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[期刊] 林业科学
[作者]
孙晓明 严东辉 贺伟 张星耀
【目的】杨生褐盘二孢菌在杨属的不同寄主上存在2个专化型,根据形态特征和现有的一些核酸分子序列标记上不易区分;本文在利用盘二孢属核糖体转录间隔区(ITS)序列构建的系统发育树基础上,结合ITS2区分2个专化型的特异性。【方法】对23株杨生褐盘二孢菌孢子形态特征观察。以基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到ITS序列。对从NCBI数据库中下载的盘二孢属的参考ITS序列,分别利用最大似然法、最大简约法和贝叶斯法构建3种系统发育树。同时,结合应用The ITS2 database预测ITS2二级结构模型,从分子进化角度分析杨生褐盘二孢菌2个专化型的特性。【结果】在寄主叶片上挑取的病原菌孢子形态比较典型...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
王凯英 高茜 孙晓明 张琰锋 严东辉
[目的]杨生褐盘二孢的单芽管专化型和多芽管专化型分别引起白杨组和黑杨组(包括青杨组)杨树的褐斑病,其分化机制有待阐明。[方法]本文在专化性互作体系建立的基础上,利用荧光染色标记研究了病菌孢子在专化性寄主侵染过程中的萌发发育情况,并通过RT-qPCR分析了黑杨寄主抗病相关基因在应答两专化型侵染过程中的不同表达。[结果]结果发现多芽管分生孢子在黑杨寄主上能完成发育并成功侵染,单芽管分生孢子也能成功萌发和发育,但不能侵入黑杨寄主;黑杨抗性基因在两专化型侵染发育过程中均能被诱导表达,但在表达时间和表达量上,除基因
[期刊] 林业科学
[作者]
韩正敏 李传道 黄敏仁
从我国江苏、河南、山东、陕西、北京和吉林６个省（市）的不同杨树上收集了４２个杨生褐盘二孢菌（Ｍａｒｓｏｎｉｎａｂｒｕｎｎｅａ）标本，比较和分析了它们的分生孢子大小和形态、培养性状、致病性方面的差异；并观察了它们之间的菌丝融合情况。４２个菌株间的分生孢子平均长度、平均宽度和分隔位置存在差异不显著。菌株个体内单个分生孢子变异幅度很大。分离自白杨派杨树上的菌株孢子萌发时均产生一个芽管；在ＰＤＡ培养基上菌落生长速度较快（２５ｄ菌落直径在１ｃｍ以上），菌落颜色为深褐色，并产生酱红色的孢子堆。来自黑杨派和青杨派上的菌株，孢子萌发时产生多个芽管；在ＰＤＡ培养基上菌落生长速度较慢（２５ｄ菌落直径不超过１ｃｍ）...
关键词：
杨树,杨生褐盘二孢菌,专化型,菌株
[期刊] 中国水产科学
[作者]
武宝生 司李真 孔晓瑜 时伟 龚理 杨敏 刘静
ITS2 (Internal transcribed spacer 2)是位于核糖体5.8S和28S基因之间的非编码序列。为了探讨该片段的多样性特征以及进化模式,本研究选取了鲈形目(Perciformes) 5科11种鱼类为研究对象,共获得了444条ITS2克隆序列,其长度范围为332～515 bp。比较种内不同序列的长度发现,金带细鲹(Selaroides leptolepis)在种内存在24 bp的差异,剑鱼(Xiphias gladius)在种内存在32 bp的差异,这2种鱼类的差异较为明显;其余9种鱼类的长度相对比较保守,长度差异小于14 bp。依据11种鱼类的保守位点数、变异位点数、简约信息位点数、单倍型数、保守位点比例、单倍型多样性指数、核苷酸多样性等特征分析发现,种内存在着不同程度差异,特别是金带细鲹的ITS2序列存在着Type A、Type B和Type C 3种类型,各类型间差异较大。根据序列的多样性特征推断,金带细鲹和剑鱼的进化方式为非协同进化;蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)、大甲鲹(Megalaspis cordyla)、吉打副叶鲹(Alepes djedaba)和日本竹筴鱼(Trachurus japonicas)的长度和变异位点均存在着一定程度的差异,但差异并不明显,视为不严格的协同进化;泰拉鰆鲹(Scomberoides tala)、布氏鲳鲹(Trachinotus blochii)、尖吻鲈(Lates calcarifer)、射水鱼(Toxotes chatareus)和军曹鱼(Rachycentron canadum) 5种鱼类为协同进化;另外,协同和非协同进化状态与分类系统没有相关性。序列比对发现,大甲鲹种内存在着由协同进化方式演变为非严格的协同进化方式的过度序列;在金带细鲹的3个不同个体中,序列间存在着从协同进化、非严格的协同进化演变为非协同进化的3种进化方式。基于ITS2序列构建的11种鱼类的邻接系统树显示,每种鱼类的克隆都分别按种单独聚为一支,鲹科7属鱼类各属也是单独聚支,表明ITS2不仅可以用在种类的分子鉴定,同时也可以作为分子标记应用于鲹科和属级水平的系统关系研究。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
王一然 丁瑞雪 耿丽娟 刘显琦 毛晋春 杨梅 陈旭 武俊瑞
巴氏杀菌乳因最大限度地保留了乳的营养物质和风味,深受国内外消费者的普遍青睐,然而,因其杀菌温度低、货架期很短,大大限制了大规模生产、远距离销售。其中,在贮运期间发生的蛋白质腐败性变质,是导致巴氏杀菌乳在贮运期间品质劣变的主要原因之一。在前期研究的基础上,结合蛋白质含量与氨基酸含量的分析,利用傅里叶变换红外光谱技术(FT-IR)分别对采集的不同贮藏温度和时间条件下的巴氏杀菌乳样品的蛋白质二级结构进行测定,并对不同巴氏杀菌乳样品的蛋白及其酰胺Ⅰ带及酰胺Ⅲ带进行了拟合,对不同贮藏温度和时间条件下的巴氏杀菌乳的蛋白质二级结构的变化规律进行进一步研究。结果表明:贮藏温度和时间对巴氏杀菌乳中蛋白质二级结构具有显著的影响,其中,在0℃和4℃贮藏条件下,巴氏杀菌乳乳清蛋白中的α-螺旋结构所占比例显著降低,无规卷曲结构所占比例显著上升,β-折叠、β-转角结构所占比例趋于稳定。而在15℃和25℃贮藏条件下α-螺旋结构的比例先下降后上升,总体来看,乳清蛋白二级结构随着贮藏时间的增加,由有序向无序转变。该结果表明了在不同贮藏条件下巴氏杀菌乳中蛋白质二级结构由有序向无序变化,二级结构的变化降低了巴氏杀菌乳在贮藏期间的营养价值。从蛋白质二级结构的角度来看,4℃的贮藏条件能更好保持巴氏杀菌乳的营养品质。
关键词：
FT-IR 蛋白质二级结构 巴氏杀菌乳
[期刊] 工业工程
[作者]
周菲菲 谢守祥
针对短生命周期产品的供应链利润最大化问题,建立并分析了二级供应链上制造商和销售商之间的非合作和合作定价博弈模型,得出供应链系统在成员合作情形下才能达到利润最大化的结论,并探讨了合作利润的分配机制,证明了在长期博弈中成员之间通过合作达到双赢的可行性。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
郝豆豆 张勇群 雷鸣 拉多
【目的】基于ITS2条形码技术鉴定藏药材苞叶雪莲,以保证药材质量,确保用药安全。【方法】对采自西藏林芝的苞叶雪莲进行DNA提取,PCR扩增得到ITS序列并测序;所有样品的ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型(HMM)的注释方法获得,使用MAGE6.0进行多重序列比对,并构建进化树,同时预测苞叶雪莲ITS2序列的二级结构。【结果】苞叶雪莲及其近缘物种的ITS2序列间存在明显差异,基于ITS2序列的NJ树及ITS2二级结构能将苞叶雪莲及其近缘物种区分开。【结论】ITS2序列可以有效的鉴别苞叶雪莲及其近缘物种,可以为苞叶雪莲的安全用药及合理开发利用提供依据。
关键词：
苞叶雪莲 ITS2 DNA条形码
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
冯纪年 李陇梅 张兴
根据GenBank中cry2Ad基因序列设计1对特异性引物,以苏云金芽孢杆菌新菌株S249质粒 DNA为模板,应用PCR扩增技术得到了1条大小约为2．0 kb的DNA片段(cry2Ad2)。通过引物步行法测定该片段长1919 bp,其中开放阅读框(ORF)长1902 bp,编码633个氨基酸;经DNASTAR软件分析,预测其蛋白分子量为70．72 ku,等电点pI=8．26。序列比较结果表明,该基因与cry2Ad类基因高度同源(同源性达99%)。该基因已在GenBank中登录,登录号为DQ219823,并被Bt δ-内毒素基因国际命名委员会正式命名为cry2Ad2。
[期刊] 学位与研究生教育
[作者]
董维春
阐述了2002-2005年间我国学位授予单位在农学门类博士学位授权一级学科下自主设置二级学科的现状,研究了农学门类自主设置学科的特征,分析了农学门类自主设置学科的交叉学科趋势,并对自主设置学科工作提出了若干建议。
关键词：
农学 自主设置 学科特征
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
宁正元 林世强
RNA是一类具有重要生物学功能的生物大分子,它是遗传信息由DNA到蛋白质的中间传递体.RNA二级结构预测方法可以分为基于热力学的预测方法和基于系统发生学的预测方法两大类.本文就RNA二级结构预测的方法进行了综述,介绍了最低自由能预测法、配分函数预测法、协同变异预测法、随机上下文无关语法预测法等4种预测方法以及它们的优缺点.
关键词：
RNA 二级结构 结构预测
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
王凤雪 冷雪 李真光 温永俊 刘准 武华
根据GenBank上发表的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)TJ株F3代全基因序列(GenBank登录号为EU860248),结合多个PRRSV亚洲株Nsp2基因比对结果,设计合成引物,选择高致病性PRRSV TJ株噬斑克隆纯化前后14个不同代次,利用合成的引物扩增各代次Nsp2基因的高变区片段及F3代和F92代Nsp2全基因,并进行产物克隆和氨基酸序列分析及结构预测。测序结果表明:PRRSV TJ株在克隆传代过程中出现了序列整段缺失,共缺失120个氨基酸,并且从F18代噬斑克隆开始一直稳定存在。缺失高变区及Nsp2蛋白二级结构预测结果表明:缺失的氨基酸使Nsp2蛋白在空间结构上发生了较大的...
[期刊] 华北农学报
[作者]
温立斌 何孔旺 杨汉春 王玉然
旨为预测类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白的B细胞表位。采用生物信息软件和互联网服务器,预测VP2的二级结构,分析VP2表面特性(亲水性、可塑性、可及性和抗原性),综合预测VP2的B细胞抗原表位。结果表明,P1VP2蛋白肽链的6-18和80-92区段为预测的B细胞表位优势区。多参数方案综合预测P1 VP2蛋白的B细胞抗原表位,为进一步鉴定表位及设计疫苗奠定了基础。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
胡建和 张彦明 张显升 刘在新 韩雪清 季建莉 刘湘涛 谢庆阁
据已发表的 CSFV C-株序列 ,设计合成了 5′- UTR特异性 PCR引物对 P1- N 1及半套式下游引物N1′。从兔脾组织中提取总 RNA,应用 RT- PCR及 Half- nested PCR成功地扩增出了 CSFV5′- U TR,进一步将该片段克隆到 p MD- 18T载体质粒并进行了序列测定。与 Shimen株、AL D株、GPE-株、Holland C-株和 Russian C-株相应区段的比较分析表明 ,其同源性分别为 96 .2 %,95 .7%,96 .0 %,98.7%和 95 .4 %。 5′- U TR中发现的隐性 AUG起始密码子及茎环二级结构 ,可能在多聚...
[期刊] 中国卫生经济
[作者]
陈煜 刘金宝 欧阳静
目的:通过分析新疆医疗服务价格归并前后二级医院收入结构的变化,探讨价格归并政策实施前"看病贵、看病难"现象的成因以及归并政策实施后的效果。方法:抽取全疆范围内二级医院5家作为样本,对其2003—2005年财务收入状况进行收集和统计学分析。结果:门诊药品构成比下降较大、检查收入上涨明显;在住院收入中药品费用已明显下降,护理,手术费用上涨明显;同期的门诊收入和住院收入相比较而言,政策对住院收入的影响较大。结论:2005年二级医院收入结构变化较明显,总收入得到了控制,政策的预期目的初步实现。
关键词：
二级医院 收入结构 价格归并政策
[期刊] 中国农业科学
[作者]
范运峰 赵启祖 赵耘 邹兴启 张仲秋 王琴 宁宜宝
【目的】分析CSFV3′-UTR一级序列和二级结构,为研究其对病毒复制、增殖和毒力的关系奠定良好的基础。【方法】利用RT-PCR技术扩增CSFV Thiverval株、HCLV株和Shimen株的3′-UTR并测序,使用DNAstar、Sequencher和RNAstructure软件进行CSFV3′-UTR基因组序列的比对分析和二级结构模拟。【结果】Thiverval株3′-UTR最长可达259个碱基,与母源株Alfort相比,含有32nt的插入,最短只有233个碱基,含有6nt的插入。HCLV株最长有244个碱基,含有17nt的插入;最短有233个碱基,含有8nt的插入。同时,疫苗株的插入...
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