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[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈泉 羊炼 黄仁军 冯小华 何锦辉
【目的】调查分析重庆、四川两地引起塔罗科血橙新系炭疽病的病原及其遗传结构，以探索更精准高效的炭疽病防控方法，减少柑橘生产的经济损失。【方法】通过病菌形态学鉴定，以及PCR扩增ITS和GDPH基因序列分析，对我国四川和重庆两个主产区的塔罗科血橙新系进行了炭疽病病原鉴定及其遗传多样性分析。【结果】1）从四川、重庆采集的50份塔罗科血橙新系叶片、枝条和果实炭疽病菌疑似样品中总共分离到41个胶孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）菌株。2）依据培养特征、分生孢子形态和致病力差异，将病菌分为Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型和Ⅳ型共4个类型，不同类型菌株的占比分别为73.17%、17.07%、4.88%和4.88%。Ⅱ型和Ⅲ型菌株接种塔罗科血橙新系果实后的发病率达到100%，而Ⅰ型和Ⅳ型菌株接种塔罗科血橙新系果实后的发病率均为88.9%。其中，Ⅱ型平均病斑直径最大，为1.7 cm，而Ⅳ型菌株平均病斑直径最小，仅为0.6 cm，4个类型菌株接种塔罗科血橙新系果实后形成的平均病斑直径差异达到显著水平（P<0.05），而不同菌株致病性的差异与菌株地理来源、分离部位无明显相关性。3）遗传多样性分析显示，以ITS为靶标无法有效揭示柑橘胶孢炭疽菌的遗传变异，而以GDPH为靶标则可将柑橘胶孢炭疽菌分为4个类群，其聚类结果与形态学分类结果及致病性测定结果一致。柑橘胶孢炭疽菌的遗传进化与地理来源、分离部位均没有明显相关性。【结论】明确了采集的川渝两地塔罗科血橙新系炭疽病病原菌为胶孢炭疽菌，不同类型的塔罗科血橙新系炭疽病菌菌株的形态特点和致病力存在差异，并且菌株存在遗传变异，为川渝两地塔罗科血橙新系炭疽病绿色高效防控和抗病品种选育提供一定的理论基础。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
佟广香 匡友谊 尹家胜
目前哲罗鱼(Hucho taimen)处于濒危状态,野生样品采集较困难,因此对其种群遗传结构了解甚少。本研究应用7对AFLP引物对5个野生哲罗鱼群体(104个体)进行了扩增和遗传结构分析。结果显示7对引物共扩增出193个多态位点,多态位点比率为70.18%;多态性位点数(AP)、多态性位点比率(P)、观测等位基因(Na)、有效等位基因(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I)和遗传距离(D)揭示的规律一致,在5个群体中上述指标从大到小依次均为虎头江段2002、抓吉江段、海青江段、虎头江段2006、呼玛河,H在0.148～0.1953之间,I在0.2215～0.2...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
匡友谊 佟广香 尹家胜 梁利群 孙效文 马波
2002年4月在黑龙江水系呼玛河塔河河段100 km范围内,用三刺网捕获索饵洄游哲罗鱼(Hucho taimenPallas)个体20尾,用12对引物对其进行AFLP分析,每对引物组合扩增的位点在39~53之间,共扩增出了565个位点,多态性位点为477个,多态性比例为84.43%,平均Nei氏基因多样性指数H为0.386 7,平均Shannon氏指数I为0.5102,个体间平均遗传距离为0.4552,UPGMA聚类结果显示呼玛河水系哲罗鱼群体内有严重的近亲交配现象。研究结果表明呼玛河水系哲罗鱼具有适度的遗传多样性,这对呼玛河水系哲罗鱼资源量的恢复有着至关重要的作用。
关键词：
哲罗鱼 AFLP 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
朱其建 戴习林 邹卫丽 蒋飞 苏建 过正乾 王海洋 丁福江
为深入了解罗氏沼虾抗病选育群体的抗病力和遗传信息,通过人工注射溶藻弧菌感染16个罗氏沼虾选育群体,并利用微卫星分子标记对选育群体进行遗传结构分析。结果显示,16个选育群体抗溶藻弧菌感染能力存在明显差别,并从中鉴定出抗病力强的群体3个(SCR11-6、SCR11-11和SCR11-16),其在感染溶藻弧菌感染后的成活率达80%;抗病力比较强的群体7个;抗病力一般的群体4个,成活率为65%~70%;抗病力差的群体2个,成活率为35%~50%。8对微卫星引物共检测到53个等位基因,每对引物的等位基因数为5~9个,平均为6.625个,多态信息含量(PIC)为0.629 4~0.829 4,平均为0.7...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
张素贞 何超 王艳丽 马振刚 张小燕 周泽扬 许金山
采用PCR扩增、克隆与测序的方法,对重庆东南地区引起意大利蜜蜂(意蜂)蜂群出现明显下降趋势的病原微孢子虫的遗传标记基因SSU r DNA(小亚基核糖体脱氧核糖核酸,small subunit ribosomal DNA)和ITS(内转录间隔区,internal transcribed spacer)以及3个单拷贝座位分子标记肌动蛋白基因(Actin),热激蛋白基因(Hsp70)和RNA聚合酶基因(RPB1)进行分子水平扩增及测定,并与国内外不同地理分布的蜜蜂微孢子虫种群进行了分子遗传多样性比较及单倍型分析。结果显示,该蜜蜂微孢子虫分离种群为东方蜜蜂微孢子虫,命名为CQYX。序列分析表明东方蜜蜂...
关键词：
蜜蜂微孢子虫 遗传多样性 单倍型 起源
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
付贝 周晓云 罗建军 刘琼光
根据细菌基因组内广泛存在的短重复序列ERIC设计引物,采用Rep-PCR技术对来自广东省主要红掌种植的9个市区27个品种的66个红掌细菌性疫病菌株(Xanthomonas axonopodis pv.dieffenbachiae,简称Xad)进行遗传多样性分析。结果显示,在相似水平为0.85时,可以分为14个遗传组,其中Ⅰ、Ⅱ和Ⅹ为主要遗传组,这表明广东红掌细菌性疫病菌遗传分化明显且具多样性。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
孟颢光 魏晨星 祁魏峥 文才艺 王留超 万鑫茹 臧睿 赵莹
为有效防控枣树干腐病，以47株不同来源的枣树干腐病斑分离物为材料，采用ITS和EF-1α基因序列比对分析以及室内接种方法，对枣树干腐病病原菌进行鉴定，并分析其分布特点及致病力差异。结果显示，47株不同来源的枣树干腐病病原菌包括葡萄座腔菌（Botryosphaeria dothidea）、希氏座腔菌（Spencermartinsia viticola）、平截色二孢（Diplodia mutila）、色二孢菌（D. seriata）和火炬树暗葡腔菌（Phaeobotryon rhois）5个种，其中，S. viticola的分离频率最高，约65.96%,B. dothidea的分离频率次之，为17.02%；河南和河北的优势病原菌分别为葡萄座腔菌（B. dothidea）和色二孢菌（D. seriata），山西、甘肃和宁夏的优势病原菌均为希氏座腔菌（S. viticola）；枣树干腐病的5种病原菌中B. dothidea的致病力最强，P. rhois的致病力最弱；病原菌S. viticola在山西和河北的分离株致病力较强，在河南、宁夏和甘肃的分离株致病力较弱。以上研究表明，枣树干腐病的病原主要由5种葡萄座腔科的真菌组成，不同地域的优势病原菌存在差异；此外，不同地区的同种病原菌的菌株间致病力存在差异，同一地区的不同种病原菌株间的致病力也有差异。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张萌 赵伟全 于秀梅 杨文香 张汀 刘大群
【目的】利用16S rDNA序列对来自中国8个省(区)的34株马铃薯疮痂病菌和15株参比菌株进行系统发育分析。【方法】采用链霉菌通用引物对34株测试菌株的基因组进行16S rDNA序列扩增,测序后在GenBank中进行BLASTn比对,选取同源性较高的菌株构建系统发育树。【结果】34个测试菌株均为链霉菌属,其中Streptomyces scabies12株、S.galilaeus8株、S.bobili6株、S.turgidiscabies1株、S.acidiscabies1株、S.diastatochromogenes2株、S.setonii1株、S.enissocaesilis3株。其中S....
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杨海健 周心智 谭平 张云贵 弓亚林 杨世勇 钟昭林
香橙是我国原产珍贵柑橘资源,具有很大的开发利用价值。为了进一步保护和利用该类资源,通过2种分子标记研究了9个香橙资源的多样性,并比较了这两种标记在分析植物多态性上的差异。结果显示:两标记均显示出9个香橙之间均存在不同程度的差异,其中,3号香橙和8号糖橙遗传距离最近,2号香橙和7号软枝香橙距离最远。分析显示,SRAP标记比SSR标记能够更容易、更快捷的获得大量的多态性分子标记,而如果这两种标记相结合,将能获得更全面的扩增信息和更准确的聚类结果。
关键词：
SSR SRAP 香橙 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
赵丽华 李名扬 王先磊
石榴(Punica granatum)为石榴科(Punicaceae)石榴属(Punica)落叶灌木或小乔木,原产伊朗、阿富汗等中亚一带,从西汉张骞出使西域将涂林安石榴引入我国,石榴作为水果和观赏树木在我国已有2000多年的栽培历史。经长期天然杂交和基因突变,以及采用实生、分株、嫁接等多种繁殖方法,产生了复杂而多样的品种和类型,据不完全统计,我国现有石榴品种资源200多个,遍及南北各地20多个省区,形成了山东枣庄、新疆叶城
[期刊] 中国农业科学
[作者]
代帅帅 任民 蒋彩虹 程亚增 耿锐梅 张兴伟 程立锐 杨爱国
【目的】评价烟草骨干亲本主要病毒病抗性,分析抗病骨干亲本间的遗传多样性,明确不同抗源间的亲缘关系,为烟草病毒病抗性改良的亲本选择提供理论依据。【方法】在温室条件下采用苗期人工接种方法,对中国烟草育种过程中73份骨干亲本进行CMV、TMV和PVY 3种病毒病抗性鉴定,以CMV高抗、或TMV免疫、或PVY免疫为筛选标准,筛选抗病骨干亲本;并利用条带单一清晰、多态性稳定且分布在烟草24条连锁群上的103对SSR引物,对筛选出的抗病骨干亲本和烟草育种常用的4个主体优质亲本进行遗传多样性、聚类和主坐标分析。【结果】(1)不同供试材料间3种病毒病抗性存在显著性差异。在筛选出的29份病毒病高抗或免疫的烟草种...
[期刊] 华北农学报
[作者]
窦新杰 常玉梅 唐然 孙效文 陶然 王楠 梁利群 张丽霞
利用mt DNA COⅠ基因片段(有效长度635 bp)对来自达里湖(DL)、岗更湖(GG)、呼伦湖(HL)、黑龙江(HLJ)、松花江(SHJ)和乌苏里江(WSL)6个地理群体共72个样品进行了遗传多样性和遗传结构分析。从碱基组成来看,6个地理群体在COⅠ区段上的A+T含量(52.37%)明显高于G+C含量(47.67%),符合脊椎动物的碱基组成特点;从各项遗传参数来看,达里湖流域2个群体(DL和GG)的遗传多样性低于黑龙江流域4个群体(HL、HLJ、SHJ、WSL);6个群体共检测到20个单倍型,并共享1个单倍型,达里湖流域群体共享1个单倍型,黑龙江流域群体共享1个单倍型。虽然达里湖流域和黑...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
方耀林 张燕 杨焱清 肖汉兵
以线粒体DNA控制区为分子标记,对汉水流域大鲵(Andriasdavidianus)的遗传多态性进行了研究。在获得的757bp的碱基序列中,有18个多态性核苷酸变异位点,占全部碱基数的2·38%;基因突变以转换为主,有一处插入或缺失;A、T、C、G四种碱基的平均含量分别为31·8%、33·0%、20·9%、14·3%,且A+T的含量(64·8%)明显高于G+C的含量(35·2%)。28个样本检测到8种单倍型,单倍型间的核苷酸变异在0·13%~1·74%之间,单倍型多样性(Haplotypediversity)指数和核苷酸多样性(Nucleotidediversity)指数分别为h=0·8230...
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