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[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
李科 何炎森 陈晓静
以多花水仙花瓣抑制消减杂交文库获得的羟甲基戊二酰辅酶A合酶(HMGS)基因片段为基础,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术从黄花水仙2号和金盏银台中各克隆一条HMGS基因,两基因均含有一个1413 bp的开放阅读框,编码470个氨基酸,但存在2个氨基酸差异.氨基酸序列分析表明:黄花水仙2号与葡萄、大豆、蓖麻和玉米HMGS基因的氨基酸相似系数分别为83%、82%、82%和81%.以水仙Actin基因为内参基因,采用荧光定量PCR方法分析HMGS基因在两品种的表达水平,结果表明:两品种HMGS基因的表达水平差异并不明显.
[期刊] 林业科学研究
[作者]
陈段芬 彭镇华 高健
A new gene,named as NTZDS1(GenBank accession number:EU138882),was cloned from the alabastrum of Narcissus tazetta var.chinensis through RT-PCR.The sequence consists of 1 899 bp,has an open reading frame of 1 725 bp encoding a polypeptide of 574 amino acids.Homology analysis showed that the deduced N...
关键词：
中国水仙 ZDS基因 序列分析 组织表达
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
高志民 陈段芬 彭镇华
MADS-box基因在植物花发育中具有重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从中国水仙幼嫩花蕾中分离到了一个MADS-box同源基因,命名为NtMADS3(GenBank登记号:EU081900)。该基因cDNA全长980 bp;编码区编码241个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基因结构。序列分析表明,NtMADS3编码的蛋白与其他植物的MADS-box蛋白有着较高的一致性,其中与石刁柏的AOM3一致性高达89.2%,与拟南芥的AGL6一致性为60.0%。系统进化树分析表明NtMADS3基因属于E类功能基因。组织表达模式分析显示,NtMADS3基因在中国水仙的开花期各器官及花的各部位...
[期刊] 华北农学报
[作者]
于小清 陈段芬
为了探索植物凝集素在分子水平的作用机理,利用RT-PCR技术从中国水仙(Narcissus tazettavar.chinensis)金盏银台中克隆到一个新的编码凝集素的基因。序列分析与预测结果表明,该基因cDNA片段总长为609 bp,含有一个由25个氨基酸残基组成的信号肽和一个519 bp的完整开放阅读框;编码172个氨基酸,分子量为18 712.31 Da;前体蛋白在氨基酸水平上与杂种多花水仙凝集素、雪花莲凝集素、石蒜凝集素的一致性分别为83%,81%和77%;其二级结构以α-螺旋、不规则盘绕和延伸链为主;三级结构与雪花莲凝集素极其相似,是一种能与D-甘露糖特异性结合的B型凝集素。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
林晓红 潘鹤立 潘东明
【目的】克隆中国水仙几丁质酶基因,分析其在水仙不同组织中的表达,为提高中国水仙的抗病性提供参考。【方法】利用RT-PCR技术克隆得到中国水仙几丁质酶基因,对其序列及编码氨基酸序列进行生物信息学分析,通过qRT-PCR分析该基因在感染基腐病、病毒病及褐斑病中国水仙根、叶中的表达。【结果】中国水仙几丁质酶基因的cDNA序列长768bp,编码230个氨基酸,其编码蛋白的分子质量为25.4ku,理论等电点为9.04,为不稳定蛋白,亲水性强,二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主。该基因编码的蛋白与荷兰芹几丁质酶蛋白的亲缘关系最近,隶属于糖苷水解酶19家族,与溶菌酶相似超家族基因的保守结构域类似,推测其可能是...
关键词：
中国水仙 几丁质酶基因 序列分析 抗病性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
林江波 王伟英 李海明 吴水金 邹晖 李跃森 戴艺民
【目的】克隆中国水仙植物ＡＴ富集序列锌结合蛋白基因（ＮＴＰＬＡＴＺ１），为研究该基因的生物学功能奠定基础。【方法】利用ＲＡＣＥ技术克隆了ＮＴＰＬＡＴＺ１ＣＤＮＡ全长，利用生物信息学方法分析其核苷酸及氨基酸序列，将ＮＴＰＬＡＴＺ１与原核表达载体ＰＧＥＸ－４Ｔ－３连接，转化ＢＬ２１并进行诱导表达，通过半定量ＰＣＲ分析用多效唑处理后该基因在中国水仙不同生长时期叶片中的表达情况。【结果】ＮＴＰＬＡＴＺ１的ＣＤＮＡ全长１ ０２４ＢＰ，包含１个６４２ＢＰ的完整阅读框架，编码２１３个氨基酸；编码蛋白具有ＰＬＡＴＺ ｓｕＰＥＲｆＡｍｉＬｙ蛋白保守区，与大豆（ＧＬｙＣｉＮＥ ｍＡＸ，Ａｉｉ１９３１４．１）ＰＬＡ．．．
关键词：
中国水仙 PLATZ 基因表达 锌指蛋白
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
林睿涓 高建忠 金仕容 赵玉明 陈再忠
源自DEAD-box家族的Vasa基因是生殖细胞的分子标记之一。本研究克隆了七彩神仙鱼(Symphysodon haraldi)Vasa基因的全长序列,并进行了不同组织的表达分析。结果表明:七彩神仙鱼Vasa基因c DNA序列共2 370 bp,其中5'UTR占123 bp,3'UTR为279 bp,ORF编码655个氨基酸,长1 968 bp。氨基酸序列同源性分析表明七彩神仙鱼的Vasa基因与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的同源性最高。半定量分析表明,Vasa基因在成熟七彩神仙
关键词：
七彩神仙鱼 Vasa基因 克隆 表达分析
[期刊] 淡水渔业
[作者]
彭啸 温彬 陈再忠 高建忠
为了探究胸腺素基因在七彩神仙鱼(Symphysodon aquifasciatus)中的特征、进化和功能，基于转录组序列比对及生物信息学的方法对七彩神仙鱼的胸腺素进行了鉴定、基因与蛋白结构分析、系统发生分析，通过RACE技术克隆获得了七彩神仙鱼胸腺素基因全长，利用qRT-PCR技术研究其在各组织中的表达规律，通过病原感染实验，研究了七彩神仙鱼β-胸腺素基因在病原胁迫下的表达规律。结果显示，七彩神仙鱼的胸腺素基因鉴定为胸腺素β1型，命名为dfTβ。克隆结果显示，dfTβ的全长为779 bp, ORF区序列长度为303 bp,编码100个氨基酸，其5′-UTR为43 bp, 3′-UTR为433 bp,含有22个poly-A。系统发育进化分析结果显示，七彩神仙鱼β-胸腺素同尼加拉瓜湖始丽鱼β-胸腺素聚为一簇。qPCR结果显示，β-胸腺素在七彩神仙鱼各组织中均有表达，其中在肠、皮肤、鳃中表达最高，在头肾和脾中表达最低。嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染后，七彩神仙鱼皮肤、头肾、脾和肠中dfTβ均在短时间内显著上调，并随着时间出现先上升后下降的趋势，但各组织中上调倍数最高峰的时间不同。研究结果表明，dfTβ基因参与了七彩神仙鱼受病原刺激后的免疫应答，且表达模式不同，表明其可能在不同组织、免疫的不同阶段发挥不同的作用。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
鲁娜 陈晓静 申艳红 何玮毅
采用SMART技术,以多花水仙‘黄花水仙2号’盛开期花朵为材料,构建其全长cDNA文库,并对文库质量进行鉴定.结果表明,所构建初始文库的滴度为6.30×105cfu·mL-1,扩增后文库的滴度为1.58×108cfu·mL-1,重组率为84%,插入片段大小集中在500-2000 bp之间,平均长度约970 bp,符合cDNA文库的质量标准.可见,所构建的文库比较完整,能够反映黄花水仙花朵盛开期基因的表达情况.
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
周国岭 杨光圣 傅廷栋
综述了基因克隆常用技术包括图位克隆法、转座子或T DNA标签法、同源序列法、表达序列标签(EST)法和差异表达基因分离方法的原理、应用、应用的潜力和限制因素
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
张楠 温彬 金仕容 高建忠 陈再忠
以七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)为研究材料,克隆了sox9基因cDNA序列,全长为1348 bp,开放性阅读框长990 bp,编码334个氨基酸,且预测的氨基酸序列具有SOX家族的HMG高保守区域。在构建的系统进化树中,七彩神仙鱼与奥利亚罗非鱼的sox9氨基酸序列同源性达89%,表明sox9基因在进化地位中具有保守性。RT-PCR结果显示:sox9 mRNA在精巢、脑、肠、胃以及皮肤中均有表达,尤以精巢中的表达量最高,而在卵巢中未见表达。sox9基因在仔鱼出膜后第45天表达量最高,而在第50天的表达量最低。原位杂交结果显示:sox9出现在成熟精巢的支持细胞内,而在卵巢中未检测到。综上所述,sox9基因参与七彩神仙鱼精巢的发育过程,可能对其性腺功能的维持起作用。
关键词：
七彩神仙鱼 sox9 时空表达 原位杂交
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
李全超 刘洋 肖瑶宇 李琳 胡邵彬 陈晓静
以‘云香’、‘黄花2号’、白花Ⅰ号和白花Ⅱ号4种多花水仙为材料,测定盐胁迫(NaCl浓度分别为0、50、100、150、200和250 mmol·L~(-1))7 d后水仙叶片叶绿素含量、丙二醛(MDA)含量、过氧化物酶(POD)活性及叶绿素荧光参数的变化,研究多花水仙的耐盐性.结果表明,盐胁迫下,4种水仙叶片的叶绿素含量均有所下降,当NaCl浓度增大到100 mmol·L~(-1)时,白花Ⅰ号和白花Ⅱ号的叶绿素含量比‘云香’和‘黄花2号’下降得更为显著. MDA含量随着盐浓度的增大而上升,白花Ⅰ号和白花Ⅱ号的MDA含量明显高于‘云香’和‘黄花2号’.POD活性随着盐浓度的增大整体有所上升,但‘云香’的POD活性呈先上升后下降的趋势.盐胁迫下,4种水仙的最大荧光产量(Fm)、潜在光化学效率(Fv/Fo)、最大光化学效率(Fv/Fm)、有效光化学效率(Fv′/Fm′)和光化学猝灭系数(qP)下降,初始荧光产量(Fo)上升;随着盐浓度的增大,白花Ⅰ号和白花Ⅱ号各种叶绿素荧光参数的变化比‘云香’和‘黄花2号’更加显著.总之,随着盐浓度的增大,4种水仙叶片叶绿素荧光参数的变化幅度明显小于叶绿素含量、MDA含量和POD活性的变化,表明短期盐胁迫对4种水仙造成一定程度的损伤,但没有对光系统造成不可逆的破坏,说明水仙具备一定的抗盐性.
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
何炎森 何玮毅 陈晓静
采用抑制消减杂交(SSH)技术,以多花水仙的栽培品种‘黄花水仙2号’黄色花瓣和‘金盏银台’白色花瓣的cDNA分别作为测试子和驱动子,建立正、反向抑制消减杂交cDNA文库.随机挑选正、反向文库各216个阳性克隆测序,对已知功能的uniESTs进行基因本体论(GO)分类分析,荧光定量PCR检测部分可能参与色素形成的uniESTs.结果表明:水仙花色差异表达正、反向消减文库经检验质量可靠,为分离花色形成相关基因奠定了基础;GO功能分类分析显示,水仙花色差异可能受到多个代谢途径的影响;经初步筛选得到11个与水仙花色形成相关的uniESTs,为进一步克隆基因全长和功能验证提供参考.
关键词：
多花水仙 花色 抑制消减杂交
[期刊] 林业科学
[作者]
张建业 陈力耕 胡西琴 何新华
The flower meristem identity gene LEAFY is a developmental switch,sufficient for flower initiation in diverse plants. Ginkgo biloba is a kind of gymnosperm,and a dioecious tree species.The nucleotide DNA sequence was cloned from the genomic DNA of the tender leaves collected from a male tre...
关键词：
银杏 雄株 LEAFY 基因
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
马艳 朱馨蕾 杨长庚 张富春 尹伟伦
为深入研究胡杨的抗盐分子机制,并获得与之相关的抗逆基因,采用SMART技术构建了胡杨盐胁迫处理cDNA文库。经随机测序,得到一个编号为SSL061的EST序列,与欧美杨的脱水素基因有较高相似性,通过PCR快速扩增文库的方法获得了胡杨脱水素基因(Pedhn)。分析表明,该cDNA的长度为813 bp,拥有681 bp的开放读码框,共编码227个氨基酸。该序列包括两个重复的富含赖氨酸的K片段和由7个连续的丝氨酸残基组成的S片段,但是缺乏Y片段。RT-PCR结果表明,胡杨在未受胁迫的情况下脱水素基因的转录水平较低,而随着盐胁迫浓度的升高,脱水素基因的转录水平总体呈上升趋势。
关键词：
胡杨 cDNA文库 脱水素 盐胁迫
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