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[期刊] 华北农学报
[作者]
徐晓静 文思远 韩毅
采用基因芯片技术,对几种常见的肠道菌进行检测和鉴定,包括检测靶基因的扩增、基因芯片的制备、杂交反应和杂交结果的检测与分析4个步骤。结果表明:应用基因芯片对涉及4个菌属的23株肠道菌在相同的条件下进行了杂交检测,得到菌属特异性的杂交图谱,从而达到对细菌进行检测鉴定的目的。制备的基因芯片能够同时检测沙门菌属、志贺菌属、葡萄球菌属、耶尔森氏菌属的细菌。
关键词：
基因芯片 肠道菌 肠道菌检测
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
朱业培 王玮 吕青骎 范巧君 徐幸莲 周光宏
［目的］建立一种运用ＰＣＲ结合基因芯片技术鉴别牛、羊、猪、马、鹿、兔６种动物源性成分的快速、准确、灵敏的方法。［方法］选择线粒体ＤＮＡ（ｍｉｔｏＣｈｏＮＤＲｉＡｌ ＤＮＡ）基因（ｍｔ ＤＮＡ）和细胞色素ｂ（ＣｙｔｏＣｈＲｏｍｅ ｂ）基因（Ｃｙｔｂ）为目标基因，设计６对物种特异性引物和相应的６条鉴别探针，在此基础上建立了同时检测６种动物源性成分的基因芯片方法，并进行实际应用效果评价。［结果］通过对ＰＣＲ扩增体系及杂交体系的优化，该检测方法能实现对上述６种动物源性成分同时进行快速、准确检测，具有良好的特异性，检测牛肉和马肉成分时绝对灵敏度为０．５ Ｐｇ，实际检测灵敏度也可达到０．００１％；所制备的．．．
关键词：
肉类品种 基因芯片 PCR 检测
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
杨若松 姜金庆 张志 李晓成 王建华 任夫波 张丽丽
【目的】建立猪瘟病毒(CSFV)、高致病性猪蓝耳病病毒(PRRSV)、猪圆环病毒2型(PCV-2)及猪细小病毒(PPV)的基因芯片检测方法,为这4种病的实验室诊断和流行病学调查提供一种快速、高效的病原学诊断方法。【方法】根据GenBank中CSFV、高致病性PRRSV、PCV-2、PPV的相关基因序列,设计合成相关引物,采用PCR方法得到具有荧光标记的PCR产物,然后与含有特定检测探针的芯片进行杂交,建立其基因芯片检测方法,并对该方法的灵敏性和重复性进行检测。应用建立的基因芯片检测方法,对150份临床样品进行检测。【结果】建立了针对CSFV、PRRSV、PCV-2和PPV 4种病毒的基因芯片检...
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
许拉 黄倢 杨冰
基因芯片技术是近年来迅速发展起来的一项新技术,已成为国内外研究的热点。作为生物芯片技术发展中最完备的一个分支,基因芯片以其高通量、高灵敏性、高特异性的特点,在细菌、病毒、真菌等病原检测和鉴定方面发挥着越来越重要的作用。本文介绍了基因芯片的原理和作为检测手段的优越性,并综述了基因芯片技术在细菌和病毒检测方面的应用,分析了现有水产动物病原检测技术,提出了在现有水产动物病原生物信息学的基础上,研发水产养殖动物病害诊断基因芯片的策略。
关键词：
基因芯片 病原 检测 水产
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
张子龙 李深伟 邱瑾 田桢干 李晓虹 张继伦 卢钟山 李平
在口岸压载水检测中发现有多种食源性致病菌的存在,给公共卫生和口岸生态环境带来极大风险。目前对食源性致病菌的检测主要是通过细菌的培养及生化鉴定、荧光PCR等方法,但是不能同时检测多种致病菌。本研究针对一种能检测12种食源致病菌的芯片进行了应用研究,用参比菌株和实验室自分离的菌株检测该芯片的特异性,结果表明该芯片的特异性良好,在所检测的菌株之间无交叉反应。在DNA水平上可以检测到110~7 000 copy的DNA分子,在菌裂解液的水平上可以检测到104~105copy数目的菌体,样品添加实验证明1 cfu/m L的菌浓度就可以通过增菌后芯片检测到。该芯片可鉴别金黄色葡萄球菌、阪崎肠杆菌、肠出血性大肠杆菌O157∶H7、霍乱弧菌、志贺氏痢疾杆菌、空肠弯曲杆菌、单增李斯特菌、副溶血性弧菌、弯曲肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、蜡样芽孢杆菌和产气荚膜杆菌等。研究证明该芯片的灵敏度比PCR水平略低,但是其具备高通量、快速、准确,简单易操作等优点,可以应用于口岸压载水中携带食源致病菌的快速检测。
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾慧 郑洁 孟庆江 曹志艳
蚜虫作为病毒的传播介体为害植物造成的经济损失远远超过蚜虫本身,因此急需建立快速、准确、灵敏的蚜虫带毒检测方法。根据百合无症病毒(LSV)和烟草花叶病毒(TMV)外壳蛋白基因保守序列设计引物与探针,制备基因芯片;用Cy3标记下游引物,提取饲毒(LSV和TMV)棉蚜、桃蚜总RNA,RT-PCR扩增产物与芯片杂交,荧光扫描仪检测并分析信号。结果表明,该芯片可以同时检测上述2种蚜虫的带毒情况,此方法有较好的特异性和重复性,能快速、准确地对介体蚜虫的带毒情况进行检测。
[期刊] 华北农学报
[作者]
苏霞 朱瑞豪 陈小玲 杨丽聪 周宏专 徐福洲 杨兵
基于多重ＰＣＲ技术，建立鸡传染性贫血病病毒（ＣＡＶ）、禽网状内皮增生症病毒（ＲＥＶ）、禽白血病病毒禽（ＡＬＶ）Ａ、Ｃ、Ｄ亚群的基因芯检测方法。根据ＮＣＢＩ收录的鸡传染性贫血病毒（ＣＩＡＶ）、禽网状内皮增生症病毒（ＲＥＶ）与禽白血病病毒（ＡＬＶ）Ａ、Ｃ、Ｄ亚群参考毒株的序列，设计合成特异性扩增引物及探针，将下游引物进行Ｃｙ３荧光标记，制备基因芯片；分别提取几种病毒的基因组ＤＮＡ，进行ＰＣＲ扩增后与探针进行杂交，荧光检测仪扫描并分析结果。结果表明：制备的芯片能够同时检测ＣＩＡＶ、ＲＥＶ与ＡＬＶ Ａ、Ｃ、Ｄ亚群，该方法对病毒的最低检测限为１０６ＣｏＰＩＥｓ／ｍ Ｌ，特异性试验结果表明，该方法与ＮＤＶ．．．
[期刊] 林业科学研究
[作者]
王凯英 高茜 严东辉
基因芯片技术因能对生物样本进行快速、高通量的定性和定量分析，而在植物病害诊断中也得到普遍的应用［１］。树木溃疡病是指引起木本植物树皮上出现溃疡腐烂等症状的病害［２］。引起杨树溃疡病的真菌种类较多，加之其无性型和有性型多样，所以，关于杨树溃疡病病原菌的报道多有不同。另外，受地理位置、寄主植物关系及分类体系的限制，迫切需要发展不依赖于常规分离培养的病原鉴定新技术。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
闫丽 李晨 张庆利 戈蕾 黄倢
采用带正电的尼龙膜作为片基,利用手动芯片点样仪将鳗弧菌6个毒力基因的寡核苷酸探针点样于膜基底上,然后进行紫外交联,制备膜芯片。制备好的膜芯片与6个毒力基因的带有地高辛标记的PCR产物进行杂交,通过观察杂交信号来判断是否含有该基因。通过对膜芯片点样浓度、杂交时间及洗膜步骤进行优化,确定所设计膜芯片最适杂交时间为30min、点样探针最适浓度50μmol/L、洗膜过程只需要3步,时间缩短了45min。
关键词：
基因芯片 尼龙膜 鳗弧菌 毒力基因
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾慧 王艳辉 王进忠 王升启 董金皋
黄瓜花叶病毒、烟草花叶病毒和马铃薯Y病毒是世界性分布的重要植物病毒,对农业生产危害较大。农作物感病多为复合侵染,症状表现较为复杂,急需建立快速、准确、能够一次检测多种病毒的检测方法。本研究根据3种病毒的外壳蛋白基因序列,设计引物和探针,制备基因芯片;用Cy3标记下游引物,RT-PCR扩增产物与芯片杂交,荧光扫描仪检测并分析信号。结果表明,该芯片可以从病毒侵染样本中检测到特异性识别信号,检测灵敏度比RT-PCR高10～100倍,该技术能对植物病毒做出快速、准确的检测。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
徐景升 张木清 陈如凯
基因芯片技术是近年来在生命科学技术领域中迅速发展起来的一项高新技术 .本文综述了基因芯片的产生背景、概念、原理、分类和制作方法 ,并展望了其在农业上的应用前景
关键词：
基因芯片 农业
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
章先 王继璇 丁伟勇 鲍建芳 李肖梁
为践行科教协同育人理念，在病原生物学与免疫学实验教学环节，该文设计了抗体芯片应用于真菌毒素多重检测的综合性实验。基于竞争反应模式，通过设计抗体芯片布局和配套装置，同时制备真菌毒素完全抗原辣根过氧化物酶标物，经优化相关反应条件，最终建立了可实现真菌毒素多重检测的抗体芯片技术。结果显示，该方法可实现对4种真菌毒素的同时定量检测，灵敏度高、稳定性好。此综合性实验将病原微生物中真菌毒素的防控需求与免疫检测技术研究热点相结合，可在加深学生对课堂知识理解和掌握的同时，提升学习的全面性和系统性。与传统验证性实验相比，融入科研成果的综合性实验的开展，将巩固学生理论知识和实验操作技能，培养和激发其创新思维和科研热情，助力综合素质提升。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
宋慧君 王玫 于珂 马惠蕊 王玉坤 曹远银
建立玉米赤霉烯酮(ZEN)液相芯片定量检测方法。采用间接竞争法原理和液相芯片技术平台,选用ZEN多克隆抗体对ZEN定量检测方法进行探索。首先将ZEN-BSA与36﹟微球偶联,同时加入待检的游离的ZEN小分子和其标记有生物素的ZEN多克隆抗体,偶联抗原和目标抗原竞争结合生物素标记抗体,通过报告分子SA-PE在532nm波长的激光下,即可检测出报告分子发出的荧光强度,荧光强度与待检ZEN的量成反比。通过优化液相反应体系中ZEN多克隆抗体浓度以及抗原抗体孵育时间,建立了ZEN液相芯片定量检测方法。结果表明:本研究建立的ZEN液相芯片定量检测方法,采用的偶联抗原为ZEN-BSA,偶联量为100μg。Z...
[期刊] 林业科学
[作者]
蒋瑶 戚晓利 唐芳 赵树堂 陈军 卢孟柱
顶端分生组织的分化影响茎及根的生长,从而形成具有不同形态的植株,拟南芥因其在适当条件下与木本植物分生组织分化以及次生生长的共性而被运用到研究当中。花异常株系(AFDL)由于AP1表达的显著降低导致分枝增多。用拟南芥基因芯片对AFDL的幼苗进行基因表达分析,结果显示在临近抽薹期,AFDL与野生型相比有111个变化倍数大于2且P<0.01的基因;其中大部分参与对外界环境及内源刺激的感知和应答,表明AP1下降可能是由于植株对内外环境刺激的过度反应所导致。从基因芯片中挑选出表达量变化显著的2个基因,分别构建相应的植物表达载体并转化拟南芥,其中AT1G56300基因的超表达植株及AT1G65490基因的...
关键词：
基因芯片 融合茎 植物形态建成 拟南芥
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
牛吉山 郑磊 王保勤 常阳 沈天民
普通小麦(Triticum aestivum L.)品系‘兰考906’携带一个小种专化的隐性抗白粉病新基因,暂称为PmLK906.用‘中国春’ב兰考906’F2:3纯合抗、感家系构建抗、感cDNA池.以此抗、感cDNA池为探针筛选小麦基因芯片,获得了可能与PmLK906基因连锁的EST(expression sequencetag)信息.其中感病池表达量高8倍以上的34个,抗病池表达量高8倍以上的28个,排除假阳性结果,这些信息可能代表了与PmLK906紧密连锁的基因.从抗病池表达量高的28个EST中选择2个EST序列信息,设计了2对特异性引物,在抗、感亲本cDNA和抗、感cDNA池中扩增,...
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小麦 白粉病 基因芯片 EST
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