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[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘梅 朱怡轩 王孝义 陈强 董新星 严达伟 李明丽
【目的】探讨PID1基因多态性对宣和猪肉质性状的影响。【方法】以119头宣和猪为本试验的试验材料，对PID1基因外显子3采取PCR产物直接测序的方法对其进行SNP位点检测，选择最小二乘模型对各突变位点基因型及单倍型组合进行肉质性状方面的差异分析。【结果】在宣和猪PID1基因外显子3区域共检测出4个SNP位点，分别为253643 bp处的T→C(T253643C)、253675 bp处的G→C(G253675C)、253734 bp处的A→G(A253734G)和253827 bp处的G→A(G253827A)。4个SNP位点均检测出3种基因型，分别以等位基因T、G、G、A及基因型TT、GC、AG、AA的频率最高。4个SNP位点共有9种单倍型和24种单倍型组合，其中单倍型CGGA和单倍型组合CGGA/TCAA的频率最高。各位点杂合度在0.4490～0.4997，都属于中度多态且都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P >0.05)，遗传多样性比较丰富。G253675C位点与大理石纹评分存在显著关联，其中GC基因型可显著提高大理石纹评分(P
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
宋付标 昝林森 王洪程 王洪宝 田万强 王虹 钟昕
【目的】对秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行SNPs检测,并研究其与秦川牛肉质性状的相关性。【方法】采用DNA直接测序技术并结合PCR-SSCP方法,对324头2~3岁秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行多态性分析,用最小二乘法拟合线性模型对Chemerin基因不同基因型与秦川牛肉质性状(宰前活质量、胴体质量、背膘厚、大理石花纹评分、系水力、眼肌面积和嫩度)进行关联分析。【结果】秦川牛Chemerin基因第2外显子868 bp处发生了A→G突变,第6外显子2 948 bp处发生了C→G突变;用PCR-SSCP方法检测得到AA、AG、GG、EE和EF 5种基因型,其基因型频...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
邱海芳 汪超 张庆德 刘榜
采用PCR-RFLP方法对通城、大白和长白3个纯种及长大通和大长通2个三元杂种共5个群体MyoD1基因第1内含子的多态性进行了研究,并对多态位点与生长、胴体和肉质性状进行了关联分析。结果发现第1内含子第257位存在1个A/C颠换,引起DdeⅠ酶切位点的改变。PCR产物经DdeⅠ酶切后,检测到2个等位基因,3种基因型,其中通城猪中C等位基因的分布占主要优势,大白、长白猪中2种等位基因的分布频率相近。关联分析结果表明,不同的基因型与肉色评分和失水率相关(P<0.05或P<0.01);CC基因型个体的肉色评分显著高于AA和AC基因型个体;而CC基因型个体的失水率极显著低于AA基因型个体。研究结果进一...
关键词：
猪 MyoD1基因 多态性 肉质性状
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓冠群 昝林森 王洪宝 桂林生
【目的】研究秦川牛SIRT3基因的多态性及其对秦川牛体尺、肉用性状的影响，以探索改善秦川牛体尺、肉用性状的分子育种方法。【方法】随机选择相近饲喂条件下468头18~24月龄健康秦川母牛，采用DNA直接测序技术进行SIRT3基因全区域遗传变异检测。运用SPSS16.0软件中最小二乘法拟合线性模型，对SIRT3基因不同基因型与秦川牛体尺(体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽)和肉质性状(背膘厚、眼肌面积和肌肉脂肪含量)进行关联分析。【结果】经DNA测序发现，秦川牛SIRT3基因在第4内含子上存在2个突变位点，分别为C22522T突变和C22680G突变，均存在3种基因型。χ2检验...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓冠群 昝林森 王洪宝 桂林生
【目的】研究秦川牛ＳＩＲＴ３基因的多态性及其对秦川牛体尺、肉用性状的影响，以探索改善秦川牛体尺、肉用性状的分子育种方法。【方法】随机选择相近饲喂条件下４６８头１８～２４月龄健康秦川母牛，采用ＤＮＡ直接测序技术进行ＳＩＲＴ３基因全区域遗传变异检测。运用ＳＰＳＳ１６．０软件中最小二乘法拟合线性模型，对ＳＩＲＴ３基因不同基因型与秦川牛体尺（体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽）和肉质性状（背膘厚、眼肌面积和肌肉脂肪含量）进行关联分析。【结果】经ＤＮＡ测序发现，秦川牛ＳＩＲＴ３基因在第４内含子上存在２个突变位点，分别为Ｃ２２５２２Ｔ突变和Ｃ２２６８０Ｇ突变，均存在３种基因型。χ２检验．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
田万强 梅楚刚 付常振 辛亚平 张松 王国庆 昝林森
【目的】研究秦川牛、南阳牛、鲁西牛和安格斯牛共６３０头个体的单磷酸腺苷激活的蛋白激酶α２亚基（ＡＭＰＫα２）基因ＰＲＫＡＡ２的多态性，并分析其多态性与２００头秦川牛生长及肉质性状的关联性。【方法】利用ＰＣＲＳＳＣＰ、ＤＮＡ测序、飞行质谱（ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ）等技术，分析检测４个品种牛ＰＲＫＡＡ２基因６个外显子的单核酸多态性（ＳＮＰＳ）；采用生物信息学方法结合统计分析软件，分析秦川牛各多态位点的遗传变异特性与体尺及肉质性状的关联性。【结果】ＰＲＫＡＡ２基因第２、４、６、７、８、９外显子中，只检测到第４外显子２７Ｇ＞Ｃ和６０Ｔ＞Ｃ ２个突变位点；关联分析表明，２７Ｇ＞Ｃ位点与秦川牛背膘厚和眼肌面积．．．
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
刘小献 白俊杰 徐磊 于凌云 樊佳佳 韩林强
根据草鱼EST数据库中的rho型谷胱甘肽硫转移酶基因cDNA序列设计引物,扩增预计存在的SNP位点。采用PCR产物测序法和PCR-RFLP法,在珠江水系草鱼养殖群体中筛选到2个SNP位点,分别位于外显子1和外显子2上,为C-T突变,且属于同义突变,统计了多态位点在群体中的分布:C+129T位点CC型占0.69%,TC型占8.75%,TT型占80.56%;C+192T位点CC型占25.4%,TC型占48.6%,TT型占26.1%。利用一般线性模型将SNPs与草鱼6个生长性状进行关联分析,结果表明,C+129T位点TT型个体6个生长性状均值比TC型高(P>0.05);C+192T位点TT型个体体质...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
金武 闻海波 杜兴伟 马学艳 顾若波 徐跑
利用传统ＰＣＲ和ＡＢＩ ３７３０测序技术对暗纹东方鲀（ＴＡｋＩｆｕｇｕ ｏＢｓＣｕＲｕｓ）ＡｍｈＲ２基因外显子９进行了ｓＮＰ７２７１检测和测序分析，并对该ｓＮＰ位点与暗纹东方鲀性别相关性进行了研究。结果显示，在ｓＮＰ７２７１位点发生了ｇ／Ｃ碱基突变，产生了Ｃｇ、ＣＣ两种基因型。ｓＮＰ７２７１和暗纹东方鲀性别存在显著相关性（Ｐ＜０．０１）。基因型为Ｃｇ的个体生理性别为雄性，基因型ＣＣ的个体生理性别为雌性。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
方荣 梁旭方 杨宇晖 杜嵇华 曹亮 叶卫 符云
本研究旨在探寻胃蛋白酶(pepsinogen,PEP)基因的等位基因及其基因型在不同食性驯化表型鳜(Siniperca chuatsi)群体中的分布情况。通过2周食性驯化,挑选出最易驯化和最不易驯化的2组,提取各组鳜鳍条组织DNA,采用PCR产物直接测序法(direct sequencing,DS)、限制性片段长度多态性技术(restriction fragment length poly-morphism,RFLP)和创造限制酶切位点PCR法(created restriction site PCR,CRS-PCR)对鳜胃蛋白酶基因5、6、7、8内含子和6、7、8外显子进行SNPs遗传多态性...
关键词：
鳜 胃蛋白酶 SNP 食性驯化
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王卓 昝林森
【目的】分析秦川牛心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)第1外显子的遗传变异与部分肉用性能指标的相关性。【方法】随机选择相同饲养条件下的146头18~20月龄秦川牛阉牛,采用PCR-SSCP结合测序技术,对秦川牛H-FABP基因第1外显子的遗传变异进行检测;运用SPSS统计程序中的GLM模型,分析其与部分肉用性能指标的关系。【结果】秦川牛H-FABP基因第1外显子130 bp处具有PCR-SSCP可检测到的SNP位点:Y=T→C。对该SNP位点具有不同基因型的个体进行分型并与88头秦川牛的肉用性状指标进行GLM分析,表明AB型个体的后腿围、背膘厚、大理石花纹等性状极显著高于AA型个体(P<0....
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘丽元 周靖航 张梦华 李金霞 方季青 谭世新 王爱芳 黄锡霞 王雅春
【目的】探索ERAP2,Cwc27,PPFIBP2,THADA,ZNF804B和AMHR2基因多态性与新疆褐牛体细胞评分及泌乳性状的相关性,旨在寻找与新疆褐牛体细胞评分及泌乳性状相关的分子标记。【方法】以新疆乌鲁木齐种牛场、新疆天山畜牧生物工程股份有限公司共169头新疆褐牛母牛为试验对象,以2008—2015年间的生产性能测定记录(包括乳脂率、乳蛋白率、总固体含量、乳糖率和体细胞计数等)和305 d产奶量为试验数据,基于课题组前期15头中国荷斯坦牛DNA混池重测序的结果筛选外显子区域10个SNPs,采用基
[期刊] 淡水渔业
[作者]
于海静 梁旭方 方荣 彭敏燕 朱滔
采用PCR产物直接测序法(DS)对鳜(Siniperca chuatsi)胰蛋白酶基因(TRY)进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,发现外显子3上的G169A多态性。对312个样品进行分析,共发现三种基因型GG、GA、AA,其基因型频率分别为0.26、0.54、0.20,两个等位基因G和A的基因频率分别为0.53和0.47。用创造限制性酶切位点法PCR(CRS-PCR)、单管双向等位基因专一性扩增(SB-ASA)和单链构象多态性分析(PCR-SSCP)对该SNP位点进行验证。结果表明,CRS-PCR法不能对该SNP位点分型,PCR-SSCP和SB-ASA法可以且准确度分别为100%和96.67...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
余文敏 谢红涛 徐永杰 李德臻 熊远著 杨明柳
克隆了大白、长白和梅山猪肌球蛋白轻链调控蛋白2基因(MRLC2)内含子2序列,经比对发现,在内含子2中18个碱基突变和8个碱基缺失,其中179bp处的C/T突变引起Hin6I酶切位点的改变,运用PCR-Hin6I-RFLP对179头大白×梅山F2代猪进行家系关联分析,结果表明该酶切位点与屠宰率呈极显著相关,表现为加性效应,CC基因型个体比CT基因型、TT基因型个体有更高的屠宰率;与大理石纹评分呈显著相关,CC基因型个体评分比CT基因型、TT基因型个体高。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李长春 傅田 强巴央宗 唐晓惠 朱猛进 樊斌 熊统安 李奎 刘榜
利用改良等位基因特异性PCR(Modified Allele Specific PCR,M-ASP)结合PCR-RFLP以及直接测序方法对藏鸡和隐性白羽鸡生长激素(Growth Hormone,GH)基因内含子4(Intron4)的一个位点进行了SNP检测,并进行了该基因与藏鸡生长性状的关联分析。检测结果显示,GH基因Intron4的这个位点同时具有M-ASP和SacI-RFLP多态。测序结果表明,该位点发生了C→G的碱基突变,产生了CC、CG和GG三种基因型。两个等位基因和三种基因型在两鸡种中的分布基本一致。其中,基因型CC和等位基因C的频率最高。χ2检验结果表明,基因型频率或者等位基因频率...
[期刊] 华北农学报
[作者]
张彩霞 赵生国 李天科 雷赵民
旨在分析早胜牛及其杂交牛CALCA基因第4外显子的多态性及其与肉质性状的相关性,发现与肉质性状相关的分子标记,为加快肉牛选育进程提供参考。利用PCR-SSCP技术对早胜牛、南杂牛、秦杂牛和西杂牛共362个个体的CALCA基因第4外显子进行了遗传变异检测,并运用SPSS 17.0软件对早胜牛(平凉类群)遗传变异与经济性状关联性进行了分析。结果表明,CALCA基因第4外显子存在2个突变位点T3237A和G3289A,并检测到AA和AB2种基因型。相关性分析表明,CALCA基因突变位点与剪切力、眼肌面积、热胴体重和熟肉率显著相关(P<0.05),AA基因型个体剪切力、热胴体重和熟肉率显著高于AB基因...
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