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[期刊] 实验技术与管理
[作者]
张杰 张晓鹏 李鹏高 赵志强
分别将研磨、水煮两种预处理方法和改良CTAB法、试剂盒法两种提取方法进行组合,比较提取小鼠粪便细菌基因组DNA的效果。结果发现,研磨预处理过的样品提取到的细菌基因组DNA的浓度和纯度均高于水煮预处理过的样品,研磨结合改良CTAB法提取到的DNA完整性好于其他方法,研磨结合改良CTAB法是一种提取粪便细菌基因组DNA较为实用可靠的方法。
关键词：
粪便 细菌基因组DNA 提取方法
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
康强 周鑫 罗燕 田青 程建国 赵位
【目的】探索从林麝粪便中提取基因组ＤＮＡ并进行物种鉴定的可行性，为林麝野外调查工作以及分子粪便学在林麝保护中的应用提供科学依据。【方法】采集林麝粪便，采用改良的ＣＴＡＢ抽提基因组ＤＮＡ；按常规ＰＣＲ法对ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因进行扩增测序后，用ＤＮＡｍＡＮ ６．０软件进行系统发育分析；在不同温度存放不同时间，研究林麝粪便基因组ＤＮＡ的提取与ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因ＰＣＲ扩增的时效性。【结果】以提取的基因组ＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ扩增均能特异性地扩增出ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和ＣｙＴ Ｂ基因。系统发育分析结果表明：所扩增产物为林麝的ｍＴＤＮＡ Ｄ－ｌｏｏＰ区和．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘遵春 包东娥 廖明安
通过添加Vc对传统的CTAB法进行改进,结果表明:在磨样时,1 g鲜样中添加0.10 g的Vc提取的DNA质量最高;最佳提取材料是嫩芽,其次是新梢和成熟叶片。
关键词：
金花梨 基因组DNA 提取
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
谢一青 李志真 黄儒珠 肖祥希 王志洁
为从富含次生代谢物的光皮桦Betula luminifera嫩叶中获得高质量DNA,设计了5种先提核再提DNA的CTAB法Ⅰ,CTAB法Ⅱ,CTAB法Ⅲ,CTAB法Ⅳ及改进的SDS法,并以常规CTAB法为对照。用不同的方法就光皮桦基因组DNA进行了提取,采用琼脂糖凝胶电泳检测、A260/A280值测定、限制性内切酶处理和PCR扩增等方法对所提的DNA进行了比较分析。结果表明:实验设计的5种改进方法提取的DNA质量要比常规法的好,但提取的效果差异较大。其中改进的CTAB法Ⅰ是提取光皮桦基因组DNA的最佳方法;PCR扩增结果表明,不同的DNA提取方法会影响PCR带型的变化。图3表1参13
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
梁玉琴 李芳东 傅建敏 乌云塔娜 吴硕
针对柿属植物叶片富含单宁,常规CTAB法提取DNA质量低等问题,为了获得符合柿属植物SSR-PCR扩增要求的DNA,分别采用改良CTAB法和植物基因组DNA提取试剂盒两种方法,提取柿属植物DNA,结果显示:两种方法均可得到满足SSR-PCR扩增要求的DNA;试剂盒较改良CTAB法提取的DNA质量高、杂质少,DNA得率略低,但其操作步骤简单,耗时短,毒害小,因其费用较改良CTAB法高,各实验室可根据自身条件选择适宜方法提取柿属植物DNA。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
常虹 郝德君 杨晓军 肖荣堂 刘勇 钱路 安榆林
为探讨小蠹科昆虫基因组DNA的提取方法,分别以单头削尾材小蠹、削尾材小蠹足部肌肉组织以及多年75%酒精浸渍标本为研究对象,采用经典的酚仿抽提法、改良的CTAB法、SDS法及动物组织/细胞基因组DNA提取试剂盒(即磁珠法)4种方法提取小蠹基因组DNA,对提取的基因组DNA进行分光光度值的测定以及COⅠ基因扩增。结果表明:4种方法均可从单头标本中提取总DNA;对于75%酒精浸渍2年的标本,4种方法均适用,大于2年的浸渍标本,仅磁珠法适用,且磁珠法适合微量组织总DNA的提取。
关键词：
小蠹科 基因组DNA COⅠ 分子鉴定
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
王小奇 贾楠
以桃小食心虫(Carposina niponensis Walsingham)为材料,分别采用CTAB法,冰KAc法,SDS-PK法和试剂盒法提取桃小食心虫的基因组DNA。通过电泳、紫外光谱分析和ISSR-PCR扩增等检测手段,比较分析了DNA纯度。结果表明:CTAB法和SDS-PK法提取的DNA质量明显优于冰KAc法和试剂盒法,适用于PCR扩增。与其他方法比较,SDS-PK法提取的DNA经过PCR扩增后得到的多态性位点最多。因此,SDS-PK法是实验室提取桃小食心虫基因组有效、经济实用的方法。
关键词：
桃小食心虫 基因组DNA DNA提取
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
黄建安 黄意欢 罗军武 王坤波 周李华
为了从富含多酚和多糖等多种次生代谢物质的茶树叶片中分离出高质量的基因组 DNA,对 4种植物 DNA提取方法进行改良后 ,以茶树春梢为材料 ,对提取效果进行了比较 ,并首次采用 CTAB区室法提取茶树基因组DNA.结果表明 ,用该 4种方法提取的 DNA,其 OD2 6 0 / OD2 80 都在 1.8以上 ,相对分子质量均大于 2 1kb,能完全被Eco R 酶切消化 ,也能获得清晰的 PCR扩增图谱 .因此 ,只要操作合理 ,4种方法均能提取出高质量的 DNA.
关键词：
脱氧核糖核酸 茶树 提取方法
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李忆 蔡辉儒 张敏 蒲志刚 阎文昭
根据常规分离土传病菌的方法结合甘薯黑斑病菌的特性,对甘薯黑斑病菌进行分离。并用2种改良的DNA提取法提取基因组DNA与常用DNA提取法进行对比分析,结果表明,CTAB法所获得的甘薯黑斑菌DNA质量最高,用该提取方法获得的高质量DNA为构建黑斑病菌基因组文库构奠定了基础。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
周美丽 王立志 闫天海 杨营 徐琴 王继文 郭伟
为研究林麝粪便细菌的结构与组成，选取６只２～３岁的圈养条件相同且健康的公林麝，饲喂精粗比为２∶８的饲粮，收集其新鲜粪便，提取其总ＤＮＡ，然后用１６ＳｒｒＮＡ细菌通用引物进行ＰＣｒ扩增，并用ＩｌｌｕｍＩＮＡ ｍＩＳｅｑ２５０Ｐｅ测序平台，对扩增子进行ｍＩＳｅｑ双端测序。结果显示：１）借助ＩｌｌｕｍＩＮＡ ｍＩＳｅｑ２５０Ｐｅ测序平台对样品进行测序，共获得８５ ０９１条有效序列，５ １３３个有效ＯＴｕ。２）所得ＯＴｕ经物种注释被归类为２３个门，其中厚壁菌门（ＦＩｒｍＩＣｕＴｅＳ）（５１．１％±１９．９％）、拟杆菌门（ＢＡＣＴｅｒＯＩＤｅＴｅＳ）（３５．６％±１５．５％）、变形菌门（ＰｒＯＴｅＯＢＡ．．．
关键词：
林麝 菌群结构 OTU稀释曲线 共享菌群
[期刊] 西南农业学报
[作者]
和志娇 谭宏伟 徐中志 和加卫 程在全 和根强 董霞
在总结多种蜜蜂DNA提取方法的基础上,以酒精浸泡保存的东方蜜蜂为试材,发展了一种提取蜜蜂DNA的方法。用此方法提取蜜蜂DNA的OD260/280值显示产物纯度较高,能够被限制性内切酶完全酶切,取材少,时间短。用ISSR分子标记技术对其PCR扩增,可得到清晰的条带。用这种蜜蜂基因组DNA提取的改良方法所获的DNA数量和质量都很高,可用于各种分子生物学实验。
关键词：
蜜蜂 基因组DNA 提取方法
[期刊] 淡水渔业
[作者]
吴旭东 张奇 侯玉霞 张文吉
从鲶肌肉、肝、肾、血中提取基因组DNA。经过0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,DNA带型整齐。紫外分光光度仪测定基因组DNA的D260 nm/D280 nm达1.77~1.82,证明所提取基因组DNA质量较好,可用作聚合酶链式反应(PCR)的模板所需。
关键词：
鲶 基因组DNA 提取方法
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
田晔林 张党权 宋志丹 王文和 谷振军
干苔藓植物标本、多年保存苔藓植物标本等的基因组DNA提取是制约苔藓分子生物学研究的难题。本论文采用常规CTAB、高盐CTAB、改良CTAB、试剂盒、SDS法和快速提取法这6种方法来提取保存多年的苔藓标本干样的基因组DNA。结果表明,改良CTAB法是适于提取苔藓干样基因组DNA的最佳方法,提取的基因组DNA总量较多且杂质较少。进一步的ISSR分子标记实验结果表明,基于改良CTAB法所提取的苔藓标本基因组DNA能有效用于ISSR分子遗传学研究。
关键词：
苔藓 标本 DNA提取 基因组DNA
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
周诗捷 曹福祥
在传统CTAB方法的基础上进行改良,建立了适用于华南五针松成熟针叶DNA提取的CTAB法,该方法具有稳定、操作简单、可靠等特点。使用该方法对不同地理分布的华南五针松成熟针叶进行基因组DNA的提取,经紫外分光光度计检测其A260/A280在1.60～1.78之间,OD260/OD230比值介于2.0～2.3之间,无降解现象,RNA去除干净。经ISSR-PCR分析,条带清晰,完全能够达到分子标记的操作要求。
[期刊] 华北农学报
[作者]
张鲁杰 夏秀英 徐娜 贺建华 徐品三
为从越橘成熟组织中提取高质量DNA,对CTAB法进行改良,并与常规CTAB法及快速CTAB法的提取效果进行比较。结果表明:改良方法提取获得的DNA产量大、纯度高,DNA产量平均为192μg/g,OD260/OD280在1.75~1.85之间,所得DNA能被限制性内切酶完全消化,以其为模板进行SRAP-PCR扩增,能得到清晰、稳定的条带,证明改良方法适于越橘成熟组织DNA的提取。
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