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[期刊] 华北农学报
[作者]
王润豪 于永昂 胡海燕 丁超杰 李红民 牛晴晴 李成伟
为了研究非生物胁迫处理下小麦抗坏血酸过氧化物酶(APX)的作用,以小麦百农207为试验材料,根据小麦APX基因序列,采用RT-PCR技术对小麦APX基因进行克隆、生物信息学分析及组织表达模式分析;对小麦进行非生物胁迫处理,分析小麦APX基因在环境胁迫条件下的表达特征。结果表明,TaAPX基因包含876 bp的开放阅读框,编码1个291个氨基酸组成的蛋白质,分子质量为31.73 ku,等电点为7.74,分子式C_(1417)H_(2246)N_(394)O_(423)S_5,TaAPX可能是两性蛋白,无信号肽,为非分泌蛋白。蛋白质序列比对和进化树分析表明,小麦与大麦的APX编码蛋白的氨基酸全长序列相似性最高达到97.25%,亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析表明,TaAPX在小麦幼根、茎、茎节、幼叶、叶鞘、雌蕊和雄蕊中均有表达,其中在幼叶中表达量最高,其次是茎、茎节,在幼根、叶鞘中表达量较低,在雌、雄蕊中表达量最低。在非生物胁迫条件下该基因受干旱、低温胁迫表达增强,而在NaCl胁迫和渗透胁迫下表达降低。综上,获得了TaAPX基因的编码区序列,分析发现其响应干旱、低温和盐等逆境胁迫,提示该基因可能与小麦抗逆境机制密切相关。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
乔枫 耿贵工 曾阳 金兰 谢惠春
为探索青海枸杞抗坏血酸过氧化物酶(APX)基因信息,并对枸杞APX基因进行生物信息学分析以及基因表达研究,通过RT-PCR和RACE方法克隆枸杞APX基因,利用生物信息学软件预测基因结构,采用实时荧光定量PCR方法分析基因表达的变化。结果显示:枸杞APX基因的全长cDNA序列为1 047bp(Genbank No.KX981601),命名为LcAPX基因。该基因含有1个753bp的完整开放阅读框(ORF),编码250个氨基酸,包含亚铁血红素结合位点、底物结合位点和K~+结合位点。枸杞LcAPX与茄科植物的APX蛋白聚为一类,说明两者的亲缘关系较近。LcAPX基因在枸杞的成熟叶中表达量最高,花中表达量最少。其在聚乙二醇(PEG)、氯化钠(NaCl)胁迫下诱导表达,显示LcAPX在枸杞抗干旱和抗盐逆境过程起一定作用。
[期刊] 华北农学报
[作者]
张安 曹清河 周志林 赵冬兰 逄洪波 唐君
为了从甘薯野生资源中获取抗逆基因，提取Ｉｐｏｍｏｅａ ｔｒＩｆＩｄａ组培苗总ｒＮａ，经反转录获得第一链ｃ ｄＮａ，使用特异引物进行ｐｃｒ扩增，获得了Ｉ．ｔｒＩｆＩｄａ抗坏血酸过氧化物酶编码区序列，并进行生物信息学分析以及组织特异性表达研究。经测序表明，所获得的序列长约７６９ ｂｐ，包含７５３ ｂｐ完整的开放阅读框；生物信息学分析结果表明，此序列编码２５０个氨基酸，蛋白大小约为２７．６ ｋ ｄａ，等电点为５．４２，有大范围亲水区，推测在细胞质中起到抗氧化作用；进化发育系统分析表明，Ｉｔ ａｐＸ和Ｉｂ ａｐＸ最为接近；组织特异性表达分析表明，Ｉｔ ａｐＸ在各组织中均有表达。Ｉ．ｔｒＩｆＩｄａ抗坏血．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
张安 曹清河 周志林 赵冬兰 逄洪波 唐君
为了从甘薯野生资源中获取抗逆基因,提取Ipomoea trifida组培苗总RNA,经反转录获得第一链c DNA,使用特异引物进行PCR扩增,获得了I.trifida抗坏血酸过氧化物酶编码区序列,并进行生物信息学分析以及组织特异性表达研究。经测序表明,所获得的序列长约769 bp,包含753 bp完整的开放阅读框;生物信息学分析结果表明,此序列编码250个氨基酸,蛋白大小约为27.6 k Da,等电点为5.42,有大范围亲水区,推测在细胞质中起到抗氧化作用;进化发育系统分析表明,It APX和Ib APX最为接近;组织特异性表达分析表明,It APX在各组织中均有表达。I.trifida抗坏血...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
潘翔 李娜 李印军 魏弘宜 张蕾 陆海
以毛白杨总RNA为模板反转录得到cDNA,克隆获得抗坏血酸过氧化物酶基因家族中的一个成员PtAPX2 864bp的编码序列。该基因编码的蛋白包含287个氨基酸,理论分子质量为31.78ku,C末端包含锚定于过氧化物酶体跨膜结构域,推断其为过氧化物酶体定位蛋白。构建了PtAPX2原核表达载体,在大肠杆菌中表达获得了纯化的重组蛋白,并对其进行了酶学性质分析。PtAPX2对抗坏血酸的Km值为(1.37±0.22)mmol/L,Vmax值为(3.95±0.46)mmol/(L·min·mg);对H2O2的Km值为(0.026±0.003)mmol/L,Vmax值为(1.27±0.03)mmol/(L·...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
粟霞 张军科 马锋旺
根据Genbank上已报道的烟草、辣椒、龙眼和杨树4种植物的抗坏血酸过氧化物酶基因的保守区域设计兼并引物,利用RT-PCR和RACE法对皇家嘎拉苹果叶片APX基因进行克隆、分析。结果表明,皇家嘎拉苹果叶片APX基因片段长度为694 bp,与GenBank中已登陆的富士苹果果实、皇家嘎拉苹果花芽、草莓及Rosa hybridcultivar等的APX cDNA的同源性分别为97%,97%,84%和84%。
关键词：
苹果叶片 APX基因 过氧化物酶
[期刊] 中国水产科学
[作者]
马凌波 张凤英 马春艳 王素娟
利用细胞质抗坏血酸过氧化物酶(APX)基因部分片段为探针,从条斑紫菜(Porhyrayezoensis)叶状体的cDNA文库中筛选出1种新型的编码APX的全长cDNA克隆。该克隆开放阅读框编码242个氨基酸,与高等植物已知的胞质APX序列相似,同时具有两个特征性的保守区域。推导的氨基酸序列具有与在一种单细胞红藻(Galdieriapartite)中发现的APX B相似的杂交类型结构,这种结构可能是红藻或者非绿色光合生物的APX的重要特征。该cDNA克隆编码区G+C含量达到63 7%,其中密码子的第3位G+C含量高达88 4%。本实验得到的抗坏血酸过氧化物酶基因的cDNA序列已登录到GenBan...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
沈文飚 徐朗莱 叶茂炳 张荣铣
许多研究表明水杨酸（ｓａｌｉｃｙｌｉｃａｃｉｄ，ＳＡ）是植物体内一种重要的激活抗病防卫反应的内源信号分子。Ｃｈｅｎ等首先从烟草叶片中鉴定出一种可溶性水杨酸结合蛋白（ｓａｌｉｃｙｌｉｃａｃｉｄｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎ，ＳＡＢＰ），对ＳＡ的解离常数（...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
孙卫红 李风 束德峰 董新纯 杨秀梅 孟庆伟
【目的】探讨叶绿体类囊体膜抗坏血酸过氧化物酶(tAPX)与耐盐性的关系。【方法】从番茄叶片中分离到类囊体膜抗坏血酸过氧化物酶基因(LetAPX),利用农杆菌介导的叶盘法转入到烟草中。Northern杂交分析了LetAPX在盐胁迫(NaCl)下的表达特征。以野生型(WT),转正义LetAPX烟草株系T2-2(+)和T2-6(+)为试材,测定了盐胁迫条件下APX酶活性,过氧化氢(H2O2)含量,种子发芽率,植株的鲜重、干重,光合速率及叶绿素荧光参数。【结果】Northern杂交显示LetAPX已转到烟草基因组中,且基因的表达受盐胁迫的诱导。盐胁迫下转基因烟草的种子发芽率,植株的鲜重与干重,APX酶...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
张馨月 王广龙 黄蔚 王枫 倪桢燚 熊爱生
［目的］抗坏血酸过氧化物酶（ＡＰＸ）利用抗坏血酸作为电子供体，清除植物中的过氧化物，在植物应对非生物胁迫中起重要作用。本文目的是研究胡萝卜Ｄｃ ＡＰＸ基因在抵御逆境胁迫过程中的响应情况。［方法］以胡萝卜‘黑田五寸’为研究材料，克隆获得胡萝卜Ｄｃ ＡＰＸ基因（Ｇｅｎ ＢＡｎｋ登录号为ｋＲ３６４５７３），对该基因进行序列分析，并研究其主要非生物胁迫（高温、低温、干旱和盐胁迫）下的基因表达情况。［结果］序列分析表明，胡萝卜Ｄｃ ＡＰＸ基因全长７５３个碱基，编码２５０个氨基酸，预估其蛋白质相对分子质量为２７．７６×１０３，Ｐ Ｉ值５．６５。进化分析表明，胡萝卜Ｄｃ ＡＰＸ在进化关系上与同属伞形科的短果．．．
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
张馨月 王广龙 黄蔚 王枫 倪桢燚 熊爱生*
摘要：[目的]抗坏血酸过氧化物酶（APX）利用抗坏血酸作为电子供体，清除植物中的过氧化物，在植物应对非生物胁迫中起重要作用。本文目的是研究胡萝卜DcAPX基因在抵御逆境胁迫过程中的响应情况。[方法]以胡萝卜‘黑田五寸’为研究材料，克隆获得胡萝卜DcAPX基因（GenBank登录号为KR364573），对该基因进行序列分析，并研究其主要非生物胁迫（高温、低温、干旱和盐胁迫）下的基因表达情况。[结果]序列分析表明，胡萝卜DcAPX基因全长753个碱基，编码250个氨基酸，预估其蛋白质相对分子质量为27.76×103，pI值5.65。进化分析表明，胡萝卜DcAPX在进化关系上与同属伞形科的短果茴芹同...
[期刊] 水产学报
[作者]
唐蕾 傅明骏 赵超 邱丽华 刘文生 江世贵
为了研究含硒谷胱甘肽过氧化物酶（ｓｅｌｅｎｉｕｍ－ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ｇｌｕｔａｔｈｉｏｎｅ ｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ，ｓｅｇｐｘ）在斑节对虾应激反应和卵巢发育中的作用，实验以斑节对虾肝胰腺转录组数据中筛选获得的ｓｅ－ｇｐｘ基因（ｐｍ ｓｅ－ｇｐｘ）片段为基础，利用ｒａＣｅ技术获得ｐｍ ｓｅ－ｇｐｘ基因的Ｃ ｄｎａ全长，并对其进行了生物信息学分析；利用荧光定量ｐＣｒ技术研究了ｐｍ ｓｅ－ｇｐｘ在斑节对虾不同组织、卵巢发育各期、肝胰腺组织在ｐｈ９、硫酸铜（Ｃｕ～（２＋））应激下的相对表达量和变化趋势。结果显示，ｐｍ ｓｅ－ｇｐｘ基因Ｃ ｄｎａ全长为９５９ ｂｐ，５＇非编码区（ｕｔｒ）长１０ｂｐ，开放．．．
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
陈虎 贾婕 罗群风 吴东山 杨章旗
克隆获得马尾松Pinus massoniana PmGPX基因,进行生物信息学分析以及在不同抗虫材料表达模式分析。在前期马尾松转录组测序获得该基因片段基础上,用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得基因全长,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术分析该基因在不同抗虫材料中的表达模式。克隆获得基因cDNA全长序列,命名为PmGPX。该基因包含741 bp开放阅读框,编码246个氨基酸。序列分析表明:该基因具有GPX家族典型的保守结构域,等电点PI 8.29,蛋白分子量27.08 kDa,与针叶植
[期刊] 华北农学报
[作者]
程华 李琳玲 王燕 程水源
利用RACE技术从银杏中克隆到过氧化物酶基因(GbPOD1,FJ599670)的cDNA全长。GbPOD1基因编码序列为1 092 bp,编码一条长为329Aa的成熟阴离子POD蛋白,预测成熟蛋白分子量为35.8 kDa,等电点为8.10。Southern杂交及进化树分析结果表明,GbPOD1和其他物种的POD源自于相同的祖先,属于植物类型III的POD同工酶编码基因,为多基因家族。RT-PCR分析表明,GbPOD1在银杏的根、茎、叶和果中都有表达,在茎中的相对表达量最高,其次为根和果,而叶部位表达水平最低。植物激素MeJA、金属离子Cu和Cd以及MV和WOU的处理能显著诱导GbPOD1基因的...
关键词：
银杏 POD1基因 表达分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
杨尚谕 李立芹 陈倩 卓维 刘仑 鲁黎明
为烟草过氧化物酶基因的功能及结构研究奠定理论基础,采用同源克隆的方法,从烤烟品种K326中克隆出了过氧化物酶基因Nt POD1的c DNA全长,并进行了生物信息学分析;同时,运用q RT-PCR的方法,分析了该基因的组织器官及逆境胁迫表达模式。结果显示,该基因c DNA全长981 bp,编码326个氨基酸残基,预测分子量为37.19 ku,等电点为8.89。生物信息学分析表明,该蛋白是一个亲水性蛋白,结构域中含有4个保守的二硫键和2个保守的钙结合位点,可能定位在细胞外(包括细胞壁),属于植物血红素依赖性过氧化物酶超家族的Ⅲ类分泌氧化酶,与渐窄叶烟草POD42、美花烟草POD42、马铃薯POD42等具有很高的同源性。该基因在烟草根、茎、叶、花中均有表达,其中叶中表达量最高,花中表达量最低。同时,Nt POD1的表达受高盐、干旱、低钾、ABA和H2O2诱导。结果表明,Nt POD1基因属于烟草的过氧化物酶,并可能在烟草非生物逆境胁迫响应中发挥作用。
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