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[期刊] 水产学报
[作者]
杜芳芳 白俊杰 李胜杰 李小慧 樊佳佳
采用基因组步移技术克隆了大口黑鲈垂体特异性转录因子POU1F1启动子序列,该序列全长1 629 bp,预测存在4个八聚体转录因子1(Oct-1)结合位点和TATA框等基本转录元件,1个Homeobox转录因子结合位点和2个cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合位点。采用直接测序法研究发现,大口黑鲈POU1F1启动子序列的-18和-183两个位点存在SNPs,该两个突变位点只检测到A、B两种单倍型。对养殖群体进行不同单倍型的基因频率和生长关联分析,结果表明,单倍型A的等位基因频率为0.246,单倍型B的等位基因频率为0.754;群体关联分析表明,基因型为AA型和AB型的个体在体质量、体长、全长...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
宋成义 赵芹 高波 王宵燕 吴晗 周辉云 经荣斌 毛九德
【目的】获得猪POU1F1基因启动子区的多态信息,揭示其在不同品种中的分布特点,阐明其与生长性状的关联性。【方法】采用PCR克隆、DNA测序和PCR-RFLP技术进行POU1F1基因启动子区多态分析,利用一般线形模型分析其与生长性状的关联性。【结果】在POU1F1基因1.5 kb的启动子区域内发现5个多态位点;其中,5 bp短片段插入或缺失突变的A等位基因频率在引入品种猪中最高,在培育品种中中等,在中国地方品种最低。一般线形模型分析表明,该多态位点与猪的生长性状存在显著相关。多重比较分析发现,AA基因型个体的体高、体长、胸围和体重显著高于AB和BB基因型个体(P<0.05),而AB和BB基因型...
关键词：
猪 POU1F1基因 多态 生长性状
[期刊] 海洋渔业
[作者]
马冬梅 韩林强 白俊杰
生长激素释放激素（ｇｒｏｗｔｈ ｈｏｒｍｏｎｅ ｒｅｌｅａｓｉｎｇ ｈｏｒｍｏｎｅ，ｇｈｒｈ）是下丘脑弓状核合成和分泌的小分子多肽，其主要功能是调节垂体细胞合成和释放生长激素。为研究大口黑鲈（ｍｉｃｒｏｐｔｅｒｕｓ ｓａｌｍｏｉｄｅｓ）ｇｈｒｈ基因５’侧翼启动子区域的活性和该区域中潜在的转录因子对ｇｈｒｈ基因表达的调控作用，对该基因５’端启动子区域约１４００ ｂｐ长度的片段进行序列分析，预测顺式作用元件，获得了ｏｃｔ－１、ｓｐ１、ｎＦ－１、ｃ／ｅｂｐａｌｐ和ｃ／ｅｂｐ等多个潜在的调控ｇｈｒｈ基因表达的调节因子结合位点序列。在包括外显子１和内含子１的ｇｈｒｈ基因５’侧翼区两侧加入两个限制性酶切位．．．
关键词：
生长激素释放激素 启动子活性 大口黑鲈
[期刊] 西南农业学报
[作者]
余娇娇 赵雯 肖池贵 王婷 马兰 陶增
【目的】植物特异性转录因子NLPs（NIN-likeproteins）是硝酸盐响应顺式元件（NRE）的结合蛋白，在硝酸盐调控的下游基因表达中起转录激活作用。玉米转运蛋白ZmSTP1和ZmAAP2在植物碳氮产物的运输和卸载过程中发挥作用，且基因启动子区域均含有一个硝酸盐响应顺式元件。本研究旨在证实玉米ZmNLPs家族成员ZmNLP3、ZmNLP4是否为ZmSTP1和ZmAAP2基因启动子中NRE的结合蛋白。【方法】以玉米B73为试验材料，首次利用酵母单杂交技术检测ZmNLP3、ZmNLP4转录因子分别与ZmSTP1和ZmAAP2基因启动子区域的相互作用。【结果】在线预测网站Plantcare对ZmSTP1和ZmAAP2基因转录起始位点上游2000 bp序列分析表明，位于2个基因转录起始点上游-577～-589 bp和-909～-921 bp区域均包含一个序列长12 bp的NRE元件，结构分别为5'-ATTTAATACTCA-3'和5'-ATATATAAGTCA-3'；诱饵菌株AbA~(r)基因表达检测显示，能抑制诱饵菌株Y1H（pAbAi-ZmSTP1）和Y1H（pAbAi-ZmAAP2）本底表达的最低AbA浓度均为200 ng/mL；将pGADT7-ZmNLP3/4分别转化Y1H（pAbAi-ZmSTP1）和Y1H（pAbAi-ZmAAP2）菌株后，在对照培养基（SD/-Leu）和含AbA浓度为200 ng/mL的筛选培养基中Y1H[（pAbAi-ZmSTP1）/（pGADT7-ZmNLP3）]、Y1H[（pAbAi- ZmSTP1）/（pGADT7-ZmNLP4）]、Y1H[（pAbAi-ZmAAP2）/（pGADT7-ZmNLP3）]、Y1H[（pAbAi-ZmAAP2）/（pGADT7-ZmNLP4）]菌株均能正常生长。【结论】玉米转录因子ZmNLP3、ZmNLP4均能与ZmSTP1和ZmAAP2基因启动子区域相互作用，是靶基因ZmSTP1和ZmAAP2启动子区域NRE的结合蛋白。本研究为深入了解ZmNLPs家族成员参与的硝酸盐信号响应提供理论基础，也为玉米增产和氮素增效提供分子标记和理论依据。
关键词：
玉米 酵母单杂交 转运蛋白 ZmNLPs
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
赵宪林 曹少杰 王若勇 颜伟俊
【目的】探讨POU1F1基因的多态性与藏羊生长性状之间的关联性,寻找与藏羊生长性状相关的分子标记。【方法】利用DNA测序方法检测藏羊POU1F1基因的多态位点并对其进行基因分型,分析单一多态位点不同基因型及双倍型与藏羊生长性状的关联性。【结果】在POU1F1基因第4内含子上检测出1个多态位点g.14205G>A,在第5内含子上检测出2个多态位点g.15223G>A和g.15286A>G。关联性分析表明,g.14205G>A位点上AA基因型的体质量和体长分别极显著(P<0.01)和显著(PA位点上GG基因型
[期刊] 华北农学报
[作者]
贺三刚 陈芯 刘晨曦 刘国松 刘明军
采用测序和PCR-RFLP的方法,分析了MSTN基因启动子区在7个品种绵羊中的单核苷酸多态性,结果表明:存在2个SNP位点(-959T/C,-784G/A),表现为6种基因型(TT、TC、CC、GG、GA、AA),在-959T/C位点中,国外肉用绵羊品种陶赛特、德国肉用美利奴及我区的巴士拜羊,TT为优势基因型,地方品种绵羊巴音布鲁克羊、多浪羊和阿勒泰羊在该位点中CC为优势基因型,经χ2检验,其群体的基因频率和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态,群体遗传多态性分析表明,这6个绵羊品种中群体的多态信息含量(PIC)均处于0.25～0.50之间,为中度多态,特克赛尔羊在该位点未发生...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
李国辉 魏岳 张学余 韩威 屠云洁 苏一军
以GH和POU1F1作为影响鸡繁殖性状的候选基因,采用PCR-SSCP方法,检测白耳鸡GH外显子4和POU1F1外显子3区域的单核苷酸多态性,并利用最小二乘法分析GH、POU1F1单基因型和两基因聚合基因型与72周龄产蛋数的关联.结果表明,GH基因exon4(C2338G\C2341T)的突变和POU1F1基因exon3的突变(A5331T)基因型CC与白耳鸡的72周龄产蛋数显著相关(P<0.05),基因型AA、CC对产蛋数的加性效应分别为3.80和3.57.聚合基因型AACC个体72周龄产蛋数(除基因型ABCC外)与对照组差异显著(P0.05).扩...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
张爱玲 孙显月 张哲 李加琪 张豪
通过双荧光素酶报告基因载体系统检测猪抗酶１（ＡＺ１）基因启动子转录活性，分析蓝塘和长白猪群体ＡＺ１基因启动子ＳＮＰ及单倍型，在此基础上比较不同单倍型转录活性。结果表明：－４５３／＋７９为核心启动子区；在２个群体中检测到ＡＺ１基因启动子８个ＳＮＰＳ，分别为－７１３ Ｔ＞Ｃ、－５８４ Ａ＞Ｃ、－４７６ Ｇ＞Ａ、－３６５ Ｔ＞Ｃ、－３４８ Ｃ＞Ｔ、－２９４ Ｇ＞Ｃ、－２８８ Ｔ＞Ｇ和－２３４ Ｔ＞Ｃ，蓝塘猪群体具有更丰富的单核苷酸多态性，而长白猪群体仅在－２８８座位存在ＧＧ和ＧＴ ２种基因型，其他７个ＳＮＰＳ均为纯合状态；蓝塘猪群体ＬＴＨ１单倍型（ＴＡＧＣＣＧＴＣ，－７１３／－２３４）频率为０．５２．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
徐珑洋 梅寒 王英明 王志敏 杨磊 徐亚欧
【目的】为研究POU1F1基因3种剪切体在藏鸡不同的阶段中对藏鸡生长的影响。【方法】以藏鸡为研究对象,采用荧光定量技术,对POU1F1 3种剪接体在藏鸡的4个时期(81、119、154、210 d)垂体、腿肌和胸肌中的表达量进行检测,并与其生长性能进行关联分析。【结果】POU1F1基因的3个剪接体在4个时期中均于119日龄时有一较高值,之后随日龄增加而降低;且表达水平POU1F1-β>POU1F1-α>POU1F1-ω;在垂体、胸肌和腿肌中,垂体中表达远高于其他2个组织;在垂体中,雌性的表达量高于雄性。藏
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘波 陈宏 蓝贤勇 雷初朝 张志清 张润锋
本研究首次利用PCR-RFLP技术研究相同季节4月(±10d)龄纯种秦川牛(QQ)及杂种牛秦安(AQ)、秦德(DQ)、秦利(LQ)4个群体164个个体POU1F1基因多态性及其与体重、体尺等生长性状指标之间的相关性。结果表明,QQ及AQ、DQ、LQ群体POU1F1-HinfI基因座的451bp的PCR产物被限制性酶HinfI消化后表现多态性,它们的等位基因A/B频率分别为:0.232/0.768、0.333/0.667、0.178/0.822和0.181/0.819,且均处于Hardy-Weinberg平衡状态。同时,4个群体POU1F1基因座不同基因型与体重、体尺等生长性状指标相关分析的结果...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
方华 郑友民 李宏滨 杜立新 马月辉
【目的】寻找猪POU1F1多态位点和基因表达量之间可能存在的相关性。【方法】以大白猪(英系)和中畜黑猪为试验材料,对POU1F1基因第一内含子多态性进行PCR-SSCP检测分析,同时提取垂体总RNA,对POU1F1、GH、PRL、TSH-β的mRNA进行实时定量荧光PCR检测。【结果】发现一个位于第一内含子1515位点的突变和猪屠宰前日增重相关系数为R=-0.6(P<0.05);【结论】T→C的替换将导致GH的mRNA表达量升高,在生长性状上表现为屠宰前日增重降低。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
宋娜娜 柴志欣 胡丹 向超 钟金城
本研究利用DNA池和测序技术,结合PCR-RFLP方法,筛查了POU1F1基因第2外显子和第5内含子的SNP位点,分析了西藏申扎(SZ)、类乌奇(LWQ)、斯布(SB)和帕里(PL)4个牦牛类群(品种)共182个个体的POU1F1基因的多态性及其与体重、体高、体长等生长性状指标之间的相关性。结果表明:①POU1F1基因第2外显子高度保守,未发现任何突变,第5内含子中发现2个突变位点,分别为T727C(BglⅡ酶切)位点和T284C(StuⅠ酶切)位点。②申扎(SZ)、类鸟奇(LWQ)、斯布(SB)和帕里(
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
曾强 关钦泽 王思琪 李齐发 杜星
[目的]本文旨在扩增猪CYP11A1基因编码区，鉴定并分析其核心启动子区，探究猪CYP11A1基因的转录调控机制。[方法]通过基因克隆测序技术获得猪CYP11A1基因编码区全序列，并对其序列特征进行分析；利用荧光素酶活性试验鉴定猪CYP11A1基因核心启动子区，并通过生物信息学分析猪CYP11A1基因核心启动子区上潜在的甲基化位点与转录因子结合位点；同时，利用Western blot、qRT-PCR以及染色质免疫沉淀（ChIP）等分子生物学手段解析转录因子NR2C1对猪CYP11A1基因的转录调控功能。[结果]猪CYP11A1基因的编码区序列全长为1 563 bp，在哺乳动物的进化过程中高度保守；猪CYP11A1基因的核心启动子区为-398 bp～-108 bp（转录起始位点为+1），序列特征分析发现猪CYP11A1基因核心启动子区上包含多个潜在的转录因子的结合元件，包括NR2C1、SOX10、NFIX和ELF5等；另外，转录因子NR2C1可促进猪CYP11A1基因核心启动子区活性，同时显著上调体外培养的猪卵巢颗粒细胞中CYP11A1基因的表达。[结论]哺乳动物CYP11A1基因在进化过程中高度保守，NR2C1作为转录因子能够促进猪卵巢颗粒细胞中CYP11A1基因的转录。
[期刊] 华北农学报
[作者]
杨勤 柴志欣 王吉坤 王会 钟金城
为了探究骨骼肌α肌动蛋白1(ACTA1)基因在肌肉和脂肪等6个组织中的甲基化状态及mRNA表达水平,以类乌齐牦牛、麦洼牦牛为研究对象,成功克隆了牦牛ACTA1基因启动子区序列,且采用重亚硫酸氢盐测序法(BSP)检测ACTA1基因启动子区甲基化模式,并通过实时荧光定量PCR检测ACTA1基因在臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪组织中的mRNA表达水平。结果显示,牦牛ACTA1基因转录起始位点上游及第一外显子区部分序列总长为1 028 bp;BSP法分析发现肌肉组织DNA甲基化水平最低,脂肪组织甲基化率最高,其中,类乌齐牦牛臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪的甲基化概率分别为6.25%,6.88%,20.00%,16.25%,26.25%,29.38%,麦洼牦牛臀大肌、心脏、肾脏、肺脏、肝脏和脂肪的甲基化概率分别为5.00%,7.50%,18.13%,20.00%,26.25%,28.75%;ACTA1基因mRNA表达量在肾脏、肺脏、肝脏和脂肪均极显著低于臀大肌(P<0.01),且显著低于心脏(P<0.05),类乌齐牦牛和麦洼牦牛心脏mRNA表达量具有显著性差异(P<0.05),类乌齐牦牛肺脏组织甲基化率显著低于麦洼牦牛(P0.05),各组织甲基化水平与ACTA1基因mRNA表达量呈极显著负相关(r=-0.797,P=0.002)。结果表明,ACTA1基因DNA甲基化模式对肌肉发育具有一定的调控作用,可为牦牛遗传育种表观遗传标记提供部分数据支持。
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