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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
赵霞 李锐 高海侠 王文静 徐军 张瑞良 王瑞 李琳
【目的】研究临床分离的大肠杆菌多重耐药株(R)与大肠杆菌标准株ATCC 25922(S)蛋白质差异表达情况,为进一步研究大肠杆菌耐药机理奠定基础。【方法】采用串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)法结合平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)技术,对大肠杆菌R和S株的全菌体蛋白进行定量蛋白质组学研究,筛选大肠杆菌多重耐药株(S)与敏感株(R)之间的差异表达蛋白,并对其生物信息学进行分析。【结果】共筛选出300个差异表达蛋白(Fold change≥1.3,P<0.05),其中上调167个,下调133个,涉及的耐药相关通路主要包括细菌趋药性、ABC转运蛋白、β-内酰胺抗性等;PRM成功定量到13个差异蛋白,且PRM验证结果与TMT定量结果一致。【结论】筛选出多个与大肠杆菌耐药性相关的差异表达蛋白和通路。
关键词：
大肠杆菌 耐药性 蛋白质组学
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
杨文仪 肖家伟 雷连成 张付贤
为查明南京市某赛鸽公棚赛鸽出现腹泻、死亡的致病病原，本研究对采集的病料进行病原分离鉴定，分析致病菌的血清型、生物被膜表型、毒力基因、耐药菌谱，并对分离菌株进行了人工感染试验。研究表明：1)从患病鸽组织、拭子和粪便中分离出的细菌初步诊断为大肠杆菌O157;分离菌株在NA平板上长出白色、光滑的圆形菌落，在CT-SMAC平板上长出紫红色菌落。2)分离菌株的16S rRNA基因序列与大肠杆菌的相似性达98%～99%,命名为E.c.86246。3)血清学试验表明分离菌株为大肠杆菌O157:非H7菌株，动力试验进一步证实其为动力株。4)分离菌株携带tccp1014、eaeA和hly毒力基因，可导致雏鸡胃肠道出现不同程度的功能损伤，甚至导致死亡；其半数致死量为2.0×10~5 CFU/mL,具有较强的致病性。5)分离菌株携带tetA、tetM、sul2、aadA1和bla_(TEM) 5种耐药基因，具有较弱的生物被膜形成能力，对四环素、氨基糖苷类等抗菌药物严重耐药，对阿莫西林、氧氟沙星和诺氟沙星敏感。综上，本研究分离的鸽源大肠杆菌O157:非H7菌株，具有动力性，有较强的致病性和一定的耐药性，为大肠杆菌O157的流行病学调查、致病机理分析和抗菌药物的精准施治提供理论依据和数据参考。
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾艳华 李凤娟 刘建华 胡功政 莫娟 余军军
为探讨鸡源大肠杆菌生物被膜的耐药机制,采用改进的平板培养法建立鸡大肠杆菌生物被膜体外模型,用液体二倍稀释法分别测定了鸡源大肠杆菌生物被膜菌、浮游菌和脱膜菌对克拉霉素、环丙沙星、磷霉素等13种抗菌药的敏感性,并检测了细菌生物被膜中超广谱β-内酰胺酶的产生情况。结果表明:浮游菌和脱膜菌对同种药物的敏感性几乎相同,而生物被膜菌对同种药物的耐药性比后两者显著增强,并且2株不产超广谱β-内酰胺酶的浮游菌在形成生物被膜后产生了超广谱β-内酰胺酶。由此说明,生物被膜菌的耐药性主要是由于生物被膜这种特殊结构造成的,同时,由于生物被膜的存在,促使了超广谱β-内酰胺酶的产生。生物被膜的形成和超广谱β-内酰胺酶的产...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
南海辰 底丽娜 夏利宁
【目的】了解新疆不同动物源喹诺酮类耐药大肠杆菌携带质粒介导的喹诺酮耐药因子(plasmid mediated quinolone resistance,PMQR)的流行现状,及其与主要的β-内酰胺酶基因和16S rRNA甲基化酶基因的共存情况。【方法】通过PCR方法对猪源(79株)、牛源(8株)和羊源(96株)喹诺酮类(环丙沙星,诺氟沙星和恩诺沙星)耐药大肠杆菌进行PMQR(qnrA,qnrB,qnrC,qnrD,qnrS,qepA,oqxA,oqxB,aac(6’)-Ib-cr)、β-内酰胺酶基因(blaTEM,blaCTX-M,blaSHV,blaKPC,blaCMY-2,blaLAP-1...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李蓓 李旭林 郭丽娟 龙梅 郭放 何雪梅 罗燕 邹立扣
本实验分离大熊猫粪便样品中大肠杆菌,利用形态学和分子生物学方法鉴定菌株,采用药敏纸片扩散法(Kirby-Bauer)进行常用抗生素耐药性试验分析。结果表明,从抗生素大类来比较,耐药率依次为:四环素类(55.6%)>青霉素类(26.7%)>磺胺类(18.9%)>喹诺酮类(10%)>头孢类(7.8%)>氨基糖苷类(1.1%)>单环内酰胺类(0)、碳青霉烯类(0)。大肠杆菌对四环素的耐药率最高,达到55.6%;对头孢曲松、头孢他啶、氨曲南、亚胺配能及美罗配能等敏感,耐药率为0。其它抗菌药物耐药率依次是:阿莫西林(26.7%)>磺胺复合物(18.9%)>氨苄西林/舒巴坦(17.8%)>复方新诺明(11...
关键词：
大熊猫 大肠杆菌 分离 耐药性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
曲志娜 刘红玉 王娟 赵思俊 李玉清 黄秀梅 盖文燕 王君玮
【目的】通过抗菌药物敏感性测定试验以及超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)表型和基因型检测试验,了解青岛地区肉鸡养殖场产ESBLs大肠杆菌菌株的分布情况及耐药特征,分析ESBLs流行基因型和基因亚型,为指导临床合理使用抗菌药物、有效控制产ESBLs菌株的感染和流行提供依据。【方法】采用微量肉汤稀释法对249株大肠杆菌菌株进行抗菌药物敏感性测定试验,采用CLSI推荐方法进行ESBLs表型检测和确证实验,采用PCR方法、序列测定以及生物学分析软件进行ESBLs耐药质粒的DNA扩展和基因型分析,利用SPSS19.0软件对产ESBLs菌株与非产ESBLs菌株的耐药情况进行差异显著性分析。【结果】83.13...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
曲志娜 刘红玉 王娟 赵思俊 李玉清 黄秀梅 盖文燕 王君玮
【目的】通过抗菌药物敏感性测定试验以及超广谱β－内酰胺酶（ＥＳＢＬＳ）表型和基因型检测试验，了解青岛地区肉鸡养殖场产ＥＳＢＬＳ大肠杆菌菌株的分布情况及耐药特征，分析ＥＳＢＬＳ流行基因型和基因亚型，为指导临床合理使用抗菌药物、有效控制产ＥＳＢＬＳ菌株的感染和流行提供依据。【方法】采用微量肉汤稀释法对２４９株大肠杆菌菌株进行抗菌药物敏感性测定试验，采用ＣＬＳＩ推荐方法进行ＥＳＢＬＳ表型检测和确证实验，采用ＰＣＲ方法、序列测定以及生物学分析软件进行ＥＳＢＬＳ耐药质粒的ＤＮＡ扩展和基因型分析，利用ＳＰＳＳ１９．０软件对产ＥＳＢＬＳ菌株与非产ＥＳＢＬＳ菌株的耐药情况进行差异显著性分析。【结果】８３．１３．．．
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
夏绪进 程伟华 夏利宁 苏战强 林亚军
为了解２０１３年新疆昌吉地区猪源喹诺酮类耐药大肠杆菌携带质粒介导喹诺酮耐药基因的流行情况，采用ＰＣＲ方法对３５５株喹诺酮耐药猪源大肠杆菌进行ＰＭＱＲ因子（ＱｎＲＡ、ＱｎＲＢ、ＱｎＲＣ、ＱｎＲＤ、ＱｎＲＳ、ＱｅＰＡ、ｏＱｘＡ、ｏＱｘＢ和ＡＡＣ（６′）－ＩＢ－ＣＲ）检测，对目的条带进行ＤｎＡ测序确定基因型。结果显示：该地区猪源喹诺酮耐药大肠杆菌ＰＭＱＲ因子的携带率高达８６．８％（３０８／３５５），其中４２．９％（１５２／３５５）的菌株携带２种ＰＭＱＲ因子，１１．３％（４０／３５５）的菌株携带３种ＰＭＱＲ因子，６．５％（２３／３５５）的菌株携带４种ＰＭＱＲ因子；检出率较高的ＰＭＱＲ因子有ＱｎＲＳ（６．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
郑朝朝 刘聚祥 李辉 刘静 李宏娟
为监测大肠杆菌的耐药性,了解不同动物源大肠杆菌氟苯尼考耐药基因flor的差异及其对大肠杆菌耐药性影响,对从保定及其周边地区分离的23株鸡源、14株猪源大肠杆菌进行耐药性测定,并对其氟苯尼考耐药基因flor进行了变异性分析。结果表明,氟苯尼考耐药菌株检出率分别为62%和58%,不同动物源flor基因同源性为99.8%,与GenBank报道的flor基因比较存在3个氨基酸替代,鸡源flor基因在开放阅读框的第439,479,683等位存在点突变,猪源flor基因在开放阅读框的第439,683,1100等位出现点突变。
关键词：
氟苯尼考 耐药性 flor PCR
[期刊] 中国农业科学
[作者]
杨玲丽 陈杖榴 刘健华 曾振灵 马俊英 吴聪明
目的了解养殖场多重耐药大肠杆菌耐药性的传播机制,探讨人、动物与环境间耐药菌垂直克隆传播的可能性。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对分离自养殖场动物、环境和饲养员的86株耐药谱相近多重耐药大肠杆菌进行DNA指纹图谱分型,比较菌株之间的亲缘关系。结果37株鸡场来源大肠杆菌可分为20种PFGE分型;49株猪场来源大肠杆菌可分为24种PFGE分型;同一动物、环境或饲养员采样点分离菌株PFGE指纹图谱相同者较多;同一养殖场不同动物个体、养殖场环境不同采样点、动物和环境以及饲养员和环境都存在PFGE指纹图谱完全相同菌株;鸡场和猪场都发现有属同一PFGE分型的来自动物、饲养员和环境的菌株;86株菌...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
李琳 赵霞 王磊 王文静 张瑞良 代兴杨 杨艳菲 徐园园
【目的】研究鸡源大肠杆菌成簇间隔短回文重复序列（Clustered regularly interspaced short palindromic repeats，CRISPR）与耐药性的关系，并对CRISPR进行生物信息学分析，为进一步研究CRISPR功能及其对细菌耐药的影响奠定基础。【方法】对从安徽省合肥地区养鸡场分离鉴定的130株鸡源大肠杆菌进行耐药性（16种抗菌药物）和CRISPR检测，分析CRISPR与鸡源大肠杆菌多重耐药的关系。挑选扩增出片段长度不同的12株大肠杆菌，对其CRISPR PCR产
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
寇慧林 陈昕迪 王腾宇 高娃 温海峰 张艳敏 于宇 李峥 刘春霞 王文龙
为分析捻转血矛线虫伊维菌素敏感虫株与耐药虫株之间差异表达的circRNAs在调控耐药性中的作用，本研究以捻转血矛线虫敏感虫株和耐药虫株为研究对象，采用Illumina Hiseq 2 000平台进行高通量测序及cDNA文库的构建，利用相关生物信息学软件对测得的circRNAs进行差异性分析，同时对来源基因进行GO和KEGG pathway功能富集。运用TargetScan和Miranda软件预测关键circRNAs靶向的miRNAs，探究circRNAs-miRNAs的作用。随后又随机选取5个显著差异的circRNAs，进行RT-qPCR检测并与转录组测序结果进行一致性评定。结果显示：1）敏感虫株与耐药虫株共筛选出677个差异表达的circRNAs，其中47个显著差异，23个显著上调，24个显著下调。2）所有差异circRNAs的来源基因GO富集分析显示，共富集到生物过程336个、细胞组分59个和分子功能110个，主要与代谢过程、细胞膜结构和催化活性等相关；KEGG富集分析显示，富集到257条通路，主要与代谢（脂肪酸生物合成、甘油磷脂代谢和丙酸代谢）、胰高血糖素信号通路和AMPK信号通路等相关。3)circRNAs-miRNAs调控网络分析显示，627个差异circRNAs靶向结合187个miRNAs，组成了10 602组调控关系。综上，本研究成功筛选了捻转血矛线虫伊维菌素敏感虫株和耐药虫株间差异表达的circRNAs，对所有差异circRNAs的来源基因进行功能注释和富集分析，并构建了部分显著差异circRNAs-miRNAs调控网络。本研究结果为捻转血矛线虫耐药性产生的分子机制研究提供了新思路。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
罗维 余兴龙 白霞 李润成 侯强红 尹恒
根据Z26520中fedF序列设计1对引物,从发病仔猪的腹泻粪便分离获得的大肠杆菌中扩增得到fedF基因,经纯化、连接、转化,将其成功克隆到pMD18-T中,所克隆fedF基因序列与GenBank中收录的其他fedF基因序列的同源性达97.8%～99.2%.另设计1对引物,利用基因工程方法将所克隆的fedF的编码序列亚克隆到表达载体pBV220中,转化大肠杆菌BL21(DE3)获得表达重组菌.测序结果表明,插入编码序列与预期序列一致.SDS-PAGE电泳及Western-blotting分析表明,重组菌在诱导后可以表达特异性的相对分子质量为30 100的FedF蛋白.
关键词：
大肠杆菌 fedF基因 克隆 表达
[期刊] 中国农业科学
[作者]
孙建和 严亚贤 陆承平
目的进一步确定vpr基因及相关蛋白的功能。方法在获得vpr同源基因突变株MC1061△vpr的基础上,构建了vpr基因突变株的回复株MC1061-C,并进行了噬菌体裂解试验、细胞壁吸附试验、蛋白表达和印迹试验。结果亲本株MC1061和回复株MC1061-C对VT2噬菌体C43b的裂解敏感,突变株MC1061△vpr抵抗噬菌体C43d的裂解。噬菌体吸附细胞壁试验中,吸附30min后,亲本株和回复株的上清液中分别存在6.4%和5.2%的游离噬菌体,吸附到90min时未有大量的游离噬菌体释放。噬菌体与突变株的细胞壁吸附30min后,上清液中有85.4%的游离噬菌体存在,表明VT2噬菌体能与亲本MC1...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
陈朝喜 贺冬梅 汤承
【目的】针对大肠杆菌耐药性呈现逐年增加的趋势和牦牛疾病防控中抗菌药物使用存在的问题,对2009-2016年度采自川西北高原地区散养牦牛(包括健康和患病)的粪便、屠宰场宰杀牦牛的胃肠道内容物和病死牦牛的脏器1 908株大肠杆菌进行27种抗菌药物敏感性试验和整合酶基因检测,以了解川西北高原地区牦牛源大肠杆菌耐药性变迁规律和整合子携带情况,为牦牛安全用药提供参考。【方法】按照美国临床和实验室标准协会(NCCLS)推荐的微量肉汤稀释法对分离菌株进行最小抑菌浓度(MIC)测定,利用WHONet 5.6软件包对试验数
关键词：
川西北高原 牦牛 耐药性变迁 整合子
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