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[期刊] 水产学报
[作者]
孙雪 吴晓微 李兴文 裴鲁青
用核基因组rDNA的内转录间隔区(ITS)和叶绿体rbcL基因对小球藻属(Chlorella)6株小球藻的种间和种内关系进行了分析。克隆序列与GenBank数据库检索到的相关小球藻序列(ITS和rbcL序列各为15条)一起进行比较分析。结果显示:ITS序列长度在小球藻种内高度保守,在种间变异较大;而rbcL序列长度在种间和种内水平都高度保守。15株小球藻ITS序列间遗传距离在0.000~0.663之间;而15株小球藻rbcL序列间距离在0.000~0.216之间。6株实验藻中原始小球藻F-2与蛋白核小球藻F-5、F-9近似种内关系;蛋白核小球藻820与普通小球藻Cvq亲缘关系极近;椭圆小球藻C...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李春燕 孙雪 杨锐
以2株蛋白核小球藻(Chlorella pyrenoidosa)F-9和820为实验材料,根据已知绿藻rbcS基因设计简并引物,分别克隆到2条245bp的cDNA片段,以此片段为基础使用cDNA末端快速扩增(RACE)技术,获得了2条长度分别为861bp和907bp的rbcS基因。序列分析表明,蛋白核小球藻F-9和820的rbcS分别编码181和184个氨基酸,编码区具有与高等植物rbcS保守序列YYDGRYWTMWKLPMFG相类似的结构,起始密码子附近有Kozak保守序列(A/GXXATGG),3′非翻译区有加尾信号TGTAA。同源性分析结果表明,F-9与蛋白核小球藻(GenBank登录号...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
苏发文 高鹏程 来琦芳 么宗利 陆建学 周凯 仲启铖 郑亮 王慧
以盐碱池塘优势微藻铜绿微囊藻（Ｍｉｃｒｏｃｙｓｔｉｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）、小球藻（ｃｈｌｏｒｅｌｌａ ｐｙｒｅｎｏｉｄｏｓａ）为研究对象，采用正交实验方法，研究不同温度（２０℃，２５℃，３０℃）和光照强度（２０００ ｌｘ，４０００ ｌｘ，６０００ ｌｘ）组合条件下两种微藻对水环境ｐｈ的影响。结果显示，处于对数生长期的铜绿微囊藻和小球藻均能使水环境ｐｈ上升。在本实验范围内，不同温度和光照强度组合条件下，铜绿微囊藻的生长均能使水环境ｐｈ显著上升至９．５０以上，在温度２５℃、光照强度２０００ ｌｘ条件下，藻密度达最大值１．１×１０～７ ｃｅｌｌｓ／Ｍ ｌ，水环境ｐｈ也达到峰值１０．８３；小球藻生．．．
关键词：
铜绿微囊藻 小球藻 温度 光照强度 pH
[期刊] 水产学报
[作者]
孙雪 吴晓微 徐年军 杨锐
psbA基因是高等植物和藻类中介导光合电子传递D1蛋白的编码基因,该基因受光照等因素的调控。以单细胞绿藻蛋白核小球藻为材料,克隆了psbA全编码序列并用荧光定量PCR的方法研究了自养和异养藻psbA基因转录水平的变化,以揭示不同培养方式下psbA基因表达变化规律。结果克隆到2 595 bp psbA序列,包括676 bp的5'-非翻译区和857 bp的3'非翻译区。该psbA基因开放阅读框编码353个氨基酸,A+T百分含量为58.0%,其成熟的D1蛋白加工方式与高等植物高粱相似。荧光定量结果表明,自养藻在光周期内psbA基因表达量先升高后下降,而异养藻psbA表达变化不明显。从自养转为异养2 ...
[期刊] 水产学报
[作者]
王玮蔚 孙雪 王冬梅 沈佳 徐年军
为探讨小球藻中碳酸酐酶对环境调控的响应规律,提高小球藻的生物量及对无机碳的利用,实验采用生化和荧光定量PCR方法研究了盐度和2种无机碳对蛋白核小球藻生长、胞外碳酸酐酶(CA)活性及3种亚型碳酸酐酶基因(ca)表达的影响。结果发现,培养至第9天时盐度15和30培养藻生长较快,盐度45藻细胞密度降为盐度15的0.83倍;CA活性随着盐度增加而降低,盐度45长时间处理酶活性降低更为明显,3种亚型ca基因表达量则随盐度升高而增加。2倍空气CO2浓度培养藻密度可达空气CO2浓度的1.23倍,但CA活性较低,第8天为空气CO2浓度组的0.41倍,α-ca和γ-ca基因表达量比空气CO2浓度组略有升高。在0...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
何海生 原居林 刘梅 倪蒙 顾志敏
为了解接种蛋白核小球藻(Chlorella vulgaris)和种植水蕹菜(Ipomoea Aquatica)对南美白对虾(Penaeus vannamei)养殖的影响,在南美白对虾养殖水体中设置空白对照组、单纯接种蛋白核小球藻、种植水蕹菜及二者联合的4个处理组,定期监测各处理组中水质理化指标、生长特性及免疫相关酶活性的变化情况。结果显示:与对照组相比,三个处理组均能有效去除南美白对虾养殖水体中的NO~-_2-N、NH~+_4-N、TN和TP,其中接种蛋白核小球藻处理组对NO~-_2-N的去除率达到51.27%;种植水蕹菜处理组对NO~-_2-N、NH~+_4-N和TP去除效果最好,去除率分别为55.19%、70.06%和74.76%;联合处理组对水体TN去除率为49.66%,去除TN效果最佳。三个处理组均能提高南美白对虾的特定生长率和提高其成活率,其中联合处理组效果最佳,分别较对照组提高了0.66%和27.27%,水雍菜处理组分别增加了8.14%和9.10%,蛋白核小球藻处理组分别增加了4.41%和2.28%,同时联合处理组的增重率显著高于其他三组。种植水蕹菜处理组能显著增加南美白对虾CAT、GST活性和GSH含量,分别较对照组增加了128.84%、235.39%和426.26%;联合处理组对南美白对虾肝胰腺的SOD活性和GSH含量促进效果最佳且达到显著水平,分别较对照组增加了52.75%和1 376.69%。综上可见,接种蛋白核小球藻和种植水蕹菜均能不同程度地促进南美白对虾生长及免疫活性,且以联合处理的综合效果最佳。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
徐家洪 曾晴 叶富余 胡杨阳 时寰宇 张璇 陈金辉
【目的】琼岛杨是我国热带地区发现的一种杨树,至今其分类和进化鲜有报道。本研究旨在通过三代全长转录组测序等方法了解琼岛杨在杨属中的分类与进化。【方法】基于Pacbio Sequel测序技术获取的热胁迫下琼岛杨、加杨和小叶杨完整全长转录本数据,通过直系同源基因计算非同义替换值(Ka)、同义替换值(Ks)及Ka/Ks值,比较直系同源基因在热胁迫下的表达模式,并结合毛果杨和簸箕柳的直系同源基因,构建了5个树种的进化树来分析杨树亲缘关系。通过克隆琼岛杨核基因(nrDNA:UDP-SQ和POPTRDRAFT_575699)和叶绿体基因(cpDNA:atpⅠ和trnF),分析基因序列在琼岛杨种群中的多态性,计算琼岛杨种内遗传距离,及与19个树种(5个杨树组和1个类外群组)的种间遗传距离。基于最大似然法和最小进化法构建了琼岛杨与19个树种的进化树,以分析琼岛杨在杨属的亲缘关系。【结果】三代转录组测序共获得660组琼岛杨、小叶杨和加杨的直系同源基因,Ks平均值为0.150 5,峰值为0.02,Ka/Ks <1,占比97.27%,这显示了3种杨树较近的亲缘关系。直系同源基因表达模式分析发现,3种杨树在热胁迫下具有相同的表达模式。利用遗传距离法计算琼岛杨与19个树种中atpⅠ、trnF、UDP-SQ和POPTRDRAFT_575699等4种基因遗传距离的平均值,发现琼岛杨与白杨组具有最近亲缘关系,平均值为0.011。【结论】基于三代全长转录组测序获得的直系同源基因分析显示出,琼岛杨与其他杨树具有较近亲缘关系。克隆cpDNA和nrDNA基因,计算遗传距离和构建的进化树均表明琼岛杨与白杨组具有最近亲缘关系。cpDNA的多态性以及进化分支置信度明显高于nrDNA,表明在琼岛杨中cpDNA比nrDNA基因更具备物种鉴别能力。
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
谢群 王明学 闫洪海
研究了液体和固体复合氨基酸对蛋白核小球藻(Chlorella pyrenoides)生长和生理活性的影响。结果表明,两种复合氨基酸对小球藻生长、叶绿素a含量和光合放氧量均有显著促进作用,液体复合氨基酸和固体复合氨基酸对小球藻促生长的最佳浓度分别为40 mg/L和11.12 mg/L。当液体复合氨基酸浓度为40 mg/L,相对生长率(RGR)较对照组增加了81.58%,平均倍增时间(G)缩短了45.08%,叶绿素a含量和光合放氧量比对照组分别增加了(72.25±1.69)%和(38.05±2.58)%;当固体复合氨基酸浓度为11.12 mg/L,相对生长率较对照组增加了17.31%,平均倍增时间...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
沈颂东 徐建荣 郁金芳
将淡水小球藻在含有不同浓度稀土元素铕的培养基中培养 ,每天用分光光度计检测培养液在662nm和 632nm的吸光度值 ,计算小球藻叶绿素的含量变化。研究结果表明 ,小球藻叶绿素在可见光范围内有 2个吸收峰 ,分别在波长 661 8纳米和 431 6纳米 ;稀土元素Eu在低浓度 (0 5mg/L)时 ,对淡水小球藻的增殖有短期的促进作用 ,浓度大于或等于 1 0mg/L时 ,迅速抑制藻体生长
[期刊] 水产学报
[作者]
沈雷 高建操 聂志娟 郑兆伟 胡佳雯 邵乃麟 孙毅 徐钢春
为评估水产养殖中小球藻在调控水体氨氮(NH_4~+-N)和亚硝酸盐氮(NO_2~--N)的应用前景，实验以普通小球藻为对象，饲料废水为培养液，首先检测了曝气、光照、光照+曝气条件下普通小球藻细胞密度及水体中NH_4~+-N和NO_2~--N的时间变化规律，其次分析了时间(X_1)、光照强度(X_2)或初始藻密度(X_3)对2种氮盐去除率(Y)的影响，最后评估了普通小球藻去除水体中NH_4~+-N、NO_2~--N和NO3--N的效果，并解析了普通小球藻同化水体NO_2~--N的潜在途径。结果显示，普通小球藻在适宜的光照条件下具有极佳的氮盐去除能力，其在18 000 lx时对NH_4~+-N去除率高达96.23%，在9 000 lx时对NO_2~--N去除率高达99.19%；初始藻密度在2.5×10~5个/mL时对NH_4~+-N、NO_2~--N去除率最高，分别为94.92%和99.05%。氮盐去除率与处理时间和光照强度的回归方程：YNH_4~+-N=1.189X_1+5.79×10~(-4)X~2+24.158(R~2=0.664),YNO_2~--N=1.562X_1+1.909×10~(-3)X~2-26.078(R~2=0.762)；氮盐去除率与处理时间和初始藻密度的回归方程为：YNH_4~+-N=0.888X_1+1.02×10~(-5)X_3+32.555(R~2=0.408),YNO_2~--N=1.746X_1+1.64×10~(-5)X_3-17.250(R~2=0.613)。普通小球藻去除氮盐顺序为NH_4~+-N>NO3--N>NO_2~--N;NH_4~+-N同化阶段普通小球藻亚硝酸盐还原酶活性显著低于NO_2~--N同化阶段。研究表明，普通小球藻能显著降低水体NH_4~+-N与NO_2~--N含量，NO_2~--N可能是由藻细胞内亚硝酸盐还原酶还原成NH_4~+-N而被普通小球藻同化吸收。该研究结果可为养殖水体原位生物修复提供科学依据。
[期刊] 水产学报
[作者]
沈雷 高建操 聂志娟 郑兆伟 胡佳雯 邵乃麟 孙毅 徐钢春
在水产养殖中，氨氮（NH_(4)~(+)-N）和亚硝酸盐氮（NO_(2)~(-)-N）都是影响水产动物生长发育的关键因子。为评估小球藻在调控水体NH_(4)~(+)-N和NO_(2)~(-)-N的应用前景，实验以普通小球藻为对象，饲料废水为培养液，首先检测了曝气、光照、光照+曝气条件下小球藻细胞密度及水体中NH_(4)~(+)-N和NO_(2)~(-)-N的时间变化规律，其次分析了时间（X_(1)）、光照强度（X_(2)）或初始藻密度（X_(3)）对两种氮盐去除率（Y）的影响，最后评估了小球藻去除水体中NH_(4)~(+)-N、NO_(2)~(-)-N和NO_(3)~(-)-N的效果，并解析了小球藻同化水体NO_(2)~(-)-N的潜在途径。结果显示，小球藻在适宜的光照条件下具有极佳的氮盐去除能力，其在18 000 lx时对NH_(4)~(+)-N去除率高达96.23%，在9 000 lx时对NO_(2)~(-)-N去除率高达99.19%；初始藻密度在2.5×10~(5 )个/mL时对NH_(4)~(+)-N、NO_(2)~(-)-N去除率最高，依次为94.92%和99.05%。氮盐去除率与处理时间和光照强度的回归方程：YNH_(4)~(＋)-N=1.189X_(1)+5.79×10~(-4)X_(2)+24.158（R~(2)=0.664），YNO_(2)~(-)-N=1.562X_(1)+1.909×10~(-3)X_(2)-26.078（R~(2)=0.762）；氮盐去除率与处理时间和初始藻密度的回归方程为：YNH_(4)~(＋)-N=0.888X_(1)+1.02×10~(-5)X_(3)+32.555（R~(2)=0.408），YNO_(2)~(-)-N =1.746X_(1)+1.64×10~(-5)X_(3)-17.250（R~(2)=0.613）。小球藻去除氮盐顺序为NH_(4)~(+)-N＞NO_(3)~(-)-N＞NO_(2)~(-)-N；NH_(4)~(+)-N同化阶段小球藻亚硝酸盐还原酶活性显著低于NO_(2)~(-)-N同化阶段。研究表明，普通小球藻能显著降低水体NH_(4)~(+)-N与NO_(2)~(-)-N含量，NO_(2)~(-)-N可能是由藻细胞内亚硝酸盐还原酶还原成NH_(4)~(+)-N而被小球藻同化吸收。该研究结果可为养殖水体原位生物修复提供科学依据。
[期刊] 水产学报
[作者]
李渊 孙典荣 李文涛 张沛东 江鑫 郭栋 高天翔
运用PCR直接测序法,对采自爱尔兰、日本、韩国和中国的大叶藻、矮大叶藻、丛生大叶藻和红须根虾形藻及GenBank中的宽叶大叶藻5种大叶藻叶绿体的matK、rbcL和核糖体ITS的部分序列进行测定,并比较分析了5种大叶藻3个目的片段的核苷酸序列,结果发现胞嘧啶(C)在3个目的片段上的含量均较低。ITS片段检测到172处核苷酸替换,表现出丰富的遗传多态性。matK基因片段上有52处核苷酸替换,rbcL基因片段上有20处核苷酸替换,且大部分替换来自于第三密码子的同义替换,种间在氨基酸水平上产生了一定的分化。基于ITS、matK和rbcL 3个目的片段,利用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法构建...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
刘冬雨 陶贤继 魏华
通过RACE-PCR首次克隆获得了普通小球藻(Chlorella vulgaris)中八氢番茄红素合成酶编码基因psy的cDNA全长序列。该序列全长1 605 bp,包括1 245 bp开放阅读框,编码415个氨基酸。氨基酸序列对比及系统发生分析表明其与其他物种的PSY蛋白具有同源性,与绿藻聚为一支,与小球藻(Chlorella variabilis)、原壳小球藻(Auxenochlorella protothecoides)和佐夫色绿藻(Chromochloris zofingiensis)的遗传距离最
[期刊] 林业科学
[作者]
温月仙 甘红豪 史胜青 江泽平 吴利禄 褚建民
【目的】甘蒙柽柳为我国黄河流域特有种,本研究旨在探讨该物种各居群间的谱系地理结构以及黄河形成对甘蒙柽柳居群分布、遗传结构的影响。【方法】利用叶绿体基因trn Q-rps16片段和核基因片段ITS序列信息,通过PCR扩增、测序,对分布于我国黄河流域的甘蒙柽柳17个居群共266个个体的序列进行分析,研究其遗传多样性、遗传结构及种群历史动态。【结果】在甘蒙柽柳居群中,共检测得到4个叶绿体单倍型(207个个体)和32个核基因单倍型(232个个体)。该物种的叶绿体基因遗传多样性较低(HT=0. 13),但其核基因的遗传多样性较高(HT=0. 82)。甘蒙柽柳居群的遗传变异主要发生在居群内,叶绿体基因(cp DNA)和核基因(nDNA)的遗传分化系数NST(cpDNA:0. 15; nDNA:0. 22)和GST(cpDNA:0. 19; nDNA:0. 24)均不显著(P>0. 05),且NST小于GST,表明该物种无明显的谱系地理结构。中性检验结果 Tajima’s D和Fu’s Fs均为负值,且失配分析表明期望扩张群体的分布曲线与实际观测到的分布曲线基本吻合,期望分布曲线呈单峰,表明甘蒙柽柳居群经历过快速扩张,这可能与黄河的贯通形成有关。单倍型分布及网络结构分析结果表明,叶绿体单倍型H1、核基因单倍型R1频率最高,位于网络结构图中心位置,且分布最为广泛,可能为古老单倍型。叶绿体基因的结果显示,甘肃省永靖县、积石山县的甘蒙柽柳单倍型种类、多态性及核苷酸多样性显著高于其他地区,且具有特有单倍型(H2、H4),推测其在永靖县、积石山县附近最为古老,以此为起源中心,分别向上游(青海省)和中下游迁移,奠基者效应造成新建居群的遗传多样较低。【结论】本研究揭示了我国黄河流域主要甘蒙柽柳居群的遗传结构及其历史迁移动态。甘蒙柽柳的叶绿体基因遗传多样性水平较低,核基因的遗传多样性较高,遗传变异主要发生在居群内,无明显的谱系地理结构。该物种经历过快速扩张,其起源中心可能为甘肃省积石山县、永靖县附近,随着黄河的形成分别向黄河上游和中下游迁移,推测黄河的形成贯通是导致甘蒙柽柳居群迁移扩散的重要因素。
[期刊] 华北农学报
[作者]
王惠哲 邓强 曹明明 杨瑞环 李淑菊
为了分析不同地区黄瓜棒孢叶斑病菌的种内分化,能够准确地鉴定该病菌,以服务于黄瓜抗病育种,对2007-2014年采集的黄瓜棒孢叶斑病菌多主棒孢经单孢纯化获得34个菌株。利用公开发表的特异性引物CCF/CCR对其进行了PCR分子鉴定,结果表明:34个菌株均扩增得到了预期272 bp的特异片段,说明均为多主棒孢菌。应用真菌核糖体rDNA区通用引物ITS1和ITS4分别扩增各个菌株的r DNA内转录间隔区序列,经测序并比对分析,34个菌株均扩增得到了559 bp的特异片段,其中32个从黄瓜上分离的多主棒孢病菌菌株碱基序列完全一致,2个从番茄上分离的菌株碱基序列完全一致,二者的差异在于2个SNP位点T-...
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