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[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
李晨雷 齐昆龙 刘蓥珂 叶建伟 李新建 王克君 李秀领 乔瑞敏 韩雪蕾
为解决养猪生产中传统发情鉴定法工作量大、准确率低等问题,本研究以经产大白母猪为研究对象,将发情周期分为发情前3天(PE),发情期(E)和发情后3天(AE)3个阶段,分别收集口腔中唾液,提取唾液蛋白,使用Lable-free定量蛋白组学技术对3个阶段的唾液蛋白组进行质谱检测,并通过蛋白质组学定性定量软件Maxquant进行分析。结果显示:1)3个阶段共鉴定到405个蛋白质,包括149个共有蛋白和160个特异蛋白,其中有45个共有蛋白差异达到显著水平(P
关键词：
大白母猪 发情鉴定 唾液蛋白组 蛋白互作
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
王春源 熊力 杨红文 郭小江 张依裕 谭元成 杨酸
【目的】基于串联体量标记(TMT)定量蛋白组学技术探讨柯乐猪母猪乳腺发育的调控机制，为选育工作提供依据。【方法】选取乳腺发育正常和异常的柯乐猪母猪各3头，采集乳腺组织，利用TMT定量蛋白组学技术探究正常和异常乳腺组织的差异表达蛋白，筛选与乳腺发育相关的差异关键蛋白，并对差异表达蛋白进行生物信息学分析。【结果】从柯乐猪乳腺组织中共筛选出474个差异表达蛋白，包括245个上调蛋白、229个下调蛋白；基因本体(GO)功能注释和富集分析显示，差异表达蛋白主要富集在上皮细胞分化、皮肤形成和肾小管上皮细胞分化等生物学过程中，主要分布在胞外区和细胞外空隙中，参与调节肽酶抑制剂活性和肽链内切酶活性；京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析显示，差异表达蛋白主要富集在补体系统、过氧化物酶体增殖物激活受体和金黄色葡萄球菌感染等信号通路上；结合差异表达蛋白互作网络分析，筛选出10个核心差异表达蛋白[上调蛋白有P14287(骨桥蛋白)、F1RXF9(角蛋白25)、I3LDS3(角蛋白10)、Q75QW1(上皮细胞黏附分子)、A0A5S8KLN1(丛生蛋白)、F1RW75(桥粒素),下调蛋白有A0A286ZT13(白蛋白)、P06867(血纤维蛋白溶酶原)、F1SCC9(含丝氨酸蛋白酶抑制剂结构域的蛋白)、P50447(α-1-抗胰蛋白酶)]。【结论】采用TMT定量蛋白组学技术能有效筛选出母猪正常和异常乳腺组织中的差异表达蛋白。
[期刊] 华北农学报
[作者]
赖多 曹永军 卢梦玲 徐汉虹
活性测定表明仙人掌苷对荔枝霜疫霉菌菌丝生长具有良好的抑菌活性,EC50达到173.52μg/mL。为了从蛋白质水平探讨仙人掌苷对荔枝霜疫霉菌的抑菌机制,利用蛋白质双向电泳方法分析仙人掌苷处理前后荔枝霜疫霉菌蛋白质组表达的差异,结合飞行质谱以及数据库检索鉴定差异蛋白。结果发现,仙人掌苷处理后荔枝霜疫霉菌有16个蛋白发生了显著变化,其中11个下调表达蛋白,4个上调表达蛋白,1个诱导表达蛋白。其中鉴定的5种差异蛋白质为:线粒体二羧酸载体蛋白(DIC 1)、半胱氨酸合成酶A、ABC转运蛋白(ABCF-EF-3)、Class III stress response-re-lated ATPase以及假定...
关键词：
仙人掌苷 荔枝霜疫霉菌 抑菌活性 蛋白组
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
雷凯栋 滕光辉 温艳斌 冯飞起 宗超 孟奎
针对传统母猪限位栏圈养查情工作量大、效率低的关键生产问题,对母猪尿液中雌二醇(E2)和促黄体生成素(LH)2种激素进行测定,研究利用激素质量浓度和水平变化规律辅助检测断奶后母猪发情行为的可行性,并为开发试纸快速检测提供参考阈值。结果表明:1)尿液中雌二醇、促黄体生成素的质量浓度和水平在发情周期内呈规律性变化,在人工常规查情确定为发情时均达到峰值,分别为494.87pg/mL和22.52miu/mL;2)基于促黄体生成素阈值辅助查情准确率为87.50%。基于母猪尿液激素规律变化,可以实现对断奶母猪发情的快速检测筛查,在母猪辅助查情配种环节具有较大应用潜力。
关键词：
母猪 发情 快速检测 激素 福利化
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
杨铭宣 刘梦杰 王晋 虞德兵
[目的]本试验旨在研究日粮添加姜黄素对由热应激引起的蛋鸡肝脏抗氧化性能损伤的影响。[方法]以南京盘滁机械化养鸡场提供的180只280日龄海兰蛋鸡为研究对象，随机分成3组，对照组（Control）饲喂基础饲粮，环境温度为24±2℃；热应激组（HS）是基于对照组的基础上每天维持热应激6h以上，环境温度为34±2℃；姜黄素组（HS+CUR）是在热应激组的基础上，饲喂基础饲粮中添加150mg·kg~(-1)姜黄素的试验饲粮；每组4个重复，每个重复15只鸡。为了探究姜黄素对热应激蛋鸡肝脏的保护作用，采集蛋鸡肝脏组织样利用TMT蛋白质组学技术分析蛋鸡肝脏蛋白质差异表达。[结果]首先检测了蛋鸡肝脏的抗氧化功能，实时荧光定量PCR结果显示热应激组与对照组相比肝脏sod1和gpx1的表达极显著降低（P＜0.01)，cat表达显著降低（P＜0.05)；在添加姜黄素后可以极显著增加肝脏sod1和gpx1表达（P＜0.01)，显著增加cat表达（P＜0.05)。TMT (TandemMassTags)蛋白组学分析共检测到5039个蛋白，其中4235个具有定量信息，结果显示差异表达蛋白主要参与脂质和葡萄糖代谢，氧化应激，线粒体功能障碍和炎症反应等生物进程；主要参与的途径有PPAR信号通路，过氧化物酶体，脂质代谢，细胞色素P450，生物合成以及脂肪细胞因子信号通路等。进一步的，我们选取15个显著表达的差异蛋白进行在基因水平上的验证，结果表明基因水平和蛋白组学分析结果一致。[结论]本研究结果提示，补充姜黄素可以缓解蛋鸡由热应激引起的肝脏氧化应激以及与脂质代谢相关生物学过程。
关键词：
热应激 肝脏 氧化应激 脂质代谢
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
孙瑞萍 陈婷 王峰 晁哲 刘海隆 刘圈炜 黄丽丽 邢漫萍 郑心力 魏立民
为比较五指山猪和长白猪生长后期肌肉生长发育的差异,以6、8月龄五指山猪和长白猪为试验对象,采用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ)对其背最长肌总蛋白进行鉴定,结合生物信息学技术筛选品种间和品种内差异蛋白,并对其进行KEGG通路富集分析。结果表明:4组样品中共鉴定到1713个蛋白;五指山猪和长白猪品种间比较,6、8月龄猪中分别有460、337个差异的蛋白;品种内2个生长阶段比较,五指山猪和长白猪中分别有421、275个差异蛋白;2种比较均为上调的差异蛋白数多于下调差异蛋白数;KEGG通路分析发现,在五指山猪和长白猪品种间,6、8月龄在2个品种间的差异蛋白富集到差异显著(P<0.05)的条目分别为34、33个,在品种内,五指山猪和长白猪在2个生长阶段间的差异蛋白富集到差异显著(P
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
孙瑞萍 陈婷 王峰 晁哲 刘海隆 刘圈炜 黄丽丽 邢漫萍 郑心力 魏立民
为比较五指山猪和长白猪生长后期肌肉生长发育的差异,以6、8月龄五指山猪和长白猪为试验对象,采用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ)对其背最长肌总蛋白进行鉴定,结合生物信息学技术筛选品种间和品种内差异蛋白,并对其进行KEGG通路富集分析。结果表明:4组样品中共鉴定到1713个蛋白;五指山猪和长白猪品种间比较,6、8月龄猪中分别有460、337个差异的蛋白;品种内2个生长阶段比较,五指山猪和长白猪中分别有421、275个差异蛋白;2种比较均为上调的差异蛋白数多于下调差异蛋白数;KEGG通路分析发现,在五指山猪和长白猪品种间,6、8月龄在2个品种间的差异蛋白富集到差异显著(P<0.05)的条目分别为34、33个,在品种内,五指山猪和长白猪在2个生长阶段间的差异蛋白富集到差异显著(P
[期刊] 水产学报
[作者]
陶丽寒 胡丹丹 张嘉俊 陶会竹 李槿年
为探讨鱼类感染拟态弧菌后脾脏和肠黏膜组织蛋白差异变化,本研究以拟态弧菌04-14分离株人工感染实验动物草金鱼,利用双向电泳(2-DE)结合质谱技术对感染前后脾脏和肠黏膜组织的差异蛋白组学进行研究。结果显示,感染后脾脏和肠黏膜组织中分别有11个和12个显著差异表达蛋白点,经MALDI-TOF-MS质谱鉴定出19种显著差异表达蛋白,其中上调表达蛋白10种,下调表达蛋白9种,α-淀粉酶、载脂蛋白A-I、β-肌动蛋白和过氧化物还原酶2为两种组织中共同存在的显著差异表达蛋白。GO注释分析表明,显著差异表达蛋白分别定
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李平华 李杰 杨竹青 张志燕 杨斌 陈从英
【目的】分离影响母猪初情期的主效基因或分子标记。【方法】以白色杜洛克×二花脸资源群体F2代母猪为研究材料,利用Illumina猪60K SNP芯片分别对F0和F1及316头有初情期表型记录的F2代母猪进行基因型判定,通过单标记全基因组关联分析(GWAS)和连锁-连锁不平衡(LDLA)分析检测与母猪初情期显著关联的SNP位点或单倍型。采用标准关联分析、标记辅助关联分析和F值下降检验分析lin-28同源B基因(LIN28B)和跨膜蛋白38B基因(TMEM38B)3个SNP位点与母猪初情期的关联性。【结果】①与母猪初情期关联性最强的SNP为ASGA0032316,位于7号染色体(SSC7)33.07...
[期刊] 海洋渔业
[作者]
陈漪 胡瑞芹 冉皓宇 陈良标
斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用i TRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型斑马鱼发育至sphere时期即4 hpf的胚胎为样本,利用i TRAQ标记与LC-MS/MS串联质谱技术,结合数据库比对,对该时期表达的蛋白质进行定性和定量的鉴定分析。检测结果共鉴定到的总蛋白数为1 178个,利用生物信息学进行功能分析,发现这些蛋白广泛参与了细胞信号传递、细胞运动和细胞骨架构建、细胞增殖、细胞分化、物质合成与代谢等各项重要的生命活动过程。研究表明,利用i TRAQ标记的方法可以对4hpf时期的斑马鱼胚胎中的蛋白质进行有效的分离和鉴定,并初步建立了斑马鱼早期发育关键阶段sphere时期的蛋白质组表达图谱,以期为斑马鱼胚胎发育过程中蛋白质组学和调控机制的研究提供参考。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓红雨 范佳英 包军
对分娩圈中长白、大白母猪产前、产后的卧位、卧姿和卧向进行了观察,并就母猪对分娩圈空间的利用进行了研究。结果表明,母猪几乎不在采食区趴卧;长白母猪在趴卧区中央趴卧的机率约为50％,大白母猪在趴卧区四周趴卧的机率为67．54％～79．28％。母猪侧卧的机率极显著超过立卧(P<0．01);长白母猪哺乳期侧卧的机率明显高于妊娠期(P0．05)。母猪更愿意选择头朝外趴卧,且长白母猪的机率高于大白母猪,妊娠期的机率高于哺乳期(P<0．01)。
关键词：
母猪 妊娠期 哺乳期 行为 分娩圈
[期刊] 西南农业学报
[作者]
罗海玲 康红卫 马俊 琚茜茜 张力 史卫东
【目的】分析菜心-小菜蛾互作的生理和蛋白组变化规律,为明确菜心对小菜蛾取食的抗虫信号途径及防御机理提供理论依据。【方法】以四九菜心四叶幼苗为材料,测定菜心叶片接入小菜蛾24 h前后的碳水化合物代谢变化,并应用串联质量标签(tandem mass tag,TMT)标记联合高效液相色谱-质谱/质谱法(LCESI-MS/MS)技术鉴定菜心接入小菜蛾24 h前后的差异蛋白组变化。【结果】菜心接虫后较对照可溶性淀粉积累减少,可溶性蛋白及可溶性糖(包括蔗糖、还原糖)含量增加;本研究共筛选出差异表达蛋白430个(接虫后
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李文杨 刘远 吴贤锋 高承芳 黄勤楼
【目的】研究福清山羊与努比亚黑山羊发情期卵巢组织转录组差异表达水平,一方面为山羊繁殖性状形成的分子机制提供理论依据,另一方面为利用努比亚黑山羊杂交改良福清山羊提供可加快遗传进展的分子标记。【方法】利用转录组测序方法对福清山羊和努比亚黑山羊发情期卵巢组织进行研究,筛选品种间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对DEGs功能进行注释和若干基因荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证;同时通过与参考基因组比对,分析和筛选测序样品中存在的SNP/InDel。【结果】6个样品共得到46.68Gb Clean Data,DESeq分析发现了福清山羊和努比亚黑山羊发情期卵巢组织的DEGs149个(包含25个新转录本),其中表达上调53个,表达下调96个;初步认为输卵管素基因(oviductin,OVN)、类固醇合成快速调节蛋白基因(steroidogenic acute regulatory protein,STAR)、早期生长应答1基因(early growth response 1,EGR1)可作为福清山羊繁殖性能的候选基因。149个DEGs中的108个基因能被GO(gene ontology)数据库注释,30个DEGs能够被COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)数据库注释,91个DEGs能够被KEGG(kyoto encyclopediaof genes and genomes)数据库注释。KEGG通路分析表明DEGs共富集到21条信号通路中,6条通路显著富集。经过进一步的与参考基因组序列比对分析,共发掘1 506个新转录本。经qRT-PCR验证,所选基因(转录本)表达变化模式与转录组测序结果一致,表明测序结果可靠。【结论】在转录组水平上筛选出了福清山羊和努比亚黑山羊发情期卵巢组织的149个DEGs,发掘了1 506个新转录本,初步揭示了OVN、STAR和EGR1在山羊繁殖过程中可能发挥重要作用,为进一步探索山羊繁殖性状相关机理提供参考依据。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
于东立 宋晓欧 鲍亚林 林思远 王建升 王秀娟 卢唯 赵弘巍
[目的]水稻葡糖酸氧化酶1(OsGLO1)定位于水稻过氧化物酶体(peroxisome),参与过氧化氢的产生,但其是否参与水稻对稻瘟病抗性的调控还未见报道。本研究的目的是为了考察OsGLO1在水稻对稻瘟病抗性中的作用。[方法]以水稻‘日本晴’和稻瘟病病菌互作体系为研究对象,使用定量蛋白质组学技术,比较和分析了亲和型和非亲和型稻瘟病菌菌株侵染引起的水稻蛋白质表达变化。[结果]研究发现水稻OsGLO1蛋白的表达受到亲和型稻瘟病菌侵染的特异性抑制,但是在非亲和反应中的表达量变化则不明显。水稻原生质体过表达和沉默
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
祁晓晓 李学兵 周绪正 张继瑜 张振兴 吴培星
为实现流感病毒的简便快速检测,建立一种基于糖基化纳米粒子探针的荧光共振能量转移(FRET)检测方法。采用配体交换法,将合成的唾液酸寡糖链修饰到量子点和金纳米粒子表面,制备出了糖基化量子点和糖基化金纳米粒子,并对其理化性质进行了表征。结果表明:这2种纳米材料均具有良好的水溶性和光学特性,可分别作为能量供体和受体探针用于FRET检测体系;建立了一种基于FRET的唾液酸结合蛋白检测体系,麦胚凝集素(WGA),最低可检测浓度为4 nmol/L,证明该体系可快速(5 min)且灵敏地检测这种唾液酸结合蛋白。由于流感病毒表面的血凝素(HA)可特异性识别并结合唾液酸寡糖,本研究为进一步研发基于FRET的简单、快速的流感病毒检测方法奠定了基础。
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