[目的]探索水松根际微生物群落结构和功能及随季节变化的规律。[方法]采用PCR-DGGE和Biolog-ECO微平板法测定不同季节水松根际土壤理化性质、微生物群落结构和功能，通过主成分分析和冗余分析等方法解析根际微生态各环境因子的内在规律。[结果]水松根际微生物群落中优势细菌为α-变形菌（Alphaproteobacteria）、酸杆菌（Acidobacteria）和δ-变形菌（Deltaproteobacteria），优势真菌为粪壳菌（Sordariomycetes）。夏季水松根际微生物量和微生物多样性最高。根际微生物的碳代谢能力在夏季最强，冬季最弱，大致表现为夏季>秋季>春季>冬季，速效氮可能是微生物群落碳代谢功能的主要驱动因子。[结论]水松根际微生物群落多样性和碳代谢能力在夏季最优，在冬季最差。季节因素显著影响着根际微生物群落结构和功能，开展相关研究时应充分考虑季节因素造成的波动。

【目的】研究玉米根际与非根际土壤微生物群落结构及多样性季节变化特征。【方法】利用Illumina-MiSeq高通量测序技术对不同季节玉米根际与非根际土壤中细菌的16S rDNA基因V3～V4区片段和真菌18S rDNA基因V4区片段进行了测序。【结果】①不同季节玉米根际与非根际土壤理化性质随季节变化趋势一致,玉米根际、非根际土壤电导率随季节呈先增加后降低趋势,大致表现为夏季>秋季>春季>冬季,不同季节玉米根际土壤电导率均显著高于非根际(P冬季>秋季>夏季,不同季节玉米根际土壤电导率均显著低于非根际(P0.05);土壤pH与土壤细菌和真菌多样性呈负相关,土壤电导率和全磷与土壤细菌和真菌多样性均没有显著的相关性(P>0.05)。【结论】玉米土壤根际和非根际细菌和真菌群落具有很好的相似性,并且根际和非根际细菌群落产生明显的分离效应。

【目的】在枫香根际接种植物促生微生物（PGPM），研究PGPM对土壤理化性质和枫香叶色的影响以及对枫香根际微生物群落组成结构和多样性特征的改变，探明外源PGPM对植物和土壤微生物的影响。【方法】以句容市句容林场长势一致的7年生枫香为对象，通过田间接种试验并利用Illumina MiSeq高通量测序技术研究接种黏质沙雷氏菌（NJ2D）、摩西斗管囊霉（BJ04）对枫香根际土壤理化性质、叶色参数及根际土壤微生物群落结构和多样性特征的影响。【结果】1）处理组的枫香根际土壤全氮、全磷、土壤有机质、有效磷含量、土壤含水率（%）和土壤pH较对照均显著提高（P <0.05）;2）单接种BJ04菌剂的枫香叶片中叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素和类胡萝卜素含量均较对照显著提高（P <0.05），而双接种NJ2D+BJ04菌剂枫香叶片的花青素含量显著提高（P <0.05）;3）对照与处理组的枫香根际微生物多样性也存在显著差异（P <0.05），其中，单接种NJ2D、BJ04和双接种NJ2D+BJ04菌剂的枫香根际细菌的OTU（操作分类单元）数量较对照均显著增加（P <0.05），而丛枝菌根真菌（AMF）的OTU数量较对照均显著降低（P <0.05）;4）根际微生物高通量测序结果显示，放线菌门、变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门和芽单胞菌门为枫香根际土壤中主要优势细菌菌群；球囊霉属、根生囊霉属和Dominikia为枫香根际土壤中主要AMF的优势菌群。接种处理后，枫香根际的酸杆菌门、绿弯菌门和浮霉菌门的物种丰度较对照均显著减小（P <0.05），而变形菌门和放线菌门的物种丰度较对照则显著增加（P <0.05）。【结论】接种解磷菌、丛枝菌根真菌以及复合菌剂NJ2D+BJ04均可改善土壤微环境，并对枫香秋季叶色变化产生影响。

利用Biolog-ECO技术对不同育苗基质培育下的团花根际微生物群落功能多样性进行研究。结果表明:不同育苗基质的团花根际微生物群落功能多样性有显著差异,13#甘蔗渣堆肥用作团花育苗基质能显著增强微生物对碳源的利用,13#育苗基质培育的团花根际微生物总体表现较高的活性,并且根际微生物利用碳源的类型以糖类、羧酸类和氨基酸类化合物相对较多,如:D-半乳糖酸γ--内脂、D-甘露醇、D-纤维二糖、衣康酸、L-精氨酸、L-天门冬酰胺和L-丝氨酸。

研究连作对大豆根际土壤中细菌、真菌群落组成、构建的影响,为大豆连作障碍的生物防治和农田土壤修复提供理论支持。试验于2021-2022年在沈阳农业大学铁西区定位试验站进行,试验站土壤类型为棕壤土。以玉米-大豆轮作(对照)和大豆连作根际土壤为研究对象,利用16SrDNA、ITS高通量测序技术,结合土壤化学性质和土壤酶活性测定,分析连作对大豆土壤化学性质、酶活性以及根际微生物多样性、群落构建特征的影响。结果表明:连作下,土壤全氮、全磷、全钾等土壤化学性质指标含量下降,速效钾、pH值升高;连作显著提高土壤蔗糖酶和过氧化氢酶活性,显著降低土壤脲酶、亮氨酸氨肽酶活性和N-乙酰氨基葡萄糖苷酶活性。土壤细菌多样性指数连作处理(4.63)低于轮作处理(5.34),细菌属水平下,连作增加鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium)和卡氏伯克霍尔德菌属(Burkholderia,LRR:1.4%;LCR:2.4%)相对丰度;土壤真菌多样性指数连作处理低于轮作处理,真菌属水平下,连作增加病原真菌镰刀菌属(Fusarium,LCR:20.5%;LRR:13.2%)相对丰度。在群落组装过程中,大豆连作根际土壤细菌群落构建主要由确定性过程主导;玉米大豆轮作根际土壤细菌群落构建主要由随机过程主导;大豆连作根际土壤真菌群落构建和玉米大豆轮作根际土壤真菌群落构建由随机过程主导。连作引起大豆根际土壤环境因子、细菌、真菌群落组成及构建的变化,病原菌相对丰度增加,其中镰刀菌(Fusarium)相对丰度的增加可能是导致大豆连作障碍发生的重要因素。

【目的】本试验围绕玉米不同生育期根系土壤微生物的组成变化，探究鲜食玉米根系土壤微生物群落构成演化规律及其与环境因子的耦合关系。【方法】基于鲜食玉米大田试验，在鲜食玉米的播前期（PS）、拔节期（JS）、抽雄期（TS）和乳熟期（MS）进行根际土壤的采集及其理化性质的测定，并使用16S和ITS基因测序分析鲜食玉米不同生育期下根际土壤中微生物群落结构的特征。【结果】玉米不同生育期根系土壤细菌群落结构和多样性差异显著，而真菌群落组成在各生育期无显著变化。在拔节期，随土壤养分含量的显著降低，细菌变形菌门的相对丰度显著增加，而真菌子囊菌门的相对丰度则显著下降。在乳熟期，根系土壤细菌不同属间的正相关共生关系相较于其他生育期达到最高，而此时真菌不同属间的正相关共生关系则降至最低。结构方程模型分析结果显示，根际土壤细菌多样性与土壤pH、总磷和速效钾间存在正效应，而真菌多样性则与上述指标间存在负效应。【结论】土壤微生物群落结构在鲜食玉米生育期内发生了显著改变，相比真菌，细菌更易受到外界环境的影响，微生物群落结构随外界环境的改变继而影响着鲜食玉米产量的构成。

【目的】为揭示柿子树与苹果树间作体系下，苹果根际微生物群落结构和土壤理化性质，【方法】本研究以间作（I）和非间作（NI）的苹果根际土壤为材料，采用高通量测序技术，对苹果根际微生物群落结构进行了分析。【结果】间作柿子树增加了苹果根际土壤有机质（OM）、水解性氮（AN）、全磷（TP）含量，降低了土壤中有效钾（AK）含量。Alpha多样性分析表明，间作对苹果根际土壤细菌丰富度指数和多样性指数无显著影响，但显著降低了根际土壤真菌的Ace指数（P=0.03）。β多样性分析表明，间作和非间作土壤细菌和真菌群落结构都存在显著差异。进一步LEfSe分析发现，间作显著增加了苹果根际土壤中17个细菌属的丰度，分别为Sporacetigenium、Tepidisphaera 、Agromyces、Alkanindiges、Phycisphaera、假黄色单胞菌属（Pseudoxanthomonas）、Terrimonas、Pseudohaliea、Paenisporosarcina 9个已知属，8个未知属；显著降低了4个细菌属的丰度，分别为Sporichthya、Methylocystis、Devosia 、Altererythrobacter。间作显著增加了1个真菌属的丰度，为Arthrographis；降低了3个真菌属的丰度，分别为柱孢属（Cylindrocarpon）、Metacordyceps、 外瓶霉属（Exophiala）。Spearman相关性分析表明，根际细菌属Pseudomonas与有效磷（AP）、全磷（TP）呈显著正相关性，真菌属Naganishia与有效磷（AP）呈显著正相关性；真菌属Polyscytalum、Minimedusa与有效磷（AP）呈显著负相关性。PICRUSt2结果显示，间作显著降低了根际细菌碳水化合物运输和代谢以及胞外结构两大类功能丰度；FUNGuild功能分析显示，间作显著降低了病原-腐生过渡型真菌在苹果根际土壤的丰度。【结论】苹果与柿子树间作可提高苹果根际土壤OM、AN、TP含量，显著增加根际有益微生物的相对丰度，减少病原真菌微生物的相对丰度，为探讨间作抗病机理提供数据参考。

【目的】探究西藏不同产地湿生扁蕾根际土壤微生物群落组成特征，揭示根际土壤核心微生物菌群与根际土壤微生物群落的相互作用，以及影响微生物群落组成的环境因素。【方法】采用Illumina MiSeq高通量测序技术和生物信息学方法对西藏林芝市巴宜区（BY）、察隅县（CY）和工布江达县（GB）湿生扁蕾根际土壤微生物群落组成，及其与土壤理化因子间的相关性进行分析。【结果】湿生扁蕾根际土壤共获得4738个细菌OTUs和3600个真菌OTUs，BY样品根际土壤细菌和真菌丰富度指数最高，CY样品根际土壤细菌和真菌多样性指数最高；不同产地湿生扁蕾根际土壤细菌和真菌群落结构组成存在差异；根际土壤核心细菌菌群有322个属，核心真菌菌群有175个属；根际土壤细菌和真菌互作网络均具有模块化结构且以协同作用为主，核心微生物菌群相对分散，变形菌门、放线菌门、子囊菌门和担子菌门是根际土壤微生物的关键类群；相关性分析表明，核心微生物菌群的改变与土壤理化因子间存在不同程度的相关性；pH、总钾、总磷、总氮、速效钾和速效氮含量与根际土壤微生物群落结构组成显著正相关，总钾、总磷和总氮是影响根际土壤微生物α多样性的关键因子。【结论】不同产地湿生扁蕾根际土壤细菌和真菌群落组成及多样性存在一定的差异，根际土壤微生物菌群的改变与土壤理化因子间存在不同程度的相关性。本研究为湿生扁蕾人工种植及益生微生物菌群的筛选提供了理论依据。

为探究韭菜(Allium tuberosum Rottl. ex Spreng.)不同生态位微生物的分布情况，通过高通量测序技术，结合生信分析比较不同生态位的多样性差异，找出不同生态位的核心菌群；通过PICRUSt2对不同生态位微生物的功能进行预测。结果表明：韭菜根及根际土，即韭菜的地下部分，微生物群落的丰富度和多样性高于其他生态位，且主要的核心菌群为变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria);而地上部分如韭菜叶片中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度更高。通过对不同生态位韭菜细菌代谢功能进行预测，发现在韭菜地上部位内生菌主要的代谢功能是通过各种有机系统进行一系列代谢活动，而地下部分的微生物主要是参与遗传信息的处理和细胞的基础活动，变形菌门多与细胞的基础生命活动有关，而地上所发挥作用的厚壁菌门和拟杆菌门可能参与韭菜机体的一系列代谢活动。该研究结果为不同品种韭菜内生菌研究提供理论基础。

独一味（Lamiophlomis rotata）具有较高的药用价值，是青藏高原特有的重要药用植物。探究独一味根际土壤的理化性质及其微生物群落的组成特点，对于开发和推广青藏高原特色生物资源有着重要价值。本文以青藏高原5个独一味主产区根际土壤为研究对象，测定土壤理化指标。同时采用高通量测序技术，结合Spearman、RDA等方法开展微生物群落组成及多样性研究。结果表明：（1）独一味喜好生长在中性偏碱的土壤中。（2）Candidatus＿Udaeobacter、RB41属和赤芍铁杆属是独一味根际土壤中的优势细菌属；被孢霉属、寡囊盘菌属和地霉菌属为独一味根际土壤中的优势真菌属。（3）不同地区独一味根际土壤细菌和真菌群落的多样性和丰富度存在显著差异：杂多地区土壤细菌群落丰度最高，大武地区土壤细菌群落丰度最低；大武地区土壤真菌群落的多样性最为丰富，歇武地区土壤真菌群落多样性最低。（4）有机碳与全氮含量是影响独一味根际土壤微生物群落分布的关键土壤环境因子。（5）细菌Candidatus＿ Udaeobacter、Telmatobacter、Flaviaesturariibacter和真菌Seimatosporium、Ochronectria为独一味根际土壤的关键核心菌群。研究结果为筛选独一味促生或生防有益功能菌提供了理论依据。

【目的】分析不同林龄华北落叶松人工林土壤微生物结构特征变化规律，阐明土壤微生物群落结构特征对林龄变化的响应机制及关键影响因子，为人工林可持续经营和探讨土壤微生物群落对环境变化反馈机制提供理论依据。【方法】以不同林龄华北落叶松人工林为研究对象，基于土壤微生物群落结构、土壤理化性质和林下植被特征等指标，采用冗余分析探讨土壤理化性质和林下植被特征对土壤微生物群落结构的驱动机制。【结果】研究结果表明林龄变化对土壤理化性质和微生物群落结构特征均存在显著影响，其中土壤温度、含水率、pH值、全碳、全氮、全磷、铵态氮和硝态氮含量均随着人工林年龄的增加而显著增加，土壤有效磷含量则表现出相反的变化规律（P <0.05）。林龄增长也提高了土壤革兰氏阳性细菌、革兰氏阴性细菌、真菌和放线菌含量，但真菌与细菌以及革兰氏阳性细菌与革兰氏阴性细菌的比值呈下降趋势。林下灌木、草本层物种多样性也表现出随林龄增加而增长的变化趋势，不同林龄间差异则均未达显著水平。冗余分析结果表明本研究选取的土壤理化性质和林下植物物种多样性指标共同解释了土壤微生物群落总变异的86.1%，土壤含水率、温度、有效磷、硝态氮含量、灌木层丰富度指数和草本层丰富度指数则分别解释了微生物群落结构变异程度的22.7%、18.4%、11.8%、10.6%、7.9%和5.6%。【结论】土壤微生物群落结构特征、土壤理化性质和林下植物物种多样性（灌木层和草本层）均受到林龄变化的影响，并且土壤温度、含水率、有效磷、硝态氮和林下植物物种多样性是引起不同林龄人工林土壤微生物群落结构变化的关键驱动因子。

[目的]探究嫁接对番茄植株根际微生物群落组成的影响，旨在揭示嫁接提高番茄植株抗性的机制并为构建解决番茄连作障碍体系提供参考。[方法]基于高通量测序技术，以番茄品种新砧1号和宝砧1号为砧木，桃太郎品种为接穗进行以下处理：新砧1号实生植株（简称：新砧）；新砧1号×桃太郎嫁接植株；（简称：桃太郎/新砧）；宝砧1号实生植株；（简称：宝砧）；宝砧1号×桃太郎嫁接植株；（简称：桃太郎/宝砧）；桃太郎实生植株。（简称：桃太郎）。采集番茄实生与嫁接处理植株根际土壤，比较分析番茄各处理根际土壤细菌和真菌的群落组成。[结果]与新砧、宝砧、桃太郎处理植株相比，桃太郎/新砧和桃太郎/宝砧处理植株细菌和真菌群落在不同分类水平上可操作分类单元(OTU)数量均发生明显变化。与砧木和接穗实生植株相比，番茄嫁接植株根际土壤中拥有更丰富的微生物OTU和特有OTU数量。番茄实生与嫁接植株间在根际土壤细菌和真菌多样性与丰富度上无显著差异（P>0.05）。在门分类水平上，在桃太郎/新砧处理植株根际土壤中，放线菌门和厚壁菌门细菌丰度占比均高于新砧和桃太郎处理植株；在桃太郎/宝砧处理植株中，绿弯菌门、酸杆菌门、芽单胞菌门细菌丰度占比均高于宝砧和桃太郎处理植株。在属分类水平上，与新砧和桃太郎处理植株相比，桃太郎/新砧处理植株根际土壤中鞘氨醇单胞菌属、芽孢杆菌属、链霉菌属、unclassified＿f＿＿Micrococcaceae、norank＿f＿＿norank＿o＿＿Gaiellales细菌属丰度占比增加；与桃太郎处理植株相比，桃太郎/新砧处理植株根际土壤中增加特有优势菌属栖大理石菌属。与宝砧和桃太郎处理植株相比，桃太郎/宝砧处理植株根际土壤中，norank＿f＿＿norank＿o＿＿norank＿c＿＿Subgroup＿6、类诺卡氏菌、norank＿f＿＿norank＿o＿＿norank＿c＿＿Gitt-GS-136、norank＿f＿＿norank＿o＿＿norank＿c＿＿KD4-96、norank＿f＿＿JG30-KF-CM45属细菌丰度占比增加，同时增加特有优势菌属norank＿f＿＿norank＿o＿＿norank＿c＿＿JG30-KF-CM66菌属。在真菌门分类水平上，与番茄实生植株相比，嫁接植株根际土壤中油壶菌门真菌丰度占比提升，而子囊菌门真菌丰度占比下降。此外，桃太郎/新砧嫁接植株根际土壤中unclassified＿k＿＿Fungi菌门丰度占比增加，而桃太郎/宝砧嫁接植株根际土壤中unclassified＿k＿＿Fungi菌门丰度占比减少。在属分类水平上，与对应实生植株相比，桃太郎/新砧处理植株根际土壤中，根囊壶菌属、unclassified＿k＿＿Fungi、分枝孢子霉属真菌的丰度占比增加，桃太郎/新砧处理植株根际土壤中还缺失木霉属、曲霉菌属、unclassified＿o＿＿Eurotiales、unclassified＿o＿＿Sordariales等菌属，但与新砧处理植株相比，增加了镰刀菌属；在桃太郎/宝砧处理植株根际土壤中，根囊壶菌属、青霉属丰度占比增加，而分枝孢子霉属、木霉属、曲霉菌属、镰刀菌属、unclassified＿o＿＿Eurotiales、蛛网霉属等菌属缺失。[结论]与实生植株相比，嫁接不仅改变了番茄植株根际土壤微生物群落丰度占比，还改变了根际土壤微生物的群落组成。番茄嫁接植株根际土壤微生物群落组成的改良是嫁接植株抗性增强的重要原因之一。

为考察综合肥料管理（integrated fertilization management,IFM）策略和农民常规处理（farmer’s practice,FP）对微生物群落和土壤功能的影响差异，本研究利用2013-2014年设立的双季稻田间试验包括综合肥料管理（IFM）和农民实践（FP）2种处理，通过在晚稻生长季节的3个时间点采集根际和非根际土壤，调查土壤化学性质和酶活性，使用磷脂脂肪酸（phospholipid fatty acids,PLFA）鉴定微生物生物量和群落组成。结果显示：与FP处理相比，IFM处理降低了根际土壤的革兰氏阳性（Gram-positive bacteria,GP）和阴性细菌（Gram-negative bacteria,GN）的比值（GP/GN）和微生物胁迫指数。IFM处理促进了幼穗分化期和齐穗期根际土壤中蔗糖酶、酸性磷酸酶、芳基硫酸酯酶活性，抑制了成熟期脲酶活性。冗余分析表明，有效氮和总氮可分别解释微生物群落和酶活性变异的15.9%和12.5%，这表明氮的有效性和氮水平分别是影响稻田环境微生物群落和酶功能的关键因素。此外，革兰氏阴性细菌、真菌和丛枝菌根真菌对土壤酶活性改变的解释率分别达到5.39%、3.88%和3.09%。微生物胁迫指数与磷酸酶和蔗糖酶活性呈负相关，这表明细菌和真菌都参与土壤酶功能调节。研究表明，IFM主要通过调控稻田氮投入节奏改变微生物群落组成从而提升成熟期前的土壤酶活性，促进水稻生长过程中的养分循环。

采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术研究了2007年夏季桑沟湾不同养殖区水体微生物群落结构特征。DGGE指纹图谱分析表明,不同站位之间既存在共同图谱,又具有各自的特征谱带,总体上可分为4个区,湾外区、湾口区,湾中区和湾底区,分别与非养殖区、海带养殖区、综合养殖区、贝类单养与网箱养殖区行相对应;扇贝养殖区和牡蛎养殖区微生物相似性最高为94%,贝类单养与网箱养殖区和非养殖区相似性最低为41%,仅在网箱区发现对含氮污染物有去除作用的玫瑰杆菌属(Roseobacter)。17个站位表层水样共获得30个优势菌群,选择比较明显的12条带进行回收、扩增和测序,与GenBank中已经登录的细菌种群的同源性进行...

采用稻/稗共培抑草圈土壤盆栽法研究化感水稻PI312777和非化感水稻Lemont与稗草共培下水稻化感潜力、根际土壤酶活性及土壤微生物群落的变化.结果表明，化感水稻PI312777显著抑制12 cm处稗草的生长，PI312777根际土壤过氧化物酶和蔗糖酶活性高于Lemont,稗草根际土壤的蔗糖酶、脲酶活性降低；PI312777根际土壤微生物对氨基酸类、糖类和酚酸类碳源的利用程度显著高于Lemont,稗草根际土壤微生物对氨基酸类、多聚物类、酚酸类、羧酸类的利用率显著下降.相关性分析表明，水稻对稗草的抑制率与水稻根际土壤的过氧化物酶和蔗糖酶活性显著负相关，与水稻根际土壤微生物对羧酸类、多聚物类和酚酸类碳源的利用率相关，与稗草根际土壤微生物对氨基酸类和酚酸类碳源的利用率相关.水稻对稗草的化感作用与供体和受体植株根际的土壤酶活性和土壤微生物种群变化密切相关，对水稻化感作用的微生态起重要的调节作用.