多位点关联分析在人类和动植物遗传研究中的应用日益广泛。本文综述了以混合线性模型（mixed linear model，MLM）为框架下多位点关联分析的主要方法及重要软件平台。包括全基因组关联分析（genome-wide association study，GWAS）混合线性模型方法学的建立与发展，多位点模型方法的发展，多位点GWAS混合线性模型方法的发展，以及GWAS方法学研究的影响因素，最后展望了关联分析的发展动向。

黄鳍金枪鱼(Thunnus albacares)作为一种重要的高价值商业性大洋鱼类,广泛分布于大西洋、印度洋和太平洋的热带和亚热带海域。近年来的资源评估表明,其资源量呈现不断下降的趋势,且中西太平洋已处于过度捕捞的状态。为确保黄鳍金枪鱼资源的可持续利用,深入了解其种群结构是必要前提。本文综述了黄鳍金枪鱼种群结构分析的研究成果,通过比较几种研究种群结构的方法后认为:形态学方法是划分群体的重要手段,但在亚种群的划分上灵敏度相对较低;标志重捕法能揭示其运动规律,但单一的标志重捕法不能很好地进行种群划分;分子标志技术可从分子水平对种群遗传结构做深入的分析,但选择合适的分子标志对于合理划分种群结构显得尤...

二代测序数据的持续增多以及全基因组关联分析存在着只关注常见变异对表型影响的缺陷,使得研究人员开始考虑罕见变异对表型表达的影响。近年来,涉及罕见变异关联分析的统计方法研究成为一个活跃的领域,大批统计检验方法被相继提出。然而,大多数方法没有得到全面详细的比较和分析。因此,缺乏对现有方法的评价以及对它们如何使用的指导。本文对该领域的一些具有代表性的方法做一全面的综述,并介绍一些最新的研究进展。

In this paper,we review the progresses of change point problems.In particular,we discuss the research results about change point problems in China.

【目的】通过对芝麻产量相关性状的全基因组关联分析,挖掘与产量性状关联的SNP位点及预测候选基因,为通过分子标记辅助选择育种等方式提高芝麻产量提供技术基础。【方法】以363份不同遗传背景和地理来源的芝麻种质资源构成的自然群体为研究对象,调查2年2点4环境下8个产量相关性状(单株产量、单株蒴数、蒴粒数、千粒重、株高、主茎果轴长、始蒴高度和表观收获指数)的表型值,借助覆盖全基因组的42 781个SNP标记,利用多位点SNP随机效应混合线性模型(multi-locus random-SNP-effect mixed linear model,mrMLM)对8个产量相关性状进行全基因组关联分析,检测与产量相关性状显著关联的SNP位点,并预测候选基因。【结果】在4个不同环境下,8个产量相关性状表现出广泛的表型变异,变异系数为6.51%—33.57%;相关性分析表明单株产量与单株蒴数、株高、主茎果轴长、表观收获指数呈极显著正相关;方差分析表明产量相关性状的基因型效应、环境效应、基因型与环境互作效应均达到了极显著水平。通过多位点全基因组关联分析共检测到210个与产量相关性状显著关联的SNP,在2018年南阳环境下检测到47个SNP,解释表型变异的1.63%—17.29%;在2019年南阳环境下检测到35个SNP,解释表型变异的1.94%—11.90%;在2018年平舆环境下检测到35个SNP,解释表型变异的2.15%—15.90%;在2019年平舆环境下检测到53个SNP,解释表型变异的1.25%—11.13%;在4个环境的综合BLUP条件下检测到75个SNP,解释表型变异的1.44%—13.58%。上述210个SNP涉及到175个位点,其中10个位点在3个及以上环境中被重复检测到。在这10个位点基因组区域内,共鉴定到214个候选基因,其中156个候选基因具有功能注释,主要涉及植物代谢、生物调控、生长发育等生物学过程。根据功能注释筛选出4个可能与芝麻产量相关的候选基因,其中SIN_1006338编码1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶3(1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 3-like),参与乙烯的生物合成;SIN_1024330编码碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix)转录因子,负向调控植物细胞和器官的伸长;SIN_1014512编码吲哚-3-乙酸-酰胺合成酶GH3.6(indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.6),参与调控茎和下胚轴细胞的伸长生长;SIN_1011473编码泛素受体蛋白DA1(protein DA1-like),参与调节植物细胞增殖周期。【结论】通过多位点SNP随机效应混合线性模型的全基因组关联分析,检测到175个与产量相关性状显著关联的位点,筛选出4个可能与产量相关的重要候选基因。

变异点识别在区分气候变化和人类活动对水文过程的影响中具有十分重要的作用。近几十年来,国内水文序列变异点的研究逐渐发展,从最早的使用单一方法发展到由多种方法组成的水文序列变异点诊断系统和对部分方法的改进。同时,各种方法在中国各主要流域得到广泛应用,但是使用的方法不同,水文序列时间年限不同,得到的变异点的结果也不完全一致。本文将目前普遍采用的方法及在各流域的应用成果进行了系统总结,为今后水文序列变异点的方法改进及其在流域中的应用发展提供参考。

林业碳泄漏是严重影响林业项目碳抵消效率的热点问题。国内碳泄漏研究主要集中在高排放部门，林业部门的碳泄漏评估尚处于起步阶段。目前，林业碳汇已成为中国碳交易市场自愿减排项目的重要补充，需要把握林业碳泄漏的实质、厘清其产生机理和评估方法并积极应对。文章旨在阐述林业碳泄漏评估方法学的研究进展和在排放归因方面亟待优化的重点问题。首先，基于研究林业碳泄漏的一般逻辑思路，构建林业碳泄漏评估的排放主体、排放转移、排放归因和排放量化分析框架。其次，在该框架下分析林业碳泄漏类型、干预边界和排放归因在主流的林业碳汇方法学和科学文献构建的模型中如何量化林业碳泄漏，以及随着研究的深入出现研究重点的转移。最后，根据林业碳汇在我国自愿减排市场上的实际情况，结合大型林业工程以及碳汇林项目的进展，建议借鉴国外成熟的林业碳泄漏量化方法学，评估林业项目扣除碳泄漏后的实际减排贡献，并探索成熟和过熟林后续的碳泄漏管理方向；国家核证自愿减排量项目文件亟须在正确界定碳泄漏的前提下考虑多种类型的泄漏从而实现全面的碳泄漏核算；此外，随着林业项目范围扩大和国际贸易联系加深，土地利用转移问题的建模原理在具象化碳排放转移方面的优势，对于评估国际碳泄漏并促进国际气候公平具有重要的借鉴价值。

在情报缺失而信息过剩的时代,如何从海量的信息中挖掘出情报,作为情报研究的一个重要分支——情报分析责无旁贷;作为情报分析的利器——情报分析方法的重要作用更是不言自明。对当前的情报分析方法进行一番梳理,建立了包括一般情报分析方法、专门情报分析方法以及最新情报分析方法的情报分析方法体系。

专利信息分析方法在揭示专利技术信息方面已取得许多研究成果,形态分析是一种面向未来的系统分析方法,专利技术形态分析方法可以综合这两种方法的优点,为面向未来的技术分析提供一个重要研究方向。对专利技术形态分析的核心方法与研究进展进行系统介绍,并对该方法目前有待研究的问题及其解决思路以及未来的应用进行分析。

数量性状的表型变异受到大量效应微小的遗传位点和诸多环境因素的共同作用,但在数量性状的遗传研究领域,关于不同遗传位点之间加性效应与上位效应相对重要性的认识却存在着分歧。近年来,伴随着全基因组关联分析在人类及家养动物数量性状研究中的发展,在全基因组关联分析的框架内进行上位效应遗传位点的检测越发受到重视。文章以遗传力失踪问题为出发点,首先综述了标记-QTL连锁分析和GWAS框架下传统上位效应遗传位点的检测方法,然后对基于表型方差同质性检验和广义线性混合模型方法的上位效应统计推断以及混杂因素的处理方法进行了总结与梳理,旨在为数量性状全基因规模上位效应的相关研究提供理论参考。

该文提出一种基于SLAM定位的多位置和姿态点云的拼接与分割方法，可提供信息量大且准确的点云样本数据。首先，利用RTAB-MAP框架构建SLAM算法，由KinectV2传感器采集获得带有位姿信息的多角度RGBD图像样本，并转化为三维点云场景数据；其次，改进ICP算法并基于SVD算法设计多位姿点云的拼接算法；再次，根据原始点云的RGB信息与凹凸性特征，设计三维点云分割算法，以此形成一系列点云目标；最后，开展点云拼接和点云分割实验，实验结果验证了该文所提算法的正确性和有效性。

全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)是近几年发展起来的一种复杂性状研究的新方法。在过去几年中,国内外不少研究者对畜禽的重要经济性状、遗传缺陷性疾病、复杂疾病的抗性、品种的某些特征等性状开展了GWAS。这些研究不仅大大丰富了畜禽标记辅助选择中可利用的分子标记,而且为这些性状分子机理的探索研究提供了重要线索。本文对国内外畜禽GWAS中所用的群体、主要分析方法和研究结果进行综述,并对GWAS的研究应用做一展望,以期为进一步利用GWAS进行畜禽各种性状遗传基础的研究提供参考。

首先介绍当前生物医学领域在数据资源集成与共享方面的发展需求,认为当前语义Web的主要技术之一———关联数据为生物医学发展带来重要的机遇,然后对生物医学领域关联数据基础研究、建设以及应用研究情况进行详细分析,进一步对典型生物医学关联数据进行具体特性方面的比较分析,指出当前发展面临的困难和问题,并提出今后发展的方向。

城市对全球性气候变暖负有主要责任。编制城市温室气体排放清单是制定城市温室气体减排政策的工具和基础。本文概述了城市清单编制的四种方法学和两种编制模式(生产模式、消费模式),介绍了国内城市清单编制研究进展,认为中国城市清单编制研究大致以2010年为节点划分为两个阶段,前一阶段注重对清单的综合介绍和方法探究,后一阶段转向对重点城市的清单编制研究。综合现有文献看,目前学术界对大城市清单编制研究多,中小城市研究少;生产模式使用多,消费模式使用少;对单一城市的具体分析多,比较研究少;问题分析多,政策设计和情景分析少。未来应扩大研究标的范围,丰富研究方法选择,加强城市之间的比较研究并以科学合理的清单为基础,...

从专利引用、专利合作和专利技术主题关联三个角度出发,对社会网络分析方法在专利分析中的应用研究进展进行梳理,侧重对新概念、新思路、新指标、新算法等进行分析与总结,并对其功能与应用前景进行讨论。考察的主要网络节点包括专利文献本身、发明人、专利权人、主题词、专利分类号等,连接关系包括合作、引用、共现或同现等。