为解析南阳黑猪种群中脂肪表型极端差异个体之间的遗传变异基础，本研究以南阳黑猪种群中体重相近但脂肪表型差异明显的6月龄全同胞或半同胞个体为研究对象，分别对其进行胴体性状和肉质性状统计分析，采用高通量测序技术对高脂肪组和低脂肪组的样品进行全基因组重测序，整合课题组前期转录组数据分析南阳黑猪脂肪沉积相关的遗传位点和功能基因。结果表明：1)高脂肪组肌内脂肪含量((4.96±0.62)%)显著高于低脂肪组((3.61±0.11)%)(P

采取90头180日龄去势苏太猪的背最长肌组织测定肌内脂肪含量,从中选取肌内脂肪含量差异极显著(P<0.05)。提...

本文旨在克隆鲤(Cyprinus carpio)激素敏感性脂肪酶a (hormone-sensitive lipase a, lipea)基因,探究其时空表达特征及其与脂肪沉积的关系,以期为鲤脂肪沉积分子调控机制研究奠定理论基础。本实验采用RACE技术克隆获得鲤lipea基因,其cDNA全长为3379 bp,包括230 bp的5′非翻译区(5′-UTR)、1067 bp的3′非翻译区(3′-UTR)和编码693个氨基酸的开放阅读框。多序列比对显示,鲤lipea与斑马鱼(Danio rerio)、牙鲆(Paralichthys olivaceus)和虹鳟(Oncorhynchusmykiss)的氨基酸序列相似性分别为88.17%、64.94%和63.35%,不同物种间序列差异主要集中在C-端的多肽序列上。蛋白质结构分析显示该蛋白含有3个功能域分别具有脂肪酶活性、乙酰基水解酶活性和水解酶活性。应用实时荧光定量PCR技术分析了lipea基因在鲤各组织、不同发育时期以及脂肪含量极端差异个体的肌肉和脂肪组织中mRNA表达量的变化。结果显示, lipea在各组织中均有表达,腹腔脂肪中相对表达量最高,其次是腹部肌肉,血液中最少。随着胚胎的发育, lipea的表达水平呈现下降趋势, 8细胞期表达量最高,其次是囊胚晚期,开口期最少。lipea表达量与背部肌肉脂肪含量呈正相关,但差异不显著(P>0.05),与腹腔脂肪量呈负相关,且差异极显著性(P<0.01),推测lipea基因对鲤腹腔脂肪沉积可能具有抑制作用。本实验结果可为进一步解析鲤lipea基因的功能和基因调控脂肪沉积分子机制研究提供参考。

为探究gga-miR-17-5p在鸡脂肪沉积和肌肉发育中的作用，本研究以矮小品系S3(DW)和隐性白羽鸡（RR）为试验素材，分析gga-miR-17-5p在不同时期腿肌、肝脏、腹脂组织及细胞中的表达差异，并通过KEGG及蛋白互作分析筛选关键靶基因。结果表明：1)gga-miR-17-5p在腹脂、肝脏和腿肌组织中均可表达。在腹脂中，ggamiR-17-5p在0周表达有品种差异（P<0.05），且2个品种在0周时显著高于其他周龄（P<0.05）；在肝脏中，ggamiR-17-5p在16周有品种差异（P<0.05）,S3系在16周显著高于其他周龄（P<0.05），隐性白羽肉鸡在16周显著高于0周和8周（P<0.05）；在腿肌中，gga-miR-17-5p在0周有品种差异（P<0.05）,S3系在0周和2周显著于其它周龄（P<0.05），隐性白羽肉鸡在0周显著高于其他周龄（P<0.05）。2）在脂肪细胞中，gga-miR-17-5p在肌内脂肪细胞诱导分化6 d后的表达显著高于增殖期和分化1 d(P<0.05)；腹脂细胞分化1 d的表达最低，显著低于增殖期、分化4 d和分化6 d(P<0.05)。3）在成肌细胞中，gga-miR-17-5p的表达量随分化时间的延长而升高，且分化6 d的表达显著高于增殖期（P<0.05）。4)KEGG及蛋白互作分析表明，PTEN、MAPK3、PIK3R1、BECN1和PLCB4是gga-miR-17-5p重要的靶基因。RT-qPCR结果表明，PTEN和PIK3R1在成肌细胞增殖期的表达显著高于分化期（P<0.05）。综上，gga-miR-17-5p的表达存在显著的品种和组织差异性，miR-17-5p很可能通过PTEN、MAPK3、PIK3R1、BECN1和PLCB4来影响肌肉发育和脂肪沉积，其中PTEN和PIK3R1尤为关键。本研究为深入研究gga-miR-17-5p的功能和机制提供了坚实的理论基础和数据支撑。

为从全基因组水平探索影响藏猪骨骼肌发育的遗传变异，本研究对5头迪庆藏猪进行全基因组重测序，并合并NCBI数据库中来自3个省的藏猪、与藏猪同样小体型及生长慢的巴马香猪、及体型大且生长快速的杜洛克和大白猪共70个猪只的全基因组重测序数据进行整合分析，获得全基因组SNP后结合选择信号检测与等位基因频率(AF)分析鉴定藏猪-香猪与杜洛克-大白猪的遗传差异；利用GO和KEGG功能富集分析藏猪骨骼肌转录组与蛋白组相关基因。结果发现：1)2 211个基因在藏猪-香猪与杜洛克-大白猪2个比较组中存在遗传差异，138个基因富集到骨骼肌发育相关的GO功能集及KEGG通路；2)9个基因(UCHL3、POSTN、COL12A1、PGK1、JPH1、GPT2、RBFOX1、FLNB和DCX)已报道参与藏猪60 d胚胎背最长肌发育调控，1个(CKM)参与6月龄藏猪背最长肌发育调控；3)10个基因共包含936个SNP,其中655个SNP位于基因间区，255个是内含子变异，少量SNP是外显子及调控区变异。本研究从全基因组水平鉴定了与藏猪骨骼肌发育相关基因及其遗传变异，为以后持续深入解析藏猪骨骼肌发育的遗传机制提供参考。

为探究猪ARID5B基因多态性及其与脂肪沉积性状的相关性,在DNA水平上对藏猪、大白猪ARID5B(AT-rich interaction domain 5B)基因5′侧翼区进行了单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点筛选;在mRNA水平上对两猪种的肝脏、背脂和背最长肌组织中的ARID5B基因表达量进行了RT-qPCR检测;并对两猪种的背膘厚和背最长肌组织中IMF(Intramuscular fat)含量进行测定。结果表明:在ARID5B基因5’侧翼区,存在T-2 216C和In-2 029Del缺失2个连锁突变位点,藏猪与大白猪呈极显著差异(P<0.01);在相同组织不同品种间,ARID5B基因在肝脏、背脂和背最长肌中mRNA相对表达量趋势完全一致,且藏猪ARID5B基因表达量均极显著低于大白猪(P<0.01);藏猪背膘厚和IMF含量均极显著高于大白猪(P<0.01);经DNA、mRNA水平、背膘厚和IMF含量相关性分析发现,ARID5B基因mRNA相对表达量与背膘厚和IMF含量呈显著负相关(P<0.05)。

牛作为反刍动物的代表,具有独特的生物学特征和重要的哺乳动物进化地位,是人类生产活动的重要工具和肉、奶等物质需求的主要来源。近10年来,牛全基因组研究取得了很多重要的进展,为解释牛的生物学特征和加快品种的分子育种进程发挥了重要作用,文章重点介绍了牛全基因组测序的相关研究成果,以及测序工作完成后的研究进展,讨论了牛全基因组测序工作的机遇、研究重点,以及今后面临的挑战。

【目的】本试验旨在研究母鸡采食量限饲对子代脂肪沉积、脂肪酸合成酶(fattyacid synthetase,FAS)活性及其基因表达的影响,探讨母体营养效应及子代后天的补偿作用。【方法】选择东北农业大学繁育的高、低脂系肉种母鸡各384羽,分别分为两个处理组。产蛋期,处理一饲喂正常日粮,处理二日采食量是处理一的75%。产蛋高峰期收集种蛋进行孵化。子代自由采食常规水平日粮。【结果】母鸡采食量限饲显著提高子代28日龄腿肌脂肪含量(P0.05);子代肝脏脂肪含量品系间存在差异,高脂系显著高于低脂系(P<0.05);品系与采食水平的互作对子代肝脏脂肪含量和28日龄...

【目的】适合机械化收获是当今油菜育种改良和遗传研究的重要目标。该研究以一个自然变异产生的油菜有限花序(denterminate inflorescence 1,di1)突变体为研究对象,通过分析有限花序的遗传模式,开展有限花序性状的基因定位和克隆,以期发掘候选基因,为培育适合机械化收获的油菜新品种提供新思路和新材料,为揭示油菜有限花序遗传机制奠定基础。【方法】以一个稳定遗传的有限花序突变株系FM8与野生型自交系FM7开展正反交,观察F1和F2后代的花序形态,分析有限花序性状的遗传模式。在F2群体中挑选20个有限花序单株和20个野生类型单株构建混合池,对混合池和亲本开展20×和10×覆盖度的全基因组重测序,定位有限花序性状的关联区间。根据关联区间对应到拟南芥基因组的共线性区段和基因注释信息,预测候选基因,并对候选基因进行同源克隆,发掘序列变异,筛选关键基因。【结果】油菜有限花序突变性状表现为初花期主花序和侧枝花序顶部形成一个或若干个顶生花,花序无限生长受阻,导致结角期主枝和侧枝有封顶特征即有限花序。有限花序突变株系与野生型正反交F1均表现为野生型,F2代无限花序与有限花序的分离比符合13﹕3,说明有限花序的遗传受2对隐性基因和1对隐性上位抑制基因互作控制。对混合池及亲本开展全基因组重测序,得到30 123个单核苷酸多态性(SNPs)标记和107 636个插入缺失标记(In Dels)标记,用于有限花序性状的全基因组定位。定位结果共检测获得7个显著关联区间,分布于油菜A08、A09、A10、C08和C09共5条染色体。其中,A10染色体上的关联区间峰值最高,是控制有限花序性状的主效位点。并且,A10染色体关联区间内的14.36—15.07 Mb的区域与C09染色体2个关联区间显示高度同源性。候选基因预测发现位于A08、A09、A10、C08和C09的5个关联区间包含有8个候选基因,包括TERMINAL FLOWER 1(TFL1)、FLOWERING LOCUS C(FLC)、ATBZIP14(FD)、MULTICOPY SUPPRESSOR OF IRA1 4(FVE)和SCHLAFMUTZE(SMZ)。基因序列分析表明di1突变体TFL1、FVE和SMZ的基因编码区存在序列变异,并导致蛋白序列变异。【结论】油菜有限花序突变由2对隐性基因和1对隐性上位抑制基因互作控制。与有限花序性状显著关联的区间有7个,其中,位于染色体A10和C09的关联区间具有高度同源性。TFL1、FVE和SMZ被推断为有限花序性状的候选基因。

[目的]本研究旨在探讨饲料胆汁酸水平对齐口裂腹鱼幼鱼生长、脂肪沉积脂肪代谢及相关基因表达的影响；[方法]以360 尾初始体质量为( 12.74±0.14) g 的健康齐口裂腹鱼幼鱼为对象，随机分为4 组，每组设3个平行组，每个平行组放养30 尾实验鱼，分别投喂添加0、75、150 和300 mg /kg 胆汁酸的4 种实验饲料，养殖时间为70 d；[结果]结果显示，随着胆汁酸水平的升高，齐口裂腹鱼的增重率（WGR）呈先升高后降低的变化趋势（P＜0.05），且在胆汁酸水平为150 mg/kg时达到最大，为226.63%；其肠脂肪酶（LPS）、肝酯酶（HL）、脂蛋白脂酶（LPL）和总脂酶（TL）均呈先升高后趋于稳定的变化趋势（P＜0.05）；而脂肪酸合成酶（FAS）活性则呈相反的变化趋势；齐口裂腹鱼肝脏LPL mRNA表达量则呈先上调后趋于稳定的变化趋势，FAS mRNA表达量呈先下调后趋于稳定的变化趋势（P＜0.05）；实验鱼肝脏、肌肉及全鱼中粗脂肪含量均随胆汁酸添加水平的升高呈先降低后趋于稳定的变化趋势（P＜0.05），随胆汁酸添加水平对实验鱼的成活率及脂肪沉积效率无明显影响（P＞0.05）。[结论]研究表明，本实验条件下，添加适量的胆汁酸可有效上调齐口裂腹鱼LPL mRNA的表达量，下调FAS mRNA的表达量，增强脂肪代谢酶活性，促进对饲料脂肪的消化和利用，降低脂肪沉积，保护肝脏健康。

[目的]本研究旨在探讨饲料胆汁酸水平对齐口裂腹鱼幼鱼生长、脂肪沉积脂肪代谢及相关基因表达的影响；[方法]以360 尾初始体质量为( 12.74±0.14) g 的健康齐口裂腹鱼幼鱼为对象，随机分为4 组，每组设3个平行组，每个平行组放养30 尾实验鱼，分别投喂添加0、75、150 和300 mg /kg 胆汁酸的4 种实验饲料，养殖时间为70 d；[结果]结果显示，随着胆汁酸水平的升高，齐口裂腹鱼的增重率（WGR）呈先升高后降低的变化趋势（P＜0.05），且在胆汁酸水平为150 mg/kg时达到最大，为226.63%；其肠脂肪酶（LPS）、肝酯酶（HL）、脂蛋白脂酶（LPL）和总脂酶（TL）均呈先升高后趋于稳定的变化趋势（P＜0.05）；而脂肪酸合成酶（FAS）活性则呈相反的变化趋势；齐口裂腹鱼肝脏LPL mRNA表达量则呈先上调后趋于稳定的变化趋势，FAS mRNA表达量呈先下调后趋于稳定的变化趋势（P＜0.05）；实验鱼肝脏、肌肉及全鱼中粗脂肪含量均随胆汁酸添加水平的升高呈先降低后趋于稳定的变化趋势（P＜0.05），随胆汁酸添加水平对实验鱼的成活率及脂肪沉积效率无明显影响（P＞0.05）。[结论]研究表明，本实验条件下，添加适量的胆汁酸可有效上调齐口裂腹鱼LPL mRNA的表达量，下调FAS mRNA的表达量，增强脂肪代谢酶活性，促进对饲料脂肪的消化和利用，降低脂肪沉积，保护肝脏健康。

为研究PPARA对绵羊肌内脂肪(IMF)沉积的影响及作用机制，寻找绵羊肌内脂肪沉积相关分子标记，以小尾寒羊(STH)和萨寒杂交(STH×SFK)F_1群体为研究对象，通过测定其肉品质，利用H&E染色和油红O染色比较2个绵羊群体背最长肌组织学结构及脂滴分布；利用qRT-PCR和WB技术检测PPARA mRNA水平和蛋白水平在不同群体间的表达差异，并分析PPARA基因与肌内脂肪的相关性；Sanger测序技术检测PPARA基因SNP位点以评估其作为绵羊肌内脂肪沉积相关遗传标记的可能性。结果表明：小尾寒羊剪切力和失水率极显著高于萨寒杂交，但是pH值极显著低于萨寒杂交，大理石花纹评分小尾寒羊低于萨寒杂交群体；组织学染色显示，小尾寒羊肌纤维较粗，排列紧密，肌内脂肪在肌纤维间隙集中分布；萨寒杂交肌纤维较细且结构松散，肌内脂肪在肌细胞间及肌纤维间隙均匀、广泛分布，含量更高；PPARA mRNA表达量小尾寒羊群体显著高于萨寒杂交群体，PPARA蛋白表达量小尾寒羊群体极显著高于萨寒杂交群体；相关性分析显示，PPARA基因表达量与绵羊脂滴面积比及pH值呈极显著负相关，与剪切力和失水率呈极显著正相关，与大理石花纹评分弱相关；Sanger测序结果分析显示，2个绵羊群体PPARA基因第2内含子T49885C、T50007C、G50013A、G50835A、G50942A及G51154C位置上发生碱基突变，但小尾寒羊群体未检测到C49885T突变。SNP遗传多样性分析显示，SNP位点群体纯合度均大于杂合度，在群体中处于中低度多态；除G50835A突变偏离了Hardy-Weinberg平衡，其余SNPs均符合Hardy-Weinberg平衡，遗传基础稳定。研究认为，PPARA基因对绵羊肌内脂肪沉积具有重要影响，可作为绵羊肌内脂肪性状选择的潜在分子遗传标记。

【目的】通过研究牛KLF3基因对牛脂肪分化和脂肪酸代谢关键基因表达量的作用,进而探讨KLF3基因对脂质沉积的影响。【方法】合成干扰siRNA,筛选得到KLF3基因干扰效率最高SiRNA,分离培养秦川牛肉用新品系新生牛前脂肪细胞生长至70%-90%汇合度时转染筛选得到的KLF3基因SiRNA和阴性对照SiRNA(NC),并进行诱导分化培养至第0天和第4天时,利用荧光定量PCR方法研究分化标志基因过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptorγ, PPARγ)、CCAAT增强子结合蛋白(CCAAT/enhancer-binding proteinsα, C/EBPα),脂肪酸代谢关键基因脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FAS)、乙酰辅酶A羧化酶(acetyl-CoA carboxylaseα, ACCα)和脂肪酸结合蛋白4(fatty acid binding protein 4, FABP4)基因在牛脂肪细胞分化不同时期干扰KLF3基因处理组和对照组之间表达量的变化,同时在干扰KLF3基因处理并进行诱导脂肪细胞分化的第4天采用油红O染色法观察干扰KLF3基因处理组和对照组之间脂滴差异及采用酶联免疫吸附测定(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)方法测定甘油三酯含量进一步确定KLF3基因对牛脂肪细胞分化和脂肪酸代谢的作用。【结果】KLF3-Si2具有最高的干扰效率达到73%。转染KLF3-Si2后PPARγ的表达量在牛脂肪细胞诱导分化的第0天和第4天与对照组相比分别下调了58%和37%,达到了差异极显著(P<0.01)。脂质代谢的关键基因FABP4的表达量与对照组相比在牛脂肪细胞诱导分化的第0天和第4天分别下调了89%和60%,而ACCα的表达量干扰KLF3处理组与对照组相比在脂肪细胞诱导分化第0天和第4天分别下调了50%和37%,而FAS的表达量则分别下调了73%和19%,都分别达到了差异极显著(P<0.01)。在牛脂肪细胞诱导分化第4天油红O染色和甘油三酯含量测定也发现干扰KLF3基因处理组与对照组相比脂滴减少,甘油三酯含量显著下降(P<0.05)。【结论】干扰牛KLF3基因可以抑制牛脂肪细胞分化和脂肪酸代谢关键基因表达量下调,进而影响脂肪的沉积。

［目的］研究瘦素受体（ｌｅｐｔｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ，ｌｅｐｒ）的ｍｒｎＡ表达和编码序列单核苷酸多态性（ｃ ＳｎｐＳ）对猪脂肪沉积性状的影响。［方法］本文旨在利用实时荧光定量ｐｃｒ（ｒｔ－ｑ ｐｃｒ）方法和免疫印迹方法检测了该基因在高脂猪和低脂猪背最长肌、背膘、心、肝和肾共５种组织样中的ｍｒｎＡ和蛋白表达量，利用直接测序方法检测了ｌｅｐｒ第１８外显子ｃ ＳｎｐＳ，并对ｌｅｐｒ表达量、编码序列单核苷酸多态位点与苏钟猪脂肪沉积相关性状进行了关联分析。［结果］ｒｔ－ｑ ｐｃｒ结果表明：ｌｅｐｒ ｍｒｎＡ在这５种组织中均有表达，且差异显著（ｐ＜０．０５），其中背膘组织中的表达量显著高于其他组织（ｐ＜０．．．

针对花粉管通道法导入苦瓜DNA的籼稻子代D9和受体RT,采用IlluminaHiSeq TM平台进行全基因组重测序,分析了精米的基本营养成分、总皂苷成分以及膨胀势和米饭的食味品质。结果表明:苦瓜的部分DNA片段被整合进了受体水稻的DNA中,使生理活性成分总皂苷含量显著提高;苦瓜基因对水稻的营养成分有改善作用,使脂肪含量增加,膳食纤维与灰分的含量有所减少。