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[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
李伟文 许强华 陈新军 戴小杰 朱江峰
根据2010年9月-2012年1月,我国远洋捕捞船在太平洋中部(16°S~8°N;160°W~155°E)的7个采样点采集到的101个样本,利用线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)基因的585 bp序列,分析了它们的遗传多样性和遗传结构。结果显示,585 bp片段中发现23个变异位点,80个单倍型;序列多样性分析结果显示,7个采样群体单倍型多样性指数h=0.994±0.002和核苷酸多样性指数π=0.00892±0.00038。分子方差分析揭示98.18%的遗传变异来自种群内,群体间的Fst分析揭示黄鳍金枪鱼7个采样群体内部不存在显著的遗传分化。Fu’s Fs呈负值和核苷酸不配对呈单...
[期刊] 水产学报
[作者]
刘连为 许强华 陈新军
为准确掌握柔鱼的种群遗传结构,拟通过线粒体DNA的COI和Cytb基因序列分析方法对柔鱼不同产卵季节群体的遗传多样性和遗传结构进行研究。经PCR扩增与测序分别获得600 bp COI与481 bp Cytb基因序列。基于COI基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为24、(0.729±0.033)、(0.005 70±0.003 25)和3.421。基于Cytb基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为28、(0.852±0.016)、(0.006 45±0.003 73)和3.101。分析认为,北太平洋...
[期刊] 水产学报
[作者]
王中铎 郭昱嵩 颜云榕 侯刚 范艳波 冯波 卢伙胜 刘楚吾
测定了南海西沙和南沙群岛附近海区(11～12°N,15°N;110～112°E)黄鳍金枪鱼61尾(17尾成鱼、44尾幼鱼)和大眼金枪鱼26尾(22尾成鱼、4尾幼鱼)的线粒体基因组控制区部分序列(D-loop),结合GenBank数据库中印度洋、太平洋和大西洋群体的同源数据,分析结果:(1)黄鳍金枪鱼与大眼金枪鱼均具极高的单倍型多样性(Hd>99%),聚类树及群体间分化指数(FST和Snn)表明大眼金枪鱼群体分化程度明显高于黄鳍金枪鱼群体;(2)大眼金枪鱼和黄鳍金枪鱼的南海群体与印度洋群体之间基因流最强(Nm=51.638和261.280 10),其次为太平洋群体(Nm=10.868 8和-50...
[期刊] 海洋渔业
[作者]
卢丽锋 章群 杨喜书 黄镇宇 唐楚林 周琪
为探讨中国近海绿鳍鱼(Chelidonichthys kumu)遗传多样性和种群结构,测定了辽宁、山东、江苏、浙江以及广东等中国沿海5个省6个地理群体112尾样本线粒体控制区838bp全序列,共检测到15个变异位点,22个单倍型,总体呈现高单倍型多样性(h=0.849±0.019)与低核苷酸多样性(π=0.001 85±0.000 12)特点。在邻接树和单倍型网络图中,没有出现明显的谱系结构和地理结构。群体间遗传分化系数Fst值小而不显著(-0.034 61~0.038 28,P>0.05);AMOVA分析显示不同地理群体、不同海域间与台湾海峡南北两侧都不存在明显遗传分化(-0.32~1.19),遗传变异主要存在群体内个体之间(99.08%~100.40%),表明中国近海绿鳍鱼为母系随机交配群体,推测原因可能是绿鳍鱼为洄游性鱼类,且所产漂浮性卵受海流携带能进行远距离传播。中性检验呈极显著负值(Fs=-16.099 6,P=0),核酸不配对分布图为单峰分布,推测绿鳍鱼整体及除吕四群体外的其它群体在3.00万年~10.00万年前发生种群扩张,可能是受到晚更新世冰期与间冰期影响。
[期刊] 海洋渔业
[作者]
李伟文 许强华 陈新军
黄鳍金枪鱼(Thunnus albacares)作为一种重要的高价值商业性大洋鱼类,广泛分布于大西洋、印度洋和太平洋的热带和亚热带海域。近年来的资源评估表明,其资源量呈现不断下降的趋势,且中西太平洋已处于过度捕捞的状态。为确保黄鳍金枪鱼资源的可持续利用,深入了解其种群结构是必要前提。本文综述了黄鳍金枪鱼种群结构分析的研究成果,通过比较几种研究种群结构的方法后认为:形态学方法是划分群体的重要手段,但在亚种群的划分上灵敏度相对较低;标志重捕法能揭示其运动规律,但单一的标志重捕法不能很好地进行种群划分;分子标志技术可从分子水平对种群遗传结构做深入的分析,但选择合适的分子标志对于合理划分种群结构显得尤...
关键词：
黄鳍金枪鱼 基因 种群结构
[期刊] 海洋渔业
[作者]
梁述章 宋炜 马春艳 蒋科技 张凤英 赵明 马凌波
为研究我国沿海棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)的种群遗传结构,运用线粒体D-loop区全序列比较分析了中国连云港(LYG)、大丰(DF)、崇明(CM)、舟山(ZS)、温州(WZ)、宁德(ND)、厦门(XM)棘头梅童鱼7个野生群体的遗传结构特征。7个群体共208个样本的D-loop序列中,共检测到83种单倍型,66个变异位点,碱基组成符合AT碱基偏好性特点。7个群体的单倍型多样性为(0.55400±0.00998)～(0.95400±0.00067),核苷酸多样性为0.00183～0.00708,说明我国沿海棘头梅童鱼遗传多样性较高;根据海洋鱼类遗传多样性划分的分布模式,符合高h低π特点,说明其经历了快速扩张期。群体总的遗传分化系数Fst=0.86647 (P=0),两两群体间的遗传距离在0.004～0.039范围内,且明显的分为北方群体(LYG、DF、CM和ZS)和南方群体(WZ、ND和XM),DF和LYG、WZ和ND两两群体间存在显著的基因交流。AMOVA分析显示组间变异百分比为85.97%,符合南北分化特点。基于单倍型构建的单倍型邻接关系树和单倍型简约网络图等结果均表明,棘头梅童鱼以舟山为界,具有明显的南北地理遗传结构。中性检验(Tajima’s D、Fu’s Fs)和错配分析结果显示,棘头梅童鱼在3.87～12.9万年前(更新世冰期)经历了种群的规模性扩张或定向选择。本研究结果可为棘头梅童鱼资源的保护与利用提供基础数据。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李珊 陈敦学 马秀慧 安苗
为探讨苗岭作为地理屏障对斑鳜(Siniperca scherzeri)遗传结构及其多样性的影响,本研究运用mtDNA D-Loop测序技术,检测其两侧柳江、沅江和乌江3水系7个野生斑鳜种群的遗传多样性,并分析其遗传变异及种群动态。结果显示,365条序列共有57个多态位点和56个单倍型,高频hap3是3水系共享的祖先单倍型,苗岭斑鳜可划分为南北2个不同地理种群,南部柳江种群遗传变异程度低,遗传多样性匮乏,北部沅江和乌江的种群变异程度高,拥有丰富的遗传多样性,2个地理群体间存在显著的遗传分化和基因交流障碍。研究表明,南部斑鳜属封闭的小群体,因近交衰退效应,始终保持祖先的原始种群结构;北部种群规模庞大,生境理想,进化潜力大。推测苗岭斑鳜在中更新世间冰期种群扩张后,因苗岭阻隔和生境差异,沿不同方向发展进化,塑造出南北两个遗传分化明显的地理种群。柳江种群面临生存危机,可视为1个独立的ESU单元,沅江上游适宜建立斑鳜种质资源保护区。本研究从分子水平揭示了地理屏障对苗岭山区野生斑鳜种群遗传结构及其多样性的影响,丰富了我国斑鳜遗传背景资料,可为斑鳜种质保护和挖掘利用提供理论依据。
[期刊] 水产学报
[作者]
闫杰 许强华 陈新军 李纲 刘必林
根据2009年7月到10月我国大型鱿钓渔船在东太平洋(81.9°～94.9°W,8.9°N～11.3°S)秘鲁和哥斯达黎加外海作业期间采集的样本,利用线粒体DNA细胞色素b基因的724 bp部分序列,分析了采自秘鲁7个采样点和哥斯达黎加3个采样点的155个个体的序列多样性与种群遗传结构。结果显示,724 bp片段中发现了16个变异位点,155个个体出现43个单倍型。序列多样性分析结果揭示,155个个体的平均单倍型多样性指数为0.873,核苷酸多样性指数为0.003 69。群体间共享6个单倍型,秘鲁外海茎柔鱼群体享有最多特有单倍型(20个)。分子方差分析揭示,82.70%的遗传变异性出现在种群内...
关键词：
茎柔鱼 细胞色素b 遗传结构 系统发育树
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
陈丽雯 戴小杰 朱江峰 翟天晨
黄鳍金枪鱼（Ｔｈｕｎｎｕｓ ａｌｂａｃｏｒｅｓ）是３个热带金枪鱼鱼种之一，也是我国远洋金枪鱼渔业的主要捕捞对象之一。本研究根据我国金枪鱼渔业观察员在热带太平洋海域（１４°１＇ｓ－１１°４１＇ｎ，１５８°４３＇ｅ－１２８°２４＇Ｗ）采集的２２９尾雌性黄鳍金枪鱼样本，基于组织切片法对其繁殖生物学特征进行研究。结果表明：成熟度以Ⅰ、Ⅱ期为主，性成熟个体占样品总数的３６．７％；运用ｌｏｇｉｓＴｉｃ模型拟合的性成熟比率（Ｐ）与叉长（ｌ＿Ｆ）关系曲线（成熟度曲线）方程为Ｐ＝１／１＋ｅ～（［－０．０７２（ｌＦ－１３８．１３）］），对应的５０％性成熟叉长为１３８．１３ ｃｍ；在南半球，纬度越高，性成熟比率和性．．．
关键词：
黄鳍金枪鱼 繁殖生物学 成熟度 太平洋
[期刊] 中国水产科学
[作者]
周成 杨旭 杨报国 王少琴
黄鳍金枪鱼(Thunnus albacares)是生态系统中的顶级捕食者,是海洋生态系统能量流动及物质循环的重要一环。为研究太平洋黄鳍金枪鱼在个体发育过程中的摄食变化以及不同海域营养生态位差异,根据2019年东太平洋和2021年中西太平洋海域金枪鱼渔船采集的黄鳍金枪鱼样本,对其肌肉的脂肪酸组成及特征进行了分析研究。结果显示,黄鳍金枪鱼肌肉检测出34种脂肪酸,包括16种饱和脂肪酸(SFA),8种单不饱和脂肪酸(MUFA),10种多不饱和脂肪酸(PUFA)。黄鳍金枪鱼肌肉脂肪酸中SFA含量与PUFA含量呈负相关,MUFA含量与PUFA含量呈正相关。SFA含量与叉长呈显著负相关,MUFA、PUFA含量与叉长呈显著正相关。中西太平洋和东太平洋黄鳍金枪鱼肌肉脂肪酸含量存在差异,两海域之间脂肪酸组成平均不相似性为18.85%,主要差异来自n-3系列多不饱和脂肪酸(n-3 PUFA)、SFA、PUFA、C22∶6n3 (DHA)、Cl6∶0、Cl8∶1n9、MUFA、C22∶6n3/C20∶5n3 (DHA/EPA)、C18∶0、n-6系列多不饱和脂肪酸(n-6 PUFA)。主成分分析显示,黄鳍金枪鱼的营养级越高,肉食性越高,以甲藻和硅藻为食源的生物对黄鳍金枪鱼的能量来源贡献越大。相反,营养级越低的黄鳍金枪鱼主要摄食以细菌、陆地植物和植食性桡足类为食源的生物。主成分回归表明,黄鳍金枪鱼随叉长增大,其营养级增加,肉食性提高,食性逐渐由以甲壳类和头足类向虾和硬骨鱼等富含多种特征脂肪酸的生物转变。东太平洋黄鳍金枪鱼较中西太平洋肉食性更强,营养级更高,甲壳类对其能量贡献更大。
[期刊] 海洋渔业
[作者]
江建军 许柳雄 朱国平 朱伟俊
北太平洋长鳍金枪鱼（Ｔｈｕｎｎｕｓ ａｌａｌｕｎｇａ）是金枪鱼渔业的主要捕捞对象之一，其资源的养护和管理日益受到各方关注，鱼类年龄鉴定是渔业资源研究的重要内容之一。根据２０１３～２０１４年北太平洋长鳍金枪鱼探捕所采集的２２７个脊椎骨样本，用不同的染色方法分成４组进行年龄的鉴定，选用线性模型、指数模型和幂指数模型对叉长和脊椎骨半径进行拟合，最后选出结果最好的鉴定组和拟合模型，通过年龄鉴定估算长鳍金枪鱼的Ｖｏｎ ＢｅｒＴａｌａｎｆｆｙ生长方程。研究结果表明，北太平洋长鳍金枪鱼的叉长范围为５２～１０４ ｃｍ，优势叉长组为８１～９０ ｃｍ，占总数的８３．１％；年龄组成以５、６龄较多，占样本总数的８０．．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
董新培 穆淑梅 周楠 康现江 罗青 白俊杰
为研究乌鳢群体的遗传多样性和控制区结构,实验采用PCR和DNA测序技术对其线粒体DNA控制区序列进行比较。结果显示,用于分析的线粒体DNA控制区全长序列为905~908 bp。104个序列中共发现了37个多态位点,定义了27种单倍型。同时对控制区结构进行分析,识别了其终止序列区(ETAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的关键序列。3个地理群体的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(k)分别为0.875、0.003 27和2.939。群体间的平均Kimura双参数遗传距离(Kimura 2-parameter distance,K 2-P)、遗传分化指数(Fs...
关键词：
乌鳢 线粒体DNA控制区 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
郑德锋 赵金良 周文玉
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtysiucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列。棘头梅童鱼控制区序列长度为778～782bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列。共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样性(Hd)为0.9347±0.0175,平均核苷酸多样性(π)为0.0175±0.0023。棘头梅童鱼群体内的遗传距离(K2-P)为0.0017～0.0228,群体间的遗传距离为0.0023～0.0433...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
秦钦 许志强 边文冀 王明华 蔡永祥 葛家春
经克隆测序获得了我国5个批次引进的40尾斑点叉尾(Ictalurus punctatus)群体的线粒体控制区全序列,研究控制区序列结构和群体遗传变异。结果显示:比对长度包括906个位点,共有变异位点28个,简约信息位点21个。通过与GenBank中其它鱼类的mtDNA控制区序列进行结构分析,将斑点叉尾的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区3个区域;并找到了一系列保守序列:包括终止相关序列TAS,中央保守区的CSB-F、CSB-E、CSB-D和保守序列区的CSB-1、CSB-2、CSB-3。样本总体遗传多样性指数较高,40尾个体含有25个单倍型,其总体单倍型多样性指数(H)为0.920...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
海萨·艾也力汗 郭焱 孟玮 杨天燕 阿达可白克·可尔江
为了解塔里木裂腹鱼（Ｓｃｈｉｚｏｔｈｏｒａｘ ｂｉｄｄｕｌｐｈｉ）种群遗传多样性和遗传结构，本研究分析了库玛拉克河（ＫＭｌＫ）、木扎提河（Ｍｚｔ）、塔什库尔干河（ｔＳＫＥＧ）、喀拉喀什河（ＫｌＫＳ）、玉龙喀什河（ＹｌＫＳ）、克孜勒苏河（ＫｚｌＳ）、车尔臣河（ｃＥｃ）７个群体共１４３个线粒体控制区序列变异个体，获得了３９个单倍型。其中，ｃＥｃ群体与其他群体间遗传分化显著，无共享单倍性。群体间遗传差异的分子变异分析表明，在所有群体中大多数的变异来源于群体间；而排除ｃＥｃ群体后，大多数变异则来源于群体内（８１．０１％），群体间的遗传变异小（１６．６８％）。塔里木裂腹鱼不同群体间的基因流（ＮＭ）为０．．．．
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