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[期刊] 数据分析与知识发现
[作者]
魏星 胡德华 易敏寒 朱启贞 朱文婕
【目的】在海量文献中,挖掘并预测生物医学实体之间的新关联,构建关联网络。【方法】提出一种基于数据立方体的新方法挖掘疾病–基因–药物间关联,以糖尿病为例,构建关联网络,并使用关联规则量化实体关联程度。【结果】由糖尿病相关疾病(14种)、基因(23种)和药物(24种)构建三个1-D方体、三个2-D方体及其关联网络和一个3-D方体关联网络,共计存在411种关联,同时得到8个关联子网。【局限】数据预处理存在主观性,可能会对挖掘结果产生影响。【结论】算法性能优于其他同类算法,能够为糖尿病精准医疗提供更好的新研究思路
[期刊] 数据分析与知识发现
[作者]
魏星1,2 胡德华1 易敏寒1 朱启贞1 朱文婕2
【目的】在海量文献中,挖掘并预测生物医学实体之间的新关联,构建关联网络。【方法】提出一种基于数据立方体的新方法挖掘疾病-基因-药物间关联,以糖尿病为例,构建关联网络,并使用关联规则量化实体关联程度。【结果】由糖尿病相关疾病(14种)、基因(23种)和药物(34种)构建三个1-D方体、三个2-D方体及其关联网络和一个3-D方体关联网络,共计存在411种关联,同时得到8个关联子网。【局限】数据预处理存在主观性,可能会对挖掘结果产生影响。【结论】算法性能优于其他同类算法,能够为糖尿病精准医疗提供更好的新研究思路
[期刊] 情报理论与实践
[作者]
余黄樱子 董庆兴 张斌
[目的/意义]近年来,以电子病历大规模应用为标志的医疗信息化发展迅速。电子病历的广泛应用使得医疗信息管理机构产生并存储了大量医疗数据,如何从这些海量的数据中挖掘出有价值的疾病关联知识,以辅助疾病的精准诊断和预测成为当前信息科学研究人员和业界人员面临的重要问题。[方法/过程]文章提出一种疾病知识网络表示学习模型及其链路预测算法(NRL-LP),以进行疾病知识的关联关系挖掘与预测。该模型学习网络节点的内部和外部特征并将节点映射为空间向量以浅层表示节点,然后将链路预测问题转化为有监督的学习,提出NRL-LP算法预测节点对之间是否连接来挖掘和预测疾病知识间存在的关联关系。[结果/结论]以1400万条非结构化医疗临床记录的数据集为实验对象,结果表明,NRL-LP能够揭示新的疾病关联知识,为有效进行临床决策提供帮助。
关键词：
知识挖掘 链路预测 电子病历 预测方法
[期刊] 统计与决策
[作者]
陈治 吴娟娟
宫颈癌是全世界女性发病率和死亡率位居第二的恶性肿瘤,文章对宫颈癌样本数据集进行关联规则的Apriori算法分析,得到准确有效的关联规则,为宫颈癌的筛查和诊断提供一种新的思路。结果表明:年龄、性行为、吸烟情况、荷尔蒙避孕药服用情况、节育环放置情况均会导致不同支持度和置信度的性病或癌症的发生,且性病发生和癌症诊断这两者之间也存在着紧密的联系和规则。
[期刊] 图书情报工作
[作者]
雷鸣 夏梦鸽 汪雪锋 刘佳
[目的/意义]药物组合相比单一药物在临床治疗中存在多种优势,但药物数量的快速增长为药物组合筛选和推荐带来挑战,因此设计有效的预测方法为药物研发人员推荐更易产生协同作用的药物组合从而提高筛选效率具有重要意义。[方法/过程]面向疾病并发症诊疗需求,基于链路预测构建协同药物组合推荐模型,首先利用SAO语义挖掘识别医学文献中的并发症信息,在此基础上利用医学数据库构建"疾病-药物-靶点"异质网络,并引入链路预测方法对网络进行药物作用机制的相似性评估,预测哪些药物组合更可能产生协同作用,进而依据预测结果针对某个疾病或某对并发症进行药物组合推荐。[结果/结论]肠道疾病数据实证分析结果表明协同药物组合预测模型具有有效性和实用性。
[期刊] 中国卫生经济
[作者]
周大创 孙蕾 刘泽瑶 崔秀娟 马爱霞 唐文熙
目的:探讨不同严重程度的疾病、不同风险与健康偏好的人群的治疗措施的经济性评估的阈值选取。方法:基于边际效用递减理论,综合考虑人群风险与健康偏好与疾病的严重程度,引入风险、健康偏好与疾病严重程度的衡量参数,对传统的质量调整生命年与成本-效用阈值计算方式进行调整。结果:以新的方式计算出的成本-效用阈值对于一些轻微的疾病干预措施的经济学评价影响较小,但对于一些严重疾病可能计算所得的阈值与传统的阈值悬殊较大。结论:将风险、健康偏好与疾病严重等纳入考虑后计算出的成本-效用阈值更加符合经济学评价实际需求。
关键词：
药物经济学 评价阈值 人群偏好
[期刊] 统计研究
[作者]
戴稳胜,匡宏波,谢邦昌
The paper describes the classification of relationship rule and its effects judging standards and the realization procedure through computers.The paper fully introduces to the relevant knowledge about relationship rule.
关键词：
关联规则 支持度 置信度 增益
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张彬 李浩华 林强 汪波 梁万文 吕军仪
对菲牛蛭(Hirudinaria manillensis Lesson,1842)暴发性细菌性疾病的流行情况、临床症状、病原菌形态、生理生化特性、药物敏感性、病蛭的组织切片显微病理观察,病原16S rRNA基因分子鉴定以及4种中草药物对该病的治疗效果进行综合研究。结果表明,病原菌为嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)和奇异变形杆菌(Protues mirabilis)。该病可由这2种菌单独或共同引发。2种菌的人工感染和再感染重复性好、致病性强,发病死亡率均超过80%。药物敏感试验表明,2株病原菌均对氨曲南、庆大霉素、新霉素和环丙沙星敏感,而用板蓝根和陈皮药浴治疗病蛭效果较好...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
杨爱馥 周遵春 高杉 孙红娟 潘泳嘉 陈仲 董颖
为了寻找仿刺参(Apostichopus japonicus)养殖期间的"化皮病"关键调控基因,并分析这些基因所参与的信号通路,对本课题组前期已获得的仿刺参"化皮"I期(早期)、II期(中期)和III期(后期)3个阶段的病变及其同一个体正常体壁组织之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行进一步分析。主成分分析(principal component analysis,PCA)结果显示,"化皮"II期病变组织与正常组织之间的差异最小,"化皮"I期与III期表达关系比较接近,"化皮"II期是一个"转折期"。KEGG富集分析结果显示,补体与凝血级联(Complement and coagulation cascades)通路和细胞外基质受体(ECM-receptor interaction)通路在"化皮"3个阶段都显著改变。通过构建"化皮"过程关键差异表达基因调控网络,发现Ig GFc-binding protein(Fc GBP)基因和Tenascin(TN)蛋白家族基因在"化皮"不同阶段参与到发生显著变化的信号通路。q RT-PCR验证结果显示,5个DEGs在仿刺参"化皮"不同阶段表达趋势与RNA-Seq结果一致,皮尔逊相关系数r值为0.7714。"化皮"过程关键调控基因的筛选将为抗逆品种选育以及"化皮病"的防控提供科学依据。
关键词：
仿刺参 化皮 差异表达基因 调控网络
[期刊] 中国卫生经济
[作者]
陶立波
目的:探讨在我国药物经济学评价中构建和应用标准化疾病模型的方法和意义。方法:采用理论分析和定性阐述的方法。结果:在药物经济学评价中构建和使用标准化疾病模型是有可行的技术路线和方法的,建立这样的模型对提高药物经济学评价的效率、可信度都有重要的意义,但主要的挑战来自于基础数据的积累和整合。结论:在药物经济学评价中应用标准化疾病模型是必要且重要的,但必须克服数据障碍。
关键词：
药物经济学评价 疾病模型 标准化
[期刊] 统计研究
[作者]
朱建平,谢邦昌
The paper explores the problems of application of association rule of data mining.
关键词：
数据挖掘 关联规则 提升 统计
[期刊] 图书馆
[作者]
刘爱琴 王慧满 尚珊
关联数据是将超文本链接转变为超数据链接，其实质是以ＲＤＦ形式提供有用的信息，尽可能提供链接指向其它ＵＲＩ，使人们发现更多的相关知识。关联数据具备的统一、标准、定位精确的特点为图书馆信息挖掘提供了又一新的途径。文章从关联数据技术在图书馆信息挖掘与揭示中的影响机制分析入手，探讨了关联数据技术构建信息挖掘的优势，通过对文献标题、作者、关键词等内容的提取，利用关联数据自身携带的大量ＵＲＩ链接将相关领域的研究信息及数据集进行关联的实际应用来展示其可行性，有效地解决了现有匹配方法中信息关联范围小、准确率低、噪音多等问题，为信息挖掘与揭示提供了新的思路与方法，并对该方法的后续研究提供了新的研究范畴。
[期刊] 图书馆论坛
[作者]
奉国和 刘任铧 邓伟伟
挖掘高价值专利影响因素及主题，有利于政府和企业进行前瞻性专利战略部署，对抢占技术先机、赢取竞争优势具有积极意义。文章首先依托专利数据，采用因子分析法计算专利综合价值评分，依据2-8原则筛选高价值专利；然后对专利指标及其分类标签进行特征分析、差异性分析以及回归分析，探究影响专利价值的因素；最后使用BERTopic主题模型挖掘高价值专利主题。选取“纳米药物”专利数据进行实证分析，结果表明该方法能有效探究出专利价值的强影响因素，筛选出的高价值专利与其它方法获得结果高度一致。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
聂新辉 尤春源 鲍健 李晓方 惠慧 刘洪亮 秦江鸿 林忠旭
【目的】寻找与新陆早棉花品种农艺和纤维品质性状相关联的分子标记,鉴别与这些性状相关的优异等位变异及携带优异等位变异基因的典型载体材料,为新陆早棉花品种分子设计育种奠定基础。【方法】利用筛选出分布于26条染色体且多态性高的75对SSR标记对51份新陆早棉花品种进行多态性扫描;采用R语言编程软件对多环境的表型性状绘制boxplot图;在对供试材料进行群体结构和连锁不平衡分析的基础上,利用TASSEL软件中MLM(mixed linear model)方法进行分子标记与15个性状的关联分析;依据计算的表型效应值,鉴别和统计优异等位变异的位点及典型材料。【结果】通过群体遗传结构分析将51份新陆早棉花品...
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