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[期刊] 中国农业科学
[作者]
唐源江 曹雯静 吴坤林
【目的】探究国兰种质资源遗传多样性水平,并构建分子指纹图谱及分子身份证,为在分子水平上鉴定国兰种质提供技术支撑,也为国兰种质资源开发、保存利用及种质创新奠定基础。【方法】以收集于华南及邻近地区的139份国兰栽培品种和野生种质为材料,采用改良的CTAB法提取基因组DNA,由13条正向引物和16条反向引物随机组成208对SRAP引物,每对引物用品种‘宋梅’和‘大勋’扩增产物进行筛选;PCR扩增产物应用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳胶图进行人工读带,并计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。按照Botstein公式计算多态信息含量;用POPGENE32软件计算观测等位基因数、...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
刘昔辉 张荣华 张革民 周会 宋焕忠 方位宽 区惠平 杨丽涛 李杨瑞
以广西地区的１５份河八王无性系为材料，采用ＡＦＬＰ标记结合毛细管电泳进行分析，计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。进行遗传相似系数和ＵＰＧＭＡ聚类分析，并建立分子身份证。２５对ＡＦＬＰ引物组合在１５份河八王种质资源中共扩增出２ ２０８个位点，其中多态性位点１ ９１４个，多态性比率（ＰＰＢ）为８７．１１％。ＵＰＧＭＡ聚类分析表明，供试的１５份河八王种质资源其遗传相似系数变化范围在０．６５６～０．８７８，在相似系数为０．７０６时，可划分为３个类群。结合特征带和不同引物组合方法可有效建立河八王种质资源特异分子身份证，置信概率达到９９．９９％。所供试河八王种质具有较丰富的遗传多．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
何文 蔡兆琴 陈会鲜 张秀芬 黄珍玲 郭素云 阮丽霞 莫周美
【目的】对葛根种质资源进行遗传多样性分析，并构建分子身份证，为葛根种质鉴定提供参考依据。【方法】以收集自不同地区的 21 份葛根种质为试验材料，采用变异系数、Shannon-Weaver多样性指数、聚类分析、ISSR引物多态性研究葛根种质资源遗传多样性，并构建分子身份证。【结果】21份葛根种质资源各遗传性状表现出丰富的多样性，其Shannon-Weaver多样性指数为0.381～1.844，平均值为1.166，其中主茎粗Shannon-Weaver多样性指数最大（1.844）。葛根种质遗传性状变异系数范围为16.330% ～55.714%，平均值为35.157%，其中，成熟叶片花纹变异系数最大（55.714%），其他遗传性状变异系数均大于15.000%。从48条ISSR引物中筛选出10条条带清晰，多态性较好的引物，其多态性比率为40.00%～100.00%；多态性信息含量值（PIC）、等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei’s基因多样性（H'）和Shannon’s信息指数（I）分别为0.7043～0.8468、1.4000～2.0000、1.1135～1.4741、0.0776～0.2999、0.1276～0.4720，其平均值分别为0.7800、1.7830、1.3514、0.2160、0.3353。说明所筛选的10条ISSR引物多态性检测效率较高，适合用于葛根种质资源的遗传多样性分析。聚类分析可将供试葛根种质分成3类，部分种质与地理来源存在一定关联性，存在不同地域种质互相引进或交流。按照ISSR引物中PIC值由大到小的顺序，筛选P6、P17和P42作为核心引物，构建葛根种质资源DNA分子身份证。【结论】21份葛根种质资源具有丰富的遗传多样性和较高杂合度，可作为今后葛根育种选育基础材料。筛选出的P6、P17和P42可作为核心引物，能有效区分21份葛根种质资源，并构建分子身份证。本研究为葛根种质资源区分和精准鉴定及葛根种质资源DNA分子身份证的构建提供了理论参考。
[期刊] 林业科学
[作者]
廖柏勇 王芳 陈丽君 刘明骞 欧阳昆唏 阙青敏 惠文凯 李培 陈晓阳
【目的】利用相关序列扩增多态性（ＳＲＡＰ）分子标记对来自１７个省（区）的３１个苦楝种源进行遗传多样性分析，为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过ＳＲＡＰ分子标记获得１／０数据矩阵，计算ＳＲＡＰ分子标记各项遗传参数，同时进行分子方差分析（ＡＭＯＶＡ）。随后计算遗传距离矩阵并进行主坐标分析（ＰＣＯ Ａ）、邻接法聚类分析（ＮｅｉｇｈｂＯｕＲ－ＪＯｉＮｉＮｇ）以及遗传距离和地理距离ＭＡＮｔｅｌ相关性分析。【结果】从７８３对ＳＲＡＰ引物中筛选出的２０对引物可扩增出２５７条清晰的条带，其中１４５条具有多态性。引物多态性信息指数（ＰｉＣ）为０．２６２～０．４７８，均值为０．３８５。ＰｉＣ．．．
关键词：
苦楝 SRAP 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
冷宇鑫 闵义 付阳云 周奎 何颖 文晓鹏
为精准鉴定贵州荞麦种质资源，采用SSR分子标记对60份荞麦种质进行遗传多样性分析，构建DNA分子身份证数据库。结果显示，从100对SSR引物中筛选出16对稳定性好、多态性丰富的引物，在60份供试种质中共扩增出174个多态性条带；Shannon’s信息指数、Nei’s多样性指数、多态信息指数均值分别为0.337、0.206、0.693，引物的多态性较好，能有效揭示60份荞麦种质的遗传多样性；在Dice遗传相似系数为0.374时，所有供试材料可聚为A、B、C三组；当Dice遗传相似系数为0.484时，将苦荞组（A组）更细分为A1、A2两个小组。采用毛细管电泳及8%的聚丙烯酰胺凝胶（PAGE）电泳对SSR标记扩增产物进行双验证，2种方法的聚类结果一致。结果表明，本研究开发的高效性SSR分子标记能够有效地鉴定贵州荞麦重要种质的遗传多样性且用于构建分子身份证。
[期刊] 华北农学报
[作者]
李立新 杨途熙 魏安智 冯世静 陈旅 侯娜
为探讨花椒种质资源的遗传多样性和群体结构特征，用ＳＲＡＰ分子标记技术对采自陕西、山西、云南、四川、甘肃５个种源地的２６９份花椒属样品的遗传多样性进行了研究。结果表明：从１２０对引物组合中筛选出了１６对图谱带型清晰、丰富、重复性好的引物组合；２６９份花椒属样品用这些引物组合共扩增出１６９条清晰可重复的条带，其中多态性条带１５１条，多态性比率为９３．８％；通过ＵＰＧＭＡ分子系统聚类法，将２６９份花椒属种质划分为２个类群，即竹叶椒类群和花椒类群；在所研究的５个种源中，陕西花椒的遗传多样性水平最高，陕西和甘肃花椒的遗传距离最小，陕西和云南花椒的遗传距离最大；ＡＭＯＶＡ分子变异分析显示，在花椒总的遗传变．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
聂琼 黄锡才 蒙剑波 李希金 刘仁祥
为从分子水平上揭示烟草种质资源的遗传背景和亲缘关系,采用SRAP分子标记方法,对烟草属5个种共134份种质进行了遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:从228对SRAP引物中筛选出15对多态性、稳定性好的引物,15对引物在134个材料上共获得241条多态性条带,多态性比例为81.7%。134份材料间的遗传距离为0.0213～0.5802,遗传多样性较丰富。在遗传相似系数为0.57时,被聚为5个大类群,相同栽培类型的烟草并未明显的聚为一类。可较好地从分子水平反映这些烟草品种(系)间的遗传背景和亲缘关系。
关键词：
烟草 种质资源 SRAP 遗传多样性
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
谢荟 祝文娟 张应中 蒋开彬 刘天颐 莫其辉 黄少伟
利用SRAP分子标记建立广东省4个种群153个单株的广宁红花油茶种质资源遗传多样性评价体系,从594对引物组合中最终选出13对引物,结果表明:13对引物组合共扩增出206条带,平均每对引物组合获得15.85条,多态性条带为187条,多态性条带比率(PPB)为90.78%。种群Nei's基因多样度(h)、Shannon多样性指数(I)、多态性位点百分比(PPL)变化范围分别为0.217 90.356 3,0.321 70.524 8及58.25%92.72%,平均值分别为0.307 8,0.456 3及83
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
周鹏 林玮 朱芹 周祥斌 吴林瑛 陈晓阳
采用相关序列扩增多态性分子标记方法，对７个省份２３个种源的刨花润楠进行遗传多样性分析。结果表明：１）１２对引物组合共扩增出１５７条带，其中１１５条为多态性条带，占总条带数的７３．２４％；２）１２对引物的多态性指数介于０．４０６～０．５０２，平均值为０．４７６；３）通过分子方差分析发现，刨花润楠种源内差异占总差异的７２．１９％，种源间差异占总差异的２７．８１％，种源内差异为刨花润楠差异的主要来源；４）基于遗传距离的聚类分析显示，２３个种源的刨花润楠可分为４类：第１类为湖南、广东、广西的所有参试种源和江西多数种源，第２类为浙江参试的３个种源，第３类为江西婺源和安徽黄山２个种源，第４类为福建参试的４．．．
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
刘明骞 陈丽君 丁美美 欧阳昆唏 惠文凯 李俊成 陈晓阳
采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记方法,对收集到的来源于11个国家的19个剑豆种群进行遗传多样性分析。结果表明:1)在扩增出的274条清晰条带中,具有多态性的有144条,占总数的52.6%;2)28对引物的多态性指数(Polymorphism information content,PIC)介于0.16~0.43,平均值为0.28;3)剑豆总遗传多样性指数(Ht)为0.285 6,基因流(Nm)为0.065 6;4)通过分子方差分析(Analysis of molecular variance,AMOVA)...
关键词：
剑豆 相关序列扩增多态性 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
黄勇
利用SRAP分子标记,从126对引物组合中筛选出11对引物,对小果油茶全分布区的19个居群514个样品进行遗传多样性分析。结果表明:11对引物组合总共扩增出226条谱带,平均每对引物组合扩增20.55条谱带,其中多态性条带为226,占条带总数的100%。19个居群的遗传距离为0.0216～0.1645,显示了较近的亲缘关系。UPGMA聚类结果表明,除了福建6个居群和江西3个以外,其余地理位置相近的居群未能聚在一起。多态性比率(PPB)、Nei’s基因多样度(H)及Shannon信息指数(I)变化幅度分别为84.96%～95.58%,0.3213～0.3887及0.4732～0.5676;从物种...
关键词：
小果油茶 SRAP标记 遗传多样性
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
王洁 朱锡彭 王腾斐 朱建军 李文俊 邢丙聪 郑颖
【目的】采用简单重复序列间扩增(ISSR)和相关序列扩增多态性(SRAP)等2种标记技术分析不同种源白及Bletilla striata样本的遗传多样性水平和遗传关系，为白及种质的鉴定、分类、保护和开发提供理论依据。【方法】从100个ISSR引物和238对SRAP引物组合中筛选出多态性高、扩增条带清晰、重复性好的引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增，用Popgene 32.0计算来自浙江、云南、贵州和四川等省32个不同种源白及的遗传多样性参数和遗传距离，用NTSYS-pc 2.10e进行聚类分析。【结果】从100个ISSR引物中筛选出11个多态性较好的引物，共扩增出188个条带，平均每个引物扩增出17.09个条带，其中多态性位点174个，占总扩增片段的92.20%；从238对SRAP引物组合中筛选出11对多态性较好的引物组合，共扩增出216个条带，平均每个引物扩增出19.64个条带，其中多态性位点202个，占总扩增片段的93.52%。综合ISSR和SRAP的标记结果发现：四川白及种源的遗传多样性水平最高，贵州最低；非加权组平均法(UPGMA聚类)和主坐标分析(PCoA分析)结果显示：聚为一类的白及种源大多来自同一省份，云南省与四川省白及种源的遗传距离较近，浙江省和贵州省白及种源的遗传距离较近，说明遗传距离与地理距离存在一定的重合，但并不呈正相关。【结论】本研究所选白及种源间具有较高的遗传多样性，ISSR和SRAP标记技术均可有效揭示白及的遗传多样性和亲缘关系。图4表4参25
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘倩 戴志刚 陈基权 温岚 龚友才 粟建光
【目的】以来源于不同国家和地区的127份红麻栽培种、野生种和近缘种为材料,利用SRAP标记构建红麻种质资源分子身份证。【方法】利用SRAP标记对127份红麻种质进行遗传分析,计算其遗传相似系数。利用UPGMA法作聚类图,构建分子身份证。【结果】40对引物组合在127份红麻种质材料中共扩增出383条DNA片段,其中,375条为多态性片段,总的多态性条带比率(PPB)为97.9%。UPGMA聚类分析结果表明,相似系数为0.70时,127份红麻种质资源被划分为4个类群。用SRAP特征谱带和多种引物组合2种方法可有效区分所有材料,并构建出127份红麻种质资源特异性分子身份证,置信概率达到99.99%。...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈少瑜 李江 陈伟 罗婷 陈绍安
【目的】揭示思茅松主要分布区内11个群体共338份种质资源遗传多样性水平和遗传结构状况，为思茅松育种群体构建及高轮次遗传改良提供理论依据。【方法】用筛选出的18对引物进行SSR-PCR扩增，产物经毛细管电泳后用PowerMarker v3.25、GenALEx v6.4.1及Structure 2.3.4等软件分析思茅松种质资源的遗传多样性。【结果】思茅松种质资源的遗传多样性较为丰富。18对SSR引物共检测到120个等位基因，平均每个位点的等位基因数为6.667个；种质资源的平均期望杂合度（H_(e)）为0.524；平均Shannon信息指数（I）为1.016；平均多态信息指数（PIC）为0.468。思茅松种质资源的遗传变异主要来源于群体内的个体。种质资源的群体分化系数（F_(ST)）平均为0.091，即群体间的遗传变异只占总变异的9.1%，分子方差分析（AMOVA）得到了同样的结果。各位点的基因流（N_(m)）平均为4.627（N_(m) > 1），较大的基因流减小了群体间的分化。STRUCTURE分析将338份思茅松种质资源划分为2个类群，基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类将11个群体划分成3组，普洱市6个群体聚为一组；西双版纳州的2个群体、临沧市和保山市的各1个群体聚为一组；德宏州的1个群体单独为一组。【结论】思茅松种质资源具有丰富的遗传多样性，遗传变异主要来源于群体内，在进行思茅松的遗传改良时，应根据其遗传结构特征，重点选择多样性高的群体，也要特别关注对群体内优良单株的选择。
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘丹丹 逯晓萍 张瑞霞 温莹 薛春雷 杨凯 任锐 王亚男 韩平安
利用SRAP分子标记技术构建了22份高丹草品种的指纹图谱。该指纹图谱可以准确区分供试的所有22个高丹草品种,置信概率达到99.9 999%,为高丹草品种划分提供了基础。利用筛选出的19个多态性较好的SRAP引物组合对22个高丹草品种进行遗传多样性分析鉴定,共扩增出450个位点,其中多态性位点369个;平均每个引物组合产生23.6个位点和19.4个多态性位点,平均多态性水平为82.2%。通过采用UPGMA方法进行聚类分析,遗传相似系数在0.66～0.94之间,以遗传相似系数0.674为阈值,可将供试材料分为2个类群。
关键词：
高丹草 指纹图谱 遗传多样性 SRAP
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