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[期刊] 渔业科学进展
[作者]
廖梅杰 王锦锦 李彬 王印庚 荣小军 张正 范瑞用
为分析中、韩、俄沿海刺参(Apostichopus japonicus)种质遗传结构，本研究采用SSR指纹图谱技术对中国青岛、烟台，韩国浦项、群山、木浦，俄罗斯符拉迪沃斯托克的8个不同地理种群的刺参群体进行遗传多样性分析和指纹图谱构建。结果显示，13个微卫星座位的平均观察杂合度(H_(o))和平均期望杂合度(H_(e))分别为0.47和0.80。13个位点的多态信息含量(PIC)为0.465(AJ06)～ 0.909(AJ09)，除AJ06为中度多态性(0.25
关键词：
刺参 SSR标记 遗传多样性 指纹图谱
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
董胜君 王新鑫 张皓凯 陈建华 刘权钢 徐豪
东北杏（Armeniaca mandshurica）是东北地区极具经济开发前景的树种，具有重要的生态、经济、社会价值，应用SSR分子标记技术，采用101对扩增条带清晰、多态性高的引物，对61份东北杏野生种质进行PCR扩增，以分析东北杏的遗传多样性，并采用引物组合法构建东北杏的SSR指纹图谱，旨在为东北杏种质资源的鉴定评价、保育研究及合理开发利用提供科学依据。结果表明：101个位点的平均观测等位基因（Na）和有效等位基因的所占比值分别为9.6436和55.13%；平均观测杂合度（Ho）和平均期望杂合度（He）分别为0.2155和0.7711;Shannon’s信息指数（I）和多态性信息含量（PIC）分别为1.7533和0.7316，表明东北杏种质资源具有丰富的遗传多样性。10个种源的遗传多样性差异显著，其中，辽宁省沈阳市的遗传多样性最高，而辽宁省丹东市的遗传多样性最低。聚类结果表明，在遗传相似系数0.842处可以将东北杏种质分为4类(A类、B类、C类、D类)；在遗传距离0.250处可以将东北杏的不同种源分为3类(P1类、P2类、P3类)，均反映了地理种源对东北杏的分类结果占据主导地位。地理距离与遗传距离呈显著相关（p<0.05），表明东北杏种质存在地理隔离现象。采用3对SSR引物（L46、P58H、L28H）构建了东北杏种质的SSR指纹图谱，为东北杏种质资源的分子鉴定提供了重要方法。
[期刊] 水产学报
[作者]
张倩倩 陈杰 蒋霞云 邹曙明
为对不同鳊鲂鱼类进行群体鉴定和遗传多样性分析,从60对微卫星标记中筛选出18对多态性高的引物,构建了6个鳊鲂鱼类群体的微卫星DNA指纹图谱。结果显示,东江三角鲂、钱塘江三角鲂、厚颌鲂、广东鲂、团头鲂和长春鳊6群体的平均等位基因数(N a)分别为5.17、6.11、3.50、6.56、5.22、5.22,平均期望杂合度(H e)分别为0.634 2、0.720 4、0.546 2、0.681 2、0.675 2、0.559 7,平均多态信息含量(PIC)分别为0.575 6、0.666 9、0.472 0、0.630 6、0.606 4、0.517 0,表明钱塘江三角鲂的遗传多样性最高,厚颌鲂的...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
郭燕 刘声传 曹雨 赵华富 魏杰 鄢东海 周富裕
为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据，采用ＥＳＴ－ＳＳＲ标记对４０份贵州古茶树资源进行了遗传多样性分析和分子指纹鉴定。结果表明：２０个ＳＳＲ标记在４０份资源中共检测到７６个等位基因，平均每个标记３．８个，ＰＩＣ和Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数平均值分别为０．４６２和０．９３６，多态性适中。７６个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大，变异范围为１．３２％～８９．７４％。参试材料的ｎＥＩ＇Ｓ遗传距离（Ｄ）为０．０７５～０．８７５，当Ｄ≈０．１６０时，４０份古茶树资源可聚为６类，包括３个单独聚类和３个复合聚类。利用４个核心标记即可鉴定４０份古茶树资源，并根据等位基因带型，获得１８位数的．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
陈浩东 肖才升 李庠 匡政成 王为 李育强
为解决长江流域缺乏适合短季棉材料分子分析的SSR引物问题及加强对引进短季棉材料遗传信息的了解,以从中国农业科学院棉花研究所引进的15份短季棉品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,从214对候选SSR引物中筛选出稳定性好、多态性高、基本覆盖棉花26条染色体的68对引物,对15份材料的基因组DNA进行了PCR扩增,共检测出178个有效等位位点,平均每对引物检测到2.62个;引物多态性信息含量(PIC)值介于0.244 9~0.906 1,平均0.693 8。品种指纹分析结果显示,在15份材料中,12份材料可采用特征引物进行一次性区分,其他材料需采用引物组合来实...
关键词：
短季棉 SSR 指纹图谱 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
毛秀红 郑勇奇 孙百友 张元帅 韩丛聪 位晓 荀守华
【目的】对山东省刺槐无性系进行遗传多样性分析和指纹图谱构建,为刺槐新品种选育、遗传改良和品种鉴定提供可靠的依据,为中国其他省市刺槐遗传资源保存、评价与利用提供参考。【方法】采用荧光SSR引物进行PCR扩增,产物经毛细管电泳仪进行检测;利用所得结果分析49个无性系遗传多样性并构建其指纹图谱;采用非加权组平均法(UPGMA)进行基于亲缘关系的无性系聚类分析。【结果】8对SSR引物共检测到51个等位基因,每个位点的等位基因为215个,平均每对引物扩增出6.375个多态性等位基因。不同位点的PIC值变化范围很大,
[期刊] 西南农业学报
[作者]
殷丽琴 彭云强 付绍红 杨进 陈涛 黄敏 余勤 韦献雅 牛应泽
本试验从７０条ＩＳＳＲ引物中筛选出１５条多态性好的ＩＳＳＲ引物，对１０份原产自云南的彩色马铃薯材料进行遗传多样性分析和ＩＳＳＲ指纹图谱构建。结果表明，１５条引物共扩增到１０１条清晰条带，８９个多态性条带，多态性条带百分率为８９．２４％，引物平均多态性位点５．９３，平均多态性信息量０．８２３。聚类分析可将１０份彩色马铃薯划分为４类，其中Ｓ０３－２６７７和Ｓ０３－２６８５的遗传相似系数最大，而紫云１号和Ｓ０６－２７７的遗传相似系数最小。同时筛选到１条核心引物ＡＷ６７７７６，绘制了１０份彩色马铃薯品种的指纹图谱。结果表明ＩＳＳＲ标记能够较准确地按亲缘关系划分彩色马铃薯品种，可为我国彩色马铃薯的品种选．．．
[期刊] 中国农业科学
[作者]
匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱
【目的】采用SSR标记构建2008年中国3大棉区8个棉花主产省份32份棉花主栽品种的DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析。【方法】从214对候选引物中筛选出36对多态性高、稳定性好且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,构建棉花主栽品种DNA指纹图谱。【结果】36对SSR引物在32份材料中共扩增出142种多态性基因型,每对引物的基因型从2—11种不等,平均每对引物扩增出3.94种基因型。9对引物在10个品种上具有特征带型。最少采用5对引物进行组合鉴定即可将32个棉花品种完全区分开。NTSYS-pc V 2.10软件分析表明,长江流域棉区品种间遗传差异最大,新疆棉区次之,黄河流域棉区最小。常规品种...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
程保山 万志兵 洪德林
用68对SSR引物扩增了35个粳稻品种(系)的基因组DNA,结果有46对引物在35个品种间具有稳定多态性。有6个品种可用单一特异的SSR标记加以识别,其余29个品种则需要不同的SSR指纹组合才能识别。用12对核心引物构建的SSR指纹图谱能将35个粳稻品种逐一区别开来。35个粳稻品种间遗传相似系数的变异范围为0.27~0.98。采用类平均法进行聚类分析,在相似系数0.82处,可将35个粳稻品种分为4类。聚类分析结果基本上反映了依据系谱分析的品种间亲缘关系。
关键词：
粳稻 微卫星标记 指纹图谱 遗传相似性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
李怀志 张峻 李翔 陈火英
利用SRAP技术对36份茄子栽培品种进行了分子鉴定。结果表明:选用25对引物组合对其基因组DNA进行PCR扩增,共获得566条扩增带,其中多态性谱带102条,平均每个引物组合扩增出4.08条多态性条带;品种间‘望哈茄’与‘本溪早紫茄’遗传相似系数最大,为0.986,‘辐射1号’与‘沪紫长茄’间遗传相似系数为0.581。同时使用8对引物组合构建了36个品种的指纹图谱,其中引物FC8ME10可以把‘闽长茄’与其他茄子品种完全区分开。引物SA1OD3可以把‘敦和茄’和‘苏大青茄’同其他茄子品种区分开来。表明:SRAP标记技术能较好地从分子水平揭示出茄子品种的遗传多样性,并能有效应用于茄子品种指纹图谱...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
刘国霞 张全芳 杨雪 谭晴晴 胡悦 范阳阳 姚川 崔刚 步迅 陈雪燕 刘炳福
为对草莓品种进行分子鉴定，从59对SSR引物中筛选出18对多态性好的引物，采用毛细管电泳检测方法对84份八倍体草莓品种进行标记分析，检测每个标记等位变异大小，并进行初步遗传分析。将每个引物对84份草莓扩增的带型按照一定原则进行数字标注，为了简化编码，引物P1～P18分别编号为字母A～R,将引物编号与相应的带型编码进行组合得到该样品在特定引物的扩增产物编码，按照18对引物顺序串联这些编码形成该品种的DNA指纹图谱。结果表明：18对SSR引物共扩增得到多态性条带150个，不同引物扩增到多态性条带数4～17个，共检测到377个带型；各引物的多态性信息含量(PIC)值为0.494～0.908,平均值为0.738;利用18对SSR引物共构建了84个草莓品种的DNA指纹图谱。聚类分析结果表明：在遗传相似系数为0.99时能将所有品种区分开，一些来源相同的品种被优先聚在一起。综上，本研究成功构建84个草莓品种的DNA指纹图谱，这些品种遗传关系较近。
关键词：
草莓 SSR DNA指纹图谱 遗传分析
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
陈惠端 陈美霞 蔡金月 徐鲜钧 方平平 徐建堂 陶爱芬 牛小平 祁建民
以36个黄麻野生种和栽培种为材料,对其基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析.结果表明:从50对引物中筛选出扩增带型好、品种间带型差异明显、易于识别的34对多态性引物,共扩增出1845条多态性条带,平均每对引物扩增出51.25条,最后从中筛选出14对核心引物构建了36个黄麻品种的DNA指纹图谱,每个品种均有各自特异的DNA指纹,可为黄麻种质资源分子身份证绘制提供依据.
[期刊] 华北农学报
[作者]
王笑一 于拴仓 张凤兰 余阳俊 赵岫云 张德双
为研制我国小白菜品种的DUS测试标准,搜集和筛选了形态差异大、不同生态类型的地方品种和目前生产上栽培面积大的杂交一代品种80份,在植物学性状调查的基础上,利用SSR标记对80份小白菜品种进行了遗传特异性分析,构建了SSR指纹图谱。从131对SSR引物中筛选了20对多态引物组合,对80个品种进行了分析,共检测出56个多态性条带,多态性比率73.68%,平均每对引物组合产生2.8个多态性条带。用5对引物Na12E02、Na12A08、Ni4D09、BRMS-269和BRMS-296的组合获得了每个品种的SSR特征带,可以将80个品种区分开来,从而建立80份小白菜品种的SSR指纹图谱。基于SSR标记...
关键词：
小白菜 SSR标记 指纹图谱
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
郭娟 樊军锋 梁军
【目的】利用新型分子标记EST-SSR,从分子水平上区分亲缘关系较近、形态上难以区分的5个美洲黑杨品种,并构建其指纹图谱。【方法】采用EST-SSR分子标记,从22对引物中筛选多态性引物,用以鉴别I-69杨、陕林3号、创新杨1号、南抗1号、北抗1号5个美洲黑杨品种,并根据多态性条带计算各品种间的遗传相似系数,构建各自的指纹图谱。【结果】从22对引物中筛选出的17对多态性引物共扩增出86条谱带,其中多态性条带69条,多态性比率为80.23%,有5对引物可以将5个美洲黑杨品种完全区分开;各品种间的遗传相似系数为0.444 4~0.717 2,平均相似系数为0.580 8;构建了各品种的EST-SS...
[期刊] 华北农学报
[作者]
韩宗福 赵逢涛 王景会 王宗文 申贵芳 孔凡金 李汝忠 张军
利用28对SSR核心引物构建了25个鲁棉研系列抗虫棉品种的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。28对核心引物的SSR位点分属21条染色体,等位基因数为2~8个,平均4.39个;PIC值为0.63~0.93,平均0.84。数字指纹图谱显示,最少采用BNL1421、BNL1513、BNL1231、NAU2026和BNL2646这5对引物组合可以将25份供试材料区分开。对其中14个常规品种的遗传多样性分析表明,其遗传相似系数介于0.35~0.87,平均为0.57。此结果可为现阶段鲁棉研系列种质资源的杂交选育提供依据。
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