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[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
刘洋 梁绪虹 王丛丛 戴小杰
为了解淀山湖主要鱼类群落的种类组成和多样性特征，利用环境DNA技术对淀山湖鱼类进行物种多样性分析。结果显示，从淀山湖10个站点的环境DNA样本中共检测出7目、12科、36属、43种鱼类，其中6月（夏季）共检测出24种，11月（秋季）32种，大部分种类在淀山湖传统渔业资源调查中均有出现。其中，刀鲚（Coilia nasus）、鲫（Carassius auratus）、大■（Acheilognathus macropterus）、翘嘴红鲌（Culter alburnus）、鲻鱼（Mugil cephalus）为主要优势种。α多样性分析表明，淀山湖秋季的Chao1指数、Observed species指数、Shannon多样性指数、Simpson指数和Pielou均匀度指数平均值都高于夏季的平均值，表明秋季鱼类物种相对丰富，多样性较高。站点间鱼类物种差异分析表明，多样性和丰富度较高的站点为S1、S2、S3、S5，均为初级生产力较高、人为干扰较小的站点。研究表明，环境DNA技术检测灵敏度高，可以作为淀山湖鱼类物种多样性调查的有效补充手段。
关键词：
环境DNA 淀山湖 生物多样性 鱼类
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
梁绪虹 王丛丛 刘必林 刘洋 俞晔伟 宋成辉
西北太平洋黑潮-亲潮交汇区是世界上最高产的渔区之一，鱼类资源众多。为了解交汇区鱼类群落的生物多样性，保护和合理开发利用该海域的渔业资源，利用环境DNA（Environmental DNA，eDNA）技术对夏季西北太平洋黑潮与亲潮交汇区进行鱼类多样性分析，通过22个站点水样的采集、DNA提取及测序，共检测出22目，30科，44属，51种海水鱼类，其中灯笼鱼科种类最多，共17种，占鱼类物种总数的33.33%。此外，相对丰度较高的物种为宽尾臂灯鱼、西钻光鱼、日本背灯鱼、远东拟沙丁鱼、斑点多纪鲀、瓦氏角灯鱼、斑头六线鱼、日本鲭、日本海鰶、黑潮眶灯鱼。站点间Alpha多样性差异较大，总体上呈现高纬度断面生物多样性低，低纬度断面生物多样性高的特点。冗余分析表明，影响交汇区鱼类群落结构的主要环境因子为溶解氧。研究证明了eDNA技术用于监测西北太平洋黑潮-亲潮交汇区鱼类多样性及其空间分布的可行性。
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
孙菁煜 戴小杰 朱江峰 季伟彬 田芝清
2006年5-12月,对淀山湖进行了5次刺网调查和3次拖网调查,收集鱼类样本1983尾,隶属9科18属、23种,多数种类属鲤科鱼类。优势种为刀鲚、鲫和子陵吻鱼叚虎鱼分别占样本个体总数的40.09%、20.52%和10.29%。人工放养的鲢、鲫、鲤、鳙是淀山湖目前主要的经济种类。多样性指标选择种类丰富度、平均种类丰富度、多样性指数、均匀度指数、优势度指数、相对稀有种类数。目前的多样性指数为1.8996,比1959年调查的下降了49%,均匀度也相应降低,优势度则由1959年的0.034上升为0.2264。水质污染等环境的恶化,加上过度捕捞等人为因素,使淀山湖鱼类物种多样性正逐渐降低。
关键词：
淀山湖 鱼类多样性 多样性指数
[期刊] 水产学报
[作者]
俞晔伟 刘洋 朱国平 王丛丛
欺骗岛是位于南极南设得兰群岛西南方向的火山岛，该岛附近海域受岛上活火山的影响显著，生物资源丰富。为探究该海域内鱼类物种组成，本研究通过对欺骗岛海域环境DNA样本采集、高通量测序开展鱼类物种多样性研究。结果显示，从欺骗岛海域5个采样站点的环境样本中共检测出南极鱼类1目、6科、23属、31种，调查得到的大部分鱼类物种均在以往南极传统渔业资源调查中出现。eDNA序列相对丰度最高的鱼类物种为裘氏鳄头冰鱼和花纹南极鱼，分别占鱼类总丰度的53.52%和28.27%。近岸站点和远岸站点间的α和β多样性的各项指数差异较大，但远岸站点间鱼类物种组成相差不大。研究表明，环境DNA技术作为传统渔业调查方法的补充，对环境干扰小，可以对欺骗岛海域鱼类物种多样性进行快速检测。本研究结果可为欺骗岛海域的鱼类多样性监测和渔业资源管理与保护提供数据支持。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
仝亚东 匡箴 刘鹏飞 梁翼东 凡迎春 徐东坡
东平湖是黄河下游重要滞洪湖泊,也是南水北调东线最后一个调蓄湖泊。为探究东平湖鱼类多样性现状及鱼类群落特征,本研究采用环境DNA (environmental DNA, eDNA)技术,与传统网具捕捞调查进行对比分析,阐述东平湖鱼类群落多样性特征,探讨环境DNA技术在东平湖鱼类多样性长期监测中的可行性。结果显示,应用环境DNA技术共检测到5目7科23属23种鱼类。进一步分析显示,Shannon-Wiener多样性指数平均值为1.04,变幅在0.21～2.36;Pielou均匀度指数平均值为0.54,变幅在0.29～0.81;Margalef丰富度指数平均值为0.75,变幅在0.13～2.09。相似性分析(analysis of similarities, ANOSIM)表明,多样性指数在湖区与河道之间没有显著差异。非度量多维尺度分析(non-metricmultidimensionalscaling,NMDS)显示,东平湖鱼类群落可划分为4个群聚结构,分别位于东平湖沿岸、湖心以及两条河道内,群聚结构总体差异显著(R<1,P<0.05)。传统网具捕捞调查共捕获4目6科21属24种鱼类,其中有18种鱼类在两种方法中均检测到。两种方法检测到的鱼类中均以鲤形目(Cypriniforms)最多。研究结果表明,环境DNA技术与传统网具捕捞两种方法调查得到的鱼类种类数相似度较高,达到62.06%。东平湖鱼类群落呈现一定空间分布特征,自柳长河、至小清河,东平湖鱼类群落总体呈现南北差异性。本研究证明环境DNA技术在东平湖渔业资源监测中具有可行性,可有效补充鱼类资源监测手段,在禁捕以及开捕时期可根据实际情况采用不同方法对东平湖渔业资源进行监测,同时也为东平湖渔业资源管理和保护提供资料支持与技术参考。
关键词：
东平湖 环境DNA 鱼类多样性 黄河
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
邵严 唐文乔 龚珑 张亚 郭弘艺
为了解淀山湖及黄浦江上游的鱼类物种多样性组成及群落结构状况，于2020年6月(夏季)和10月(秋季)在10个采样断面对鱼类样本作了定量和定性采集，并对其多样性及群落结构作了分析。2次调查共采集鱼类11 408尾、49种，隶属于9目14科37属。夏季和秋季，淀山湖5个断面合计有鱼类29种和30种，黄浦江上游5个断面有37种和29种，刀鲚(Coilia nasus)、鲫(Carassius auratus)和大鳍鱊(Acheilognathus macropterus)为主要优势种。两个水体秋季的Shannon-Wiener多样性指数(H~’)、Pielou均匀度指数(J~’)、Simpson优势度指数(C)和Margale丰富度指数(D)指数均值都高于夏季的均值。相似性分析显示淀山湖各断面之间的鱼类群落相似性高于黄浦江上游各断面之间。ABC曲线表明，淀山湖及黄浦江上游鱼类群落结构总体上并不稳定，特别是淀山湖区域。Cluster聚类和非参数多维标度排序分析可明显将鱼类群落分为黄浦江群组Ⅰ、淀峰群组Ⅱ和淀山湖群组Ⅲ,似鳊(Pseudobrama simoni)、刀鲚、大鳍鱊、■(Hemiculter leucisculus)和鲫是造成群组间差异性的主要分歧种。与以往研究数据相比，本次调查淀山湖及黄浦江上游鱼类种类有所上升，但鱼类群落仍以小型鱼类为主，受人为因素干扰较为明显。建议淀山湖要继续提升水质、开展鱼类增殖放流、减轻渔业捕捞压力，并控制贝类底拖网的捕捞区域及时间。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
邵严 唐文乔 龚珑 张亚 郭弘艺
为了解淀山湖及黄浦江上游的鱼类物种多样性组成及群落结构状况，本文于2020年6月（夏季）和10月（秋季）在10个采样断面对鱼类样本作了定量和定性采集，并对其多样性及群落结构作了分析。2次调查共采集鱼类11408尾、49种，隶属于9目14科37属。夏季和秋季，淀山湖5个断面合计有鱼类29种和30种，黄浦江上游5个断面有37种和29种，刀鲚（Coilia nasus）、鲫（Carassius auratus）和大鳍鱊（Acheilognathus macropterus）为主要优势种。两个水体秋季的Shannon-Wiener多样性指数（H′）、Pielou均匀度指数（J′）、Simpson优势度指数（C）和Margale丰富度指数（D）指数均值都高于夏季的均值。相似性分析显示淀山湖各断面之间的鱼类群落相似性高于黄浦江上游各断面之间。ABC曲线表明，淀山湖及黄浦江上游鱼类群落结构总体上并不稳定，特别是淀山湖区域。Cluster聚类和非参数多维标度排序分析可明显将鱼类群落分为黄浦江群组Ⅰ、淀峰群组Ⅱ和淀山湖群组III，似鳊（Pseudobrama simoni）、刀鲚、大鳍鱊、?（Hemiculter leucisculus）和鲫是造成群组间差异性的主要分歧种。与以往研究数据相比，本次调查淀山湖及黄浦江上游鱼类种类有所上升，但鱼类群落仍以小型鱼类为主，受人为因素干扰较为明显。本文建议淀山湖要继续提升水质、开展鱼类增殖放流、减轻渔业捕捞压力，并控制贝类底拖网的捕捞区域及时间。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
邵严 唐文乔 龚珑 张亚 郭弘艺
为了解淀山湖及黄浦江上游的鱼类物种多样性组成及群落结构状况，本文于2020年6月（夏季）和10月（秋季）在10个采样断面对鱼类样本作了定量和定性采集，并对其多样性及群落结构作了分析。2次调查共采集鱼类11408尾、49种，隶属于9目14科37属。夏季和秋季，淀山湖5个断面合计有鱼类29种和30种，黄浦江上游5个断面有37种和29种，刀鲚（Coilia nasus）、鲫（Carassius auratus）和大鳍鱊（Acheilognathus macropterus）为主要优势种。两个水体秋季的Shannon-Wiener多样性指数（H′）、Pielou均匀度指数（J′）、Simpson优势度指数（C）和Margale丰富度指数（D）指数均值都高于夏季的均值。相似性分析显示淀山湖各断面之间的鱼类群落相似性高于黄浦江上游各断面之间。ABC曲线表明，淀山湖及黄浦江上游鱼类群落结构总体上并不稳定，特别是淀山湖区域。Cluster聚类和非参数多维标度排序分析可明显将鱼类群落分为黄浦江群组Ⅰ、淀峰群组Ⅱ和淀山湖群组III，似鳊（Pseudobrama simoni）、刀鲚、大鳍鱊、?（Hemiculter leucisculus）和鲫是造成群组间差异性的主要分歧种。与以往研究数据相比，本次调查淀山湖及黄浦江上游鱼类种类有所上升，但鱼类群落仍以小型鱼类为主，受人为因素干扰较为明显。本文建议淀山湖要继续提升水质、开展鱼类增殖放流、减轻渔业捕捞压力，并控制贝类底拖网的捕捞区域及时间。
[期刊] 水产学报
[作者]
钟兰萍 高天翔 张浩博 陈治 王晓艳
岛礁生境支撑着极高的水生生物多样性，而鱼类物种多样性是水生生物多样性的重要组成部分。为准确了解岛礁海域的鱼类时空分布格局和多样性特征，依靠传统的渔业资源调查方式存在诸多的困难与挑战，亟需建立灵敏、高效的生物多样性监测方法。本研究于2019年在中街山列岛海域设置了4个采样站位，并在2、5、8和11月4个季节采集了海水表层样品，采用环境DNA metabarcoding技术进行高通量测序。结果显示，中街山列岛近岸海区共检测出37种鱼，隶属于10目26科36属；鱼类种数呈现夏季>冬季>秋季>春季的趋势；四季共有种仅2种，约占鱼类总种数的5.41%；只在一个季节被检测出的鱼类约占总种数的54.05%。结合NMDS分析和ANOSIM检验的结果显示，鱼类群落在不同季节间有显著差异（P<0.05），而在不同站位间无显著差异。鱼类群落的均匀度较为稳定，多样性和丰富度指数在站位间无明显变化，但在季节间表现为夏季最高、春季最低。研究表明，中街山列岛近岸海区的鱼类分布受季节影响较大，而在不同采样站位的差异不大，可能受站位较为集中的影响。本研究将为其他岛礁海域的鱼类多样性调查提供环境友好的新方法，并为渔业资源的管理和保护提供技术参考。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
韩婵 高春霞 田思泉 戴小杰
淀山湖是上海市内陆水域最大的淡水湖泊,主要的淡水渔业水域和水产品来源地,也是重要的水生生物保护基地。为了评估增殖放流和生态环境变化对淀山湖鱼类群落结构变化的影响,本研究以2010-2012年淀山湖的渔业调查资料为基础,对该湖泊的鱼类优势种组成和多样性指数进行年际变化分析,并应用丰度生物量曲线方法对该湖的鱼类群落状况进行分析。结果表明:2010-2012年淀山湖鱼种类数基本稳定,基本鱼种组成变化不显著,优势鱼种组成趋势渐以小型鱼类为主;群落结构多样性指数年间差异不显著(P>0.05);ABC曲线显示2010-2012这三年淀山湖群落的数量优势度曲线均高于生物量的优势度曲线,鱼类群落结构仍处于严重...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
李忠利 冉辉 巴家文 杨天友
2013年8月—2016年8月对沅江水系支流锦江的鱼类资源现状进行了调查。通过向渔民购买、现场捕捞等方式,共调查野生鱼类43种,隶属于5目11科39属,其中鲤科鱼类25种,占总种类数的58.1%。调查到新记录种5种,分别为大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)、吻(Rhinogobio typus)、洞庭华鲮(Sinilabeo tungting)、云南盘(Discogobio yunnanensis)和大眼鳜(Siniperca kneri)。干、支流均以底层鱼类为主,种类数分别占
关键词：
锦江 鱼类资源 现状 多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
麦俊晓 张帅 郑若丹 王腾 赖晓芳 蒋佩文 王文欣 陈作志 李敏
本研究通过提取南海西沙海域水体样本的环境DNA,利用鲸类线粒体12S r RNA和16S r RNA通用引物进行扩增和高通量测序,并结合目视观测的结果探讨环境DNA技术在鲸类物种多样性研究中的应用前景。结果显示,4种通用引物在鲸类鉴定方面具有一定的有效性,利用4种通用引物在西沙海域19个站点的样品中检测到5种鲸类,分别为热带斑海豚(Stenella attenuata)、长吻飞旋海豚(Stenella longirostris)、弗氏海豚(Lagenodelphis hosei)、小布氏鲸(Balaenoptera edeni edeni)和短鳍领航鲸(Globicephala macrorhynchus),采样过程中观测到的3种鲸类分别为:热带斑海豚、长吻飞旋海豚和瑞氏海豚(Grampus griseus)。两种方法检获的优势物种一致,利用环境DNA技术检测到了未被观测到的物种。结合引物Cet-12S和Marver3的检测结果可以涵盖所有站点(n=17)和所有鲸类物种(n=5),表明针对不同基因片段的引物结合使用有利于检测效果的提高。对于检出的鲸类序列和物种数,4种引物之间不存在显著差异,其中Cet-12S检出的鲸类序列数和物种数占比最高,分别为33.0%和21.1%,而其他引物检出的鲸类序列数和物种数占比仅为0.2%～0.6%和2.0%～4.1%。此外,Cet-12S非特异扩增的序列数和物种数显著低于其他3种引物,是特异性较高的鲸类环境DNA通用引物。相较目视观测,环境DNA技术具有灵敏度高、效率高且成本低等优势,适用于鲸类的物种多样性研究。本研究丰富了西沙海域的鲸类物种多样性信息,为鲸类保护和研究提供了技术参考。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
胡军华 胡慧建 何木盈 彭平波 杨道德
洞庭湖是长江中游现存仅有的两大通江湖泊之一,研究其鱼类资源对了解湖泊通江的生态作用有着重要意义。为此,在2002年9月~2004年6月每月定期定点在西洞庭湖区开展鱼类调查,结果如下:①实地调查到鱼类111种,隶属9目20科,包括中华鲟、胭脂鱼等珍稀物种;②鱼类物种数年动态波动较大,最高月份达69种,最低为26种,月均50±13种;③物种多样性指数年动态与物种数年动态大体一致,最高达3.34,最低为1.89,月均2.84±0.38;④空间分布上,位于入湖口的调查点物种数和多样性指数高于内湖,且差异有显著性(p<0.05);⑤在数量上,湖泊定居型鱼类占50%以上,其中,鲫数量最多,占16%左右。可...
关键词：
西洞庭湖 鱼类多样性 时空变化 通江湖泊
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
凌岚馨 范共 胡云 黄俊满 李晨虹
崇明岛位于长江入海口，其内河网密布，鱼类资源众多，但违规捕捞现象屡禁不止，严重影响崇明岛鱼类资源。鱼类多样性是水生态环境保护的一个重要指标，为评估崇明岛内鱼类资源、揭示鱼类多样性，于2020年6月至2021年5月在崇明岛内河设置24个采样位点，利用环境DNA（eDNA）技术与传统捕捞手段，每个季度进行了1次共4次采样调查。调查共检出13个目级阶元的78种鱼类，其中鲤形目最多，约占44%。基于捕获鱼类样本计算的全年香农-威纳多样性指数为2.08，基于eDNA数据计算的全年香农-威纳样性指数值为2.96，表明崇明岛具有较丰富的鱼类多样性。两种方法检测出共同的优势种为鳊（Parabramis pekinensis）、似鳊（Pseudobrama simoni）、麦穗鱼（Pseudorasbora parva）、子陵吻虾虎鱼（Rhinogobius giurinus）、大鳍鱊（Acheilognathus macropterus），表明崇明岛内河鱼类群落结构由淡水鱼类主导。主坐标分析和PERMANOVA检验结果显示东-西部群落鱼类组成存在差异（R~(2)=0.1012，P=0.0276）。研究结果亦表明eDNA技术可以作为传统鱼类资源调查的一个重要辅助手段。本研究为崇明岛内河鱼类资源现存状况、合理利用及保护提供了基础资料。
关键词：
eDNA 崇明岛 生态调查 生物多样性
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