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[期刊] 水产学报
[作者]
郭爱环 原居林 练青平 倪蒙 刘梅 顾志敏
为评估钱塘江上游黄尾鲴的增殖放流效果和潜在遗传风险，本实验利用已开发的11对微卫星引物，基于亲子鉴定技术对钱塘江上游增殖放流黄尾鲴的资源贡献率进行估算，同时开展黄尾鲴养殖群体和野外群体的遗传多样性比较，评估其增殖放流的遗传风险。结果显示，33尾繁殖亲本群体和105尾回捕群体的平均等位基因数(N_(a))为8.64，平均观测杂合度(H_(o))为度为0.708，平均期望杂合度(H_(e))为0.739，平均多态信息含量(PIC)为0.703，11对微卫星引物多样性较高。亲缘关系分析表明，11座位累计非亲权（CEP）排除率达到99.999 980%，在回捕的105尾黄尾鲴个体中，5尾回捕个体被确认为放流的子代，对野外群体的资源贡献率为4.76%。黄尾鲴养殖群体和野外群体均具有较高的遗传多样性，且群体内各个遗传参数相差较小，遗传多样性水平相近；分子方差分析（AMOVA）表明，遗传变异主要来自于群体内（95.92%），遗传分化系数F_(ST)为0.053 59，群体间的N_(m)为4.42，属于低等程度的分化，基因交流无障碍。综合分析表明，钱塘江增殖放流的黄尾鲴具有良好的资源恢复效果，且无放流带来的潜在遗传风险。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
成为为 汪登强 危起伟 王成友 杜浩 吴金明 李雷
利用已经发表的11对胭脂鱼多态性微卫星标记,对长江中上游胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)增殖放流效果进行评估。结果表明,5个胭脂鱼养殖场内所有的149尾繁殖亲本和长江中上游采集的65尾胭脂鱼中共观测到140个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度的平均值(范围)分别为0.771(0.519~0.906)和0.759(0.469~0.894),多态信息含量(范围)为0.726(0.392~0.882)。通过软件Cervus统计得到,11个微卫星座位累计排除率为99.998 3%,并且在长江中上游采集的65个样本中,11个样本与养殖场内繁殖亲本确定存在亲子关系,据此确定这11尾为...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
冯晓婷 杨习文 杨雪军 刘熠 周彦锋 方弟安 徐东坡
为评估长江江苏段鳙(Aristichthysnobilis)增殖放流效果,本研究基于微卫星标记的亲子鉴定技术,选用10对扩增效果稳定的微卫星荧光标记引物,结合毛细管电泳对江苏省内良种场563尾鳙亲鱼和长江江苏段687尾回捕鳙进行基因分型,并对位点多态性及亲子鉴定结果进行了分析。结果表明,各位点等位基因介于19～55之间,其观测杂合度为0.530～0.909(平均值为0.748),期望杂合度为0.818～0.929(平均值为0.882),多态性信息含量为0.797～0.924 (平均值为0.871); Cervus3.0模拟结果显示,当双亲未知且置信度为95%时, 10个微卫星位点的累积非亲权排除率为99.996%。亲子鉴定结果发现,所有回捕鳙中有42尾与亲本之间存在亲子关系,被确认来源于鳙增殖放流群体,并由此推算此次评估亲本的放流子代对长江江苏段野生群体的贡献率为6.11%。结果显示该研究进行的鳙亲子鉴定技术可为长江鳙增殖放流效果评估工作提供可靠的数据支撑,为长江渔业资源管理提供参考资料。
关键词：
鳙 微卫星标记 增殖放流评估 长江江苏段
[期刊] 淡水渔业
[作者]
李树华 陈大庆 段辛斌 刘绍平 汪登强
为探索草鱼(Ctenopharyngodon idellus)亲本增殖放流对野生群体遗传多样性和遗传结构的影响,对2011和2012年在长江中游增殖放流的4个草鱼亲本群体和当年草鱼早期资源调查的2个野生群体共182个个体的线粒体Dloop和Cytb基因片段进行遗传分析。结果发现,在2 046 bp的DNA片段中共发现65个多态位点,22个简约信息位点,定义了39个单倍型,群体平均单倍型多样性(Hd)为0.772,平均核苷酸多样性(π)为0.001 00,表明六个草鱼群体的遗传多样性较低,且群体间无差异。群体间的分子方差分析(AMOVA)显示群体间遗传分化系数为FST=0.010 12,P>0....
[期刊] 水产学报
[作者]
季晓芬 段辛斌 刘绍平 陈大庆 汪登强
利用筛选的13对草鱼多态性微卫星标记,开展了2011至2015年长江中游草鱼亲本增殖放流对野生群体遗传多样性的影响评估。通过对各位点的遗传多样性分析,13个微卫星位点的多态信息含量为0.8622(0.6570.950),基因多样度为0.8555(0.6750.936)。15个群体的有效等位基因数为7.450310.1536,等位基因丰度为11.48315.204,说明15个草鱼群体的遗传多样性水平总体较高。遗传分化指数分析表明,群体间不存在显著遗传分化(FST<5%)。通过贝叶斯聚类分析和主成分分析可将草
关键词：
草鱼 微卫星 遗传多样性 增殖放流
[期刊] 华北农学报
[作者]
佟广香 匡友谊 张永泉 尹家胜
为了研究微卫星标记在哲罗鱼增殖放流中的应用，采用１８对微卫星标记分析了哲罗鱼放流回捕群体（ＪＣ）、塔河群体（ＴＨ）及放流亲本群体（ＨＴ、ＹＺ）的遗传多样性和遗传结构，并对回捕个体进行了鉴定。结果表明，Ｎａ、Ｎｅ、Ｉ、Ｈｅ和Ｈ均是ＨＴ＞ＪＣ＞ＴＨ＞ＹＺ，Ｈｏ是ＹＺ群体最高，ＴＨ群体最低，这４个群体的遗传多样性均处于中等偏上水平；ａＭｏＶａ分析表明，４个群体内差异不显著，群体间差异达到显著水平；遗传距离分析显示ＹＺ群体和ＨＴ群体的相似度最大为０．７１８ ３，ＪＣ群体与其他３个群体的遗传相似度处于中等水平在０．５６６ ５～０．６８９ ５，ＹＺ群体和ＴＨ群体的遗传相似性最小为０．４９５ ９。结果显示，．．．
关键词：
微卫星标记 哲罗鱼 增殖放流
[期刊] 水产学报
[作者]
郭香 李琪 孔令锋 于红
为了提高长牡蛎遗传图谱上的微卫星标记密度,实验采用6个家系图谱间的共有微卫星标记作为锚定标记,构建了长牡蛎的整合图谱。该整合图谱共有161个微卫星标记,覆盖10个连锁群,图谱长度和平均间距分别为615.4和3.8 cM。各连锁群的标记数介于10～24个之间,连锁群长度为47.3～73.3 cM,是目前密度最高的长牡蛎微卫星图谱。不同作图家系连锁群上的标记分组保持一致,但标记顺序出现差异,可能与长牡蛎自然群体中存在大量的染色体重排现象有关。结果表明,该图谱可以为今后长牡蛎的遗传育种研究提供新的遗传工具。
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
刘云国 陈松林 李八方
应用10对微卫星引物对中国牙鲆一个养殖群体的30个个体进行了群体遗传结构分析。结果显示,微卫星标记比其他标记具有更高的多态性,10个微卫星座位的等位基因数在4～10之间,有效等位基因数在2.23～5.82之间,平均等位基因数为7.6,群体平均杂合度为0.6960,Hardy-wein-berg遗传偏离指数的平均值为0.1774。
关键词：
牙鲆 养殖群体 遗传变异 微卫星标记
[期刊] 中国农业科学
[作者]
应杰政 施勇烽 庄杰云 薛庆中
【目的】为正确评估中国水稻(Oryza sativa L.)主栽品种的遗传多样性提供依据。【方法】应用位于水稻)12条染色体上已筛选的24个微卫星(simple sequence repeats,SSR)标记组合(每条染色体2个),分析63个主栽常规稻品种和杂交稻组合亲本(2002年推广面积达6.67×104ha(100万亩))的遗传变异。【结果】共检测到135个等位基因,平均每个标记5.6个;多态性频率(frequency of polymorphisms,FP)变动范围为0.486～0.840,平均0.682。水稻恢复系比保持系/不育系遗传差异大;与常规籼稻品种相比,常规粳稻品种的遗传多样...
关键词：
水稻 微卫星标记 遗传多样性 遗传关系
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李春艳 丁君 常亚青 孙效文
采用新型生物素-磁珠吸附微卫星与同位素杂交相结合的方法筛选出15对微卫星引物,并对大连地区3个虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)养殖群体(黑石礁海区、小长山岛海区、广鹿岛海区)的遗传结构进行分析。获得175个阳性克隆并测序,得到160个含微卫星的序列,其中完美型,非完美型和混合型分别占42.69%(73)、46.20%(79)和11.11%(19),经筛选得到15个微卫星标记。虾夷扇贝3个群体的有效等位基因数在1.0000～8.8573之间;期望杂合度在0.0211～0.9111之间;观测杂合度在0.0000～0.8778之间。表明这几个群体遗传多样性水平较高。群体间遗...
关键词：
虾夷扇贝 微卫星 养殖群体 遗传结构
[期刊] 淡水渔业
[作者]
李燕平 覃川杰 吕云云 龚全 王均 颉江 文正勇
为研究14个不同养殖群体的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)遗传多样性及遗传结构，采用8对多态性微卫星引物对14个群体的209尾个体进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示：14个群体的平均等位基因数在8～10之间，平均有效等位基因在5.160～6.882之间，平均观测杂合度在0.633～0.717之间，平均期望杂合度在0.358～0.749之间，平均多态信息含量在0.594～0.681之间，均大于0.5。分子方差分析结果表明：3.69%的遗传变异来自群体间，3.93%来自群体内个体间，92.38%来自所有个体间，变异来源主要来自个体间，其中RB群体和WH群体的遗传分化最大(F_(st)=0.116),ZL群体和XB群体的遗传分化最小(F_(st)=-0.009)。基于遗传距离构建了UPGMA系统树，发现14个群体共分为5个聚类支，HJ、YZ、YH、YB 4个群体聚为一支，HQ和LG单独各自聚为一支，LZ和RB 2个群体聚为一支，DB、ZJ、WH、XH、XB和ZL 6个群体聚为一支。基于贝叶斯的Structure聚类分析同样支持14个黄颡鱼群体可分为5个聚类支，与聚类树的结果吻合。14个黄颡鱼群体的遗传多样性均处于高度多态水平，遗传分化处于低等分化水平。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
胡玉婷 凌俊 江河 汪焕 潘庭双 段国庆 周华兴 杨敏 李彤
为评估奇数年江苏和安徽中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)养殖群体的遗传背景，进而为后续的遗传改良及新品种培育提供科学依据，本研究利用10对微卫星标记分析了6个中华绒螯蟹养殖群体的遗传多样性和遗传结构。结果显示，所有群体的遗传多样性水平都较高且相近(等位基因数N_(a)=16.0～18.4，有效等位基因数N_(e)=10.1～12.4，观测杂合度H_(o)=0.759～0.836，期望杂合度H_(e)=0.897～0.916，多态信息含量PIC=0.870～0.892)。群体间遗传距离D_(n) (0.154～0.277)、遗传分化系数F_(st )(0.001～0.011)均较小，分子方差分析(AMOVA)结果中群体间遗传变异仅占0.47%，一致表明群体间不存在显著遗传分化。群体间系统发育树显示，6个养殖群体具有共同的祖先型，高淳群体与其他群体亲缘关系最远，结合其高的遗传多样性水平，高淳群体可作为选育基础群之一。Structure遗传结构分析显示，每个养殖群体的遗传组成多样且比例近似，结合近交系数和瓶颈效应分析表明，中华绒螯蟹养殖群体存在较大程度的外源种质混杂。综上，苏皖地区中华绒螯蟹养殖群体遗传多样性仍然较高，具有潜在的开发与利用价值，但其可能存在种质混杂，在开展后续的良种选育时，需对养殖群体进行进一步的研究，提纯种质，使其种质资源得到合理的可持续性利用。
关键词：
中华绒螯蟹 遗传多样性 微卫星 养殖群体
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
许宙 黄耀江 周文化
为了从分子水平上揭示独龙鸡群体遗传结构,利用鸡基因组中25个微卫星标记,检测了独龙鸡群体的遗传多样性,同时探讨了独龙鸡在国内几个地方鸡种中的系统地位.结果表明:25个微卫星位点共检测到90个等位基因,其中ADL0166位点的等位基因数最多,为8个,而ADL0112、LEI0166、MCW0067、ADL0268、MCW0294、MCW0078和MCW0183这7个位点的等位基因数最少,为2个;聚类分析结果显示,独龙鸡与我国华南、西南地区鸡种之间有比较密切的亲缘关系,而与我国华北和东北地区鸡种亲缘关系均较远.总体而言,该系统聚类结果与13个鸡种的地理分布是一致的,并且认为独龙鸡是由红原鸡进化而来...
关键词：
独龙鸡 微卫星标记 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
商鹏 郭新颖 张健 吴绿草 段梦琪 杨娜娜 赵雨农 李盼 强巴央宗
为研究西藏藏马种群的微卫星多态性,应用生物素标记的微卫星探针与藏马基因组酶切片段杂交,通过链霉亲和素包被的磁珠捕获150～1 000 bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pEASY-T1载体中,构建藏马基因组微卫星富集文库。结果表明:从2 380个转化子中随机挑取112个阳性克隆进行测序后,经筛选比对发现,从62个微卫星中筛选出39个在马属基因组卫星库中未被检测到的微卫星;成功设计了10对藏马微卫星引物,经聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测到3个具有多态性的微卫星标记,其中有2个多态性信息含量(PIC)值均大于0.5。因此,这3个微卫星标记可应用于藏马遗传多态性检测、种群遗传结构等方面研究,为藏马遗传连锁图谱的构建、辅助育种、群体遗传学分析、基因组结构分析以及分子进化研究等提供依据。
关键词：
藏马 微卫星标记 遗传多样性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
崔景香 李传忠 孟祥凯 尹逊河 王慧
采用微卫星标记技术检测了山东省3种地方鸡种:汶上芦花鸡、济宁百日鸡和日照鸡的遗传多样性,在40种微卫星引物中筛选出多态性丰富且扩增条带清晰稳定的6个引物。统计分析了各群体的等位基因数(NA)、多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H)、群体间的遗传距离(DS)和相似系数(I)。采用UPGMA法构建系统发生树。结果表明:3个地方鸡种在6个微卫星位点上共发现了15个等位基因,每个位点的等位基因数为2~3个;每个群体的平均等位基因数分别为2.5、2.2和2;大小在110~300bp之间,期望杂合度与观测杂合度比较接近。芦花鸡(W)多态信息含量最大,为0.3075;日照鸡(R)中最小,为0.2915。以...
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