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[期刊] 渔业科学进展
[作者]
谷龙春 黄桂菊 何毛贤 喻达辉
利用6对微卫星DNA分子标记对三亚和北海的大珠母贝群体进行遗传多样性分析。结果表明,两个群体的平均等位基因数A分别为10.5和9.7,平均有效等位基因数Ne为7.0和6.3,平均观察杂合度Ho为0.588和0.445,平均期望杂合度He为0.859和0.828,平均多态信息含量PIC为0.853和0.796;卡方检验发现只有位点Pmx+022、Pmx16-41和Pmx16-23在三亚种群中Hardy-Weinberg平衡偏离不显著(P>0.05),其他位点在两个种群都有不同程度的偏离。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张志伟 陈爱华 张志勇 陆勤勤 张朝晖 姚国兴 蔡永祥 吴杨平 曹奕 张雨
运用微卫星标记对大竹蛏(Solen grandis)辽宁丹东(DD)、河北秦皇岛(QHD)、山东日照(RZ)、江苏吕四(LS)和广西北海(BH)近海5个不同地理野生群体共计150个样品进行了遗传多样性分析。结果表明:14个位点多态信息含量范围为0.696~0.853,均呈现高度多态性,每个位点检测到的等位基因数8~22个,共检测到199个等位基因,平均等位基因数为14.2,等位基因丰富度为11.05,5个群体的期望杂合度分别为0.769(DD),0.791(QHD),0.826(RZ),0.815(LS),0.785(BH),观察杂合度分别为0.837(DD),0.812(QHD),0.875...
关键词：
大竹蛏 微卫星 野生群体 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
宋春妮 李健 刘萍 陈萍 高保全
利用10对微卫星引物对我国大连黑石礁(DL)、莱州湾(LZ)、青岛鳌山湾(QD)、海州湾(HZ)4个日本蟳野生群体的遗传多样性进行了分析。结果表明,不同引物获得的等位基因数从11～17不等,10个位点其平均等位基因数为13.600 0,平均有效等位基因数为8.592 0;各位点的平均观测杂合度(Ho)为0.318 2～0.858 4,平均期望杂合度(He)为0.846 6～0.923 9;平均多态信息含量(PIC)为0.828 0～0.914 0,说明各位点在4个日本蟳野生群体内均表现出很高的遗传多样性水平。各群体间遗传分化较大,基因分化指数(FST)为0.032 74～0.088 03。群体...
关键词：
日本蟳 野生群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
贾舒雯 刘萍 李健 李吉涛 高保全 陈萍 潘鲁青
利用12对微卫星标记分析了莱州湾(LZ)、海州湾(HZ)、象山(XS)脊尾白虾野生群体的遗传多样性。12个位点在3个群体中均表现出高度的多态性。12个微卫星位点共得到115个等位基因,各个位点的等位基因数介于6~14,平均每个位点上的等位基因数为9.583 3个;各个位点的平均期望杂合度(He)、平均观测杂合度(Ho)、平均多态信息含量(PIC)分别为0.8278、0.517 5、0.705 1,表明3个脊尾白虾野生群体均有良好的多态性。经F-统计分析,各个群体间的遗传分化指数均值为0.093 0(0.05
关键词：
脊尾白虾 野生群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
宋炜 孟永永 蒋科技 赵明 任桂静 张凤英 马凌波
为研究中国沿海地区棘头梅童鱼群体的遗传多样性,利用微卫星标记技术,采用9对微卫星引物对中国连云港(LYG)、大丰(DF)、崇明(CM)、舟山(ZS)、温州(WZ)、宁德(ND)、厦门(XM)棘头梅童鱼7个野生群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果显示,实验检测到63个等位基因,各位点等位基因数为313个,有效等位基因数为1.75108.0317;各位点的观测杂合度(Ho)为0.35960.7854,期望杂合度(He)为0.43000.8780;多态信息含量(PIC)为0.36040.8631,其中有2
关键词：
棘头梅童鱼 野生群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
毛守康 马爱军 丁福红 闫喜武 罗海忠 李伟业 徐宝荣 王怀忠 王宝义 王广宁
利用１４对微卫星引物，对采捕于辽宁葫芦岛、山东青岛、江苏连云港以及浙江舟山附近海域的梭鱼（Ｌｉｚａ ｈａｅｍａｔｏｃｈｅｉＬａ）４个野生地理群体进行群体遗传多样性分析。结果显示，１４对微卫星引物均能扩增出清晰的条带且具有一定的多态性，４个野生群体的多态性百分率分别为９２．８６％、９２．８７％、１００．００％和８５．７１％。４个群体共扩增出６１个等位基因，４个群体的等位基因数为３．７８６－４．０００，有效等位基因数为２．６７３－２．８９９，观测杂合度为０．３５９－０．３８９，期望杂合度为０．５０３－０．５６１，多态信息含量为０．４６５－０．５１３，说明４个群体遗传多样性处于中等多态水平。运用ＳＰ．．．
关键词：
梭鱼 地理群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
冯建彬 吴春林 丁怀宇 华雪铭 李应森 李家乐
利用微卫星标记分析了洪泽湖避风港、蒋坝、鲍集等9个日本沼虾(Macrobrachium nipponense)野生群体的遗传多样性。结果表明,8个微卫星位点呈现高度多态性;每个群体中至少有5个位点显示杂合不足,显著偏离了Hardy-Weinberg平衡;9个日本沼虾野生群体均表现出较高的遗传多样性水平,洪泽湖中、东部避风港和蒋坝等群体遗传多样性高于西部鲍集和界集群体。突变-漂移平衡分析表明,洪泽湖日本沼虾群体部分位点杂合显著过剩,表明洪泽湖日本沼虾群体部分位点偏离了突变-漂移平衡,但近期没有经历过瓶颈效应,群体数量也没有下降。群体间F-统计量及AMOVA分析表明,群体遗传分化极显著(F ST=...
关键词：
洪泽湖 日本沼虾 微卫星 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
田吉腾 刘志鸿 杨爱国 吴彪 周丽青
利用多态性好的20对微卫星引物,对中国日照、黄岛、蓬莱和韩国的4个魁蚶地理群体进行了遗传多样性分析。结果显示,20个位点在4个群体中的等位基因数为3~17,平均等位基因数为8.35,平均有效等位基因数为6.230 6;观测杂合度(Ho)为0.466 7~0.966 7;期望杂合度(He)为0.619 8~0.931 8;多态信息含量(PIC)为0.530 1~0.909 3,表现出高的遗传多样性水平。4个群体间的遗传分化指数(Fst)在0.013 2~0.031 4之间,呈现出较低的遗传分化。群体间的遗传距离在0.125 5~0.245 8之间;通过构建UPGMA聚类树,显示日照群体和黄岛群体...
关键词：
魁蚶 微卫星 地理群体 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
侯仕营 马爱军 王新安 黄智慧 薛宝贵 杨志 曲江波
利用12对微卫星分子标记对大菱鲆Scophthalmus maximus 4个引进地理群体进行遗传多样性分析。结果表明,等位基因数(A)为2~10个,平均等位基因数为4.3,有效等位基因数(Ne)为1.6~6.1,平均有效等位基因数为2.7,各位点的杂合度观测值(Ho)为0.0000~0.5625,杂合度期望值(He)为0.3823~0.8416。各群体之间无偏倚杂合度期望值由小到大依次为丹麦群体、英国群体、法国群体、挪威群体,运用SPSS软件对无偏倚杂合度期望值进行Kruskal-Wallis检验,其结果(H=4.438,df=3,P=0.218)表明,4个群体的遗传多样性差异不显著。群体间...
关键词：
大菱鲆 地理群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
高红梅 马海涛 喻子牛 张跃环 肖述 黄飘逸 彭建军
采用磁珠富集和PCR筛选相结合的方法,得到番红砗磲的19个多态性微卫星标记。利用新开发微卫星标记对西沙群岛2个野生群体的遗传多样性进行比较分析,七连屿海域野生群体和永兴岛海域野生群体的平均观测等位基因数(Na)分别为11.105、11.895,平均有效等位基因数(Ne)分别为6.274、6.173,平均期望杂合度(He)分别为0.776、0.788,平均多态性信息含量分别为0.730、0.744,发现2个野生群体的遗传多样性都处于高度多态水平,说明其有效群体大小仍然保持在较高水平。Bonferroni校正后,在2个群体中各有4个位点偏离Hardy-Weinberg平衡。另外分析了这些引物在近缘种中的通用性情况,发现鳞砗磲中有7对微卫星引物具有通用性,6对具有多态性;无鳞砗磲中有3对微卫星引物具有通用性,1对具有多态性;诺瓦砗磲中有5对微卫星引物具有通用性,5对具有多态性;长砗磲中有9对微卫星引物具有通用性,8对具有多态性;砗蚝中有2对引物具有通用性,2对具有多态性。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
梁利群 冯国军 常玉梅 汪海燕
采用7个微卫星标记,研究了鲤(Cyprinus carpio)、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系(Cyprinus carpio var.wananensis)三个群体的遗传变异。结果显示,鲤野生群体、高寒鲤、荷包红鲤抗寒品系的平均杂合度分别为0.276、0.147、0.0952,平均无偏倚杂合度期望值为0.431、0.355、0.305。鲤野生群体的杂合度明显高于其他两个养殖品种,说明其较其他两个养殖品种的遗传多样性丰富。
[期刊] 华北农学报
[作者]
杨洁 周丹银 黎仁军 赵文正 苗永旺 和绍禹
为了阐明大蜜蜂的群体遗传特征,评价云南地区大蜜蜂的遗传多样性,本研究利用14对微卫星引物对采自云南省的35群野生大蜜蜂进行了群体遗传变异检测和遗传多样性分析。在大蜜蜂群体中共检测到51个等位基因,平均等位基因数为3.642 9,平均有效等位基因数2.809 2,平均期望杂合度为0.573 0,平均多态信息含量为0.524 3。根据Nei's遗传距离用UPGMA方法对35群大蜜蜂进行亲缘关系分析,结果聚为A,B,C,D共4个支系。结果表明云南大蜜蜂群体遗传多样性相对贫乏,分化程度较低。
[期刊] 水产学报
[作者]
冯建彬 马克异 李家乐 华雪铭 丁怀宇
采用(CT)15、(CA)15两种生物素标记及磁珠富集法构建了太湖日本沼虾基因组微卫星富集文库。120个微卫星克隆中83个位点的核心序列重复在10个以上,长度介于191～580bp,平均为311bp;重复类型中,(CA/GT)n及(AG/TC)n分别占59.09%及20.45%,还检测到(GC)n、(AAG)n、(ACAA)n和(GGCAGA)n等17种类型,包括25.75%完美型、20.45%非完美型和53.80%复合性。用其中12条微卫星引物扩增吴江、滨湖、宜兴和吴兴4个群体240个个体的基因组DNA,各位点表现出较高的遗传多样性,除Mni86、Mni103和Mni114外,其它群体位点大...
关键词：
日本沼虾 微卫星引物 筛选 遗传多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张亚妮 张恩平 吴迪 张涛 李相运 任战军 耿社民
采用5个微卫星引物对2个藏猪类群(合作猪和迪庆猪)及参照群体成华猪的遗传多样性进行了研究。结果表明,所选的5个微卫星引物均具有多态性,3个猪种在5个位点的等位基因数为4～8个;合作猪、迪庆猪和成华猪在5个位点的平均有效等位基因数分别为4.5104,3.0696和3.1250,位点平均杂合度分别为0.7713,0.6405和0.5197,平均多态信息含量分别为0.7402,0.5656和0.5798;遗传分化系数表明,2个藏猪类群间亲缘关系较近(GST=22.07%),二者与成华猪的关系较远(GST=22.46%,GST=31.11%)。
关键词：
藏猪 微卫星 遗传多样性
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
夏婷婷 周丽 陈兴勇 匡厚坤 耿照玉
利用14个微卫星标记分析安徽省地方品种巢湖麻鸭群体的遗传多样性.结果表明,14个微卫星标记在巢湖麻鸭群体中共检测出48个等位基因,每个基因座平均等位基因数为3.43个,各个基因的基因频率分布在0.0265-0.9735之间,14个微卫星座位的多态信息含量在0.1866-0.9471之间,有效等位基因数为2-6个,基因遗传杂合度变化范围为0.0516-0.8054.群体遗传结构显示巢湖麻鸭核心群存在一定的遗传多样性,可用于巢湖麻鸭的定向选育.
关键词：
巢湖麻鸭 微卫星标记 群体遗传多样性
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