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[期刊] 西南农业学报
[作者]
徐志婷 许玲玲 薛龙海
【目的】附球菌(Epicoccum)引起的叶斑病在多花黑麦草上普遍发生,本文研究西南不同地理来源附球菌菌株的遗传差异性和亲缘关系。【方法】以贵州花溪、重庆南川和合川、云南曲靖、四川崇州5个地区获得的37株代表性Epicoccum菌株为材料,利用真菌基因组DNA提取试剂盒提取供试菌株的基因组DNA;用35条ISSR引物对不同地理来源的8株菌株进行预扩增,之后选用其中扩增条带数多的引物对所有参试菌株进行扩增,将数据整理成0、1矩阵,利用NTSYSpc(Version2.10e)、PopGene(Version 1.32)和GenAIEx6.51软件分别进行聚类分析和主成分分析。【结果】35条ISSR引物中,有6条多态性丰富,条带清晰;供试6条引物共扩增出63条多态性条带,多态性比例为100%。菌株间的遗传相似系数为0.3100~0.9300。当遗传相似系数为0.4180时,37株Epicoccum被划分为5个类群。5个居群的平均遗传一致度(I_(N))和平均遗传距离(D)分别为0.9168和0.0871,37株供试菌株的平均基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.3628和0.5388,均高于5个居群的平均值(0.3121和0.4606),相对应的遗传分化系数(Gst)为0.1289,基因流值(Nm)为3.3794。【结论】从聚类分析结果可知ISSR类群划分与菌种分类之间存在一定相关性,不同地理来源的菌株之间遗传相似性较高;主成分分析(PCoA)结果表明遗传多样性与菌株的地理来源不存在明显相关性。
关键词:
多花黑麦草 附球菌 ISSR 遗传多样性
[期刊] 草业科学
[作者]
余帅 冯光燕 苏晓丽 许肖恒 张献芳 左粟田 张新全
为探究多花黑麦草种质资源表型性状的遗传多样性,筛选优异种质资源,构建可靠的综合表型评价体系,本研究通过对114份多花黑麦草种质资源的15个表型性状进行多样性分析、相关分析、聚类分析、主成分分析及综合评价结果表明:供试多花黑麦草种质资源的表型性状的变异系数介于5.20%(开花期)~26.15%(单株干草产量),遗传多样性指数介于1.9094(单株干草产量)~2.0851(株幅),广义遗传力介于47.25%(单株鲜草产量)~83.72%(茎粗)之间,各性状间呈显著或极显著相关。聚类分析表明,114份种质资源可分为5类,第Ⅰ类(综合性状表现优)、第Ⅱ类(综合性状表现中等)和第Ⅲ类(综合性状表现差)均属中晚花类群,第Ⅳ类为晚花、高分蘖类群,第Ⅴ类属早花、低分蘖类群;主成分分析表明,15个表型性状可概括为3个主成分,累计贡献率达78.642%,株幅、叶宽、生育期、茎粗、分蘖数、单株草产量是影响多花黑麦草种质资源差异的主要因素;通过综合评价Z值筛选出综合性状表现优异种质材料共20份,排名前5位为第Ⅰ类群综合性状表现优秀材料,末尾4位为第Ⅲ类综合性状表现较差材料,15个性状中有14个与Z值呈极显著相关。以Z值作为因变量y,15个相关指标作为自变量x,进行逐步回归分析,回归方程如下:y= -2.004 + 0.006x1 + 0.001x2 + 0.005x3 + 0.010x4 + 0.068x5 + 0.015x6 - 0.297x7 - 0.002x8(R2=0.960;F=312.963),筛选出8个独立性状综合评价指标。本研究结果可为多花黑麦草优异种质资源的发掘和选育提供理论支撑。
[期刊] 草业科学
[作者]
曾令霜 张晨晨 张敬 徐彬
多年生黑麦草(Lolium perenne)是广泛栽培利用的优质牧草、草坪草。为研究多年生黑麦草种质资源的遗传多样性,选用简单重复序列(SSR)分子标记技术对10份多年生黑麦草自主选育品系和75份来自于23个不同国家的种质资源进行了分析。结果表明,26对引物扩增出的多态性条带有91条,占总条带数的69.5%。每个SSR位点的多态性信息含量(PIC)为0.156~0.722,平均为0.455。85份供试材料的遗传相似性指数为0.700~0.900,NTSYS聚类分析结果显示,在遗传相似系数(GS)为0.738时,85份材料被划分为五大类;同时,综合聚类分析及Structure群体遗传结构分析表明,供试材料的遗传关系与其地理来源无明显的关联性。研究结果将为多年生黑麦草种质资源评价利用及育种提供理论基础。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
黄婷 马啸 张新全 张新跃 张瑞珍 符开欣
【目的】多花黑麦草是具世界栽培意义的牧草,但因异花授粉特性,育种材料的频繁交流导致品种间的遗传差异越来越小,传统农艺性状进行品种鉴定变得越来越困难。高效、快速有效地鉴定品种对实现育种目标具有重要作用,可为辅助多花黑麦草品种DUS测试和品种鉴定、知识产权保护等提供科学依据。【方法】基于SSR标记具有稳定性强、多态性高和共显性特点,对6个国审骨干多花黑麦草品种采用30株混合取样策略,每个品种以不同单株构成的30株混合样本量进行3次重复试验,以重复试验中至少出现2次的频率高的强带进行统计,从165对多花黑麦草SSR引物中,筛选出20对引物用于多花黑麦草品种鉴定。并采用30株单株样本扩增与30株混合样...
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘永财 孟林 张国芳 毛培春 张德罡
利用ISSR标记对15份新麦草(Psathyrostachys juncea)种质资源进行遗传多样性检测。为获得稳定的新麦草ISSR反应体系,对反应条件中的dNTP、Taq酶浓度、引物浓度、Mg2+浓度等因子进行了优化,建立起的最佳反应体系为:25μL的反应体系中含有dNTP 2.5μL、Taq酶0.2μL、Primers 1μL、Mg2+1.5μL、2.5μL 10×Buffer、2μL模板DNA和ddH2O 15.3μL。ISSR标记结果显示,筛选出的重复性好、谱带清晰的ISSR引物8条,共获得84个扩增位点,其中多态性位点72个,多态性比率(PPB)为85.7%。通过遗传相似系数(GS)...
[期刊] 草业科学
[作者]
程少波 宋阳 杨巽喆 马啸 周永红 张海琴
利用SSR分子标记构建23个一年生黑麦草(Lolium multiflorum)品种(系)的指纹图谱,以实现对一年生黑麦草新品系‘川饲1号’的准确及快速分子鉴定。12对SSR引物共扩增出104条谱带,多态性信息量(PIC)平均为0.613,变幅为0.392~0.822;香农指数和基因多样性指数变化范围分别为0.911~2.061和0.407~0.838,平均为1.325和0.650。聚类分析表明:23份材料聚为三大支,第一大支包括新品系‘川饲1号’及其5个亲本群体,其中‘川饲1号’与‘PI 611146’(母本,‘Billion’)和‘杰威’聚为一小支,‘PI 283610’、‘PI 283612’和‘PI 376875’(‘G. Manawa’)聚为另一小支;第二大支为‘赣饲3号’、‘盐城’等12个国审品种;第三大支为‘邦德’、‘特高’等5份国审品种。综上可知‘川饲1号’与亲本供体(特别是母本‘Billion’)亲缘关系较近,而与其他17个一年生黑麦草国审品种差异较大。研究发现引物02-12E在‘川饲1号’新品系上扩增出特有条带,可用于品种指纹图谱的快速构建和品种分子鉴定。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
胡中会 赵立华 孔宝华 陈海如 范静华 刘飞 李小鹏 蔡红 杨根华 秦西云 方敦煌
采用ISSR和RAPD 2种分子标记方法对来自不同地区的28份烟草赤星病菌进行遗传多样性分析,筛选后选用10个ISSR引物和10个RAPD引物,ISSR扩增出多态性条带112条,多态性条带百分率为86.82%,菌株间相似性系数为0.53~0.97;RAPD引物扩增出多态性条带70条,多态性条带百分率为81.39%,菌株间相似性系数为0.57~0.94;用SPSS17.0软件对2种标记遗传距离进行相关性分析,发现2种分子标记结果呈显著正相关,表明2种分子标记方法都适合于烟草赤星病菌遗传多样性研究,ISSR是一种多态性优于RAPD的标记技术。根据2种标记的结果,利用NTSYS软件按UPGMA方法进...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
于辉 沈益新
比较了不同海盐质量浓度 (以下简称浓度 ) ( 3 2 ,6 4 ,9 6 ,12 8,16 0g·L-1)灌水条件下砂培盆栽苇状羊茅(Festucaarundinacea)和多花黑麦草 (Loliummultiflorum)苗期的生长情况。结果表明 :低海盐浓度下 ,两种牧草的生长均未受到不良影响 ,海盐浓度大于 6 4g·L-1时 ,株高、鲜重、干重皆随浓度的增高呈下降趋势 ,苇状羊茅所受的影响大于多花黑麦草 ;与对照相比 ,两种牧草在海盐灌水条件下叶绿素含量增加 ,多花黑麦草相对增长率高于苇状羊茅 ;两种牧草茎叶中Na+含量均随海盐浓度的增高而升高 ;随灌水海盐浓度的升高苇状羊茅...
关键词:
耐盐性 苇状羊茅 多花黑麦草 苗期
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
葛台明 章荣德 秦发兰 余毓君 谢岳峰
以多花黑麦草 (LoliummultiflorumLam .)幼穗为外植体诱导愈伤组织 ,经高有机态氮培养基改造得到易碎型胚性愈伤组织 ,在 1 / 2AA培养基 +1 / 2MSDL培养基中得到了生长迅速、分散的胚性悬浮系。分离原生质体经培养后得到了再生白化苗
[期刊] 中国农业科学
[作者]
冯俊杰 赵文达 张新全 刘英杰 袁帅 董志晓 熊毅 熊艳丽 凌瑶 马啸
【目的】测定引种自日本的多花黑麦草标准品种DUS测试用性状的一致性和特异性状况,优化我国多花黑麦草DUS测试体系,进而更快速准确地鉴定多花黑麦草新品种(系)。【方法】选择在成都平原种植的7个引自日本的多花黑麦草标准品种,在每个标准品种群体中选取15株长势一致的材料,基于其DUS测试用性状数据对标准品种进行聚类分析,鉴定标准品种在成都平原DUS性状表达情况。通过计算供试材料单株的18个DUS测试用性状的变异系数和方差值,并对测试用性状进行嵌套方差分析,筛选出品种内一致性较高、品种群体间特异性明显的性状。对筛选出来的性状进行概率分级,基于该等级划分为参试国审品种和新品系进行聚类分析和品种鉴定,并对参试品种的测试性状进行相关性分析。【结果】根据标准品种的18个DUS测试用性状的具体数值可以明确地将标准品种聚为7类,且DUS性状表达充分,能较为清晰地相互区分,可以进行后续的相关分析。品种内的一致性分析结果表明,叶色程度、春化后生长习性、孕穗期株幅、孕穗期旗叶宽、孕穗期旗叶长宽比和外颖长在多个品种内部的一致性表现较差。在进行品种群体间特异性分析时发现,孕穗期株高、孕穗期旗叶长宽比和小穗密度在品种群体间的特异性较差,其中孕穗期旗叶长宽比的品种群体间方差分量为54.83%,群体内单株间方差分量为45.17%。对筛选出的10个数量性状进行K-S检验及χ2检验,仅有基部小穗长符合χ2检验。最终将10个数量性状划分为5个等级,基于此性状分级结果对参试的多花黑麦草国审品种及新品系进行鉴定,结果表明供试品种能聚类为8个与品种相互对应的分组,证明了此性状分级对于多花黑麦草品种鉴定的可靠性。此外,基于参试品种性状表达级别绘制的热图结果表明,品种“特高德”在营养生长期的叶长明显区别于其他参试品种,表现为叶长较短;品种“川农2号”表现为春化后株高较高;品种“钻石T×长江2号”的穗下茎节长度明显短于其他参试品种;“达伯瑞”品种群体内一致性表现较差;“川农1号”“川农2号”品种群体内一致性表现较好。同时,筛选出的10个性状之间相关性较低,独立性较强,仅有3组性状间的相关系数大于0.5,可以作为DUS测试用性状。【结论】基于日本标准品种建立的DUS测试用性状分级体系可以应用于我国多花黑麦草的品种鉴定和区分,研究结果为多花黑麦草品种DUS测试方法体系的优化提供了重要的技术和理论参考。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
田艳伶 李志辉
利用ISSR分子标记对钩栗CaStanopSIS tIbetana HanCe 9个野生居群进行了遗传多样性分析。利用100条引物分别对111份钩栗基因组Dna进行pCR扩增,共扩增出158条清晰条带,其中多态性条带141条,多态性条带百分率(p)平均为89.01%。钩栗9个居群的neI’S基因多样性指数、SHannon’S信息指数分别为0.332 3、0.492 0;总种群基因多样度(Ht)、各种群基因多样度分别为(HS)0.410 8、0.334 6,表明钩栗的遗传多样性较高。9居群的基因分化系数GSt为0.185 5,占总遗传多样性的81.45%。分子方差分析表明,80.21%的遗传差异...
[期刊] 华北农学报
[作者]
马彪 南丽丽 姚宇恒 夏静 汪堃 陈洁 何海鹏
探究苜蓿种质资源亲缘关系,为苜蓿品种鉴定和新品种选育提供理论依据。采用ISSR和SSR分子标记方法对30份苜蓿材料进行遗传多样性分析。12条ISSR标记引物共扩增出125条带,多态性条带117条,多态性条带比率(PPB)为93.01%。有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)和香农多样性指数(I)均值分别为1.465 9,0.281 3,0.431 4;12条SSR标记引物共扩增出152条带,多态性条带144条,多态性条带比率(PPB)为94.05%。有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)和香农多样性指数(I)均值分别为1.542 7,0.313 9,0.470 1。2种标记遗传相似系数及聚类分析表明,材料Zxy2010p-7900、Zxy2010p-7740可单独分为一类,与其他材料亲缘关系较远;清水紫花苜蓿、陇东紫花苜蓿、甘农4号杂花苜蓿可分为一类,其品种间遗传相似系数较大,亲缘关系较近。2种标记方法客观真实地检测出供试苜蓿种质的亲缘关系。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
黄敏 黄旭萍 陈孝丑 吴明晶 翁建宇 陈发兴
为了明确枫香不同种质间的亲缘关系远近和遗传差异,采用简单序列重复区间(inter-simple sequence repeat, ISSR)分子标记技术对福建将乐、福建南靖、福建大田、福建光泽、江西永丰和安徽祁门6个居群137份彩叶观赏价值高的枫香种质资源进行遗传多样性及亲缘关系分析.结果表明:6个枫香居群的遗传一致度为0.832 8~0.971 1,遗传距离为0.029 4~0.182 9,居群内的遗传分化显著大于居群间,居群间的遗传多样性大于居群内,居群间基因交流丰富.UPGMA聚类分析将6个居群分为3类:第1类为安徽祁门、福建大田、福建光泽和福建南靖居群,第2类为福建将乐居群,第3类为江西永丰居群.
关键词:
枫香 ISSR 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 中国农业科学
[作者]
雒新艳 王晨 戴思兰 李宝琴 刘倩倩 朱珺 卢洁
【目的】大菊品种数量众多,形态繁杂。本研究通过探讨不同瓣类大菊品种的遗传多样性,为菊花品种分类和品种演化研究提供重要资料。【方法】选取涵盖大菊品种5个瓣类的150个品种,采用ISSR分子标记进行遗传多样性分析。【结果】从50对引物中筛选出的10对引物共检测到清晰可重复的229个位点,其中多态性位点220个,多态性位点百分率(PPB)96.07%,Nei’s基因多样性指数(He)和Shannon信息指数(I)分别为0.3485和0.5154;5个瓣类内的遗传多样性水平都比较高,其中平瓣类最高(PPB=95.20%),桂瓣类(PPB=86.90%)和匙瓣类(PPB=89.52%)最低;瓣类类群间遗...
关键词:
大菊 瓣类 遗传多样性 ISSR
[期刊] 中国农业科学
[作者]
侯永翠 颜泽洪 兰秀锦 魏育明 郑有良
利用RAMP和ISSR两种标记分别对60份大麦种质资源遗传多样性进行了检测。结果发现,两种标记都能揭示材料间较高的遗传多样性,其中ISSR标记多态性又高于RAMP标记。在RAMP分析中,每个引物可扩增出1~10条DNA片段,平均为5.27条;22个RAMP引物共扩增出116条DNA片段,其中98条具有多态性,多态性比率(PPB)为84.48%;平均多态信息量(PIC)为0.277;每个位点有效等位基因数(Ne)为1.602;材料间遗传相似系数GS变化范围为0.551~0.965,平均值为0.830。在ISSR分析中,每个引物可获得1~10条DNA片段,平均为5.95条;19个ISSR引物共扩增...
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