存在显著差异,根际真菌的多样性及丰富性显著高于内生真菌。该研究为分离鉴定韭菜中抑制植物病原菌及致死根结线虫的生防真菌提供参考。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
胡兰 徐秀德 姜钰 刘可杰
采用分离培养检验法,对采自我国13个省17市区的274份高粱籽粒寄藏真菌类群进行了分析,结果表明:主要分离获得链格孢菌(Alternaria spp.)、曲霉菌(Aspergillus spp.)、镰孢菌(Fusarium spp.)、青霉菌(Penicillium spp.)、芽枝孢菌(Cladosporiumspp.)、蠕孢菌(Bipolaris spp.)和弯孢霉菌(Curvularia spp.)共7个不同类群真菌。在分离到的真菌中,链格孢菌、曲霉菌和镰孢菌等出现频率较高,分别为33.61%、16.6%和14.98%,高粱籽粒带菌率、带菌种类及分离频率地区间差异明显。
关键词：
高粱 籽粒寄藏真菌 分离频率
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