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[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
程建慧 廖荣俊 宋其岩 陈友吾 叶碧欢 柳娟 沈建军 李海波
【目的】科学保护和合理利用香椿天然遗传资源，揭示浙西南香椿天然群体的分子遗传背景。【方法】利用16个多态性SSR标记对浙西南5个香椿天然居群的156份香椿材料进行遗传多样性、遗传分化程度和遗传结构分析。【结果】1)156份香椿材料在16个SSR位点共检测出110个等位基因，每个位点的平均等位基因数(N_a)和平均有效等位基因数(N_e)分别为6.88和2.48，不同等位基因在香椿个体中呈不均匀分布；16个SSR位点的多态性信息含量(PIC)介于0.04～0.79，平均为0.45;2)16个SSR位点的Shannon’s信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)平均值分别为0.99和0.49；居群内近交系数(F_(is))和总近交系数(F_(it))平均值分别为-0.02和0.03，遗传分化系数(F_(st))平均值为0.05，仅5%的遗传变异来自不同居群间；基因流(N_m)平均值为4.82；分子方差(AMOVA)分析显示遗传分化的根本原因为总的个体内变异(95%)，极少为居群间变异(5%)，没有来自居群内的个体变异；3)遗传差异和UPGMA聚类分析表明5个居群的Nei’s基因遗传一致度为0.93。浙江开化和浙江常山居群的遗传差异最小，Nei’s基因遗传一致度为0.97；浙江龙游居群与其他4个居群的遗传差异较大；4)群体遗传结构分析表明156份香椿材料无最佳K值；根据ΔK值最大分为3个亚群，各居群材料在3个亚群中皆有一定数量分布。【结论】浙西南天然居群香椿资源在个体水平上的遗传多样性较为丰富；居群内近交程度很低，主要繁殖方式为杂交；香椿居群间的遗传分化程度很小，居群间存在频繁的基因交流，遗传变异主要发生在个体内；浙西南香椿不同居群间的遗传差异总体上较小；居群间未形成相对独立的遗传结构，绝大部分的香椿种质遗传背景比较单一，少量种质拥有复杂的遗传背景。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
刘闵豪 肖兴翠 张春花 何芝然 黄振 李佳蔓
【目的】揭示四川主要野生香椿种源群体的遗传多样性，为香椿种质资源的保护与育种提供理论基础。【方法】筛选多态性好的简单重复序列（SSR）分子标记，对16个香椿种源群体进行遗传多样性分析，计算遗传多样性指数，并通过遗传相似性进行聚类分析。【结果】筛选出8对SSR分子标记，共检测到69个等位基因位点，有效等位基因数23.764个；遗传分化指数显示群体分化率为0.296 0，基因流为0.594 6；分子方差分析显示群体间方差分量比为22%，群体内为9%，个体间为69%；遗传多样性指数显示香椿种源群体的平均Nei’s遗传多样性指数为0.339 6,Shannon信息指数为0.597 1;16个种源群体的遗传一致度为0.482 2～0.987 6，遗传距离为0.037 9～0.729 5，在遗传相似性阈值为0.82处将可参试的种源群体划分为6类，其中四川香椿种源群体可分为5类。【结论】四川主要香椿种源群体的群体遗传多样性极其丰富，群体间遗传分化较大，基因交流不频繁，主要变异存在于个体间，大部分种源群体间遗传一致度较高，遗传距离较小，种源群体的遗传距离与种源分布地实际距离具有明显的相关性。在后续的四川香椿育种工作及研究中，应重视群体内不同类型个体的保存，建立资源保护区，尽量涵盖全部的香椿种源类别，以选育适合不同生长地区的良种，为四川香椿资源的进一步推广奠定基础。
关键词：
香椿 群体 SSR 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
王滑 郝俊民 王宝庆 裴东
Eight Juglans populations (4 populations of J. sigillata and 4 of J. regia), which are distributed in Yunnan, Sichuan, Henan, and Shanxi Province, were selected to investigate their genetic structure and diversity using 8 microsatellite loci. A moderate level of genetic diversity was observed at pop...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张怀山 鄢秀芹 鲁敏 王道平 安华明
【目的】通过分析评价贵州野生刺梨(Rosa roxburghii Tratt)资源居群遗传多样性和遗传结构,为刺梨资源的保护和发掘利用提供科学依据。【方法】从刺梨EST-SSR引物中筛选扩增效果好、多态性较高的10对引物,对收集的12个野生刺梨自然居群(共255份资源)的遗传多样性及遗传结构应用POPGENE 1.31软件进行分析,并根据Nei’s标准遗传距离,利用NTSYS-pc2.10e软件对各居群进行聚类分析,同时进行Nei’s遗传距离与地理距离的Mantel相关性检验。【结果】居群内Shannon
关键词：
刺梨 SSR 遗传多样性 居群遗传结构
[期刊] 林业科学
[作者]
刘军 陈益泰 孙宗修 姜景民 何贵平 饶龙兵 吴天林
利用8对微卫星标记对分布于我国的3个毛红椿天然居群的遗传结构进行研究。收集毛红椿3个天然居群209个单株材料并对每个单株的位置进行定位,运用空间自相关分析研究毛红椿居群的空间遗传结构,了解该物种的进化历程和濒危机制,并为制定有效的保护策略和措施提供科学依据。研究结果表明:1)居群等位基因的平均数为5.3,有效等位基因数平均为2.6;2)观察杂合度平均为0.5990,期望杂合度平均为0.5893;3)空间自相关分析结果揭示毛红椿宜丰天然居群在0~240m存在着显著的空间遗传结构;4)宾川和师宗居群内遗传变异在空间上为随机分布,不存在明显的空间遗传结构;5)导致居群内空间遗传结构形成的原因,包括花...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
刁松锋 邵文豪 陈涛 姜景民 段文彬
［目的］通过我国无患子主要分布区的居群样本，研究无患子天然居群的遗传多样性和遗传结构。［方法］采用ＩＳＳＲ分子标记技术，利用１２条ＩＳＳＲ引物分析１８个天然居群的２６５株个体样本。［结果］表明无患子遗传多样性水平较高，物种和居群水平上的多态位点百分率（ＰＰＢ）分别为９５．３７％和５７．８２％，Ｓｈａｎｎｏｎ’Ｓ信息指数（Ｉ）分别为０．２５６ ９和０．１９９ ８，ｎｅＩ’Ｓ遗传多样性指数（ｈ）分别为０．３９０ ９和０．２９８ ０。ａＭｏＶａ分析表明，１８个居群间出现一定程度的遗传分化，且遗传变异主要发生在居群内。ＵＰＧＭａ聚类和Ｍａｎｔｅｌ检验结果表明，１８个天然居群可分为２大组群，且居群间的地．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
杨海健 周心智 谭平 张云贵 弓亚林 杨世勇 钟昭林
香橙是我国原产珍贵柑橘资源,具有很大的开发利用价值。为了进一步保护和利用该类资源,通过2种分子标记研究了9个香橙资源的多样性,并比较了这两种标记在分析植物多态性上的差异。结果显示:两标记均显示出9个香橙之间均存在不同程度的差异,其中,3号香橙和8号糖橙遗传距离最近,2号香橙和7号软枝香橙距离最远。分析显示,SRAP标记比SSR标记能够更容易、更快捷的获得大量的多态性分子标记,而如果这两种标记相结合,将能获得更全面的扩增信息和更准确的聚类结果。
关键词：
SSR SRAP 香橙 遗传多样性
[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
李峰卿
红豆树(Ormosia hosiei)为国家二级重点保护植物,自然分布于陕西南部和江苏、浙江、江西、福建、湖北、四川、重庆、贵州等省(市),呈星散间断或小块状生于溪边、山谷常绿阔叶林中。红豆树材质优良,有光泽,其纹理美观,是制作工艺雕刻、装饰镶嵌等的上等用材。由于红豆树具有较高的经济和人文价值,其原有天然资源被遭到严重的人为破坏。红豆树现有天然居群较小,自然更新困难,已经处于濒危状态,但目前对其遗传背景了解较少。本研究在已有研究基础上,首先,开发适用于红豆树遗传多样性分析的SSR标记,系统研究不同小流域红
[期刊] 华北农学报
[作者]
史红丽 韩明玉 赵彩平
采用相关序列扩增多态性(SRAP)和简单序列重复多态性(SSR)分子标记,对47份桃(Prunus persica)品种的遗传多样性进行了分析。选用带型清晰的19对SRAP引物和5对SSR引物对47份桃品种的基因组DNA进行扩增,共检测到82个多态性位点。平均每对引物组合产生3.4个多态性位点。应用NTSYS-PC(Version 2.1)软件采用平均距离法(UPGMA)进行聚类分析。结果表明,47份桃品种的相关系数为0.501~0.842,从总体来看,所选取的47个桃品种相关系数相对较低,遗传多样性比较丰富。对聚类结果分析显示,大部分具有亲缘关系的品种及形态学、生物学特征相近的品种聚在一类,...
关键词：
桃 SRAP SSR 遗传多样性
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
郑刘辉 詹利云 侯宇 喻卫武 曾燕如 戴文圣
【目的】旨在利用SSR荧光标记对榧树雄株5个野生居群的121个单株进行遗传多样性及群体遗传结构分析，为榧树雄株遗传背景、种质资源评价和优良种质筛选提供参考。【方法】采用CTAB法提取榧树基因组DNA，设计引物，通过荧光引物PCR扩增方法，利用毛细管电泳检测技术检测榧树雄株的多态位点。【结果】24对引物共检测到85个等位基因，变幅为2～7个，平均每个标记有3.542个，其中平均有效等位基因有1.915个。5个居群的平均Nei’s遗传多样性指数为0.365，平均Shannon’s信息指数为0.608。5个居群中，多态位点百分比为75.00%～95.83%，平均为82.50%，居群遗传多样性从大到小依次为嵊州居群、临安居群、富阳居群、黄山居群、淳安居群。居群间的基因流为4.172，遗传分化系数为0.096，遗传分化程度很低。聚类分析结果表明：5个居群的遗传相似度为0.865～0.978，平均为0.932。【结论】雄性榧树居群的遗传多样性较丰富。榧树雄株的遗传变异主要存在于居群内，但居群间也存在一定的基因交流。5个居群可以分为3大类群，这与表型的遗传多样性分析结果比较相似。图4表6参32
[期刊] 西南农业学报
[作者]
张羽 陈进 高文渊 张晓娟
为了掌握陕南地区油菜主要育种材料的遗传多样性，了解其遗传背景，明确各材料间的亲缘关系，为油菜育种提供理论依据。利用３４对有多态性的ＳＲＡＰ标记和２５对ＳＳＲ标记，对５６份陕南地区油菜自交系材料进行遗传多样性分析。结果表明，ＳＲＡＰ标记共检测到２７３个等位变异，平均每个标记检测到８个等位基因，每个ＳＲＡＰ位点的遗传多态性信息含量在０．３２～０．９３，平均值为０．６４。供试材料的遗传相似系数集中在０．４７～０．９３，两两遗传相似系数的平均值为０．６９，变幅为０．３４～０．９３，聚类分析表明。在相似系数０．４７处，所有材料被聚为一类。ＳＳＲ标记共检测到１５５个等位基因，平均每个标记检测到７个等位基因．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
李丽霞 刘济明 黄小龙 骆畅 熊雪 柳嘉佳 邓明明 李佳
【目的】评价米槁天然种群的遗传多样性，为其遗传资源的保护和利用提供理论依据。【方法】采用ISSR分子标记，对采自贵州的8个米槁（Cinnamomum migao H.W.Li）天然种群及其62株个体的遗传多样性和遗传结构进行分析，基于遗传相似系数和遗传距离对8个种群进行UPGMA聚类分析，并对62株米槁建立PCoA散点聚类图。【结果】米槁8个天然种群通过19条引物扩增出167个多态性条带，多态性条带比例为89.78%。米槁种群间平均观测等位基因数为1.572 6，有效等位基因数为1.390 9，Nei’s
关键词：
米槁 天然种群 ISSR标记 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
张玉梅 徐刚标 申响保 吴雪琴 覃建庸 陈娟
利用ISSR分子标记分析来自11个天然珙桐种群的遗传多样性。从100条引物中筛选出5条引物能扩增出稳定、清晰且具多态性的条带,共扩增出77个条带。其中74个为多态,多态条带百分率(PPB)为96.10%;各种群PPB值为37.66%～63.64%,平均为54.07%。种内Shannon多样性指数(HSP)为0.4849,种群内Shannon多样性指数(HPOP)为0.1886～0.3274,平均为0.2774。这表明珙桐在物种和种群水平上均维持较高的遗传多样性。分子方差分析显示,种群间与种群内遗传变异分别占总遗传变异的46.22%,53.78%,种群间呈高度遗传分化。种群间遗传距离与对应的地理...
关键词：
珙桐 遗传多样性 ISSR 保护策略
[期刊] 西南农业学报
[作者]
林开勤 李悦欣 魏杰 汪安然 喻云春 段长流 王枫 鄢东海
【目的】探明石阡茶树种质资源的遗传多样性和亲缘关系，为开发和保护石阡茶树资源提供理论依据。【方法】利用SSR分子标记技术，对贵州石阡7个茶树群体122份资源进行SSR位点多态性、遗传多样性及亲缘关系分析，并对不同地域来源的石阡茶树资源进行遗传距离分析。【结果】21对SSR引物共扩增出72个多态性位点，每对引物平均扩增3.43个位点，多态信息含量（PIC）为0.19～0.76，平均为0.51，等位基因在群体中分布均匀且多态性较高。7个茶树群体的Nei’s基因多样性指数（He）均值为0.22，Shannon信息指数（I）均值为0.33，多态位点百分率（PPB）均值为75%，遗传距离为0.017 7～0.103 6。122份石阡茶树资源的遗传距离为0.10～0.67，当遗传距离为0.21时，分为3个大类群：第I类群包含113份资源，第Ⅱ类群仅有1份茶树资源(SWXD009)，第Ⅲ类群包含8份茶树资源，分别是SWXD-B、SWXD-F、SWXD-H、SWXD-M、SQT3、SQT4、SWX005和SWX006；在3个大类群中均有五德镇长兴村的茶树资源。【结论】贵州石阡茶树群体间的遗传差异较小，但群体内个体单株之间具有一定的遗传差异，尤其是五德长兴茶树群体内的遗传背景较丰富，筛选优异资源的基础较好。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
秦英英 韩海荣 康峰峰 赵琦
利用SSR分子标记对山西省8个辽东栎天然群体进行遗传多样性分析,并与北京东灵山小龙门林场群体进行地理距离和遗传距离相关关系的对比分析,旨在为辽东栎遗传多样性保护提供一定的依据。研究使用11对SSR引物进行遗传多样性分析,得到平均等位基因数为10.2727,平均有效等位基因数为5.1859;得出山西省辽东栎群体的平均期望杂合度为0.7538,Nei多样性指数为0.7521,Shannon多样性指数为1.7543。这一结果表明辽东栎的遗传多样性水平是相对较高的。研究还表明,辽东栎群体的绝大部分遗传变异是发生在群体内的(95.99%),仅有4.01%的遗传变异发生在群体间,并且遗传距离和地理距离之间...
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