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[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
刘昆玉 徐丰 石雪晖 钟晓红 杨国顺 倪建军
运用SRAP标记对分布在湖南省内的21份刺葡萄资源进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明:从84对SRAP引物组合中筛选出的7个引物组合中共扩增出61条带,其中有34条稳定的多态性条带,多态性比率为55.7%;运用NTSYS软件计算出21份材料的成对遗传相似系数为0.80～0.99,在遗传相似系数0.92处可将全部材料划分为3个类群;UPGMA聚类分析表明,在湖南省境内分布的刺葡萄有6个基本类型,并推测出了农大1号至农大9号育种材料(2003年由湖南农业大学运用秋水仙素处理不同地区刺葡萄种籽得到的诱变材料,由于经过3次搬迁,现已遗失亲本档案)的亲本。
关键词：
刺葡萄 亲缘关系 SRAP标记
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
巴巧瑞 赵政阳 高华 王艳丽 孙彪
【目的】用SSR和SRAP分子标记技术,分析苹果(Malus domestica Borkh.)重要栽培品种的亲缘关系,为苹果杂交育种亲本及组合的选配提供参考。【方法】用亲缘关系较近的金冠和秦冠筛选SSR和SRAP多态性引物,利用SSR和SRAP分子标记技术对37个苹果栽培品种进行遗传多样性和亲缘关系分析。【结果】筛选出了用于37个苹果主栽品种亲缘关系分析的10对SSR和10对SRAP引物,其分别产生56和64条扩增带,平均多态性比率分别为61.09%和70.8%。根据SSR+SRAP分析结果,37个苹果品种被聚为6大类。【结论】所选取的引物能够有效地揭示供试苹果品种的遗传多样性,并且苹果品种...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
董爱香 王涛 徐进 赵梁军
应用SRAP分子标记,对24个国内外优良一串红品种(系)进行了亲缘关系分析。结果表明,从88个引物组合中筛选到24个多态性较高的引物组合,共扩增出306个多态性条带,平均每个引物组合产生12.8个多态性条带,获得了较高的多态性比率。对不同样本产生的扩增产物进行聚类分析发现,在相似系数0.72的水平上,可以把24个一串红品种(系)分为3大类:本课题组自育品种(系)全部聚在Ⅰ类;国外品种全部聚在Ⅱ类;‘展望白’和‘展望鲑红’聚为Ⅲ类,与其他花色截然分开。一串红SRAP分子标记的多态性与种质来源的关系密切,利用SRAP分子标记的聚类分析结果可为一串红杂交亲本选配、品种鉴定和知识产权保护提供依据。
关键词：
一串红 多态性 SRAP
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李晓玲 程岁寒 杨进
本文采用１０对ＳＲＡＰ引物，对１０份续断属植物样本进行遗传亲缘关系分析。结果表明，１０对引物共扩出５６６条谱带，平均每对引物扩增出５６．６条带，片段大小为１５０～２０００ ｂＰ，其中多态性条带为３６２条，平均每对引物扩增的多态性条带为３６．２条，平均多态性条带百分率为６４％，结果表明续断属植物具有丰富的遗传变异。ＵＰＧＭＡ聚类分析表明１０份续断属植物分为２个大类和４个亚类，大头续断和深紫续断有一定的亲缘关系，与其它续断属植物间遗传差异较大；日本续断、恩施续断、大理续断和川续断遗传亲缘关系较近，其中大理续断和川续断聚为一个小类群，支持大理续断并入川续断。
关键词：
续断属植物 SRAP 遗传亲缘关系
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
黄非 盛炳成
酯酶同工酶和过氧化物酶同工酶的酶谱显示:宿晓红葡萄与欧洲葡萄酶谱距离系数分别为0.00和0.20,亲缘关系最近.花粉电子扫描结果亦表明,两者花粉粒在大小,芽发孔两端扩展性和网眼形状等方面,具有相同特征.实验结果还显示,宿绕红葡萄与华东葡萄具有一定同源性,两者亲缘关系较近.
关键词：
葡萄 同工酶 花粉 扫描 亲缘关系
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王明明 陈化榜 王建华 宋振巧 李圣波
【目的】探讨木瓜属品种的种源、亲缘关系以及遗传多样性,旨在为木瓜属品种的分类提供科学依据。【方法】利用22个SRAP(sequence-related amplified polymorphism)引物组合对27份品种和5份野生种进行聚类分析、主坐标分析及遗传多样性的评价。【结果】共检测到152个多态性位点,平均每个引物组合6.91个多态性位点,多态性位点百分数为73.08%。聚类分析显示,32份材料可划分为毛叶木瓜种系、西藏木瓜、皱皮木瓜种系、日本木瓜种系4个类群。西藏木瓜与毛叶木瓜种系聚为一支,亲缘关系密切;日本木瓜种系和皱皮木瓜种系聚为另一支,日本木瓜种系与毛叶木瓜种系亲缘关系最远,皱皮...
关键词：
木瓜属 品种 SRAP 遗传多样性
[期刊] 林业科学研究
[作者]
郭丽琴 李友丽 饶国栋 张建国
[目的]对采集自不同地区的22个杨属树种33个样本的遗传变异和亲缘关系进行研究。[方法]利用从72对引物中筛选出的40对相关序列扩增多态性(SRAP)引物组合对杨属不同树种进行遗传变异和亲缘关系分析。[结果]40对引物共扩增出487条清晰条带,其中,多态性条带为441条,多态性条带比率为90.55%。利用UPGMA得到的聚类分析结果表明了33个样本间的遗传关系,遗传相似系数为0.448 6～0.910 3;白杨派和胡杨派的派间平均遗传距离最大,为0.377 7。聚类分析结果表明,33个样本可分为4大类,这一聚类结果与传统的分类结果一致。通过系统发育树可以看出,白杨派单独形成一个分支,黑杨派、胡杨派和青杨派形成另一分支,可能暗示白杨派与其他各派的亲缘关系较远,青杨派与黑杨派和胡杨派的亲缘关系则比较近。[结论]不同的杨树品种在SRAP位点有较高的多态性,SRAP分子标记适用于分析杨属的遗传变异和亲缘关系,研究结果为杨属树种的分类鉴定、系统进化等提供了一定的理论依据。
关键词：
杨属 SRAP 遗传变异 亲缘关系
[期刊] 华北农学报
[作者]
耿广东 张素勤 贾开家 徐如宏 任明见 张庆勤
采用SRAP技术分析提莫菲维小麦与葡萄牙野燕麦远缘杂交后代的真实性及其特点。结果表明,22对SRAP引物中,20对引物在双亲间扩增出多态性条带,其多态性比率为73.81%。me4-em1、me3-em5、me4-em3和me3-em3四对引物在提莫菲维小麦与葡萄牙野燕麦杂交F3株系中扩增出双亲特异带,表明该F3株系具有双亲的遗传物质,该F3株系是提莫菲维小麦和葡萄牙野燕麦成功属间杂交的真实杂种后代。在F3株系的扩增结果中部分双亲带型消失,并且提莫菲维小麦消失的带数远少于野燕麦的;同时有非父母标记新带型出现。杂种后代DNA序列的这种变化可能有利于新形成异源多倍体小麦的快速进化、遗传协调和遗传稳定...
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
许玉凤 闫小风 邵美妮 关萍 陈旭辉 曲波
为探讨北方地区15种鸢尾的遗传多样性和亲缘关系,采用SRAP分子标记的方法对鸢尾遗传多样性的亲缘关系进行评价。结果表明:利用优化的SRAP-PCR反应体系和筛选出的6对引物组合对15种鸢尾扩增,共得到207条清晰稳定的条带,片段大小是50~1500bp,多态位点百分比为100%。多态信息含量为0.3976,遗传多样性参数分别为Na=2.000,Ne=1.6947±0.2416,H=0.3967±0.0941,I=0.5816±0.1065,说明15种鸢尾在种水平上有较高的遗传多样性,并有较大的遗传分化。鸢尾的亲缘关系通过UPGMA聚类分析和主成分分析两种方法进行,在遗传相似性系数为0.589时...
关键词：
鸢尾 SRAP 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈勇 唐昌亮 李浩 钱磊 罗树凯 周修任
【目的】分析所收集洋紫荆(Bauhinia variegata)种质资源亲缘关系和遗传多样性。【方法】通过ISSR-PCR方法,对15个不同来源和特征的洋紫荆个体间亲缘关系和遗传多样性进行研究。【结果】ISSR实验共得到150个清晰位点,其中145位点具有多态性,总的多态性比率为96.67%,其中8条引物的扩增产物多态位点比率达到100%;洋紫荆材料的平均等位基因(Na)为1.9667±0.1801、平均有效等位基因数(Ne)为1.6847±0.2934、平均Shannon信息指数(I)为0.5611±0.1639;亲缘关系分析表明,相同花色、相似开花量或相同来源地的不同个体间亲缘关系有时不显著。【结论】所收集洋紫荆资源形态特征具有丰富的遗传来源,亲缘关系复杂;同时,由于异地洋紫荆商品种苗活跃的流通导致不同来源种质资源亲缘关系复杂,种质资源高度杂合,育种过程亲本性状的纯化需较长周期。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
潘丽芹 李纪元 李绍翠 范正琪 殷恒福 何丽波
【目的】开发基于山茶转录组的EST-SSR分子标记,并应用该标记进行山茶种质的亲缘关系分析。【方法】本研究以山茶叶片转录组测序所获得的50 518条Unigenes为背景数据,利用MISA软件搜索SSR标记,设计并筛选SSR多态性引物,对8份山茶种质进行了UPGMA聚类。【结果】共检索到13 197个SSR位点,SSR的发生频率和分布频率分别为19.52%、26.12%,平均分布距离为4.33 kb;在6种SSR重复类型中,以单、二、三核苷酸这3种重复类型为主,分别占48.420%、34.917%和15.473%;出现频率高的基序类型为A/T、AG/CT和AT/TA,占总SSR位点的79.61%;三核苷酸中以AAG/CTT、ACC/GGT、AAT/ATT类型居多;在设计出的10 974对引物中,随机选用其中90对引物进行多态筛选,73对引物扩增产物与预期大小一致,有效扩增率为81.11%,29对引物存在扩增多态性,占39.73%。扩增得到72个等位基因,有效等位基因数平均达到3.264;观察杂合度和期望杂合度的平均值分别为0.208和0.638,引物多态信息含量平均为0.496;8份山茶种质在相似系数为0.58时,可以分为4类:山茶原种为Ⅰ类,‘黑蛋石’、‘红叶黑魔法’和‘黑骑士’为Ⅱ类,‘黑魔法’和‘金华美女’分别为Ⅲ类和Ⅳ类。【结论】山茶转录组测序的Unigenes信息可作为SSR标记开发的有效来源,为山茶的遗传多样性研究、亲缘关系鉴定以及分子标记辅助育种等奠定了一定的理论基础。
关键词：
山茶 转录组 SSR 标记 亲缘关系
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
许先松 刘志钦 林晓丹 牟少亮 官德义 何水林
采用形态学标记与序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记相结合的手段,分别对49和72份辣椒资源的遗传多样性及亲缘关系进行了分析.结果表明:(1)根据果实性状及叶色等形态学标记聚类分析,在遗传相似系数为0.69处将辣椒分为4个组群,即朝天椒、圆锥椒、棱柱形椒和樱桃形椒;(2)基于辣椒资源的SRAP分子标记分析,发现72份辣椒材料间的遗传相似系数为0.56-0.91,在相似系数为0.737处被分为8个组群,形态学标记与SRAP分子标记结果有较大的出入.可见,SRAP作为分子标记的结果不受环境影响,所揭示的种质资源遗传多样性更为丰富,在辣椒等作物遗传多样性和亲缘关系的研究中更具应用价值.
关键词：
辣椒 SRAP 表型 聚类分析 种质资源
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李秀 徐坤 巩彪
【目的】生姜为无性繁殖作物,千百年来,在经历气候变迁、自然选择和人工选择过程中,其生物学性状呈现出多方面变异,造就了许多地方品种。因此,研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,对生姜资源进行科学分类,为生姜种质的收集、保护和创新利用提供理论依据。【方法】采用CTAB法提取生姜幼叶基因组DNA,利用SRAP(相关序列扩增多态性,sequence-related amplified polymorphism)分子标记技术,对来源于世界不同地区的51份生姜种质的基因组DNA进行多态性扩增,PCR产物采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,采用银染法显色。根据电泳结果得到"0,1"矩阵,利用POPGENE...
关键词：
生姜 SRAP 遗传多样性分析 起源
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李莉 彭建营 白瑞霞
【目的】从分子水平研究中国枣属植物的系统发育,探讨枣属属下种间及种下分类单元间的亲缘关系,为自然的中国枣属植物分类系统的建立提供新的分子证据,同时为中国枣种质资源的保护和利用提供科学依据。【方法】利用SRAP标记方法对原产中国的枣属全部14个种、11个枣品种和1个外类群的基因组DNA进行分析。【结果】筛选出的19对SRAP引物组合对26份供试材料共扩增出580条DNA带,其中570条为多态带(占98.28%),平均每个引物扩增多态性带30条。26份材料间的遗传相似系数变化范围为0.22～0.99。UPGMA聚类表明,26份材料在相似系数0.38处被划分为6个类群。【结论】SRAP标记技术能很好...
关键词：
枣属植物 亲缘关系 SRAP 聚类分析
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
李永平 康建坂 林珲 温庆放
研究影响佛手瓜SRAP扩增反应的主要因子,建立佛手瓜SRAP反应的优化体系,利用SRAP技术对福建省10个佛手瓜栽培种进行亲缘关系分析.筛选出10对具有较高扩增多态性的引物组合,共扩增出条带114条,其中62条为多态性条带,多态率为54.38%.聚类分析结果表明,当遗传距离为0.20时,可将10个品种分为3个类群;遗传距离为0.35时,10个品种聚为一类,表明10个佛手瓜品种的亲缘关系较近.
关键词：
佛手瓜 亲缘关系 SRAP 聚类分析
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