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年份: 2011(1)

作者: 佳(1); 妮(1); 小(1); 戴(1); 捷(1); 李(1); 枫(1); 永(1); 汪(1); 田(1); 相(1); 胤(1); 陈(1)

学科

机构: 业(1); 中国(1); 中国农业(1); 作物(1); 作物科学(1); 农(1); 农业(1); 农业科学(1); 学院(1); 所(1); 研究(1); 研究所(1); 科学(1); 科学研究(1); 科学院(1)

基金: 027(1); 100700(1); 2007(1); 2011(1); 2011cb100700(1); 973(1); cb(1); fy(1); sb(1); sb2007fy027(1); 专项(1); 划(1); 国家(1); 基础(1); 基础性(1); 家(1); 工作(1); 性(1); 础(1); 科技(1); 计划(1); 项目(1)

期刊: 业(1); 中国(1); 中国农业(1); 农(1); 农业(1); 农业科学(1); 科学(1)

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大丽轮枝菌(Verticillium dahliae VdLs.17)分泌组预测及分析

[期刊] 中国农业科学 [作者] 田李陈捷胤陈相永汪佳妮戴小枫

【目的】预测并分析大丽轮枝菌基因组范围内的分泌蛋白,为大丽轮枝菌分泌蛋白致病机理的研究奠定基础。【方法】利用已公布的大丽轮枝菌全基因组序列,组合使用生物信息学软件SignalP、TargetP、TMHMM、Big-pi和PROSITE,预测大丽轮枝菌基因组范围内所有分泌蛋白,定义为分泌组。统计分析分泌组中蛋白N-端信号肽特点;应用碳水化合物活性酶类数据库和病原菌-寄主互作蛋白数据库对分泌组蛋白进行注释,预测分泌组中潜在果胶酶、纤维素酶和病原菌寄主互作蛋白;利用真菌激发子的保守结构域,预测分泌组中潜在的激发子蛋白集;应用BLASTP程序比较分析大丽轮枝菌和黑白轮枝菌分泌组,获得大丽轮枝菌相对于黑...

关键词：大丽轮枝菌分泌蛋白信号肽碳水化合物活性酶激发子

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