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[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
钱荷英 徐安英 张月华 孙平江 赵云坡
利用微卫星(SSR)标记,在DNA分子水平上对不同地理系统和化性的家蚕品种之间的遗传差异进行了研究。结果表明:在11对引物中均出现稳定的扩增带,扩增带总数为106条,最多的有16条,最少有4条,平均每个引物9.6条。利用单匹配相似系数和UPGMA聚类法对结果进行分析,发现其SSR不但具有品种特异性,而且具有系统特异性,证明不同化性及地理系统的家蚕在进化上属有显著差异的类群。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
杨瑞生 王振营 何康来 白树雄 姜义仁
以mtDNA-COⅠ基因作为分子标记,研究了中国分布秆野螟属(Ostrinia)8种螟虫的分子系统学和系统进化。结果表明:秆野螟属昆虫COⅠ基因全长1 545 bp,编码514个氨基酸,COⅠ基因全部核苷酸位点中多态性位点占6.08%,氨基酸突变率为3.11%。碱基转换数(Ts)明显高于颠换数(Tv)。总体上,秆野螟属COⅠ基因序列相似度较高,种内差异明显小于种间差异,种内不同地理种群遗传距离在0.000 6～0.005 2之间,种间遗传距离为0.007 1～0.050 5。分别采用UPGMA法、NJ法和MP法构建秆野螟属分子系统树,结果显示,物种间进化关系基本一致:8种螟虫明显分为2个大群,...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杜周和 刘俊凤 刘彬斌 吴建梅 陈义安 张剑飞 鲁成
用生物信息学方法分析了家蚕α-淀粉酶基因的系统发育关系,发现Bmamy2是一个起源较早、变异丰富的基因。以之为标记基因,采用DNA序列分析法,对60个家蚕地方品种进行了遗传多样性检测,结果表明,Bmamy2基因组序列中碱基突变频率5.6%,单倍型多样度Hd=0.8294,核苷酸多样度π=0.02362±0.00122。Bmamy2是家蚕品种资源多样性分析中一个较好的标记基因。
关键词：
家蚕 淀粉酶基因 系统发育 遗传多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
周连第 兰彦平 韩振海
板栗为中国栗属的代表种,广泛分布于中国的寒温带、温带和暖温带,其分布区地形复杂,由于条件各异,形成了极其丰富的板栗品种。采用AFLP技术对收集到的86个板栗品种进行了分子水平的遗传多样性研究,结果表明,供试板栗群体间的遗传多样性(Dst)为0.072 8,群体内遗传多样性(Hs)为0.080 4,群体分化系数Gst为0.475 3,基因流Nm为0.452 9,供试板栗群体内分化比较严重。通过对AFLP分析的各个步骤进行反复试验,证明了以AFLP-荧光法来分析板栗品种资源分子水平遗传多样性是可行的方法。
关键词：
板栗 AFLP 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
孙明媛 朱锐 孙晓晴 张研 李尚琪 王红伟 李炯棠
本研究以库页岛马珂蛤(Pseudocardium sachalinense)为研究对象,讨论COI和16S rRNA两种DNA条形码在贝类的遗传多样性、分子进化和种类鉴定的适用性,并利用两种条形码评估库页岛马珂蛤的遗传多样性。本文在获得库页岛马珂蛤线粒体全基因组的基础上,测序获得库页岛马珂蛤群体的COI和16S rRNA序列,发现COI基因核苷酸多样性为0.00195,高于16S rRNA核苷酸多样性(0.00073)。基于COI基因的单倍型多样性为0.76,大于16S rRNA的单倍型多样性(0.318)。其次,用全线粒体基因组构建8种贝类的系统进化树为参考,发现基于COI和16S rRNA的系统进化树与参考一致,提示这两种条形码片段可用于推断贝类的分子进化关系。最后,分别对马珂蛤科和帘蛤科15属17种贝类的COI基因和16Sr DNA进行序列比较,发现COI基因和16S rRNA的种间遗传距离均是种内距离的62倍。以上结果说明,16S rRNA与COI基因一样,能有效地构建马珂蛤科和帘蛤科的系统发育关系和物种鉴定,但在分析库页岛马珂蛤的遗传多样性时利用COI基因比16S rRNA能发现更多的遗传变异。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张涛 郑家奎 徐建第 蒋开锋 吴先军 汪旭东
【目的】研究香稻品种的遗传多样性。【方法】利用分布于12条水稻染色体上的60个SSR引物和22个水稻功能基因标记检测了32个香稻品种的遗传多样性。【结果】60对SSR引物共检测出188个等位基因,其中有效等位基因数126个。每对引物等位基因数在2～6之间,平均为3.13个。多态性信息含量(PIC)变幅为0.116～0.744,平均为0.467±0.175。32个品种间的遗传相似系数在0.51～0.96之间,平均为0.697。聚类分析将32个香稻品种在遗传相似系数0.58处分为籼、粳两类,分类结果与品种系谱分析比较吻合。【结论】SSR分子标记在香稻品种遗传多样性分析和育种应用方面具有重要价值。功...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
连帅 陆平 乔治军 张琦 张茜 刘敏轩 王瑞云
【目的】从分子水平研究国内外黍稷种质资源的遗传多样性差异，为黍稷种质资源的研究、保护和利用提供依据。【方法】用不同地理来源且性状差异显著的６份黍稷种质资源对来自高通量测序技术开发的黍稷基因组ＳＳＲ引物进行筛选，从而获得条带清晰，稳定性好的６３对ＳＳＲ黍稷基因组引物，利用这６３对ＳＳＲ多态性引物对来自国内外的１９２份黍稷地方品种和野生种质进行遗传多样性分析。统计各试材在同一引物中的条带情况，并以此来分析试材的遗传多样性与所在群体间的亲缘关系。【结果】６３对ＳＳＲ引物共检测出１６１个等位变异位点，平均每个ＳＳＲ位点２．５６个；平均Ｓｈａｎｎｏｎ－ＷｅａｖｅＲ指数（Ｉ）为０．６２７５，平均基因多样度．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
郭宝生 张建宏 刘素恩 刘存敬 崔瑞敏 王兆晓 张香云 耿军义 王凯辉
利用9对引物对46个品种或品系的DNA进行扩增,共得到39条多态性谱带,以相似系数和遗传距离矩阵,采用类平均法进行聚类分析,46份材料在相似系数0.33时,被分为两大类,I类为海岛棉,II类为陆地棉。II类组中陆地棉在相似系数0.568时,被分为2个亚组。亚组1为海陆杂交低代材料,具有陆地棉和海岛棉综合特征较多,从DNA扩增的谱带看,多是海陆杂合带,并有较多海岛棉带型。亚组2除品系冀031823和冀04425为纯陆地棉外,具有海岛棉优质基因的陆地棉渐渗系被分成不同的小组。扩增结果表明渐渗系主要遗传背景为陆地棉,个别性状来源于海岛棉。由于渐渗位点和基因不同,从而造成一定的差异,被聚类到不同小组。...
关键词：
棉花 分子标记 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王国泽 左福元 曾兵 王冉
本文利用SRAP分子标记对国内8个鸭茅品种及野生材料进行快速鉴定和遗传多样性分析,结果表明,20对引物扩增出93个条带,多态性条带为72条,多态性条带比率为76.99%,每对引物组合的多态性带数平均为3.6条。GS值范围在0.7633~0.9232间,平均GS值为0.8547;聚类分析表明鸭茅的遗传多样性与地理分布密切相关,同时揭示出国产鸭茅品种遗传基础较为狭窄。此结果为国内鸭茅资源保护利用及新品种选育提供科学依据。
关键词：
鸭茅 分子标记 SRAP 遗传多样性
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
刘跃钧 张媛 蒋燕锋 刘京晶
为揭示中药材黄精种质资源的遗传多样性及种源间亲缘关系，建立了目标起始密码子多态性分子标记（ＳＣｏＴ）方法 ，采用非加权平均距离法（ＵＰＧＭＡ）和主坐标分析（ＰＣｏ Ａ）等方法对１９份不同种源的黄精ＰｏｌｙＧｏｎＡＴＵＭ材料进行分析。从待选的２９个引物中筛选出１５个ＳＣｏＴ引物用于扩增基因组ＤｎＡ，总共得到５００个条带，平均每个引物产生３３．３个条带，其中多态性条带４９８个，多态性比率为９９．６％，１９个黄精种质间的遗传相似系数范围为０．５５４ ０～０．７３４ ０。结果表明：不同种源的黄精种质有较丰富的遗传多样性，ＳＣｏＴ分子标记可以为黄精的分类及鉴别提供一定的依据，为中药黄精优良品种的培育及资．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
匡梅 王素娟 曾呈奎
红藻分子系统学研究进展匡梅，王素娟，曾呈奎（上海水产大学，２０００９０）（中国科学院海洋研究所，青岛２６６０７１）关键词红藻，分子系统学ＡＤＶＡＮＣＥＳＩＮＴＨＥＳＴＵＤＹＯＦＭＯＬＥＣＵＬＡＲＳＹＳＴＥＭＡＴＩＣＳＩＮＲＨＯＤＯＰＨＹＴＡ￥Ｋｕａｎ...
关键词：
红藻,分子系统学
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
谢荟 祝文娟 张应中 蒋开彬 刘天颐 莫其辉 黄少伟
利用SRAP分子标记建立广东省4个种群153个单株的广宁红花油茶种质资源遗传多样性评价体系,从594对引物组合中最终选出13对引物,结果表明:13对引物组合共扩增出206条带,平均每对引物组合获得15.85条,多态性条带为187条,多态性条带比率(PPB)为90.78%。种群Nei's基因多样度(h)、Shannon多样性指数(I)、多态性位点百分比(PPL)变化范围分别为0.217 90.356 3,0.321 70.524 8及58.25%92.72%,平均值分别为0.307 8,0.456 3及83
[期刊] 林业科学
[作者]
廖柏勇 王芳 陈丽君 刘明骞 欧阳昆唏 阙青敏 惠文凯 李培 陈晓阳
【目的】利用相关序列扩增多态性（ＳＲＡＰ）分子标记对来自１７个省（区）的３１个苦楝种源进行遗传多样性分析，为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过ＳＲＡＰ分子标记获得１／０数据矩阵，计算ＳＲＡＰ分子标记各项遗传参数，同时进行分子方差分析（ＡＭＯＶＡ）。随后计算遗传距离矩阵并进行主坐标分析（ＰＣＯ Ａ）、邻接法聚类分析（ＮｅｉｇｈｂＯｕＲ－ＪＯｉＮｉＮｇ）以及遗传距离和地理距离ＭＡＮｔｅｌ相关性分析。【结果】从７８３对ＳＲＡＰ引物中筛选出的２０对引物可扩增出２５７条清晰的条带，其中１４５条具有多态性。引物多态性信息指数（ＰｉＣ）为０．２６２～０．４７８，均值为０．３８５。ＰｉＣ．．．
关键词：
苦楝 SRAP 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 中国农业科学
[作者]
高瑞 李春林 童晓玲 曹明亚 石美宁 徐安英 鲁成 代方银
【目的】家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,BmNPV)所引发的血液型脓病是一种传染性强的蚕病,极大地影响蚕业生产。本研究旨在定位对BmNPV高抗的家蚕品系中控制其抗性的基因,进而解析其抗性遗传机制,为培育抗性素材和品系提供理论支持。【方法】以BmNPV高抗家蚕品系99R和较感品系Dazao-N为亲本,配制连锁分析(BC_1F)和定位分析(BC_1M)回交群体。首先对两个亲本品系进行浓度梯度添毒,统计感病死亡的家蚕头数,运用SPSS 17.0软件,计算其半
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李莹莹 郑成淑
【目的】在品种群水平和花色群体水平上分析菏泽牡丹资源的遗传多样性和遗传分化,为该资源的保护和利用提供理论依据与技术支持。【方法】利用CDDP分子标记技术,对白、粉、黑、红、黄、蓝、绿、紫红、紫和复色系等10个花色群体构成的299份菏泽牡丹品种资源的基因组DNA进行扩增分析。【结果】用18条CDDP引物对10个花色群体共299份样品进行扩增,共检测到385条扩增带,其中多态性条带368条,特异条带23条,分别占总条带的95.58%和5.97%。在品种群水平上,Nei’s基因多样性指数、有效等位基因数和Shannon信息指数分别为0.1648、1.2569和0.2695;在花色群体水平上,上述指标...
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