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[期刊] 实验技术与管理
[作者]
李凯 刘晓兰 邱康丽
为适应交叉学科生物信息学的教学要求,基于高校网站群技术建设了面向GEO的生物信息学全流程标准分析平台,按照功能模块化设计思路,使用模型分层方法实现数据模型、管理模型、呈现模型划分,形成从样本选择、数据处理到前端交互的闭环实践。以临床痛风疾病为例进行生物信息学分析,实验平台达到实验操作模块化、实验分析可视化、实验数据临床化的效果,对高校生物信息学实践教学具有借鉴意义。
关键词:
生物信息学 GEO分析 网站群 实践教学
[期刊] 情报学报
[作者]
黄科 曹家树 吴秋云 温庆放
生物信息学是生物技术的核心 ,是一门由生物、数学、物理、化学、计算机科学、信息科学等多学科交叉产生的新兴学科。本文介绍了生物信息学的概念 ,分析了发展生物信息学对现今科学发展的重大意义。根据生物信息学的发展特点 ,具体分析了生物信息学研究的内容 :基因组序列的分析 ;基因进化 ;药物设计 ;基因区域预测 ;基因功能预测 ;蛋白质结构预测。评述了生物信息学发展的现状 ,指出我国生物信息学发展中存在的问题 ,并对我国发展生物信息学提出了一些建议。最后分析了生物信息学发展的方向 ,展望了生物信息学的发展前景
关键词:
生物信息学 生命科学 新兴学科
[期刊] 数据分析与知识发现
[作者]
张志强 范少萍 陈秀娟
【目的】了解并梳理大数据驱动的知识发现新范式下,生物医学信息学的最新进展,并给出生物医学信息学未来发展的建议。【方法】通过文献调研与平台试用,总结近几年生物医学信息学在大数据资源体系建设、数据分析平台、数据分析方法、辅助临床决策应用等方面的发展现状。【结果】未来可将加强生物医学大数据体系建设、创新大数据分析基础理论与方法研究、推进知识分析工具与平台开发、促进临床转化应用以及培养高层次专门人才等作为生物医学信息学的重点发展方面。【局限】限于篇幅,未全面涉及生物医学数据资源、方法与应用案例等。【结论】本文针对
[期刊] 中国远程教育
[作者]
尹学松 蒋融融 张吉先 齐幼菊 厉毅
远程开放实验平台是开展远程实践教学的主体,为培养应用型人才提供了重要的远程实验资源保障。现有的大多数远程开放实验平台通常不能有效处理大并发量访问请求,也不能提供自适应的个性化学习环境,难以满足大规模实验教学和个性化学习的要求。针对这些问题,结合工作实践,笔者对面向大数据远程开放实验平台进行了深入研究。首先,使用云计算技术搭建平台基础服务设施,着重解决大数据存储与分析等问题,为应用层服务提供计算支撑;其次,基于泛在学习理念,并融入开放教学设计理念,勾勒出一个新的面向大数据的远程开放实验平台体系架构,以支持个性化自适应学习;最后,以平台架构为依托,以提升学习效果为导向,设计面向大数据远程开放实验平...
[期刊] 统计与决策
[作者]
杨海山
[期刊] 情报理论与实践
[作者]
朱庆华 李亮
本文重点介绍了国内外生物信息学的研究现状,分析了情报学与生物信息学的联系,并提出了情报学在生物信息学研究中的切入点。
关键词:
情报学 生物信息学 理论研究
[期刊] 情报学报
[作者]
万跃华 何立民
大量的蛋白质和核酸数据的积累与理性地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义的双重需要 ,产生了综合生物学研究与计算技术研究等领域最新成果的交叉性学科生物信息学。本文分别从生物信息学的基因组数据库 ,核酸和蛋白质一级结构序列数据库 ,生物大分子 (主要是蛋白质 )三维空间结构数据库 ,以及以这 3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库 (包括基因组二次数据库、蛋白质序列二次数据库、蛋白质结构二次数据库 )和生物信息学数据库的集成系统等几个方面 ,概述了发展中的生物信息学数据库的最近动态和有关信息 ,同时对主要的热门生物信息学数据库站点和资源进行了评价。此外 ,就国内生物信息学数据库存在的问题与前景进...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
苏群 田敏 刘俊 王凌云 李春牛 李先民 黄展文 王虹妍
【目的】分析蓝星睡莲和小花睡莲叶片转录组测序产生的Unigene序列及蓝星睡莲全基因组序列的简单重复序列(SSR)位点特征,为开展睡莲属植物种质资源鉴定、遗传多样性分析及遗传连锁图谱构建等提供基础数据。【方法】利用前期研究获得的蓝星睡莲和小花睡莲叶片转录组数据及已公开发表的蓝星睡莲基因组,以MISA进行SSR位点搜索,并统计分析其全基因组序列的SSR位点出现频率、基元序列长度和基元类型等。【结果】在蓝星睡莲和小花睡莲叶片转录组的114 762个Unigenes序列中搜索到38 998个SSR位点,SSR位点出现频率为33.98%,其中完整型SSR位点30 124个;SSR基元序列总长度为465 550 bp,总平均为21.65 bp。在蓝星睡莲基因组中搜索到249 029个SSR位点,平均分布频率为609.0个/Mb,其中完整型SSR位点163 265个;SSR基元序列总长度为2 775 181 bp,总平均为27.25 bp,占基因组大小的0.68%。在转录组和基因组中,SSR位点均以二核苷酸和单核苷酸重复类型为主,分别占SSR总数的48.87%和41.03%、51.70%和43.37%;在二核苷酸重复基元中,AG/TC和AT/TA型的占比较高,且远高于其他类型重复基元;SSR基元中各类型重复以5~11次为主,其中重复10次的最多;基于荧光毛细血管电泳法从合成的144对SSR引物中筛选出12对扩增性好且多态性高的SSR引物。【结论】蓝星睡莲和小花睡莲叶片转录组及蓝星睡莲基因组SSR中的低级基元类型较丰富,具有开发为高多态性SSR引物的潜力;筛选出12对扩增性好且多态性高的SSR引物可用于开展睡莲属植物种质资源鉴定、遗传多样性分析及遗传连锁图谱构建等研究。
[期刊] 情报理论与实践
[作者]
张敏 邓胜利
公共信息服务平台是国家创新系统的组成部分,是建设创新型国家和实现自主创新的重要保证。本文在分析我国公共信息服务平台跨系统资源整合的实践基础上,结合欧美各国公共信息服务平台基于知识协同的发展启示,提出了面向协同创新的公共信息服务平台的构建模型、技术实现方式和基于创新价值链的服务组织。
关键词:
协同创新 信息服务 信息资源
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
陈琪 付嘉炜 何毓辉
搭建了面向智能驾驶的深度学习综合实验平台。平台包括基于Coppelia Sim的智能驾驶虚拟仿真系统和基于英伟达Jetson Nano嵌入式小车的交通沙盘实物系统。基于该平台设计的实验方案,涉及了深度学习主要知识点,实现了智能驾驶若干子场景,采用了边缘人工智能常用方案“云端训练+边缘推断”。基于上述虚拟仿真系统,建模并训练实现了深度强化学习Q值网络、卷积神经网络、循环神经网络等多种类别神经网络。实物系统测试结果表明,该平台基于上述神经网络能够有效实现车道保持、交通标志牌识别、语音控制等智能驾驶场景。学生可利用该平台自主搭建需要的场景,接入不同类型的神经网络,实现其他智能驾驶功能,并完成深度学习相关算法的测试和评估。
关键词:
智能驾驶 深度学习 虚拟仿真 嵌入式系统
[期刊] 实验技术与管理
[作者]
刘洋 谢胜利 杜玉晓 蔡述庭 王永华
为了满足新工科建设和智能制造对自动化专业人才培养的要求,组建了中国制造2025国家智能制造试点示范基地——工业4.0汽车智能制造实验基地。介绍了基地的平台构建,从教学模式、课程体系、师资建设、教学内容等多方面来深化工程教育改革。提出了一种项目驱动式实验教学新模式,开发了一系列层次化、模块化和系统化的综合实验课程。实践表明,利用工业4.0实验基地开展新工科建设,为自动化专业人才培养提供了有效的新途径。
[期刊] 中国科技论坛
[作者]
王俊峰
本文介绍了德国弗朗霍夫协会的基本情况、为中小企业提供技术和技术服务的方式、政府的支持和监管方式及其内部的组织和用人制度等内容,并在此基础上,结合我国科研院所企业化转制的实际和中小企业发展的需要,提出了以转制科研院所为依托,构建我国面向中小企业的公共技术服务平台的设想。
关键词:
构建 面向中小企业 公共技术服务平台
[期刊] 企业经济
[作者]
李斌
信息技术和知识经济的迅猛发展,推动了电子商务的发展与普及,也对物流业的地位、物流的组织模式以及作用和功能环节产生了巨大冲击,构建面向电子商务应用的企业物流信息系统平台成为研究和讨论的热点。本文分析了电子商务环境下企业物流信息平台的系统功能和关键技术,在此基础上重点研究了该系统的需求情况、体系架构和功能结构,总结了面向电子商务应用的物流信息系统平台建设中需要注意的关键要素。
关键词:
电子商务 物流信息化 平台构建
[期刊] 经济学家
[作者]
谢廖斌
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