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[期刊] 中国农业科学
[作者]
唐露 金梦雅 黄琳凯 张旭 赵欣欣 张新全
【目的】利用转录组测序开发的EST-SSR标记和鸭茅基因组调研测序开发的基因组SSR(genomic-SSR)标记,对已构建的四倍体鸭茅遗传图谱加密,为定位控制鸭茅重要农艺性状的QTL位点奠定基础。【方法】基于拟测交策略,以"楷模"(高杆、多分蘖、宽叶、早熟)和"01436"(矮秆、少分蘖、细叶、晚熟)作为亲本材料进行杂交,得到一个含有214株鸭茅材料的作图群体,利用亲本和随机选取的5个单株对574对EST-SSR标记和150对Genomic-SSR进行引物筛选,PCR产物经8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检
关键词：
鸭茅 SSR 遗传图谱加密
[期刊] 华北农学报
[作者]
朱云 郭晓 孙小磊 马伟清 董道峰 郭宝太 杨煜 杨晓慧 李广存
为了丰富马铃薯分子标记,定位青枯病抗性基因位点,利用具有抗青枯病遗传背景的二倍体马铃薯亲本USW5337.3(C)和772102.37(E)及其123份杂交一代无性系,进行了马铃薯SSR遗传图谱的构建。根据马铃薯全基因组序列设计了864对SSR引物,其中187对在亲本间表现出差异,135对(72.2%)能够在杂交一代中扩增出清晰的条带,最终构建了一张由12个连锁群组成,包含135个SSR标记的马铃薯分子标记遗传图谱。12个连锁群总长度为948.4 c M,标记间平均间距7.03 c M,含有5个标记偏分离
关键词：
二倍体 马铃薯 SSR 连锁图谱
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
廖梅杰 王锦锦 李彬 王印庚 荣小军 张正 范瑞用
为分析中、韩、俄沿海刺参(Apostichopus japonicus)种质遗传结构，本研究采用SSR指纹图谱技术对中国青岛、烟台，韩国浦项、群山、木浦，俄罗斯符拉迪沃斯托克的8个不同地理种群的刺参群体进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果显示，13个微卫星座位的平均观察杂合度(H_(o))和平均期望杂合度(H_(e))分别为0.47和0.80。13个位点的多态信息含量(PIC)为0.465(AJ06)～ 0.909(AJ09)，除AJ06为中度多态性(0.25
关键词：
刺参 SSR标记 遗传多样性 指纹图谱
[期刊] 水产学报
[作者]
李建中 鲁双庆 刘少军 刘正华 张轩杰 刘筠
在优化RAPD检测条件的基础上,从100个随机引物中筛选出60个扩增较好的引物对异源四倍体鲫鲤及其原始亲本红鲫和湘江野鲤相互间扩增DNA片段的异同性进行比较研究。结果显示,60个引物共产生1554条带,单一引物扩增的DNA片段数在6～20条之间,片段大小在200～3500bp之间。遗传相似率分析表明,异源四倍体鲫鲤与其原始母本红鲫的相似率为69.41%,与其原始父本野鲤的相似率为64.47%,说明异源四倍体鲫鲤接受原始母本红鲫的遗传物质要多一些;而红鲫和野鲤之间的相似率为42.18%,说明两者的基因组成有较大的相似性,从分子水平证实了红鲫和野鲤的远缘杂交具有较大的亲和性。在分析中,还发现异源四...
[期刊] 华北农学报
[作者]
朱洪运 颉建明 郁继华 简元才 康俊根
以不同生态型甘蓝抗枯萎病高代自交系R4-P1和感枯萎病自交系R2-P2组配得到的142个F2单株作为构图群体,利用AFLP、SSR、SRAP这3种分子标记技术对该群体进行遗传连锁分析,构建了一张含有9个连锁群、240个标记位点的高密度甘蓝分子遗传连锁图谱(LOD≥4),其包含162个AFLP标记、52个SSR标记和26个SRAP标记,标记间平均图距3.6 cM,覆盖864.4 cM。该图谱涉及标记种类多,是目前发表的覆盖基因组较全面的结球甘蓝亚种内遗传连锁图谱,可供参考的SSR标记数量多,将为后期甘蓝枯萎病抗性基因的定位及克隆搭建良好平台,同时为结球甘蓝重要农艺性状的QTL定位及分子标记辅助选...
关键词：
结球甘蓝 分子标记 遗传连锁图谱
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
赵春杰 李慧慧 刘德梅 兰彩霞
以印度小麦品种Sujata与澳大利亚小麦品系Avocet杂交获得148个家系的重组自交系群体为材料,利用6 397对基于二代测序技术的GBS标记、705对DArT-array标记和164对SSR标记构建普通小麦高密度遗传图谱。结果显示:该图谱覆盖小麦的21条染色体,分为25个连锁群,总长度6 104.4 cM,标记间平均距离为0.84 cM。本研究构建的高密度连锁图为后续QTL定位、图位克隆和分子标记辅助选择等研究奠定基础。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
周玲玲 张桂蓉 魏开建 邹桂伟 王卫民 梁宏伟 冉玮
采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23～40个;各群体的Nei's基因多样性(h)和Shannon's信息指数(I)平均值分别为0.205～0.218和0.324～0.341,4个群体间的h以及I差异不明显;基于Nei's无偏遗传距离构建的UPGMA树显示,洞庭湖二倍体和四倍体泥鳅群体亲缘关系最近,先聚为一支,再与武汉四倍体泥鳅聚为一支,而武汉二倍体泥鳅聚为单独一支。测定了4个泥鳅群体40个个体线粒体D...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
林强 祁广军 赵卫国 朱方容 邱长玉 陈小青 方荣俊
利用SRAP分子标记技术,对8份桑树二倍体品种和经秋水仙碱化学诱变得到的同源四倍体进行DNA遗传差异研究和聚类分析。结果表明:桑树不同材料二倍体及其同源四倍体间的SRAP多态性有明显差异。农桑8号、璜桑37号、湖桑197号、湖桑199号和国桑20号的二倍体及其同源四倍体间的扩增条带完全一致,无差异,而育71-1二倍体及其同源四倍体的SRAP多态性最高,达到1.41%,所有的二倍体及其同源四倍体材料均聚在一起,不同材料间亲缘关系近的聚为一大类。说明不同桑树材料经秋水仙素诱变后产生的遗传差异较大,桑树二倍体及其同源四倍体产生变异的原因可能是染色体上的等位基因积加效应造成DNA分子遗传结构的改变。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
秦鸿德 张天真
作物遗传作图与QTL定位常应用在源于两自交系的单交群体上,是利用2个亲本之间的遗传多态信息;而育种实践中经常用到的四交群体却很少用于遗传作图。本研究将异交物种中F1分离群体的作图方法应用于常异花授粉作物棉花上,以4个陆地棉栽培品种泗棉3号、苏棉12、中4133和8891为亲本,构建陆地棉品种间四交作图群体泗棉3号/苏棉12//中4133/8891,利用JoinMap3.0构建了1张陆地棉栽培品种间的SSR标记遗传图谱。该图谱由56个连锁群组成,总长为2113.3cM,含有286个SSR多态位点,覆盖率达42.3%;单个连锁群的标记数2~24个,平均5.2个;长度为0.37~125cM,平均38...
关键词：
陆地棉 四交群体 遗传作图
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
董胜君 王新鑫 张皓凯 陈建华 刘权钢 徐豪
东北杏（Armeniaca mandshurica）是东北地区极具经济开发前景的树种，具有重要的生态、经济、社会价值，应用SSR分子标记技术，采用101对扩增条带清晰、多态性高的引物，对61份东北杏野生种质进行PCR扩增，以分析东北杏的遗传多样性，并采用引物组合法构建东北杏的SSR指纹图谱，旨在为东北杏种质资源的鉴定评价、保育研究及合理开发利用提供科学依据。结果表明：101个位点的平均观测等位基因（Na）和有效等位基因的所占比值分别为9.6436和55.13%；平均观测杂合度（Ho）和平均期望杂合度（He）分别为0.2155和0.7711;Shannon’s信息指数（I）和多态性信息含量（PIC）分别为1.7533和0.7316，表明东北杏种质资源具有丰富的遗传多样性。10个种源的遗传多样性差异显著，其中，辽宁省沈阳市的遗传多样性最高，而辽宁省丹东市的遗传多样性最低。聚类结果表明，在遗传相似系数0.842处可以将东北杏种质分为4类(A类、B类、C类、D类)；在遗传距离0.250处可以将东北杏的不同种源分为3类(P1类、P2类、P3类)，均反映了地理种源对东北杏的分类结果占据主导地位。地理距离与遗传距离呈显著相关（p<0.05），表明东北杏种质存在地理隔离现象。采用3对SSR引物（L46、P58H、L28H）构建了东北杏种质的SSR指纹图谱，为东北杏种质资源的分子鉴定提供了重要方法。
[期刊] 华北农学报
[作者]
张继益 蒋观敏 罗耀武
对同源四倍体高粱品系和杂交种的细胞学观察发现，其减数分裂的各个时期均有特异性。具体表现在，前期Ⅰ有３．９４％的ＰＭＣ中存在多个核仁，其中以双核仁形式出现的频率最高；终变期—中期Ⅰ具有不同的染色体构型，可观察到同源染色体的四种组成形式；后期Ⅰ出现大量落后染色体，其中以单价体提前分离造成的染色单体落后较为常见，单价染色体落后较少；前期Ⅱ和四分体时期可观察到核外染色体；中期Ⅱ发现有部分染色体不排列于赤道板上；后期Ⅱ仍有新的落后染色体产生。对四价体频率和后期Ⅰ带有落后染色体细胞出现频率进行的统计分析发现，品系间和不同的杂交种间存在显著的差异，说明染色体的配对能力和正常分配能力均受基因型影响。研究还发现...
关键词：
高粱,多倍体,减数分裂,同源配对
[期刊] 中国农业科学
[作者]
骆晚侠 张李 杨凯 李奕松 赵波 李明 万平
【目的】以小豆SSR为锚定标记,将公开发表的豇豆SSR、普通菜豆SSR和EST-SSR标记定位整合到小豆遗传连锁群中,构建中国小豆遗传图谱,为小豆基因定位、图位克隆和分子标记辅助选择育种提供更多可用的分子标记。【方法】用1 473对SSR和EST-SSR引物进行PCR扩增,包括906对豇豆SSR、123对普通菜豆和196对小豆SSR引物及248对普通菜豆EST-SSR引物,筛选亲本间多态性标记,验证栽培小豆HB801×AG109及GM892×AG110的F2分离群体。【结果】整合和构建了含有145个SSR和EST-SSR标记小豆遗传连锁图谱,包括59个小豆SSR标记,新增63个豇豆SSR、9个...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
马海财 马雄 柳剑丽 巩红冬
以中国甜瓜地方品种自交系4G21与3A823杂交产生的114个F2单株为作图群体,采用SSR法构建了一张包含14个连锁群、196个标记位点的甜瓜遗传连锁图谱,新增加48个SSR标记.构建的遗传图谱覆盖基因组总长度806 cM,平均间距7.54 cM,最小间距1 cM,最大间距29 cM.将48个SSR标记定位于甜瓜遗传图谱,可作为锚定引物与不同群体构建的甜瓜遗传图谱整合.
关键词：
甜瓜 遗传图谱 SSR标记
[期刊] 中国水产科学
[作者]
乔慧 吴滟 傅洪拓 龚永生 蒋速飞 熊贻伟
采用SSR和SRAP标记结合拟测交策略构建青虾(Macrobrachium nipponense)遗传连锁图谱。共有175个标记(含27个SSR、148个SRAP标记)分布在53个连锁群上。每个连锁群含2~8个标记,其中不少于3个标记的连锁群有35个,连锁对18个,平均每个连锁群的标记数为3.3个;连锁群长度在6.7~91.2 cM之间,相邻标记间最大间隔为49.0 cM,最小为1.4 cM,平均间隔为13.1 cM。青虾框架图谱长度为997.2 cM,图谱观察总长度为2 270.5cM,根据估算,青虾遗传连锁图谱预期长度为4 380.6 cM,图谱的覆盖率为51.83%。本研究构建了青虾遗传...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
兰进好 张宝石
以黄早四×Mo17自交形成的191个F2单株为作图群体,利用240对SSR引物和280对AFLP选扩引物,在亲本黄早四和Mo17之间进行了多态性检测,筛选出91对SSR引物和20对AFLP选扩引物用于F2群体分析。利用上述引物组合共检测到248个多态性标记位点,其中的218个标记构建了玉米分子连锁图谱,该图谱覆盖基因组全长2015.5cM,标记间平均间距9.69cM。
关键词：
玉米 遗传图谱 SSR AFLP
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