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[期刊] 林业科学研究
[作者]
江锡兵 龚榜初 李大伟 吴开云 赵献民
山桐子(Idesia polycarpa Maxim.)属大风子科(Flacourtiaceae)山桐子属(Idesia Maxim.)植物,主要分布于我国长江流域、华北和西北南部的17个省区。另外,朝鲜、日本的南部也有分布[1]。山桐子树干通直,树形美观,生长迅速,适应性强,材质优良,3年生实生苗木即可挂果,是我国南方主要城市园林
关键词：
山桐子 天然居群 表型性状 变异
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
岁立云 刘晓敏 李周岐 肖斌
【目的】通过在陕西省山桐子自然分布区的大量调查、系统观察与测定,研究山桐子果实性状的自然变异状况并进行类型划分,为山桐子种质资源开发利用、收集保存和良种选育提供依据。【方法】在山桐子分布区内全面踏察,选取果实性状特异的植株,观察记录其果穗形状和果粒颜色,测量果穗长度、果穗直径、果柄长度、果粒纵径和果粒横径,并计算平均果径和果形指数等性状。根据果实性状自然变异调查的结果确定类型划分依据进行类型划分,然后对其经济性状进行分析和评价。【结果】山桐子在果穗形状、长度、紧密度及果粒形状、大小、颜色等性状上存在广泛的变异,依据果穗长度、果粒颜色、果粒大小及形状,可将陕南地区山桐子划分为红果短穗小果型、红果...
关键词：
山桐子 果实性状 自然变异 变异类型
[期刊] 西南农业学报
[作者]
管俊娇 虞泓 何露 和云峰 张时刚 彭少波 范源洪
对小桐子8个居群种子表型进行研究,测量种子长度、宽度、重量等11项形态学指标。种子表型性状,居群间的变异系数c.v.%=10.64~19.33,表型频率分化系数平均Pst=10.02%,表型方差分化系数平均Vst=14.27%,表明小桐子种子表型居群内变异是其变异的主要来源。居群间欧氏距离Q-聚类分析表明,种子表型分化基本与居群间的地理距离远近相关联。11个表型性状间多数呈极显著或显著的正相关,种子长度、宽、厚、周长和种子百粒重为小桐子易测定和重要的表型性状。
关键词：
小桐子 居群 种子 表型性状 变异 分化
[期刊] 水产学报
[作者]
田永胜 齐文山 田敬云 廖小林 陈松林
对半滑舌鳎、黑鳃舌鳎和短吻三线舌鳎2个自然群体(Ca1和Ca2)的21个可量性状进行了测定,利用单因素方差分析(One-Way ANOVA)和Student-Newman-Keuls多重比较法,对21个可量性状进行分析和比较。结果发现,短吻三线舌鳎2个群体之间无显著性差异性状达71.43%,半滑舌鳎与短吻三线舌鳎具有显著性差异性状达71.43%,黑鳃舌鳎与短吻三线舌鳎具有显著性差异性状达66.67%~71.43%,半滑舌鳎与黑鳃舌鳎具有显著性差异性状达57.14%。对4个舌鳎群体线粒体(mt DNA)细胞色素氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)和细胞色素b(Cyt b)基因进行克隆,在Gen Bank上未发...
[期刊] 林业科学
[作者]
王娅丽 李毅 陈晓阳
调查祁连山青海云杉天然分布区的10个群体,每群体10个个体,以系统揭示其表型变异程度和变异规律为目的,对针叶、球果、种鳞、种翅和种子的17个表型性状进行系统的比较分析。采用方差分析、多重比较,相关分析、聚类分析等多种分析方法,对群体间和群体内的表型多样性进行讨论。方差分析结果表明:各性状在群体间都存在极显著差异;除球果干质量和球果长/球果径外,其余性状在群体内都存在着极显著的差异。表型分化系数即群体间变异为31.20%,小于群体内的变异(68.80%)。17个表型性状间多数呈极显著或显著的正相关。表型性状呈现出以经度变异为主的梯度规律性。通过表型性状的聚类分析可以将青海云杉10个群体划分为4个...
关键词：
青海云杉 天然群体 表型多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
唐琼英 夏正龙 蔡缪荧 谢巨洪 潘月明 李景芬 杨国梁
为研究罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)养殖群体表型性状间的相互关系及不同类群间的性状差异,本研究对人工养殖的罗氏沼虾雌、雄及"老头虾"3个类群共490个个体的体重、体长、全长等12个表型性状进行了相关分析、形态性状对体重影响的通径分析等。结果表明, 3个类群除上、下额刺数2个可数性状外,其他9个可量形态性状与体重都呈极显著的正相关(P<0.01);影响体重的关键形态性状在3个类群中各不相同,但体长、头胸甲长、第二步足长在3个类群中均是影响体重的关键指标;分别建立了各类群体重与关键形态性状的多元回归方程。聚类分析和主成分分析结果表明,雌、雄2个类群表型上更为相似,"老头虾"与雌性个体的差异最大。腹部轮廓特征(包括腹长、腹宽、腹高)、全长、体长及第二步足长对3个类群的差异贡献较大。雌性个体腹部发达,"老头虾"则第二步足尤为发达。本研究结果可为罗氏沼虾的选择育种、基础生物学及行业标准的制定提供数据资料。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
李洪 田永胜 李祥孔 陈张帆 宋莉妮 段会敏
半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)养殖群体中存在真雄鱼(ZZ)和伪雄鱼(ZW)现象,进行表型和遗传特征研究对其育种及优良苗种培育具有重要的意义。本研究以半滑舌鳎真、伪雄鱼群体及母系半同胞家系为研究对象,首先测定了性成熟半滑舌鳎的真、伪雄鱼群体的表型性状,对其性状进行了比较分析。结果显示,性成熟半滑舌鳎真、伪雄鱼的体重、全长、体长、体宽、头长、眼间距和眼径7个表型性状都存在极显著差异(P<0.01),伪雄鱼的生长速度比真雄鱼快。利用半滑舌鳎22对多态性微卫星标记,对2组半滑舌鳎真、伪雄
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
刁松锋 邵文豪 姜景民 董汝湘 孙洪刚
【目的】阐明无患子(Sapindus mukorossi Gaertn.)种实表型性状间的关系及其变异规律。【方法】从浙江省天台县8年生无患子实生林分中,选择102棵无患子单株,连续2年观测102棵单株的15个种实性状,并对观测数据进行聚类、相关性和主成分等分析。【结果】102棵无患子的15个表型性状的遗传变异系数为4.91%~65.67%;基于15个种实性状划分的6个群组间性状差异明显,可为营建不同用途的无患子林提供基本材料;果实质量、单株产量、果皮皂苷含量和种仁油脂含量是无患子4个重要的经济性状,4个性状与其他性状有着不同程度的相关关系;表征产量、种实化学成分和种实形态因子的4个主成分累积...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
周书栋 杨博智 欧立军 刘周斌 吕俊恒 马艳青 邹学校
选用辣椒自交系‘6421’作为构建突变体库的试验材料,分析甲基磺酸乙酯(EMS)处理对辣椒种子萌发和幼苗生理特性的影响,确定适宜的EMS诱变浓度,在此基础上构建辣椒突变体库,并对突变体库中突变群体的表型变异进行分析。结果表明:EMS质量分数为1.0%时,辣椒种子发芽率和幼苗成活率分别为41.01%和49.32%,接近半致死剂量,且该浓度下辣椒幼苗中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性均达最大值,分别为246.45 U/g、33.99 U/g和158.10 U/(g·mi
关键词：
辣椒 甲基磺酸乙酯 半致死剂量 突变体库
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
陈香波 叶文国 田旗 张启翔
选取夏蜡梅自然分布区8个群体,对花部、叶部、果部和种子的22个性状进行了系统调查与分析,以揭示夏蜡梅天然群体的表型变异特征及变异规律。结果显示:夏蜡梅天然群体存在丰富的表型变异,20个表型性状在群体间与群体内差异均达到极显著水平(P<0.01),平均变异系数为12.15%(6.40%～45.87%),平均表型分化系数为41.87%(1.14%～85.07%),群体内变异(58.13%)大于群体间变异(41.87%);夏蜡梅花色(外被片颜色)表现为白、浅粉、粉、粉红4种类型,不同群体间各花色比例各有不同;各表型性状与生态因子间相关性分析结果显示,22个表型性状中有8个和生态因子呈显著相关。通过表...
关键词：
夏蜡梅 天然群体 表型变异 地理变异格局
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
王媛 温阳俊 王艳萍 刘汉钦 马若洵 吴清太 张瑾
[目的]表型数据缺失是影响全基因组关联分析准确性的重要原因之一，利用统计学方法对缺失表型进行有效预测，可以增大样本容量并提高数据分析的准确性。多性状联合插补分析可以利用性状之间的遗传结构，并同时对多个表型缺失值进行预测，省时高效。[方法]本研究利用均值法、KNN（k-nearest neighbor）、决策树、MICE（multiple imputation by chained equations）、PHENIX（phenotype imputation expediated）和softImpute插补方法对多表型模拟缺失数据进行预测，比较在不同表型缺失率、性状个数、样本量和性状相关性下的插补效果。进一步，对拟南芥真实数据的长日照花期、短日照花期、春化长日照花期和春化短日照花期的表型缺失值进行多性状联合插补，并通过全基因组关联分析验证插补数据的可靠性。[结果]模拟研究表明，随着表型缺失率的增大，插补的准确性不断下降；随着性状个数和性状相关性增大，插补的准确性不断上升；样本量越大插补效果越稳定。在实际数据分析中，多性状联合插补的效果与模拟试验相似，并通过全基因组关联分析和已验证基因检验了插补数据的可靠性。[结论]表型缺失率、性状个数、性状相关性对缺失数据插补效果影响较大，多性状联合插补方法PHENIX、决策树和KNN可以利用性状之间的遗传结构，因此在模拟研究和实际数据分析中更精确、有效。
关键词：
表型缺失数据 预测 插补 多性状 基因
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
王媛 温阳俊 王艳萍 刘汉钦 马若洵 吴清太 张瑾
[目的]本文旨在探索不同情况下多性状联合插补分析对缺失表型的预测效果。利用统计学方法对缺失表型进行有效预测，可以增大样本量并提高数据分析的准确性。[方法]利用均值法、K邻近(K-nearest neighbor, KNN)、决策树、多重插补法(multiple imputation by chained equations, MICE)、PHENIX(phenotype imputation expediated)和softImpute插补方法对多表型模拟缺失数据进行预测，比较在不同表型缺失率、性状数、样本量和性状相关性下的插补效果。对拟南芥真实数据的长日照花期、短日照花期、春化长日照花期和春化短日照花期的表型缺失值进行多性状联合插补，并通过全基因组关联分析验证插补数据的可靠性。[结果]模拟研究表明，随着表型缺失率的增大，插补的准确性不断下降；随着性状数和性状相关性增大，插补的准确性不断上升；样本量越大插补效果越稳定。在实际数据分析中，多性状联合插补的效果与模拟试验相似，并通过全基因组关联分析和已验证基因检验了插补数据的可靠性。[结论]表型缺失率、性状数、性状相关性对缺失数据插补效果影响较大，多性状联合插补方法PHENIX、决策树和KNN可以利用性状之间的遗传结构，因此在模拟研究和实际数据分析中更精确、有效。
关键词：
表型缺失数据 预测 插补 多性状 基因
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
周子杨 卜琛皞 宋跃朋 张德强 张晓宇
【目的】通过对我国小叶杨叶绿素荧光表型的分析，多角度展示小叶杨叶绿素荧光表型的多样性，为相关的光合遗传机制的探究奠定基础。【方法】针对我国小叶杨叶绿素荧光参数的表型数据，通过聚类分析、表型可塑性和变异系数计算、动态拟合等方法来探究其变化规律。【结果】（1）在静态光照强度下（同一光强）对小叶杨4类荧光表型进行k均值聚类，最优聚类数目受光照强度影响显著。不同类别下，所研究的经过光系统Ⅱ的电子传递速率（ETR）、PSⅡ实际的光量子产量（Yield）、光化学猝灭系数（qP）、非光化学猝灭系数（qN）4个叶绿素荧光参数具有显著差异。（2）4个小叶杨荧光参数的表型可塑性指数和变异系数的计算结果显示：所选小叶杨群体在可变环境下具有丰富的表型可塑性，随光照强度的逐渐增强，ETR、Yield、qP的表型可塑性呈现出先减后增再减的整体变化趋势，而qN的表型可塑性整体呈下降趋势，这可能与各表型内部的遗传控制有关，也反映了不同表型对梯度光强的不同响应程度；ETR、Yield、qP的变异系数随光照强度的增加呈现出先下降后上升的趋势。qN的变异系数随光照强度的增加而逐渐减小，当光照强度达最大值时，所有类别样本的变异系数均小于0.1。（3）梯度光照强度下，小叶杨叶绿素荧光表型经聚类后可划分为2个大类，经生长方程拟合后可发现，不同类别样本的表型变异速率和最大（最小）值差别明显。【结论】小叶杨叶绿素荧光表型变异丰富，受光照强度的影响显著。通过聚类分析、表型可塑性及变异系数计算和生长方程拟合等方法可以有效地探究小叶杨叶绿素荧光表型的变化规律，为小叶杨遗传分析、光合作用机制挖掘奠定了基础，对小叶杨的培育提供了科学指导。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
张亦弛 王文磊 徐燕 许凯 纪德华 陈昌生 谢潮添
突变体是开展坛紫菜(Neoporphyra haitanensis)良种选育和性状遗传调控机理研究的重要材料。为获得坛紫菜突变体，本研究利用不同强度的γ射线辐照(辐射剂量梯度：700、900、1100、1300、1500 Gy)处理野生品系NSD35的幼苗，恢复培养结果显示，γ射线照射导致叶状体部分细胞死亡，且藻体细胞的死亡量随着诱变剂量的增加而升高；同时，突变的细胞数量随着辐射剂量增加呈先增后降的趋势。其中，经1300 Gy处理后藻体的突变细胞最多。之后利用体细胞酶解技术和单克隆技术获得了突变体的纯系藻体，从中初步筛选出性状各异的株系67个，并利用14个表型性状对其中21个株系的F_(1)代进行相关性分析和聚类分析。结果显示，相较于对照组，突变体F_(1)代群体中大部分性状的变异系数增加。突变体的多个性状间存在显著相关性，其中，藻体长度与宽度、鲜重没有显著相关性(P>0.05)；宽度与鲜重、叶形态呈极显著正相关(P<0.01)；鲜重与颜色显著负相关(P<0.05)；藻体不同部位的厚度之间存在极显著正相关；叶型与藻体中部、尖端的厚度呈显著负相关。进一步采用系统聚类的方法(遗传距离为20)，将21份材料分成4个主要类群，分别为颜色偏红的藻体组、宽而生物量大的藻体组、薄而日均增长快的藻体组和长而窄的藻体组。综上所述，γ射线对坛紫菜叶状体具有良好的诱变效果，本研究为开展坛紫菜经济性状的遗传调控机理研究以及优良新品种选育提供了基础材料。
关键词：
坛紫菜 γ射线 酶解 突变体 聚类分析
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
国增超 郭炜 侯静 尹佟明 陈赢男
以簸箕柳F1杂交群体为材料,对132个子代的木材基本密度,木材纤维素、半纤维素及木素含量进行了测定,并对所得数据进行了统计分析。研究结果表明:木材的纤维素平均含量为53.19%,变异范围为47.91%~57.00%;木质素平均含量为14.20%,变异范围为12.28%~16.43%,半纤维素的平均含量为19.80%,变异范围为16.52%~23.76%,木材基本密度为0.392 6 g/cm3,变异范围为0.241 6 g/cm3~0.504 4 g/cm3。结果显示上述性状在杂交子代中有较大的变异幅度。对上述性状的表型值进行Anderson-Darling正态分布检验,并利用BOX-COX公...
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