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[期刊] 林业科学
[作者]
占明明 杨毅 程子彰 苏光灿 胡伟 陈华萍 黄乾明
【目的】油橄榄作为重要的油料经济作物,其健康价值越来越受到人们的重视,相关产业在我国已初具规模。引种品种混乱和遗传关系不明确影响了我国油橄榄事业的进一步发展,因此我国油橄榄品种的遗传变异有待评估。【方法】采用SRAP技术对32个来自四川西昌市的油橄榄品种进行遗传多样性分析,其中5个油橄榄品种为国内育种品种,27个油橄榄品种为国外引种品种。利用改良的CTAB法提取得到32个油橄榄品种的基因组DNA。【结果】25对SRAP引物共扩增出293条多态性条带,平均每对引物扩增出11.72条多态性条带,平均多态性比率为90.75%;引物组合M5E5扩增出的多态性条带最多(37条);期望杂合度(He)为0....
关键词：
油橄榄 SRAP 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
李金花 俞宁
为研究我国53个油橄榄品种(13个引种驯化选育品种和40个引种品种)的遗传变异,利用SSR荧光标记技术对从甘肃的陇南、四川的西昌、广元和云南的永仁5个地点收集的107份材料进行遗传多样性分析。20对引物共检测出294个等位变异,每对引物的等位基因数在9～26之间,平均为14.7个;多态性信息量PIC值平均为0.73(0.33～0.89)。基于Jaccard系数的NJ法聚类分析结果表明,参试材料分为2大组,选育品种与引种品种未被分开,但大多数具有相同品种名称的材料被分在同一组中,无论是选育品种还是引种品种均具有高水平遗传多样性。对来自5个国家的油橄榄品种群体进行分子方差分析(AMOVA)结果表明...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
徐悦 黄兰 李金花 邓煜 张建国 曾艳飞
[目的]该研究对我国油橄榄主产区甘肃省陇南市现有品种进行了的准确鉴定和遗传多样性计算，为我国油橄榄种质资源引种和驯化、育种及利用提供参考。[方法]利用13个SSR标记对来自83个油橄榄品种的110棵单株进行品种鉴定和遗传多样性分析，并对其中属于68个品种的90棵单株进行叶片、果实和果核形态性状的测定和分析，最后开展了基于表型性状和SSR标记的单株聚类和结果比较。[结果]陇南油橄榄表型数量性状和质量性状多样性指数分别为1.83和0.79;SSR分析发现83个品种包括78个不同的基因型，观测杂合度和期望杂合度分别为0.683和0.754；这些基因型可分为3大组，基因型所属分组与其起源地有一定相关性；我国选育品种的基因型大多与起源意大利的品种分组更近；与基于表型的聚类树相比，基于SSR基因型的聚类树更倾向于将同一品种的不同单株聚在同一支。[结论]陇南共有78种不同基因型的品种，SSR标记比表型鉴定品种更具准确性，且能反映亲缘关系。该地区油橄榄表型多样性和遗传多样性较高，引种品种主要是来自地中海西部和中部国家，国内选育品种与意大利起源的品种相似；为更多样化可考虑引种或选育更多起源国的品种。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
秦倩 王楠楠 李金花 苏光灿
［目的］利用表型性状和分子标记，对我国油橄榄品种进行鉴定和遗传多样性研究，有利于种质资源保存和利用，对了解油橄榄品种的组成结构及未来的引种和育种工作都具有重要意义。［方法］以甘肃省陇南市１７个油橄榄品种为研究材料，利用表型上１５个数量性状、１８个质量性状和８个ＳＳＲ荧光标记分别进行多样性和聚类分析。［结果］各性状在品种间存在显著差异，数量性状和质量性状的表型多样性指数分别介于１．５７９ ２．０８９和０．３６２１．０９１，８个ＳＳＲ位点共检测到５１个等位基因变异，平均每个位点等位基因数为６．３７５个，利用表型性状和ＳＳＲ标记可以将１７个品种完全区分开。［结论］１７个油橄榄品种具有较丰富的表型和遗．．．
[期刊] 林业科学研究
[作者]
王楠楠 李金花 王长海 苏光灿 付永平
[目的]利用SSR标记对油橄榄品种自由授粉的子代进行父本分析,研究品种间的亲和性,确定品种适宜的授粉树,为油橄榄建园品种配置提供依据。[方法]以四川凉山州油橄榄园‘豆果’、‘鄂植8号’和‘九峰4号’3个品种的自由授粉子代为材料,利用12个SSR标记进行父本分析。[结果]每个SSR位点的等位基因数为512个,平均9.08个,其中,DCA11和GAPU103A等位基因数(12个)最多。试验群体中的平均观测杂合度为0.732,平均期望杂合度为0.709,平均多态性信息量为0.675。12个SSR标记在95%的置
关键词：
油橄榄 SSR标记 父本分析 亲和性
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
刘晨 高明伟 刘超 何俊娜 吴健 僧珊珊 钟雄辉 吴晨雨 张凤勤 义鸣放
为进一步研究唐菖蒲杂交育种亲本选配和杂种的早期鉴定，以２１个唐菖蒲品种为试材，对这些品种的表型性状特征进行聚类分析，并利用ＳＲＡＰ技术对其构建指纹图谱。结果表明：２１个品种的表型性状表现出一定的遗传多样性，变异６．７８％～１４７．２９％。经过对ＳＲＡＰ－ＰＣＲ反应条件的优化，从１００对引物中筛选出１６对引物适用于唐菖蒲ＰＣＲ反应；通过对２１个品种ＳＲＡＰ标记的试验与分析，共在４６８个位点上扩增出条带，多态性位点４１１个，平均每个引物组合扩增多态性条带２５．７个；基于ＳＲＡＰ标记的ＵＰＧＭＡ聚类分析显示，２１个品种间ＪＡＣＣＡＲｄＰ’Ｓ相似系数０．４６～０．７５。将２种聚类结果进行比较发现，唐菖．．．
关键词：
唐菖蒲 表型性状 SRAP标记
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
周鹏 林玮 朱芹 周祥斌 吴林瑛 陈晓阳
采用相关序列扩增多态性分子标记方法，对７个省份２３个种源的刨花润楠进行遗传多样性分析。结果表明：１）１２对引物组合共扩增出１５７条带，其中１１５条为多态性条带，占总条带数的７３．２４％；２）１２对引物的多态性指数介于０．４０６～０．５０２，平均值为０．４７６；３）通过分子方差分析发现，刨花润楠种源内差异占总差异的７２．１９％，种源间差异占总差异的２７．８１％，种源内差异为刨花润楠差异的主要来源；４）基于遗传距离的聚类分析显示，２３个种源的刨花润楠可分为４类：第１类为湖南、广东、广西的所有参试种源和江西多数种源，第２类为浙江参试的３个种源，第３类为江西婺源和安徽黄山２个种源，第４类为福建参试的４．．．
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
刘明骞 陈丽君 丁美美 欧阳昆唏 惠文凯 李俊成 陈晓阳
采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记方法,对收集到的来源于11个国家的19个剑豆种群进行遗传多样性分析。结果表明:1)在扩增出的274条清晰条带中,具有多态性的有144条,占总数的52.6%;2)28对引物的多态性指数(Polymorphism information content,PIC)介于0.16~0.43,平均值为0.28;3)剑豆总遗传多样性指数(Ht)为0.285 6,基因流(Nm)为0.065 6;4)通过分子方差分析(Analysis of molecular variance,AMOVA)...
关键词：
剑豆 相关序列扩增多态性 遗传多样性
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
蒋开彬 祝文娟 潘文 何紫迪 朱报著 Nguyen Duy Kien 黄少伟
【目的】在我国野生土沉香被大量被采伐,种质资源越来越少,甚至面临消失的情况下,为了利用与保护野生土沉香提供理论依据,采用SRAP分子标记对其种源遗传多样性进行分析。【方法】基于我国11个土沉香种源群体和越南2个土沉香种源群体的SRAP结果,应用POPGEN32软件对遗传多样性参数进行计算。【结果】各群体Nei’s基因多样度指数的变化范围为0.171 5～0.539 4,Shannon多样性指数的变化范围为0.249 1～0.483 7,多态位点百分比的变化范围为42.03%～76.81%。运用GenAlex 6.4软件对土沉香13个群体进行分子方差分析(Analysis of molecular variance, AMOVA),结果显示有30%的遗传变异来自土沉香群体间,70%的遗传变异来自土沉香群体内。【结论】13个土沉香种源有中度的遗传多样性和遗传分化,野生土沉香种质资源正日渐稀少,应该加强资源的保护与利用。
[期刊] 林业科学
[作者]
廖柏勇 王芳 陈丽君 刘明骞 欧阳昆唏 阙青敏 惠文凯 李培 陈晓阳
【目的】利用相关序列扩增多态性（ＳＲＡＰ）分子标记对来自１７个省（区）的３１个苦楝种源进行遗传多样性分析，为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过ＳＲＡＰ分子标记获得１／０数据矩阵，计算ＳＲＡＰ分子标记各项遗传参数，同时进行分子方差分析（ＡＭＯＶＡ）。随后计算遗传距离矩阵并进行主坐标分析（ＰＣＯ Ａ）、邻接法聚类分析（ＮｅｉｇｈｂＯｕＲ－ＪＯｉＮｉＮｇ）以及遗传距离和地理距离ＭＡＮｔｅｌ相关性分析。【结果】从７８３对ＳＲＡＰ引物中筛选出的２０对引物可扩增出２５７条清晰的条带，其中１４５条具有多态性。引物多态性信息指数（ＰｉＣ）为０．２６２～０．４７８，均值为０．３８５。ＰｉＣ．．．
关键词：
苦楝 SRAP 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 林业科学
[作者]
黄勇
利用SRAP分子标记,从126对引物组合中筛选出11对引物,对小果油茶全分布区的19个居群514个样品进行遗传多样性分析。结果表明:11对引物组合总共扩增出226条谱带,平均每对引物组合扩增20.55条谱带,其中多态性条带为226,占条带总数的100%。19个居群的遗传距离为0.0216～0.1645,显示了较近的亲缘关系。UPGMA聚类结果表明,除了福建6个居群和江西3个以外,其余地理位置相近的居群未能聚在一起。多态性比率(PPB)、Nei’s基因多样度(H)及Shannon信息指数(I)变化幅度分别为84.96%～95.58%,0.3213～0.3887及0.4732～0.5676;从物种...
关键词：
小果油茶 SRAP标记 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
邱源 韩华柏 李俊强 侯春霞 王永清
采用RAPD技术对23个引种的油橄榄品种进行分类和鉴定研究。从80个10bp的随机引物中筛选出11个扩增效果较好的引物进行扩增,共产生127条带,其中78条为多态性带,占61.4%,平均每个引物扩增的DNA多态性带数为7.09条。4个品种具有特异的位点,可作为种质鉴定的依据。根据扩增结果构建反映品种间亲缘关系的UPGMA聚类图,23个品种可划分为2大类。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
李怀志 张峻 李翔 陈火英
利用SRAP技术对36份茄子栽培品种进行了分子鉴定。结果表明:选用25对引物组合对其基因组DNA进行PCR扩增,共获得566条扩增带,其中多态性谱带102条,平均每个引物组合扩增出4.08条多态性条带;品种间‘望哈茄’与‘本溪早紫茄’遗传相似系数最大,为0.986,‘辐射1号’与‘沪紫长茄’间遗传相似系数为0.581。同时使用8对引物组合构建了36个品种的指纹图谱,其中引物FC8ME10可以把‘闽长茄’与其他茄子品种完全区分开。引物SA1OD3可以把‘敦和茄’和‘苏大青茄’同其他茄子品种区分开来。表明:SRAP标记技术能较好地从分子水平揭示出茄子品种的遗传多样性,并能有效应用于茄子品种指纹图谱...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
文雁成 王汉中 沈金雄 刘贵华 张书芬
【目的】探讨中国甘蓝型油菜遗传多样性和遗传基础。【方法】采用SRAP(sequence-relatedamplifiedpolymorphism)标记对建国以来不同时期选育的130个品种进行分析。【结果】25个SRAP引物组合共扩增到509个谱带、123个多态性带;多态性带的比例为24%。每对引物组合的谱带数和多态性带数分别为20.4个和4.9个。在遗传距离为0.12处,将130个甘蓝型油菜品种(系)分为A、B、C、D4个类群,其中78.5%的品种归入C类。C类又可在遗传距离0.10处分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ5个亚群,又有58.5%的品种归入Ⅲ亚群。说明我国近60%的甘蓝型油菜品种遗传多样性较匮...
[期刊] 华北农学报
[作者]
史红丽 韩明玉 赵彩平
采用相关序列扩增多态性(SRAP)和简单序列重复多态性(SSR)分子标记,对47份桃(Prunus persica)品种的遗传多样性进行了分析。选用带型清晰的19对SRAP引物和5对SSR引物对47份桃品种的基因组DNA进行扩增,共检测到82个多态性位点。平均每对引物组合产生3.4个多态性位点。应用NTSYS-PC(Version 2.1)软件采用平均距离法(UPGMA)进行聚类分析。结果表明,47份桃品种的相关系数为0.501~0.842,从总体来看,所选取的47个桃品种相关系数相对较低,遗传多样性比较丰富。对聚类结果分析显示,大部分具有亲缘关系的品种及形态学、生物学特征相近的品种聚在一类,...
关键词：
桃 SRAP SSR 遗传多样性
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