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[期刊] 西南农业学报
[作者]
贾伟 张龚炜 陈仕毅 贾先波 赖松家
本文旨在研究家兔BMPR1B基因的多态性及其与生长速度的相关性。采用PCR产物测序方法检测BMPR1B基因编码区的多态性,利用PCR-RFLP技术对候选SNPs位点(c.117G>A)进行基因分型,研究其与家兔生长速度的关联性(N=262)。结果表明,在BMPR1B基因编码区共存在14个SNPs位点,它们分别是c.9C>T、c.54C>T、c.75T>A、c.88C>T、c.96T>C、c.117G>A、c.384A>G、c.392C>T、c.540C>T、c.603T>C、c.1254T>A、c.1332A>G、c.1356A>G及c.1436A>G,除c.392C>T突变致使该基因编码的第...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
吴周林 曾予 贾先波 陈仕毅 王杰 赖松家
【目的】研究家兔ＸＫＲ４基因的遗传多态性，并分析其与家兔生长速度的相关性。【方法】以新西兰兔（１８４只）和伊拉兔（１９３只）为研究材料，取其耳部组织，提取ＤＮＡ，ＰＣＲ扩增ＸＫＲ４基因，采用直接测序法寻找ＣＤＳ区单核苷酸多态性（ＳＮＰ）位点，利用ＨＲＭ技术对突变位点进行分型，并分析其与生长性状的相关性。【结果】在家兔ＸＫＲ４基因内检测到３个ＳＮＰ位点（内含子１中的Ｃ．８０４－８Ｃ＞Ｔ及外显子３中的Ｃ．１６６８Ｃ＞Ｔ和Ｃ．１６９８Ｃ＞Ｔ）。针对外显子３中的２个ＳＮＰ位点，对４０个样本直接测序，结果发现仅存在ＣＣ和ＣＴ ２种基因型，且处于完全连锁状态。对２种兔突变位点的群体遗传参数分析发现其总杂合．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李彦宏 胡深强 王杰 贾先波 赖松家
【目的】探究家兔血管生成素样蛋白4(angiopoietin-like protein 4,ANGPTL4)基因第6外显子内的多态性及其与家兔部分生长性状的关联性。【方法】采用PCR产物测序法检测家兔ANGPTL4基因外显子内的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并应用PCRRFLP酶切分型技术对3个家兔品种(天府黑兔、伊拉兔和新西兰兔)共495个群体样本进行酶切分型,分析SNPs与3个家兔品种部分生长性状的关联性。【结果】ANGPTL4基因第6外显子中共检测发现3个遗传变异位点(c.823 G>A为非同义突
[期刊] 西南农业学报
[作者]
张娟丽 张文秀 彭瑾 张龚炜 杨宇 王杰 赖松家
基于病例对照研究的试验设计,本试验对β-防御素135基因(β-defensin 135,DEFB135)非编码区和编码区进行单核酸多态性(SNPs)检测,在5’非编码区(5’-UTR)检测到2个SNPs(c.-47 T>A,c.-40 C>A),3’-UTR区检测到1个SNP(c.*42 C>G),它们处于完全连锁状态。选取c.-40 C>A位点进行基因分型,研究DEFB135基因多态性与家兔非特异性消化道疾病易感性间的相关性。结果发现健康组和肠炎组中等位基因A的频率分别为30%和33%,差异不显著(P>0.05);OR(odds ratio)值为1.11(95%的置信区间:0.849~1.4...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
宋娜娜 柴志欣 胡丹 向超 钟金城
本研究利用DNA池和测序技术,结合PCR-RFLP方法,筛查了POU1F1基因第2外显子和第5内含子的SNP位点,分析了西藏申扎(SZ)、类乌奇(LWQ)、斯布(SB)和帕里(PL)4个牦牛类群(品种)共182个个体的POU1F1基因的多态性及其与体重、体高、体长等生长性状指标之间的相关性。结果表明:①POU1F1基因第2外显子高度保守,未发现任何突变,第5内含子中发现2个突变位点,分别为T727C(BglⅡ酶切)位点和T284C(StuⅠ酶切)位点。②申扎(SZ)、类鸟奇(LWQ)、斯布(SB)和帕里(
[期刊] 华北农学报
[作者]
肖正龙 张龚炜 杨宇 王杰 赖松家
为了研究家兔ATG16L1基因对非特异性消化道紊乱的易感性,试验采用PCR-HRM技术,首次对家兔ATG16L1基因进行单核苷酸多态性(SNP)检测,同时结合低纤维群体结肠ATG16L1基因mRNA表达量进行关联分析。结果表明:ATG16L1基因存在1个SNP位点(c.1482 G>A)与NSDD的易感性相关联;c.1482 G>A位点A等位基因能增加NSDD的易感性(OR=1.43,95%置信区间:1.08～1.91,P<0.05);ATG16L1基因在结肠中的mRNA表达...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王真 王敏 李铭 闫海龙 朱海鲸 陈宏 屈雷 蓝贤勇
【目的】探究生长激素受体（GHR）和生长分化因子9（GDF9）基因多态性与内蒙古白绒山羊生产性状的相关性。【方法】采集452只阿拉善品系内蒙古白绒山羊雌性个体（其中包括382只18月龄左右的育成羊和70只36月龄左右的成年羊）的耳组织并测定其体质量和体尺数据。提取试验羊耳组织的DNA，通过InDel分型和琼脂糖凝胶电泳技术鉴定出452只内蒙古白绒山羊GHR和GDF9基因的多态性，利用SPSS 23.0分析软件探讨其与生产性状的相关性。【结果】在内蒙古白绒山羊GHR基因第1内含子中检测到9-bp插入缺失标记（InDel）位点（NC_022312:g.42801_42809delCTGTGGCAT），该位点属于低度多态（PIC＜0.25）且处于哈代温伯格平衡状态（P＞0.05）；在GDF9基因3′调控区检测到12-bp InDel位点（NC_022299.1:g.66028950insTACTTTCAACAA），该位点属于中度多态（0.25＜PIC＜0.50）且处于哈代温伯格非平衡状态（P＜0.05），2个InDel位点均存在纯合插入型、杂合型和纯合缺失型3种基因型。在育成羊中，GHR基因第1内含子中9-bp InDel位点纯合插入基因型个体体质量、体长、胸围和胸宽均值显著大于杂合基因型个体（P＜0.05）；在成年羊中该位点两种基因型间各生长指标差异不显著（P＞0.05）。在育成羊中，GDF9基因3′调控区12-bp InDel位点杂合基因型和纯合缺失基因型个体体质量、体高和胸围均值极显著大于纯合插入基因型（P＜0.01）；在成年羊中，GDF9基因该InDel位点纯合插入基因型个体体质量、胸围和管围均值显著大于纯合缺失基因型（P＜0.05）。【结论】GDF9基因3′调控区12-bp InDel位点和GHR基因第1内含子中9-bp InDel位点多态性与内蒙古白绒山羊体质量和部分生长性状具有显著或极显著的相关性。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
吴绿草 董世雄 段梦琪 刘思源 陈莹 张健 严飞飞 强巴央宗 商鹏
为探究猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性,在DNA水平上对藏猪、大白猪ARID5B(AT-rich interaction domain 5B)基因5′侧翼区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选;在mRNA水平上对两猪种的肝脏、背脂和背最长肌组织中的ARID5B基因表达量进行了RT-qPCR检测;并对两猪种的背膘厚和背最长肌组织中IMF(Intramuscular fat)含量进行测定。结果表明:在ARID5B基因5’侧翼区,存在T-2 216C和In-2 029Del缺失2个连锁突变位点,藏猪与大白猪呈极显著差异(P<0.01);在相同组织不同品种间,ARID5B基因在肝脏、背脂和背最长肌中mRNA相对表达量趋势完全一致,且藏猪ARID5B基因表达量均极显著低于大白猪(P<0.01);藏猪背膘厚和IMF含量均极显著高于大白猪(P<0.01);经DNA、mRNA水平、背膘厚和IMF含量相关性分析发现,ARID5B基因mRNA相对表达量与背膘厚和IMF含量呈显著负相关(P<0.05)。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
林长光 刘亚轩 吴悌霖 林金玉 郭长明 朱志明
采集395头核心群的种猪耳样,采用PCR-SNaPshot方法检测长白猪和大白猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因内含子3的位点多态性,并分析各基因型与生长性状的相关性.结果表明,长白和大白猪中均存在3种基因型,大白猪3种基因型分布为:AA>GA>GG,长白猪3种基因型分布为:GA>AA>GG.大白和长白猪的A等位基因频率分别为0.710、0.541,G等位基因频率分别为0.290、0.459.AA基因型个体比GA和GG基因型个体生长速度快,等位基因A对猪的生长具有正效应,同时背膘厚变薄.3种基因型个体在达100 kg活体背膘厚及其估计育种值(EBV)的大小为:GG>GA>AA.因此,在种猪选...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张陈华 王阳 丁月云 殷宗俊
【目的】探究圩猪心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因的多态性,及其与IMF含量的相关性【方法】采用PCR-RFLP(HinfⅠ、HaeⅢ及MspⅠ3种限制性内切酶)分子标记技术,分析了123头圩猪H-FABP基因5′-上游区和第二内含子区的遗传变异情况。【结果】(1)在5′-上游区:HinfⅠ位点上存在多态性,等位基因H的基因频率为0.6545,表现为中度多态(PIC=0.3500);第二内含子区:HinfⅠ*位点上存在多态性,等位基因B的基因频率为0.7195,表现为中度多态(PIC=0.3222);HaeⅢ位点上也存在多态性,等位基因D的基因频率为0.6301,表现为中度多态(PIC=0...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
康晓龙 张莉莉 王昊升 毛浩 杨润 冯登侦
【目的】本文探讨了FTO基因多态性与不同绵羊群体生长性状的相关性。【方法】采用飞行质谱技术检测了FTO基因在杜泊羊和滩寒杂交群体中的多态性及其与生长性状的相关性。【结果】FTO基因的rs160915957位点的AA基因型个体体重在杜泊和滩寒绵羊群体中分别为极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)低于GG型个体。GG型绵羊胸围最大,且GG型杜泊羊胸围显著大于滩寒羊GG型个体(P0.05);不同基因型间,滩寒群体绵羊体高大于杜泊羊,但只有AA型个体在2个群体间显著差异(P0.05)。FTO基因的rs160
[期刊] 中国水产科学
[作者]
唐永凯 李建林 俞菊华 陈雪峰 李红霞
通过PCR和基因组步移法,从吉富罗非鱼DNA中扩增出肌细胞生长抑制素(MSTN)基因及其5′调控区。该序列全长2413bp,含有3个外显子,2个内含子。5′调控区462bp,外显子Ⅰ379bp,外显子Ⅱ371bp,部分外显子Ⅲ145bp,内含子Ⅰ305bp,内含子Ⅱ751bp,编码区共编码298个氨基酸。5′调控区含有与肌肉特异性基因转录密切相关的转录调控元件E-box以及其他一些转录调控元件,如TATAbox,OCT1,AP1,AP4。通过随机测序法寻找SNPs(Signal nucleotide poly morphisms),获得了3个SNPs,但在群体筛选中,只有内含子Ⅱ内的1个SNP...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
贾建磊 张利平 丁强 杨志文
【目的】探索绵羊ＢＭＰＲ－ＩＢ基因第７外显子多态性与产羔数的相关性，寻找控制绵羊繁殖力的分子标记位点。【方法】以相同饲养管理条件下同龄已有产羔记录的蒙古羊（单胎母羊和双胎母羊）、无角陶赛特羊（单胎母羊和双胎母羊）、小尾寒羊（多胎母羊）为试验材料，采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ结合ＤＮＡ直接测序的方法，对ＢＭＰＲ－ＩＢ基因第７外显子进行多态性检测与分析。【结果】试验羊只存在ＡＡ型和ＡＢ型２种基因型；ＡＢ型个体在ＢＭＰＲ－ＩＢ基因第８６４位点发生Ｃ→Ｔ突变，出现Ｔ／Ｃ的杂合，所有试验样本的优势基因型均为ＡＡ型，优势等位基因均为Ａ基因。χ２适合性检验表明，无角陶赛特羊、蒙古羊和小尾寒羊均处于ＨＡＲＤｙ－ｗｅＩ．．．
[期刊] 中国农业科学
[作者]
吴宏梅 王立贤 程笃学 马小军
【目的】探讨Nramp1基因第6内含子多态在大白猪和松辽黑猪(是由杜洛克、长白猪和民猪合成)中的分布及其与猪免疫抗病的关系。【方法】采用PCR-RFLP法对165头大白猪和109头松辽黑猪Nramp1基因第6内含子多态性与免疫功能(中性粒细胞还原力和单核细胞细胞毒百分率)的相关性进行了研究。【结果】两个品种在该位点均存在多态性,品种间、合并基因型间免疫功能差异不大,但同一品种内不同基因型间差异显著;大白猪BB基因型个体的单核细胞细胞毒百分率显著高于AB基因型个体(P<0.05),BB基因型个体的中性粒细胞NBT还原力值极显著高于AB基因型个体(P<0.01),而在松辽黑猪中则是AB基因型个体的...
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