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[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
聂靖茹 张博 马黎 张浩 李国美 严达伟 董新星
为筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长差异的关键基因并分析其调控途径，以40、80和120kg的大型迪庆藏猪为对象，基于RNA-seq技术对背最长肌组织进行转录组测序，对获得的测序数据进行拼接、比对、注释和差异分析，筛选与肌肉生长相关的差异基因进行STEM趋势分析、功能分析并构建差异基因互作网络。结果表明：1)10～40kg阶段与40～80kg阶段、40～80kg阶段与80～120kg阶段比较共检测到730个、981个基因显著差异表达；2）差异表达基因STEM趋势分析显示，共有4个差异显著模块，模块11和14的差异基因先上调表达后轻微下调；模块9和10的差异基因先上调后下调表达；3）差异基因互作网络显示，10～40kg vs 40～80kg,FOS基因位于调控网络核心，与EGRs、CCL2和NOR-1等基因有互作关系，NOR-1基因上调导致肌肉生长速度加快，FOS基因下调抑制肌源性分化，EGRs基因下调导致胶原纤维束减少，CCL2基因下调导致肌肉再生受损；40～80kg vs 80～120kg,FOXO1、PDK4和PPARD等基因位于网络中心，SFRPs基因上调阻止成肌细胞终末分化，FZD7基因下调减缓肌纤维肥大速度，FOXO1下调导致肌生长抑制素mRNA下降减缓肌肉萎缩进程，PPARD与FOXO1均降低PDK4含量从而使肌肉丙酮酸脱氢酶复合物活性增强，对碳水化合物氧化和葡萄糖摄取增加，肌纤维变粗，与大型迪庆藏猪40至80kg生长速度显著快于10至40kg阶段，而80kg之后缓慢下降的规律吻合；4）挑选了12个差异基因进行qPCR验证，EGR1、SFRP1和FOXO1等12个基因定量验证结果与转录组测序结果一致。综上，本研究利用RNA-seq技术筛选出12个影响大型迪庆藏猪不同生长阶段肌肉生长的差异基因，可为解析地方猪肌肉生长的遗传调控机制、应用分子标记辅助选择提高迪庆藏猪瘦肉产量提供参考。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王琳 严达伟 马黎 张博 王莉兴 张浩 董新星
【目的】为筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂沉积差异的关键基因并分析其调控途径。【方法】对体重长至40、80、120 kg的大型迪庆藏猪背脂组织进行转录组测序，测序数据进行拼接、比对、注释并进行功能富集分析、STEM趋势分析和互作网络分析。【结果】10～40 kg（S1阶段）与40～80 kg（S2阶段）、S2阶段与80～120 kg（S3阶段）比较分别筛选到845个、558个显著差异表达基因（DEGs）；差异表达基因STEM趋势分析显示，模块0、3和4的基因随大型迪庆藏猪体重增加而下调表达，模块14的基因先上调后轻微下调；显著差异基因互作网络显示，在模块0、3和4的基因互作网络中，PTGER3、CPT1B、LPIN3基因位于核心位置，PTGER3下调抑制脂肪分解、促进脂肪细胞增大，CPT1B下调降低脂肪酸氧化能力、导致甘油三酯增多，LPIN3下调维持脂质稳态；在模块14的基因互作网络中，AACS、SOCS3、AQP3、RPS6KA1位于核心位置，AACS上调促进脂肪细胞分化、脂肪细胞数量增多，SOCS3、RPS6KA1上调促进脂肪生成，AQP3上调促进脂肪细胞内甘油三酯增多，这与大型迪庆藏猪随体重增加背膘厚显著增加，但S1阶段与S2阶段背膘厚的增幅大于S2阶段与S3阶段的结果一致；对PTGER3、AACS等15个差异基因进行qPCR验证，定量结果与转录组结果一致。【结论】本研究筛选到15个调控大型迪庆藏猪背膘厚的潜在候选基因，可为迪庆藏猪的遗传改良提供参考。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
闫允君 卢霞 孟宪红 栾生 陈宝龙 孔杰
Myostatin (Mstn)即肌肉生长抑制素，在脊椎动物中是胚胎期肌肉形成和成体肌肉生长的主要调控因子之一，通过抑制肌细胞的扩增和分化而抑制肌肉的生长和发育。为了筛选在中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)中Mstn调控的肌肉生长相关的基因，为肌肉生长调控机理奠定基础，本研究利用RNA-Seq技术对PBS对照组和Mstn表达抑制组进行了测序分析。结果显示，Mstn表达被抑制后共筛选到1657个差异表达基因，其中，805个显著上调，852个显著下调。参考脊椎动物Mstn调控的肌肉生长经典信号通路TGF-β/Smad和MAPK通路和差异基因功能的已有报道，初步筛选出29个Mstn调控的与肌肉生长相关的基因。在涉及TGF-β/Smad和Mapk通路的16个基因中，除ActRI被检测到略微上调外，其他基因均表现出不同程度的下调；在另外13个涉及蜕皮、肌肉生长等过程的基因中，促进肌肉生长的基因显示为上调。前期的研究表明，Mstn可能同脊椎动物功能类似，在中国对虾中负向调控肌肉生长，而本研究结果提供了进一步的证据，为阐明对虾的肌肉发育调控机制提供了重要基础。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈晓晖 吕学斌 何志平 龚建军 应三成 曾凯 李正确 刘锐 杨雪梅 梁艳
选择出生1月龄左右藏猪54头,分别在1、2、3、4、5、6、12月龄时进行胴体性能和肉质特性测定,结果表明:随着月龄的增加腹油、背膘厚、皮厚、眼肌面积呈上升趋势;屠宰率在1~6月龄之间变化不大,而在12月龄时增加较多;瘦肉率、前后腿比例、前腿、背腰、后腿中瘦肉率均随月龄增加呈下降趋势。在肉质特性方面,从pH值、Opto值、LF值、肌肉含水量、脂肪IMF、滴水损失等数据来看,藏猪不同阶段肉质指标均属肉质优。
关键词：
藏猪 胴体性能 肉质特性
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
吴丹 江敏 吴昊 戴习林 余苗苗 金若晨 孙世玉 王旭娜 姚丹
分析凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)在大棚养殖(40、60、74、94 d)和露天养殖(40、60、80、95 d)模式下相近生长阶段肌肉中水解氨基酸和脂肪酸的组成和含量,并对其营养价值进行评价。结果表明:(1)在大棚养殖和露天养殖模式下,凡纳滨对虾肌肉中粗蛋白、粗脂肪和粗灰分的含量在其相近生长阶段间无显著性差异。(2)大棚养殖模式下,凡纳滨对虾生长至40、60、74、94 d时的不饱和脂肪酸分别占脂肪酸总量的64.46%、60.97%、62.47%、63.16%;露天养殖模式下,凡纳滨对虾生长至40、60、80、95 d时的不饱和脂肪酸含量分别占脂肪酸总量的67.69%、64.74%、65.35%、65.63%。两种养殖模式下凡纳滨对虾肌肉均含丰富的不饱和脂肪酸,且大棚养殖模式下凡纳滨对虾在其相近生长阶段的多不饱和脂肪酸显著(P
[期刊] 中国农业科学
[作者]
孙伟 唐中林 谭林 雷初朝 李奎
【目的】研究HMGCS1基因对猪骨骼肌生长发育的影响及其靶标的验证。【方法】采用real-time PCR对通城猪不同组织以及背最长肌不同发育时间点的HMGCS1基因的表达变化进行检测。【结果】①HMGCS1基因在成年猪肺组织中的表达量最高;②在背最长肌发育中,该基因分别在胚胎期33和65 d高表达,出生后20、30、40和60 d低表达;③双荧光素酶试验显示,转染miR-18a/b minics组荧光素酶活性低于对照组。【结论】HMGCS1参与了猪骨骼肌生长发育过程,并受miR-18a/b的调控,是猪的产肉性状的潜在候选基因。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
单艳菊 徐文娟 陈剑 宋卫涛 束婧婷 陶志云 李慧芳
为探讨不同鸭种胚胎期和初生早期胸肌和腿肌中甲状腺激素受体(TRα)基因表达水平的发育性变化及其对胸肌质量、腿肌质量和胚质量(或体质量)的影响,选用生长速度差异较大的高邮鸭和金定鸭为研究材料,采用实时荧光定量PCR方法检测两鸭种13、17、21、25、27胚龄和出雏后7日龄时胸肌和腿肌中TRαmRNA的表达水平。结果表明:在鸭胚胎期和初生早期,两鸭种肌肉TRαmRNA的表达趋势较为一致,即在胸肌中呈"W"形,在腿肌中呈前高后低的表达规律。在13、17和21胚龄时两鸭种胸肌TRαmRNA的表达量均极显著低于腿肌(P<0.01),而在25、27胚龄和7日龄时则均高于腿肌。相关性分析表明:两鸭种胸肌中...
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
张庆文 张天杨 孔杰 栾生
为培育优良大菱鲆养殖品种,收集来源于不同国家、不同地区和不同批次的大菱鲆亲鱼8批,从各群体中挑选性腺发育良好的个体,利用不平衡巢式设计方法和人工授精技术,每条雄鱼个体配两条雌鱼个体,共构建38个父系半同胞和76个母系全同胞,分别测定了每个家系生长到25和80日龄的体重、全长和体长,利用父系半同胞组内相关法估计各性状之间的相关性。对大菱鲆遗传相关分析表明,体重和全长的遗传相关系数为0.95,体重和体长的遗传相关系数为0.88和1.00,全长和体长的遗传相关系数为0.99。对大菱鲆表型相关分析表明,体重和全长的表型相关系数为0.881,体重和体长的表型相关系数为0.622和0.871,全长和体长的...
关键词：
大菱鲆 生长性状 遗传相关 表型相关
[期刊] 中国水产科学
[作者]
毋玉婷 郭宝英 祁鹏志 吕振明 吴常文 史会来 平洪领
Phb2是抗增殖蛋白(Prohibitin)的一个亚型。本研究利用RACE技术首次获得了曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)Phb2基因的全长序列,该序列全长为1283 bp,其中5′非编码区(5′-UTR)150 bp,3′非编码区(3′-UTR)236 bp,开放阅读框(ORF)897 bp,预测编码298个氨基酸。序列分析表明,曼氏无针乌贼Phb2基因编码的蛋白无信号肽,第2042位氨基酸为跨膜结构,包含1个PHB家族的结构域。采用荧光定量PCR技术检测其在曼氏无针乌贼不同生长时期(幼
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
侯建君 施正香 李保明
体型特征参数是了解不同生长阶段猪的生长发育情况,开展猪的育种和养猪设施、设备等工程配套技术研究的重要参考参数。选取4个不同生长阶段长白猪的6个体型特征参数进行了主成分分析,结果表明:不同阶段长白猪各体型特征参数之间均呈现显著的正相关(P<0.01),其中以胸围与体重的相关性最为明显。不同日龄猪的主成分因子有所不同,1日龄的第一主成分为长度因子,第二主成分为高度因子;28日龄、70日龄和150日龄的第一主成分为宽度因子,第二主成分为长度因子;1日龄和70日龄的第三主成分为长度因子,28日龄和150日龄的为高度因子。不同生长阶段长白猪在长、宽、高方向的生长速率存在一定差异。
关键词：
长白猪 体型特征 相关性 主成分分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵茜 罗梅 夏雪岩
对约翰逊草、四沈甜、四6A及其杂交后代饲草的营养成分进行分析,结果表明,四倍体高粱与约翰逊草杂交种及分离世代粗蛋白在孕穗期达到最高,粗脂肪含量以抽穗期最高,单位能量值和单株生物产量以抽穗期最高。综合各营养成分含量分析认为,抽穗期有效养分含量较高,能量达到最大值,为刈割的最佳时期。四沈甜×约翰逊草杂交种粗蛋白含量在8%~10.3%,F3达到10.36%。为开展高粱与约翰逊草杂交选育优质饲料作物提供参考及依据。
[期刊] 自然资源学报
[作者]
邱甜甜 刘国彬 王国梁 孙利鹏 姚旭
研究深层土壤碳库动态对了解陆地生态系统深层碳汇潜力、应对全球ＣＯ２升高具有重要意义。论文以黄土丘陵区人工油松林为研究对象，以撂荒地为参照，分析了不同生长阶段的人工油松林地０～２００ Ｃｍ土层土壤有机碳（ｓＯｉｌ ＯｒｇａｎｉＣ ＣａｒｂＯｎ，ｓＯＣ）和活性有机碳（ｒｅａｄｉｌｙ Ｏｘｉｄｉｚａｂｌｅ ＣａｒｂＯｎ，ｒＯＣ）动态变化特征及其影响因素。结果表明：在０～２００ Ｃｍ剖面上，不同生长阶段油松林ｓＯＣ含量及储量较撂荒地显著提高。浅层（０～１００ Ｃｍ）ｓＯＣ平均含量，成熟林为撂荒地的２．０３倍，提高最大；其次是中龄林，为１．８５倍；最后是幼龄林，为１．５９倍。深层（１００～２００ Ｃｍ）．．．
[期刊] 中国水产科学
[作者]
吴曼 刘宝锁 黄桂菊 陈明强 范嗣刚 喻达辉
为了研究合浦珠母贝(Pinctada fucata)不同生长阶段基因型与环境的互作效应,从2012年1月在海南构建的家系中选取生长快、中、慢3个典型家系(分别编号为F1、F2和F3),于海南陵水黎安、广东湛江覃斗和广西防城白龙3个不同海区进行养殖试验,每个海区每个家系的放养数量为800个,养殖1年。采用方差和加性主效应乘积交互作用(additive main effects and multiplicative interaction,AMMI)模型对各家系不同生长阶段壳长、壳高、壳宽和体重4个性状的基因型与环境互作效应进行分析。结果显示,不同海区间合浦珠母贝的生长差异显著(P<0.05),其...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
葛永怡 吴石平 谭玉梅 刘永翔 刘作易
冠突散囊菌（Ｅｕｒｏｔｉｕｍ ｃｒｉｓｔａｔｕｍ）闭囊壳的产生和数量受各种与有性产孢相关的基因控制，而ｍａｔ基因（ｍａｔｉｎｇ ｔｙｐＥ ｇＥｎＥ，ｍａｔ）是其中的关键基因之一，为调查ｍａｔ基因在冠突散囊菌不同发育阶段的表达量变化，应用实时荧光定量ｐｃｒ技术对该菌的营养生长时期、无性产孢时期和有性产孢时期３个阶段的ｍａｔ基因表达量进行检测。结果显示：以营养生长时期为对照，在有性产孢时期ｍａｔ１－１－１基因上调３１．１２倍，ｍａｔ１－２－１基因上调５．８７倍；在无性产孢时期ｍａｔ１－１－１基因上调４．２５倍，ｍａｔ１－２－１基因仅为对照的０．０３倍。表明，ｍａｔ基因与冠突散囊菌的有性产孢相关，其．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
郁建锋 张营 王星果 徐建荣 卢祥云 李建林 顾志良
以鳡肌肉总RNA为模板,采用RT-PCR和RACE的方法,获得了鳡肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的3个重叠片段,测序后拼接得到2177bp全长cDNA序列,其包含了5′端非翻译区的89个核苷酸和3′端非翻译区1052个核苷酸以及1125个核苷酸的开放性阅读框,翻译编码375个氨基酸,其中前22个氨基酸为鳡MSTN的信号肽。鳡MSTN具有MSTN的共同特征,有蛋白酶水解位点RIRR和在C端生物活性区含9个保守的半胱氨酸残基。核苷酸和氨基酸同源性分析发现鳡MSTN与厚颌鲂、草鱼和鲤等鲤形目鱼类的同源性较高,与鲈形目的同源性较低,与哺乳动物和鸟类的同源性最低;系统发育分析表明鳡M...
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鳡 肌肉生长抑制素 开放性阅读框 表达
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