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[期刊] 西南农业学报
[作者]
王琳 严达伟 马黎 张博 王莉兴 张浩 董新星
【目的】为筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂沉积差异的关键基因并分析其调控途径。【方法】对体重长至40、80、120 kg的大型迪庆藏猪背脂组织进行转录组测序，测序数据进行拼接、比对、注释并进行功能富集分析、STEM趋势分析和互作网络分析。【结果】10～40 kg（S1阶段）与40～80 kg（S2阶段）、S2阶段与80～120 kg（S3阶段）比较分别筛选到845个、558个显著差异表达基因（DEGs）；差异表达基因STEM趋势分析显示，模块0、3和4的基因随大型迪庆藏猪体重增加而下调表达，模块14的基因先上调后轻微下调；显著差异基因互作网络显示，在模块0、3和4的基因互作网络中，PTGER3、CPT1B、LPIN3基因位于核心位置，PTGER3下调抑制脂肪分解、促进脂肪细胞增大，CPT1B下调降低脂肪酸氧化能力、导致甘油三酯增多，LPIN3下调维持脂质稳态；在模块14的基因互作网络中，AACS、SOCS3、AQP3、RPS6KA1位于核心位置，AACS上调促进脂肪细胞分化、脂肪细胞数量增多，SOCS3、RPS6KA1上调促进脂肪生成，AQP3上调促进脂肪细胞内甘油三酯增多，这与大型迪庆藏猪随体重增加背膘厚显著增加，但S1阶段与S2阶段背膘厚的增幅大于S2阶段与S3阶段的结果一致；对PTGER3、AACS等15个差异基因进行qPCR验证，定量结果与转录组结果一致。【结论】本研究筛选到15个调控大型迪庆藏猪背膘厚的潜在候选基因，可为迪庆藏猪的遗传改良提供参考。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
聂靖茹 张博 马黎 张浩 李国美 严达伟 董新星
为筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长差异的关键基因并分析其调控途径，以40、80和120kg的大型迪庆藏猪为对象，基于RNA-seq技术对背最长肌组织进行转录组测序，对获得的测序数据进行拼接、比对、注释和差异分析，筛选与肌肉生长相关的差异基因进行STEM趋势分析、功能分析并构建差异基因互作网络。结果表明：1)10～40kg阶段与40～80kg阶段、40～80kg阶段与80～120kg阶段比较共检测到730个、981个基因显著差异表达；2）差异表达基因STEM趋势分析显示，共有4个差异显著模块，模块11和14的差异基因先上调表达后轻微下调；模块9和10的差异基因先上调后下调表达；3）差异基因互作网络显示，10～40kg vs 40～80kg,FOS基因位于调控网络核心，与EGRs、CCL2和NOR-1等基因有互作关系，NOR-1基因上调导致肌肉生长速度加快，FOS基因下调抑制肌源性分化，EGRs基因下调导致胶原纤维束减少，CCL2基因下调导致肌肉再生受损；40～80kg vs 80～120kg,FOXO1、PDK4和PPARD等基因位于网络中心，SFRPs基因上调阻止成肌细胞终末分化，FZD7基因下调减缓肌纤维肥大速度，FOXO1下调导致肌生长抑制素mRNA下降减缓肌肉萎缩进程，PPARD与FOXO1均降低PDK4含量从而使肌肉丙酮酸脱氢酶复合物活性增强，对碳水化合物氧化和葡萄糖摄取增加，肌纤维变粗，与大型迪庆藏猪40至80kg生长速度显著快于10至40kg阶段，而80kg之后缓慢下降的规律吻合；4）挑选了12个差异基因进行qPCR验证，EGR1、SFRP1和FOXO1等12个基因定量验证结果与转录组测序结果一致。综上，本研究利用RNA-seq技术筛选出12个影响大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长的差异基因，可为解析地方猪肌肉生长的遗传调控机制、应用分子标记辅助选择提高迪庆藏猪瘦肉产量提供参考。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
付言峰 李兰 周艳红 李碧侠 方晓敏 王学敏 任守文
［目的］研究瘦素受体（ｌｅｐｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，ｌｅｐｒ）的ｍｒｎＡ表达和编码序列单核苷酸多态性（ｃ ＳｎｐＳ）对猪脂肪沉积性状的影响。［方法］本文旨在利用实时荧光定量ｐｃｒ（ｒｔ－ｑ ｐｃｒ）方法和免疫印迹方法检测了该基因在高脂猪和低脂猪背最长肌、背膘、心、肝和肾共５种组织样中的ｍｒｎＡ和蛋白表达量，利用直接测序方法检测了ｌｅｐｒ第１８外显子ｃ ＳｎｐＳ，并对ｌｅｐｒ表达量、编码序列单核苷酸多态位点与苏钟猪脂肪沉积相关性状进行了关联分析。［结果］ｒｔ－ｑ ｐｃｒ结果表明：ｌｅｐｒ ｍｒｎＡ在这５种组织中均有表达，且差异显著（ｐ＜０．０５），其中背膘组织中的表达量显著高于其他组织（ｐ＜０．．．
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
吴绿草 董世雄 段梦琪 刘思源 陈莹 张健 严飞飞 强巴央宗 商鹏
为探究猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性,在DNA水平上对藏猪、大白猪ARID5B(AT-rich interaction domain 5B)基因5′侧翼区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选;在mRNA水平上对两猪种的肝脏、背脂和背最长肌组织中的ARID5B基因表达量进行了RT-qPCR检测;并对两猪种的背膘厚和背最长肌组织中IMF(Intramuscular fat)含量进行测定。结果表明:在ARID5B基因5’侧翼区,存在T-2 216C和In-2 029Del缺失2个连锁突变位点,藏猪与大白猪呈极显著差异(P<0.01);在相同组织不同品种间,ARID5B基因在肝脏、背脂和背最长肌中mRNA相对表达量趋势完全一致,且藏猪ARID5B基因表达量均极显著低于大白猪(P<0.01);藏猪背膘厚和IMF含量均极显著高于大白猪(P<0.01);经DNA、mRNA水平、背膘厚和IMF含量相关性分析发现,ARID5B基因mRNA相对表达量与背膘厚和IMF含量呈显著负相关(P<0.05)。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈晓晖 吕学斌 何志平 龚建军 应三成 曾凯 李正确 刘锐 杨雪梅 梁艳
选择出生1月龄左右藏猪54头,分别在1、2、3、4、5、6、12月龄时进行胴体性能和肉质特性测定,结果表明:随着月龄的增加腹油、背膘厚、皮厚、眼肌面积呈上升趋势;屠宰率在1~6月龄之间变化不大,而在12月龄时增加较多;瘦肉率、前后腿比例、前腿、背腰、后腿中瘦肉率均随月龄增加呈下降趋势。在肉质特性方面,从pH值、Opto值、LF值、肌肉含水量、脂肪IMF、滴水损失等数据来看,藏猪不同阶段肉质指标均属肉质优。
关键词：
藏猪 胴体性能 肉质特性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
毋玉婷 郭宝英 祁鹏志 吕振明 吴常文 史会来 平洪领
Phb2是抗增殖蛋白(Prohibitin)的一个亚型。本研究利用RACE技术首次获得了曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)Phb2基因的全长序列,该序列全长为1283 bp,其中5′非编码区(5′-UTR)150 bp,3′非编码区(3′-UTR)236 bp,开放阅读框(ORF)897 bp,预测编码298个氨基酸。序列分析表明,曼氏无针乌贼Phb2基因编码的蛋白无信号肽,第2042位氨基酸为跨膜结构,包含1个PHB家族的结构域。采用荧光定量PCR技术检测其在曼氏无针乌贼不同生长时期(幼
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
张庆文 张天杨 孔杰 栾生
为培育优良大菱鲆养殖品种,收集来源于不同国家、不同地区和不同批次的大菱鲆亲鱼8批,从各群体中挑选性腺发育良好的个体,利用不平衡巢式设计方法和人工授精技术,每条雄鱼个体配两条雌鱼个体,共构建38个父系半同胞和76个母系全同胞,分别测定了每个家系生长到25和80日龄的体重、全长和体长,利用父系半同胞组内相关法估计各性状之间的相关性。对大菱鲆遗传相关分析表明,体重和全长的遗传相关系数为0.95,体重和体长的遗传相关系数为0.88和1.00,全长和体长的遗传相关系数为0.99。对大菱鲆表型相关分析表明,体重和全长的表型相关系数为0.881,体重和体长的表型相关系数为0.622和0.871,全长和体长的...
关键词：
大菱鲆 生长性状 遗传相关 表型相关
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
侯建君 施正香 李保明
体型特征参数是了解不同生长阶段猪的生长发育情况,开展猪的育种和养猪设施、设备等工程配套技术研究的重要参考参数。选取4个不同生长阶段长白猪的6个体型特征参数进行了主成分分析,结果表明:不同阶段长白猪各体型特征参数之间均呈现显著的正相关(P<0.01),其中以胸围与体重的相关性最为明显。不同日龄猪的主成分因子有所不同,1日龄的第一主成分为长度因子,第二主成分为高度因子;28日龄、70日龄和150日龄的第一主成分为宽度因子,第二主成分为长度因子;1日龄和70日龄的第三主成分为长度因子,28日龄和150日龄的为高度因子。不同生长阶段长白猪在长、宽、高方向的生长速率存在一定差异。
关键词：
长白猪 体型特征 相关性 主成分分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵茜 罗梅 夏雪岩
对约翰逊草、四沈甜、四6A及其杂交后代饲草的营养成分进行分析,结果表明,四倍体高粱与约翰逊草杂交种及分离世代粗蛋白在孕穗期达到最高,粗脂肪含量以抽穗期最高,单位能量值和单株生物产量以抽穗期最高。综合各营养成分含量分析认为,抽穗期有效养分含量较高,能量达到最大值,为刈割的最佳时期。四沈甜×约翰逊草杂交种粗蛋白含量在8%~10.3%,F3达到10.36%。为开展高粱与约翰逊草杂交选育优质饲料作物提供参考及依据。
[期刊] 自然资源学报
[作者]
邱甜甜 刘国彬 王国梁 孙利鹏 姚旭
研究深层土壤碳库动态对了解陆地生态系统深层碳汇潜力、应对全球ＣＯ２升高具有重要意义。论文以黄土丘陵区人工油松林为研究对象，以撂荒地为参照，分析了不同生长阶段的人工油松林地０～２００ Ｃｍ土层土壤有机碳（ｓＯｉｌ ＯｒｇａｎｉＣ ＣａｒｂＯｎ，ｓＯＣ）和活性有机碳（ｒｅａｄｉｌｙ Ｏｘｉｄｉｚａｂｌｅ ＣａｒｂＯｎ，ｒＯＣ）动态变化特征及其影响因素。结果表明：在０～２００ Ｃｍ剖面上，不同生长阶段油松林ｓＯＣ含量及储量较撂荒地显著提高。浅层（０～１００ Ｃｍ）ｓＯＣ平均含量，成熟林为撂荒地的２．０３倍，提高最大；其次是中龄林，为１．８５倍；最后是幼龄林，为１．５９倍。深层（１００～２００ Ｃｍ）．．．
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
薛春阳 汪秀星 王晓娜 刘红林 徐银学 程占军 陈杰
采取90头180日龄去势苏太猪的背最长肌组织测定肌内脂肪含量,从中选取肌内脂肪含量差异极显著(P<0.05)。提...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
吴曼 刘宝锁 黄桂菊 陈明强 范嗣刚 喻达辉
为了研究合浦珠母贝(Pinctada fucata)不同生长阶段基因型与环境的互作效应,从2012年1月在海南构建的家系中选取生长快、中、慢3个典型家系(分别编号为F1、F2和F3),于海南陵水黎安、广东湛江覃斗和广西防城白龙3个不同海区进行养殖试验,每个海区每个家系的放养数量为800个,养殖1年。采用方差和加性主效应乘积交互作用(additive main effects and multiplicative interaction,AMMI)模型对各家系不同生长阶段壳长、壳高、壳宽和体重4个性状的基因型与环境互作效应进行分析。结果显示,不同海区间合浦珠母贝的生长差异显著(P<0.05),其...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
葛永怡 吴石平 谭玉梅 刘永翔 刘作易
冠突散囊菌（Ｅｕｒｏｔｉｕｍ ｃｒｉｓｔａｔｕｍ）闭囊壳的产生和数量受各种与有性产孢相关的基因控制，而ｍａｔ基因（ｍａｔｉｎｇ ｔｙｐＥ ｇＥｎＥ，ｍａｔ）是其中的关键基因之一，为调查ｍａｔ基因在冠突散囊菌不同发育阶段的表达量变化，应用实时荧光定量ｐｃｒ技术对该菌的营养生长时期、无性产孢时期和有性产孢时期３个阶段的ｍａｔ基因表达量进行检测。结果显示：以营养生长时期为对照，在有性产孢时期ｍａｔ１－１－１基因上调３１．１２倍，ｍａｔ１－２－１基因上调５．８７倍；在无性产孢时期ｍａｔ１－１－１基因上调４．２５倍，ｍａｔ１－２－１基因仅为对照的０．０３倍。表明，ｍａｔ基因与冠突散囊菌的有性产孢相关，其．．．
[期刊] 中国农业科学
[作者]
蔡更元 陈瑶生 李加琪 张豪 王翀
【目的】寻找肉质性状候选优势表达基因,研究猪肉质优良性状的遗传基础和分子机制。【方法】利用抑制性消减杂交技术构建蓝塘猪和大白猪肌肉组织差异表达的消减cDNA文库,利用实时荧光定量PCR法研究基因的差异表达。【结果】获得61个有效克隆。对整个文库进行测序分析,获得47条有效序列。用BLAST在线软件与GenBank和GenBank EST等数据库进行同源序列比较,发现其中有2条未知序列。对文库中所包含的MYL1、LDHA、KPNA3、TPM3、HUMMLC2B、GNTN和Oaz等基因进行了实时荧光定量PCR检测,结果显示MYL1、LDHA、KPNA3、TPM3和HUMMLC2B这5个基因在蓝塘猪...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
束刚 冯嘉颖 余凯凡 徐平稳 朱晓彤 高萍 王松波 习欠云 王修启 张永亮 江青艳
【目的】脂肪酸转位酶(fatty acid translocase,FAT/CD36)是介导脂肪酸跨膜转运和脂肪细胞聚脂的重要载体蛋白。本试验采用主动免疫法研究FAT/CD36在鸡脂肪沉积调控中的作用。【方法】将FAT/CD36膜外区抗原表位基因片段克隆入表达载体pET-32a(+),并转化在大肠杆菌BL21(DE3),构建FAT/CD36融合蛋白表达载体。主动免疫试验选取22日龄黄羽肉鸡60只,按公、母各随机分为2组,共4组。公鸡和母鸡的试验组分别在第34、49、和63天肌肉注射1mg重组鸡FAT/CD36融合蛋白,以牛血清白蛋白(bovineserumalbumin,BSA)为对照。【结果...
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