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[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈勇 唐昌亮 李浩 钱磊 罗树凯 周修任
【目的】分析所收集洋紫荆(Bauhinia variegata)种质资源亲缘关系和遗传多样性。【方法】通过ISSR-PCR方法,对15个不同来源和特征的洋紫荆个体间亲缘关系和遗传多样性进行研究。【结果】ISSR实验共得到150个清晰位点,其中145位点具有多态性,总的多态性比率为96.67%,其中8条引物的扩增产物多态位点比率达到100%;洋紫荆材料的平均等位基因(Na)为1.9667±0.1801、平均有效等位基因数(Ne)为1.6847±0.2934、平均Shannon信息指数(I)为0.5611±0.1639;亲缘关系分析表明,相同花色、相似开花量或相同来源地的不同个体间亲缘关系有时不显著。【结论】所收集洋紫荆资源形态特征具有丰富的遗传来源,亲缘关系复杂;同时,由于异地洋紫荆商品种苗活跃的流通导致不同来源种质资源亲缘关系复杂,种质资源高度杂合,育种过程亲本性状的纯化需较长周期。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
苏小俊 徐海 陈龙正 宋波 袁希汉 陈劲枫
利用ISSR标记,对来源于不同地区的丝瓜种质资源的亲缘关系进行了分析。从80个ISSR引物中筛选出多态性强、重复性好的9个引物,对43份丝瓜种质基因组DNA进行扩增,共扩增出60条谱带,平均每个引物扩增出6.67条带,其中多态性带47个,多态性位点百分率为78.3%。丝瓜种质间遗传相似系数变化范围在0.37~0.98之间,暗示了丝瓜栽培种内的遗传基础相对狭窄。利用UPGMA聚类分析,43份丝瓜种质被划分为6个类群,类群的划分与形态学性状较吻合,而且与地理来源也有较高的相关性。
关键词:
丝瓜 种质资源 亲缘关系 ISSR
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张建农 赵建华 李计红 曹孜义
采用RAPD标记方法,对22份甜瓜材料进行了品种遗传多样性分析。结果显示,22个引物共扩增 出189条DNA条带,其中143条表现出多态性,占总带数的75.66%。聚类分析结果表明,22个甜瓜品种(系)中首 先可分为薄皮甜瓜与厚皮甜瓜两大类,彼此亲缘关系最远;厚皮甜瓜中网纹甜瓜与厚皮甜瓜的其他类型又被分开; 再次一级的分类为河套蜜、皇后和剩余的厚皮甜瓜。对照田间表型观察结果可见,聚类分析结果与传统分类结果相 近。
关键词:
甜瓜 亲缘关系 RAPD标记 聚类分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵海艳 赵纯 杨爱珍 王秋锦 孙清鹏 赵福宽
参考马铃薯和烟草的反转录转座子LTRs保守区域设计引物,对34份茄子材料进行PCR扩增,得到了多态性丰富的指纹图谱。聚类分析将34份茄子材料分为三大类群,表明IRAP分子标记适合于茄子种质资源的亲缘关系分析。
关键词:
茄子 种质资源 分子标记 IRAP
[期刊] 中国农业科学
[作者]
梁景霞 祁建民 方平平 王涛 陈顺辉 周东新 陶爱芬 梁康迳 吴为人
【目的】深化烟草种质资源遗传多样性研究,为种质利用改良烟草提供科学依据。【方法】应用ISSR分子标记方法,以烟草属6个种共96份有代表性的种质为材料,进行遗传多样性与亲缘关系分析。【结果】(1)从90个ISSR引物中筛选出18个多态性引物对全部实验材料进行PCR扩增,共获得314条稳定的条带,其中多态性条带299条(占95.2%)。(2)应用Nei-Li相似系数法估算了96份材料间的遗传相似系数(GS),其GS在0.28~0.97之间,遗传多样性丰富。其中普通烟草栽培品种间的GS在0.62~0.98之间,平均为0.78,品种间的遗传基础相对狭窄,普通烟草栽培种与野生种及黄花烟的GS在0.28~...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张鹏 张源 王铁杆 严兴洪
利用SSR标记对9个坛紫菜(Porphyra haitanensis)品系(2个野生品系,2个优良品系,2个杂交品系,3个色素突变品系)的丝状体进行了亲缘关系分析。结果表明:从52对微卫星引物中筛选出7对引物,它们的反应稳定并且其PCR产物具有多态性。9个品系的平均有效等位基因数(Ne)为1.7166,平均期望杂合度(He)为0.4074,平均多态信息含量(PIC)为0.3308,Shannon多样性指数(I)为0.6239。用Nei氏法计算出这9个品系的遗传距离和遗传相似性系数,再用UPMGA和Neighbor-joining2种方法所获得的系统学关系图,其结果均基本上反映了各品系间的亲缘关...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
宋莎 吴亚维 季祥彪 宋来庆 文晓鹏
利用ISSR标记,对原产于贵州的10份苹果砧木种质及5份外来资源进行亲缘关系分析。结果表明:采用筛选出的10条引物,共扩增出75条重复性好的谱带,其中67条(占89.3%)具有多态性;应用引物827、M05、M08可以有效区分出15份种质资源,构建其DNA的ISSR指纹图谱;聚类分析表明,供试种质间的遗传相似系数在0.49~0.93之间,贵州威宁苹果砧木资源遗传多样性较为丰富,ISSR分析结果与已知苹果砧木间的谱系较为一致。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
薛延桃 陆平 乔治军 刘敏轩 王瑞云
【目的】利用SSR标记,分析黍稷种质资源(野生材料和地方品种)的遗传多样性水平,揭示不同来源黍稷种质资源的亲缘关系和遗传群体结构差异,为黍稷起源进化研究奠定基础。【方法】用6份地理差异显著的黍稷种质资源对137对小宗作物课题组开发的具有多态性的SSR引物进行初步筛选,最终筛选103对条带清晰、扩增良好且多态性稳定的SSR引物,利用这103对多态性SSR标记对146份黍稷材料进行PCR扩增,通过遗传参数、聚类、遗传结构等分析,评估不同个体间及不同群体间的遗传多样性,探讨遗传结构差异。【结果】103对SSR标记共检测出308个等位基因(Na),平均值为2.99,平均Shannon-Weaver指数(I)为0.8478,平均期望杂合度为0.3642,平均多态性信息含量指数(PIC)为0.5544。103对SSR标记的分布区间为0—1、1—2、2—3、3—4和4—5,分辨率范围为0.334—4.002,77.67%的标记分布于区间1—4,具有适度分辨力。国内资源的观测等位基因数(2.9126)、多样性指数(0.8302)、期望杂合度(0.5023)、多态性信息含量指数(0.5278)均高于国外资源,遗传多样性更丰富。12个群体的遗传距离的变化范围为0.0783—0.5762,均值为0.2938;遗传一致度变化范围为0.5620—0.9247,均值为0.75,遗传相似性与地理分布具有一定相关性,地理分布越近,遗传距离越小,遗传一致度越高。聚类分析在遗传距离为0.15处可以把12个群体分为4个组群,其中南美洲和山西资源各自独立分为一支,与其他资源亲缘关系较远。个体间聚类中,国内外资源划分非常显著,在遗传距离为0.63处,146份黍稷资源可分为3大组群,组群Ⅰ和组群Ⅱ为国外资源,组群Ⅲ为国内资源。组群Ⅱ在遗传距离为0.39处又分为3个亚群,组群Ⅲ在遗传距离为0.45处分为5个亚群,其中亚洲与欧洲资源、中国河北与中国山西、中国内蒙古资源的遗传关系较近。遗传结构分析结果显示国内外群体间存在明显的遗传分化,其中5个组群(组群2、组群5、组群6、组群7和组群9)为国内野生资源特有基因型,分布较为分散;2个组群(组群1和组群4)为国外资源特有基因型,分布较为集中。中国宁夏、南美洲资源的群体结构趋向单一化,中国河北、中国黑龙江、亚洲资源的群体结构趋向多元化。UPGMA聚类结果与遗传结构分析结果一致,且不同地区黍稷资源群体间遗传关系远近均与其地理分布相关。【结论】野生资源的遗传多样性高于国外资源,其中中国河北群体的遗传多样性最丰富,中国河北可能是黍稷的起源中心。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
张春英 林同香 戴思兰 张秀英
利用36 个10 碱基随机引物首次对7 个桃花( Prunus persica) 近缘种和30 个品种进行RAPD 反应.对选出10 个引物扩增出的具有多态性、可重复的、清晰的56 条带进行数据统计分析.UPGMA聚类结果表明:毛桃( Prunus persica) 和新疆桃( P. ferganensis) 之间具有很近的亲缘关系,并与桃花品种间亲缘关系最近;寿星桃、垂枝桃类品种在聚类图上分别较早地聚合在一起,表明其类内具有较近的亲缘关系;直枝桃类品种没有在树系图上聚合成一类,表明直枝桃花品种群演化关系较为复杂,多样性较丰富.该文还从分子生物学角度探讨了桃花品种的演化关系和‘白花山碧’桃的起...
[期刊] 华北农学报
[作者]
谭雪 郭爽 郑少薇 刘自珠 林锦英 林春华
利用RAPD标记对31份菜薹种质资源进行亲缘关系分析。15条引物共扩增出66条谱带,其中多态性谱带43条,多态性谱带比率为65.15%,平均多样性指数为0.302 2。菜薹种质间遗传距离为0.046 5~0.526 1,遗传相似系数为0.590 9~0.954 5。UPGMA聚类结果表明,在遗传相似系数为0.74处,将31份菜薹种质分为四大类,与传统分类结果相比,有一致性但也存在差异。
关键词:
菜薹 种质资源 亲缘关系 RAPD
[期刊] 华北农学报
[作者]
郭荣雨 路曼 宋晓飞 孙成振 李晓丽 闫立英
为了解旱黄瓜种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用黄瓜全基因组测序的450对SSR引物对38份旱黄瓜种质资源进行了多样性和聚类分析。结果表明:72对引物共扩增出133个等位变异,平均每个SSR位点的等位基因数为1.85个,变幅为1~4个。38份旱黄瓜种质资源的相异系数分布在0.215~0.704,其中6457与佳美旱黄瓜、选丰与佳美旱黄瓜、新宝与绿之秋亲缘关系较远,而gfcS与四季翠绿、玉翡翠与翠玉、真把握与唐山秋瓜、真把握与皇家绿秀亲缘关系较近。在阈值为0.54处,可将这38份黄瓜种质资源划分为Ⅰ、Ⅱ类。在阈值为0.48处,可将Ⅰ类再分为Ⅰ_A、Ⅰ_B、Ⅰ_c、Ⅰ_D4个亚类,Ⅱ类可再分为Ⅱ_...
[期刊] 华北农学报
[作者]
林建丽 朱正歌 王建成 高建伟
利用200个随机引物对21份白菜类蔬菜种质资源材料的基因组DNA进行了扩增,研究了它们的亲缘关系。结果表明,有22个随机引物可得到稳定的RAPD谱带,扩增带总数为135条,其中多态性带为125条,多态性比例为92.6%。系统聚类分析结果显示,在遗传距离(D)=0.25处,可将供试材料分为2类10组,其中第1类包括5个甘蓝品种,另外还包括芜菁;而第2类包括白菜和芥菜2个亚类。这表明芜菁和白菜的亲缘关系较远。芜菁和散白菜的杂交后代与芜菁和其他白菜的杂交后代形态相似,不能从形态学上为李家文的"杂交起源"假说提供佐证。推测白菜可能起源于野生小白菜的原始类型,在向北方传播的过程中相互杂交,经过长期的自然...
关键词:
白菜类蔬菜 RAPD 种质资源 聚类分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
李艳梅 段会军 马峙英
利用AFLP指纹图谱分析技术对57个西瓜材料进行了基因组DNA多态性分析。结果表明,18对AFLP引物共产生709条DNA带,平均每个引物组合扩增出39.4条带,其中440条为多态性带,占总带数的61.4%;根据DNA谱带计算品种间遗传相似系数,其变化范围在0.24~0.99之间,平均相似系数为0.70,说明西瓜品种间遗传基础狭窄。用NTSYS软件进行聚类分析,57个西瓜品种被划分为2个类群。其中类群1包括1个野生西瓜,类群2均为栽培种。在类群2中引进的资源聚在一起,杂交种和双亲或其一聚在一起。此外,本研究表明,AFLP指纹分析技术具有很高的分辨率,能够揭示西瓜品种间的差异,是鉴定西瓜品种的有...
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
燕丽萍 吴德军 王因花 刘翠兰 王开芳 吴红 任飞 李庆华
为了探讨白蜡属植物种间、品种间亲缘关系以及同品种不同区域间的基因型差异,利用荧光AFLP分子标记技术,采用8对Pst I/Mse I引物组合对90个白蜡种质进行了DNA遗传多样性分析。结果表明:8对引物组合扩增出1 630条带,其中多态性条带1 399条,平均多态位点百分率为85.8%,平均有效等位Ne基因数为1.258 8,Nei’s平均遗传多样性指数为0.171 7;Shannon平均信息指数为0.286 9,表明白蜡属种间具有丰富的遗传多样性。采用NTSYS-PC软件的DICE法计算样本间的相似系数,UPGMA法进行聚类分析,结果表明,白蜡属植物种的聚类结果与传统的分类结果基本一致,绒毛白蜡及新品种(鲁蜡1号-鲁蜡4号)、美国紅梣及新品种(鲁蜡5号、鲁蜡6号)、美国白蜡及新品种(红叶白蜡、秋紫白蜡、秋火白蜡和秋欢白蜡)聚为一类;秦岭梣、庐山白蜡、花曲柳、中国白蜡、和窄叶白蜡聚为一类;不同之处在于花具花萼的象蜡树和对节白蜡与花无花萼的欧洲白蜡、水曲柳、新疆小叶白蜡和狭叶白蜡聚类为一类,象蜡树和水曲柳的亲缘关系较近,对节白蜡和象蜡树的起源与分类学地位有待于进一步的研究。说明AFLP标记技术能较好地揭示白蜡属种质资源的亲缘关系及演化规律,为种的分类及亲缘关系分析提供有力参考依据。
关键词:
白蜡属 优良种质 亲缘关系 AFLP
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