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[期刊] 林业科学研究
[作者]
杜淑辉 王兆山 保尔江·阿布都哈米提 邢世岩 张建国
［目的］对分布于我国新疆地区欧洲山杨自然居群的遗传多样性与遗传分化进行研究。［方法］对４个欧洲山杨自然居群共７２个个体的６个单拷贝核基因标记（ｓｉｎｇ－ｃｏｐｙ ｎｕｃｌｅａｒ ｍａｒｋｅｒｓ）进行扩增与测序，并计算相应的遗传多样性和遗传分化参数。［结果］表明：比对后６个基因的长度在４５９ ｂｐ到７４７ ｂｐ之间，平均多态核苷酸位点个数为１４，遗传多样性指数π和θｗ分别达到了０．００４ ８和０．００４ ４，基因多样性指数为０．７３，以上结果表明欧洲山杨表现出较高的遗传多样性水平。Ｔａｊｉｍａ中性检验结果均不显著，表明所用６个单拷贝核基因均符合中性进化假设。ａｍｏＶａ分析表明８９．７２％的遗传变．．．
[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
陈君
物种之间的系统发育关系及物种形成过程一直以来都是进化生物家研究的焦点。系统发育关系重建可以清楚地显示物种之间的系统发育关系,而物种形成过程的研究能够从本质上解释物种进化的进程。随着测序技术的发展,计算机科学及生物信息学软件的开发给系统发育分析及物种形成过程的研究注入了新的活力。栎属物种存在广泛的种间杂交,引起了植物分类学家们的注意。然而,关于栎属物种的界定和种间系统发育的相关研究非常有限。本文中,依据蒙古栎(Quercus mongolica)和欧洲夏栎(Q.robur)的转录组序列,开发了19对在白栎组
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
陈锦华 汪小凡 梁述平
采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和等位酶分析方法 ,研究了矮慈姑一个自然居群的遗传多样性。根据 9个酶系统 16个等位酶位点的检测结果 ,表明矮慈姑的遗传多样性属中等水平。矮慈姑自然居群的多态位点百分率P =2 5 .0 ,平均每位点等位基因数A =1.4 375 ,平均多态位点等位基因数Ap =2 .5 0 0 ,等位基因有效数Ae=1.30 93,平均预期杂合度He=0 .132 7,平均观察杂合度Ho =0 .194 8,固定指数F =- 0 .4 6 84。实际观察到的杂合体比率高于理论预期杂合体比率 ,居群表现为杂合体过量。
关键词：
矮慈姑 等位酶 遗传多样性 自然居群
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
秦英英 韩海荣 康峰峰 赵琦
利用SSR分子标记对山西省8个辽东栎天然群体进行遗传多样性分析,并与北京东灵山小龙门林场群体进行地理距离和遗传距离相关关系的对比分析,旨在为辽东栎遗传多样性保护提供一定的依据。研究使用11对SSR引物进行遗传多样性分析,得到平均等位基因数为10.2727,平均有效等位基因数为5.1859;得出山西省辽东栎群体的平均期望杂合度为0.7538,Nei多样性指数为0.7521,Shannon多样性指数为1.7543。这一结果表明辽东栎的遗传多样性水平是相对较高的。研究还表明,辽东栎群体的绝大部分遗传变异是发生在群体内的(95.99%),仅有4.01%的遗传变异发生在群体间,并且遗传距离和地理距离之间...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张怀山 鄢秀芹 鲁敏 王道平 安华明
【目的】通过分析评价贵州野生刺梨(Rosa roxburghii Tratt)资源居群遗传多样性和遗传结构,为刺梨资源的保护和发掘利用提供科学依据。【方法】从刺梨EST-SSR引物中筛选扩增效果好、多态性较高的10对引物,对收集的12个野生刺梨自然居群(共255份资源)的遗传多样性及遗传结构应用POPGENE 1.31软件进行分析,并根据Nei’s标准遗传距离,利用NTSYS-pc2.10e软件对各居群进行聚类分析,同时进行Nei’s遗传距离与地理距离的Mantel相关性检验。【结果】居群内Shannon
关键词：
刺梨 SSR 遗传多样性 居群遗传结构
[期刊] 林业科学研究
[作者]
刁松锋 邵文豪 陈涛 姜景民 段文彬
［目的］通过我国无患子主要分布区的居群样本，研究无患子天然居群的遗传多样性和遗传结构。［方法］采用ＩＳＳＲ分子标记技术，利用１２条ＩＳＳＲ引物分析１８个天然居群的２６５株个体样本。［结果］表明无患子遗传多样性水平较高，物种和居群水平上的多态位点百分率（ＰＰＢ）分别为９５．３７％和５７．８２％，Ｓｈａｎｎｏｎ’Ｓ信息指数（Ｉ）分别为０．２５６ ９和０．１９９ ８，ｎｅＩ’Ｓ遗传多样性指数（ｈ）分别为０．３９０ ９和０．２９８ ０。ａＭｏＶａ分析表明，１８个居群间出现一定程度的遗传分化，且遗传变异主要发生在居群内。ＵＰＧＭａ聚类和Ｍａｎｔｅｌ检验结果表明，１８个天然居群可分为２大组群，且居群间的地．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
何恒流 蔡宇良 高天翔 李彬 宛甜 王玉
【目的】研究陕西野生毛樱桃自然居群的遗传多样性,为科学保存和利用陕西野生毛樱桃资源提供理论依据。【方法】以陕西野生毛樱桃的7个自然居群140份样本为材料,用SSR分子标记技术研究其遗传多样性和遗传结构。【结果】用10对SSR引物从7个毛樱桃自然居群中共检测出92个等位基因,各引物扩增的条带在6~14个。居群多态位点比率(PPL)为100%,Shannon’s信息指数(I)平均值为1.280,Nei’s基因多样性指数(H)平均值为0.655,可观察杂合度(Ho)平均值为0.584,期望杂合度(He)平均值为0.672,表明陕西7个毛樱桃自然居群具有较高的遗传多样性水平。居群的基因分化系数Fst=...
关键词：
野生毛樱桃 SSR 遗传多样性 遗传结构
[期刊] 林业科学
[作者]
王雁红 俞琦 杨佳 赵鹏 李忠虎 赵桂仿
【目的】短柄枹栎作为中国南方重要的森林树种之一，近年来受人为活动影响物种退缩严重，对该物种居群的遗传多样性、遗传结构以及遗传结构与地理分布的相关性进行研究，以对短柄抱栋提出相关的保护策略。【方法】共采集到２４个短柄抱栋居群共计３９８个个体样本覆盖短柄抱栋现今的分布范围。采用８对变异丰富的核微卫星（ｎＳＳＲ）分子标记统计短柄抱栋各个居群的遗传多样性，使用分子方差分析（ＡＭＯＶＡ）计算物种的遗传差异，并采用ＳＴＲＵＣＴＵＲＥ和ＡｌｌＥｌＥＳ Ｉｎ ＳｐＡＣＥ软件分析物种整体的遗传结构探讨短柄抱栋遗传结构与其地理环境的关系【结果】短柄抱栋居群具有丰富的遗传多样性平均期望杂合度Ｈ＿Ｅ＝０．４３，平均观．．．
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
付光晟 谭学春 王滑
为有效挖掘湖北神农架核桃(Juglans regia)的种质资源,采用12对多态性高的SSR分子标记引物对3个神农架核桃居群90个单株的遗传多样性及其种群内、种群间的遗传分化进行研究。结果表明:用12对针对核桃属植物基因组设计的SSR引物共检测到108条谱带,其中多态带占比为100%。遗传多样性分析结果显示:居群总期望杂合度为0.604,其遗传多样性水平较高,很可能蕴含了稀有基因资源。遗传分化系数(Fst)显示:有8.22%的变异存在于3个居群间,遗传分化程度中等。这可能与3个居群的地理距离远有关。部分位
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王兰芬 BALFOURIERF 郝晨阳 EXBRAYAT-VINSONF 董玉琛 盖红梅 张学勇
【目的】在分子水平上回答欧洲和东亚小麦品种的遗传关系和多样性差异;同时对Genomic-SSR(gSSR)和EST-SSR(eSSR)多态性水平进行比较分析。【方法】利用38个Genomic-SSR引物对和44对EST-SSR引物对分析371份欧洲小麦品种和363份东亚品种。【结果】共检测到865个等位变异,每个引物对的等位变异数为1～50,平均为10.42;多态性信息含量(PIC)为0～0.91,平均为0.53;欧洲和东亚品种分别检测到730、716个等位变异,特有等位变异分别为150、135,平均遗传丰富度分别为8.80和8.61,遗传多样性指数分别为0.46和0.52。欧洲和东亚小麦品种...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
张羽 张晓娟 李英 谌国鹏 孙晓敏
为探索ＳＣＯＴ标记在油菜遗传多样性研究中的应用，本利用３６对有多态性的ＳＣＯＴ标记和在油菜多样性分析中广泛使用的３０对ＳＲＡＰ标记，对６５份陕南地区甘蓝型油菜高代材料进行遗传多样性分析。结果表明，ＳＣＯＴ标记平均每个标记检测到５个等位变异，每个ＳＣＯＴ位点的遗传多态性信息含量在０．２８～０．８１，平均值为０．５７，供试材料的遗传相似系数集中在０．５６～０．８９。平均每个ＳＲＡＰ标记检测到４个等位基因，每个ＳＲＡＰ位点的遗传多态性信息含量在０．１７～０．８５，平均值为０．５１。供试材料的遗传相似系数集中在０．５０～０．８８。本试验得出，ＳＣＯＴ标记的聚类结果和ＳＲＡＰ标记近似，ＳＣＯＴ标记的多态．．．
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
金则新 李钧敏 李增鸿
采用ISSR分子标记技术,对中国特有树种长叶榧的遗传多样性和遗传分化进行分析.用10个引物对浙江省仙居县的5个长叶榧居群共100个样品进行扩增,共测到136个位点,其中多态位点72个,多态位点百分率(P)为52.97%.长叶榧总的Shannon信息指数(I)为0.269 1,Nei指数(h)为0.175 8,表明种水平的遗传多样性较高,而居群水平的遗传多样性较低,P平均为28.09%,I平均为0.138 9,h平均为0.091 2.AMOVA分子差异分析表明长叶榧居群间遗传分化程度高,45.72%的变异存在于居群间,54.28%的变异存在于居群内,居群间的基因分化系数(Gst)为0.489 1...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
瞿印权 杨德明 徐雯 杜溶讫 何天友 施成坤 荣俊冬 陈礼光 郑郁善
[目的]研究花吊丝竹居群遗传多样性和遗传结构,为种质资源有效利用和良种选育提供理论指导。[方法]利用12条ISSR引物对48份种质(共3个居群)花吊丝竹居群进行遗传多样性和遗传距离分析。[结果]共检测到124个位点,其中,多态性位点为102个,种质和居群水平上的多态位点百分比(PPB)分别为82. 26%和50. 27%,Ne’基因多样性指数(He)分别为0. 220 4和0. 206 6,Shannon’s信息指数(I)分别为0. 349 4和0. 300 5,表明花吊丝竹居群间存在中等水平的遗传变异。根据Nei’s遗传多样性计算出不同居群间分化水平(Gst)=0. 163 3,表明16. 33%的遗传变异存在于居群间,居群内的遗传变异为83. 67%。居群间的基因流Nm为2. 562 1,表明花吊丝竹居群间存在较大基因流,很大程度减少居群间遗传差异。基于遗传距离的UPGMA聚类结果表明,48份种质可分为3组,3个居群可分为2组,居群间地理距离与亲缘关系无显著相关性。[结论]虽然花吊丝竹主要靠营养生殖来繁衍后代,其居群遗传多样性较丰富,且居群内遗传多样性大于居群间。此外,福建居群遗传多样性明显高于广西和广东地区居群。
关键词：
花吊丝竹 遗传多样性 ISSR
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
张鲜艳 陈发棣 张飞 陈素梅 房伟民
利用ISSR和SRAP分子标记对11份不同地理居群野生菊的遗传多样性进行了分析。结果发现:25个ISSR引物共扩增到203条扩增带,其中有187条呈多态性,多态性比率平均为91.9%;29对SRAP引物组合共扩增到446条扩增带,其中有435条呈多态性,多态性比率平均为97.5%;11个居群间的Ne′is遗传距离分布在0.088 7~0.615 5之间。聚类分析表明,紫花野菊、野路菊及其变种能很好地区分开来,但是野生菊资源的遗传变异与地理分布相关性似乎并不明显。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
周宁宁 张颢 杨春梅 汪国鲜 李绅崇 单芹丽 唐开学
以收集的8个绢毛蔷薇居群的80份样本为研究对象,利用SSR技术分析其遗传多样性。80个样本的多态位点百分率、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)分别为69.66%、0.1425、0.2296。比较8个居群的遗传多样性指标,显示居群间遗传变异55.53%,居群内遗传变异44.47%。茂林居群的遗传多样性最高(H=0.0879,I=0.1331,多态位点百分率为25.84%)。聚类分析结果显示,8个居群可聚类为2组。居群遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)分别为0.5553和0.4005,表明绢毛蔷薇基因分化明显,基因交流受阻。
关键词：
绢毛蔷薇 居群 SSR 遗传多样性
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