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[期刊] 水产学报
[作者]
唐首杰 杨洁 赵金良 王成辉 李思发
人工驯养和选育是家养动物适应性进化的主要动力之一，中国大陆尼罗罗非鱼引进群体经历了长期的人工驯养和选育，是研究鱼类在驯养、选育条件下适应性进化的良好材料。本实验以尼罗罗非鱼１个埃及土著群体为对照组，以中国大陆具有代表性的尼罗罗非鱼５个驯养群体和４个选育群体为实验组，采用１２个多态性微卫星位点分析了驯养群体和选育群体的遗传多样性和瓶颈效应。结果显示，土著群体、驯养群体和选育群体平均每个位点的有效等位基因数（ＡＥ）分别为５．４３３、５．１１３～６．５１５和３．２３９～６．７３４，期望杂合度（ＨＥ）分别为０．８１２、０．７９６～０．８５９和０．６５７～０．８５８，多态信息含量（ＰＩＣ）分别为０．７６．．．
[期刊] 中国水产科学
[作者]
唐首杰 杨洁 王成辉 李思发 赵金良
家养动物是研究长期人工选择对动物基因组产生选择效应机制的独特对象，尼罗罗非鱼（ＯｒｅＯｃｈｒＯｍｉｓ ｎｉｌＯｔｉｃｕｓ）是一种受人工干预（驯养、选育）历史较短的优良养殖对象，可作为研究新近发生的人工干预对动物基因组产生影响的遗传机制的良好模型。本研究以１个尼罗罗非鱼埃及野生群体为对照组，以４个＂新吉富＂罗非鱼选育系群体、２个企业自主选育群体和５个驯养群体为实验组，采用３种模型分析方法（岛屿模型、分级岛屿模型和贝叶斯似然法），在１２个微卫星位点上进行Ｆ＿（ｓｔ）－离群值点检测（Ｆ＿（ｓｔ）－Ｏｕｔｌｉｅｒ ｔｅｓｔ）。结果显示，在本研究所分析的１２个微卫星位点中，４个＂新吉富＂罗非鱼选育系群体．．．
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李莉好 喻达辉 黄桂菊 叶卫 杜博 符云 童馨 郭奕惠
用7对微卫星引物检测了尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)和奥利亚罗非鱼(O.aureus)群体及其正、反交群体共128个个体的遗传多样性。共检测到38个等位基因,尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼、正交群体和反交群体的平均等位基因数分别为4.0、1.4、5.3和2.7,平均PIC值分别为0.557、0.099、0.590和0.497,平均观测杂合度分别为0.505、0.071、0.826和0.883,平均期望杂合度分别为0.622、0.117、0.684和0.598,杂合子偏离指数(D)分别为-0.146、-0.241、0.215和0.522。结果表明,正交群体的遗传多样性比两个亲...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李晓晖 许志强 潘建林 杨家新 葛家春 柏如发 朱清顺
利用10对微卫星引物对中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)长江水系天然群体、人工选育F4A级群体、F4B级群体以及江苏射阳群体共95个体进行遗传多样性分析。F4A、F4B选育起始群体均来源于固城湖国家级长江水系中华绒螯蟹原种场,射阳群体为江苏省河蟹养殖普遍采用的苗种,其亲本为当地养殖河蟹。结果表明,中华绒螯蟹4个群体的平均观察杂合度(H o)分别为0.8053、0.8197、0.8105、0.8100,平均期望杂合度(H e)分别为0.7149、0.7161、0.7262、0.7286。其中,人工选育F4A级以及B级群体的遗传多样性指数均高于天然群体,但是无显著性差异(P>0.0...
关键词：
中华绒螯蟹 人工选育 遗传多样性 微卫星
[期刊] 中国水产科学
[作者]
杨洁 何安元 何学军 唐首杰 王成辉
利用线粒体DNA控制区部分序列对中国8个尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)养殖群体(埃及、吉拉达、美国、鹭业、吉诺玛、宝路、广东、新吉富)的遗传多样性和相互间遗传关系进行了分析。在所分析的237个样本中,可归结为15种单倍型,其中单倍型BL1为宝路(BL)、埃及(EGY)、吉拉达(GLD)、吉诺玛(GNM)和鹭业(LY)5个群体所共享,但没有一个单倍型为所有群体共享。8个群体内的核苷酸多态位点数(S)在4~83,平均核苷酸差异数(K)的范围为0.50~37.26,单倍型多样性(h)为0.190 8~0.802 3,核苷酸多样性(π)为0.000 8~0.056 9。AMO...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
唐首杰 李思发 蔡完其
通过对线粒体DNA控制区和CO I基因序列的联合分析,研究了团头鲂(Megalobrama amblycephala)3类遗传生态群体(包含4个野生群体、2个驯养群体、1个选育良种"浦江1号"群体)的遗传多样性和遗传分化情况。结果表明:(1)在所分析的7个群体中,共确定了64种单倍型,群体间无共享单倍型。(2)4个野生群体内线粒体DNA的单倍型多样度(Hd)在0.857～0.943之间,核苷酸变异位点数在31～40之间,核苷酸多样性指数(π)在0.275%～0.461%之间,平均核苷酸差异数(K)的范围为4.043～6.800;2个驯养群体的相应参数变化范围分别为0.714～0.800、18～...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王军 王清印 孔杰 孟宪红 曹家旺 王明珠 冯亚萍 吕丁
利用微卫星标记技术分析了中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)野生群体(Wild Population,WP)和‘黄海2号’第10代选育群体(Breeding Population,BP)的遗传多样性,以检测累代人工选育对中国对虾群体遗传结构的影响。结果显示,15个微卫星位点共检测到462个等位基因,微卫星位点等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为344个和229个,多态信息含量(PIC)为0.5180.964。野生群体和选育群体的平均观测杂合度分别为0.852和0.810
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王军 王清印 孔杰 孟宪红 曹家旺 王明珠 冯亚萍 吕丁
利用微卫星标记技术分析了中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)野生群体(Wild Population,WP)和“黄海2号”第10代选育群体(Breeding Population,BP)的遗传多样性,以检测累代人工选育对中国明对虾群体遗传结构的影响。结果显示,15个微卫星位点共检测到462个等位基因,微卫星位点等位基因数(N_a)和有效等位基因数(N_e)分别为344个和229个,多态信息含量(PIC)为0.5180.964。野生群体和选育群体的平均观测杂合度分别为0.852和0
[期刊] 中国水产科学
[作者]
郭香 曾志南 郑雅友 巫旗生 宁岳 祁剑飞 贾圆圆
利用8个微卫星标记对福建牡蛎(Crassostrea angulata)基础群体、‘金蛎1号’选育系F6和野生群体进行遗传多样性分析。结果表明,每个位点在各群体的等位基因数为7~24个,各群体在所有位点的平均等位基因数为10.3~17.6个,平均等位基因丰度为9.8~16.8。平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.655~0.662和0.788~0.872。经邦弗朗尼校正,哈迪–温伯格平衡检验结果显示,在24个群体–位点组合中18个群体–位点组合显著偏离平衡(P<0.01)。群体内近交系数F_(is)值介于0.0095~0.2874,平均值为0.1992,遗传分化系数F_(st)介于0.0224~0.1627,平均值为0.0767,暗示选育群体中存在较低水平的非随机交配现象,属于中度偏低分化。研究表明,连续的选育对群体的遗传分化产生了一定的影响,但是,选育群体仍然具有较高水平的遗传多样性。
关键词：
福建牡蛎 微卫星 群体遗传 遗传多样性
[期刊] 淡水渔业
[作者]
卢建峰 白俊杰 李胜杰 李镕
采用AFLP技术对大口黑鲈(Micropterus salmoides)F3、F4代选育群体的遗传结构进行分析,并计算2个选育群体和一个对照养殖群体的遗传多态度、遗传距离及分化系数。结果显示,8对AFLP引物共扩增到262条带,其中多态性条带有80条,每对引物检测到的多态性条带在5～13之间。F3、F4代选育群体和对照养殖群体的多态性位点比例分别为29.36%、29.20%、30.29%。Shannon多样性指数分别为0.2017,0.1955,0.2042。结果表明,选育群体相较于对照养殖群体多态位点比例和遗传多态度均有所下降。群体间的遗传变异平均为0.0752,由此可见,92.48%的遗传...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
聂鸿涛 李佳 霍忠明 郭炜 闫喜武
本研究利用１０对微卫星标记对菲律宾蛤仔（Ｒｕｄｉｔａｐｅｓ ｐｈｉｌｉｐｐｉｎａＲｕｍ）人工选育群体与野生群体进行遗传多样性分析。结果表明，每个位点的等位基因数为３～１２个，期望杂合度范围为０．３０７～０．７５７，观测杂合度范围０．２０８～０．５８３。等位基因丰富度ａＲ的大小范围是３．０～１０．７，ｐＣＲ扩增产物片段大小在１７８～３９０ ｂｐ，共得到６３个等位基因，平均等位基因数范围从４．４（白蛤）到５．１（龙王塘野生群体），野生群体等位基因丰富度最大（５．２７８），白蛤群体的等位基因丰富度最小（４．２６７）。哈迪–温伯格检验发现４个群体和１０对微卫星的４０个组合中，有２１个组合显著偏离哈迪–．．．
关键词：
菲律宾蛤仔 微卫星 群体遗传 遗传多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
朱佳杰 周宇 沈夏霜 李莉 罗永巨 甘西
采用微卫星标记技术,对吉富品系尼罗罗非鱼(GIFT strain)抗病群体和易感病群体进行了遗传差异分析。结果显示:在30个微卫星位点中20个能扩增出多态性高、重复性好的清晰条带;抗病群体和易感病群体的平均等位基因数分别为2.5,2.4个;观测杂合度和期望杂合度分别为0.469和0.441,0.440和0.476;多态信息含量PIC分别为0.359和0.379;UNH845和UNH189位点在抗病群体中偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),GM180位点在易感病群体偏离Hardy-Weinberg平衡,2个群体间的遗传距离和遗传分化指数为0.055和0.054。此外,GM251...
[期刊] 水产学报
[作者]
李思发 蔡完其
用ＬＫＢ平板电泳仪、４．４％聚丙烯酰胺凝胶对南京罗非鱼良种场尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼养殖群体肌、肝、脑、心、眼中的１０种同工酶进行电泳分析的结果表明，奥利亚罗非鱼的群体未见多态位点，平均杂合度为０，是超“纯”的养殖群体；尼罗罗非鱼群体中有２０％的尼奥杂交鱼，其体形酷似尼罗，难以肉眼鉴别。由此可见，我国尼罗罗非鱼养殖群体中已存在遗传渐渗问题，须注意防杂和提纯。在剔除了杂交鱼后，该场尼罗罗非鱼群体的平均杂合度为０．０４０，ＥＳＴ有多态现象。
[期刊] 水产学报
[作者]
张天时 刘萍 李健 孔杰 王清印
利用微卫星技术对中国对虾人工选育群体第1代和第6代群体的遗传多样性进行了分析。对10个微卫星位点进行了扩增,共产生74个等位基因,每个位点产生的等位基因数从3到13不等。在两个群体中,所观察到的等位基因数都比有效等位基因数多。多态信息含量PIC值0.5567～0.8877,说明这10个微卫星位点在中国对虾中具有较高的信息含量。两个群体的平均杂合度分别为0.6400(CP1)、0.6300(CP6),并通过计算基因型的P值,确定了对Hardy Weinberg平衡的偏离情况。对Fis值的计算表明两个群体内共有5个微卫星位点存在杂合度观察值过剩的现象。两个群体的Shannon多样性指数分别为1.6...
关键词：
中国对虾 微卫星 遗传变异 杂合度
[期刊] 海洋渔业
[作者]
王婧璇 范嗣刚 黄桂菊 刘宝锁 张东玲 郭奕惠 喻达辉
利用微卫星标记对2012年3月和6月分别构建的两批共17个合浦珠母贝(Pinctada fucata)选育基础群体进行了遗传多样性分析。6对微卫星引物在17个群体共680个个体中检测到29个等位基因,每个位点的等位基因数在2~7之间,平均有效等位基因数在2.06~3.07之间,平均观测杂合度在0.31~0.58之间,平均期望杂合度在0.46~0.65之间,平均多态信息含量在0.39~0.58之间,高度多态(PIC≥0.50)群体有11个(占64.7%)。Hardy-Weinberg平衡检验(卡方检验)的结果显示,在检测得到的102个数据结果中,有53个(占52.0%)极显著地偏离了Hardy-...
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