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[期刊] 草业科学
[作者]
赵柏霞 闫建芳 肖敏 郑玮 李俞涛 夏国芳 张立恒 潘凤荣
为了探究甜樱桃(Prunus avium)果园生草对土壤代谢物的影响，本研究以甜樱桃果园行间覆盖鼠茅草(Vulpia myuros)(S)的土壤和行间清耕的土壤(Q)为研究对象，采用超高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱(UHPLC-QTOFMS)的代谢组学方法分析土壤中差异代谢产物。结果发现，两组样品中共检测出441种代谢物，其中405种为两者共有，S组样品检测出427种，Q组样品检测出419种。在鉴定出的代谢物中，脂类和类脂分子数量最多，占代谢物总数的33.33%，其次是有机酸及其衍生物，占代谢物总数的23.19%。两组土壤样品筛选得到差异代谢物203种(P <0.01)，占共有代谢物的50.12%，其中上调2个，下调201个。差异代谢物主要是脂肪酸及衍生物、氨基酸及衍生物、胺类、萜类、吲哚及衍生物、固醇类及其他物质。KEGG通路富集分析结果显示，有34种差异代谢物富集到了20条代谢通路，其中显著富集(P <0.05)到色氨酸代谢、脂肪酸生物合成、芳香族化合物的降解通路之中。综上，樱桃果园生草对土壤代谢物产生了明显的影响，生草后土壤代谢物种类增加。与清耕对照相比，13个差异代谢物显著下调，分别富集到色氨酸代谢、脂肪酸生物合成、芳香族化合物的降解通路中。其中色氨酸代谢中的邻苯二甲酸下调显著。筛选到的差异代谢物通过参与各种生物过程，进而影响土壤理化性质和微生物的种群。研究结果为樱桃果园生草种植模式影响果园土壤微生态提供理论依据。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
赵柏霞 闫建芳 潘凤荣
【目的】明确樱桃果园行间生草对土壤的生态效应，为选择适宜的人工生草种类和生产优质的甜樱桃提供参考依据。【方法】以清耕为对照，在8年生樱桃果园行间进行种植鼠茅草（Vulpia myuros）、黑麦草（Lolium perenne）以及覆盖园艺地布处理，测定各处理的土壤温湿度、理化性质。并采用高通量测序技术对各处理土壤中细菌的多样性和群落结构进行分析。【结果】与对照相比，樱桃果园行间种植鼠茅草和黑麦草在春季可以提高土壤的温湿度，夏季则是降低土壤温度，提高土壤湿度。樱桃果园生草栽培能明显提高樱桃果园土壤的有机质、氮、磷、钾含量。高通量测序结果表明，共获得了2203个OTUs，主要分布在21个门，39个纲，85个目，119个科，221个属，263个种。多样性分析显示，鼠茅草处理的细菌多样性和丰富度最高。各处理的优势菌门为变形菌门（Proteobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）等。与清耕相比，种植鼠茅草后使酸杆菌门细菌丰度增加，而种植黑麦草则富集了γ-proteobacteria纲的细菌。【结论】樱桃果园行间生草对土壤微生态环境产生了明显的影响，土壤中细菌的多样性显著提高，并在一定程度上提高了土壤有机质及各养分含量，改善了土壤质量。
[期刊] 华北农学报
[作者]
于文全 刘海荣 杨晓华 赵恒田
为了克隆草原樱桃多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,并进行生物信息学分析。以草原樱桃叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,通过PCR扩增获得约1 kb的DNA片段。序列分析表明,该基因全长1 193 bp,包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990 bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列,GenBank登录号为GU068977;该基因与中国李、杏、桃、马哈利樱桃、梅等李属植物的PGIP基因序列一致度达95%～99%。系统进化分析显示,属内亲缘关系较近、属间亲缘关系较远的特点。克隆了草原樱桃PGIP基因,为樱桃抗病育种提供一...
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
刘灵芝 肖亦农 秦嗣军 吕德国 马怀宇
为了解东北山樱土壤细菌碳代谢特征及种群分布,研究了东北山樱原产地(辽宁省本溪市)植株表土与根际土壤碳代谢细菌活性及其种群特征。结果表明:各类土壤中共分离优势细菌19株。优势细菌对供试糖、醇与氨基酸类碳源的平均菌株利用率分别为36.2%、29.4%和28.9%。其中,甜樱桃/东北山樱植株土壤细菌碳代谢活性较低,表土中土壤细菌总数与碳代谢菌株数量均高于相应根际土壤。与根际土壤相比,甜樱桃/东北山樱表土分离到的优势细菌中,利用半乳糖和乳糖等糖类化合物,肌醇、丙三醇和山梨醇等醇类化合物,L-丙氨酸等氨基酸类化合物的菌株数量明显增多;东北山樱处理表土分离得到的优势细菌中,对各类供试糖类碳源均表现出较好的...
关键词：
东北山樱 土壤微生物 碳代谢 种群变化
[期刊] 中国农业科学
[作者]
戴宇樵 吕才有 何鲁南 易超 刘学艳 黄雯 陈加敏
【目的】基于代谢组学的超高相液相色谱/质谱(LC-MS)联用技术探究云南大叶种‘云抗10号’晒青茶加工过程中代谢产物的变化,发现影响晒青茶品质形成的标志性代谢物,并进一步研究这些物质的变化路径,为了解云南晒青茶品质形成机理奠定基础。【方法】在制作‘云抗10号’晒青茶过程中,取‘云抗10号’鲜叶、揉捻叶、晒青叶各3组。样品经预处理后,运用LC-MS检测3组样品中的代谢产物,利用质谱数据库对其定性。运用多元统计方法主成分分析(principal component analysis,PCA)和偏最小二乘判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)对3组样品检测数据进行分析。通过PLS-DA方法筛选差异显著的代谢物。【结果】建立了‘云抗10号’鲜叶、揉捻叶和晒青叶的代谢物谱的LC/MS分析方法,将代谢组数据进行主成分分析和偏最小二乘法判别分析,并将3组样品聚类区分。并用LC-MS技术对‘云抗10号’晒青茶及在制茶进行检测,结合多元统计分析,在鲜叶、揉捻叶、晒青叶之间发现差异代谢物701种,揉捻叶与鲜叶的差异显著代谢物116种,晒青叶与鲜叶的差异显著代谢物158种,晒青叶与揉捻叶的差异显著代谢物48种。比对KEGG与MWDB数据库分析代谢物,这些代谢物主要与氨基酸及其衍生物代谢、多酚物质代谢等代谢途径有关。【结论】利用LC-MS技术可以有效地对鲜叶组、揉捻叶组与晒青叶组进行区分,证明代谢组学技术在一定程度上可以揭示晒青毛茶在加工过程中内含代谢物的化学变化规律。研究发现的晒青毛茶品质形成关键代谢物,可为晒青品质的评价指标体系建立提供理论依据。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
齐晓雨 孔小平 周红伟 严湘萍
【目的】萜类代谢物是评价胡萝卜风味品质的主要指标，对胡萝卜口感风味品质的形成具有重要作用。通过比较甜味浓烈组（-3）和苦味浓烈组（3）两组不同品种胡萝卜成熟期肉质根风味成分的代谢谱，为胡萝卜风味特征成分鉴定及优异资源的开发利用提供参考。【方法】建立高效的、具有高灵敏度和高通量的代谢组学分析平台和方法：采用UPLC-MS/MS方法对胡萝卜萜类代谢物进行分析测定，鉴定影响胡萝卜风味品质的萜类代谢物。采用OPLS-DA结果的VIP值、log2FC值筛选差异性代谢物（设置阈值：VIP>1、fold change≥2和fold change≤0.5）。【结果】利用UPLC-MS/MS技术对胡萝卜成熟期肉质根进行广泛靶向代谢组学测定，共筛选出50种显著差异的萜类代谢物，12个上调，2个下调。其中，显著上调的分别是京尼平（0.754）、粳米素B(0.936)、氧叶烯A(1.03)、乙酸香芹酯（1.04）、3-(3'-羟基丁基)-2,4,4-三甲基环己烷-2,5-二烯酮（0.662）；显著下调的是脱氢地芰普内酯（0.617）。从含量来看，苦味胡萝卜中萜类代谢物含量综合较高的分别是甲黑素甲苷A(16.98)、莪术醇（17.57）、京尼平（15.32），甜味胡萝卜中萜类代谢物含量综合较高的分别是甲黑素甲苷A(17.61)、异香附醇（16.01）、莪术醇（18.73）。根据P值来看，排名前5的分别是薇甘菊内酯（0.994）、寥二醛（0.991）、甲基(E)-5,11-二羟-4-((Z)-2-甲基丁-2-烯酰氧基）-3,10-二亚甲基-2-氧代-2,3,3a,4,5,8,9,10,11,11a-十氢环癸并[b]呋喃-6-羧酸酯（0.978）、(3R)-3-羟基-紫罗兰酮（0.974）、布卢门醇A(0.969)。采用聚类分析方法对两组胡萝卜肉质根中的差异代谢物进行分析，其中，分组3中的代谢物含量要明显高于分组-3中的代谢物含量。利用KEGG进行差异代谢物注释和富集分析。【结论】萜类代谢物是影响胡萝卜风味的主要化合物，其中，京尼平、粳米素B、氧叶烯A、乙酸香芹酯、甲黑素甲苷A、莪术醇、异香附醇、脱氢地芰普内酯、薇甘菊内酯等萜类代谢物可能是影响胡萝卜风味的关键成分。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
余苹中 戴荣彩 贺敏 陈莉 贾春虹
为探明甲拌磷使用后在农田土壤中的残留降解行为,采用添加回收试验,借助气相色谱分析技术,建立了气相色谱同时测定土壤中甲拌磷及其代谢物甲拌磷砜含量的方法.结果表明,当土壤中分别添加甲拌磷和甲拌磷砜0.02、0.2和2.0mg/kg时,甲拌磷的平均回收率为91.5%～99.8%,变异系数为1.3%～4.8%;甲拌磷砜的平均回收率为91.0%～98.3%,变异系数为3.4%～5.6%.该方法最低检测限为0.02mg/kg,仪器最小检出限为0.02ng.
关键词：
甲拌磷 甲拌磷砜 土壤 检测 气相色谱
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李紫曦 牟美睿 杨仁杰 刘海学
【目的】探究产地环境对铁皮石斛生长及代谢物质的成分表征影响，筛选不同产地的铁皮石斛差异代谢物。【方法】采用气相色谱质谱联用技术(GC-MS)结合主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)等多元统计分析方法对不同产地铁皮石斛样品进行非靶向代谢组学分析。【结果】对不同产地石斛代谢物进行主成分分析可以将栽培品种与除湖南外的野生品种区分开，结合偏最小二乘判别分析与T检验(Student’s t-test)对湖南野生种与室内栽培种进行差异代谢物分析，并利用聚类热图分析(HCA)进行差异代谢物的验证，最终找到包括丙酸(Propionic acid)、苏氨酸(Threonine)等在内的20种极显著差异代谢物(P<0.01)。【结论】野生铁皮石斛与栽培品种间存在20种显著差异代谢物，主要为有机酸及多糖类代谢物，本研究可为指导铁皮石斛的植源性鉴定及真伪判断提供理论依据。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
曹东伟 蔡宇良 杨娟 赵桂仿
采用三因素五水平正交组合设计,探讨了野生中国樱桃的PCR-RFLP扩增条件及限制性内切酶酶切反应体系,并用PCR-RFLP技术对中国樱桃进行了分子亲缘地理学研究。结果表明,利用42种引物/酶组合,在13个中国樱桃居群中检测出多态位点比率为99.48%;在所有酶切片段中,发现了5种cpDNA单倍型(H1、H2、H3、H4、H5);根据单倍型的地理分布格局,将所研究的中国樱桃居群划分为4个地理单元,地理单元间的基因分化系数(GST)值为0.397,cpDNA基因流(Nm)为0.758;中国樱桃cpDNA总的遗传多样性(Ht)为0.166,地理单元内的cpD-NA遗传多样性(Hs)为0.005。分析...
[期刊] 水产学报
[作者]
黄春红 肖调义 胡毅 赵玉蓉 刘巧林
为了探讨草鱼肝胰脏脂质过量蓄积的生化基础并促进草鱼的健康养殖,采用1H-NM R分析技术对肝脂含量分别为3%~4%和14%~16%的两组草鱼的肝胰脏和血清进行了代谢组学分析。结果表明,从草鱼肝胰脏和血清中分别检测到了58和47种代谢物。葡萄糖、别嘌呤二醇、牛磺酸、乳酸、谷氨酸、肌酸、丙氨酸、sn-甘油-3-磷酸胆碱、甘氨酸、石碳酸、次黄嘌呤、乙酸、赖氨酸、亮氨酸和缬氨酸为两组草鱼肝胰脏主要差异代谢物;其中,肝脂含量为14%~16%的草鱼肝胰脏中葡萄糖和别嘌呤二醇的含量明显高于肝脂含量为3%~4%的草鱼组,但乳酸和多种氨基酸含量则低于肝脂含量为3%~4%的草鱼组。乳酸、葡萄糖、肌酸、柠檬酸、亮氨...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
郭芮 殷超群 汪昱乔 杨梅 张政 褚文翔 王琴 胡惠蓉
为揭示高温引起草原龙胆莲座化的代谢机制,采用气相色谱-质谱法(GC-MS)结合代谢组学分析技术,研究常温和高温处理下草原龙胆成熟叶片和茎尖的代谢差异。共鉴定出30种代谢产物,偏最小二乘法判别分析显示不同温度下和不同组织中的代谢物均得到很好的分离。方差分析表明,与常温处理相比,高温下草原龙胆茎尖中的糖类含量降低,有机酸含量升高,而成熟叶片内的变化趋势刚好相反。推测草原龙胆在高温胁迫下茎尖的糖类含量下降可能导致其发生莲座化,从而无法正常抽薹开花;而成熟叶片中增加的可溶性糖有利于提高植株的渗透保护能力,从而抵抗
关键词：
草原龙胆 代谢组学 高温 莲座化 抗逆
[期刊] 草业科学
[作者]
宋淑珍 刘立山 周瑞
本试验旨在研究饲喂牛至精油对绵羊粪便代谢物的影响。选择体重接近[（20.00±1.27）kg]的萨福克与小尾寒羊杂交公羔12只，随机分为2组，每组6只羊。分别为对照组、牛至精油组。对照组饲喂基础饲粮，牛至精油组饲喂基础饲粮+7 g·d~(-1)·只~(-1)牛至精油。预试期10 d，正式期72 d。试验期结束后，采集直肠粪便进行液相色谱-串联质谱法（liquid chromatography-tandem mass spectrometry，LC-MS/MS）非靶向代谢组学技术筛选差异代谢物。结果表明：1）两组试验羊的粪便中正、负离子模式共筛选出甲基-2，3-O-二烯丙基-4，6-O-亚苄基-alpha-D-吡喃甘露糖苷、二十二碳-4，7，10，13，16-五烯酸酯、甲基胍、腺嘌呤、18：1碳链溶血磷脂酰乙醇胺、N-乙酰-D-神经氨酸、环己烷羧酸、4-甲氧基苯乙酸、DL-多巴、胸腺嘧啶、去甲氧基姜黄素、5’-甲基硫代腺苷、间羟基苯甲酸等15种差异代谢物（∣LogFC∣>1，P<0.01，VIP>1），且与对照组相比，牛至精油组的差异代谢物全部上调。2）差异代谢物KEGG通路富集到萜类和类固醇的合成，微生物代谢，苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的合成，半胱氨酸和蛋氨酸代谢、芳香族化合物的降解等6条通路（Impact>0.1），分别归属于脂质代谢，消化道微生物代谢和氨基酸代谢。这表明，牛至精油可能参与育肥羊脂质代谢、有机物代谢和氨基酸代谢，通过调节代谢途径发挥其在羊养殖中的健康维护作用。
关键词：
牛至精油 羊 微生物代谢 氨基酸代谢
[期刊] 华北农学报
[作者]
甄军波 宋世佳 刘琳琳 刘迪 欧阳艳飞 迟吉娜
为深入研究金花葵花朵开花前后基因和代谢物的变化，利用转录组学和代谢组学技术相结合的方法对金花葵花蕾和花朵进行检测。结果显示，通过转录组分析鉴定了206 636个Unigenes,筛选出42 618个差异表达Unigenes,其中包括63个差异表达转录因子家族，24个转录调节因子家族。GO分析结果显示，差异表达基因主要富集于囊泡介导的逆行运输等生物学过程。KOG功能注释显示，差异表达基因功能以通用功能预测居多，其次是信号转导机制、翻译后修饰蛋白周转以及碳水化合物的转运和代谢。差异表达基因KEGG富集分析表明，差异基因主要富集于代谢、植物激素和信号转导、淀粉和蔗糖代谢等代谢通路。通过代谢组学检测，筛选到差异显著代谢物135个，主要包括脂类、氨基酸及衍生物和黄酮类等，KEGG富集分析表明，差异代谢物主要富集于甘油磷脂代谢、糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚定生物合成和次生代谢产物的生物合成-未分类等过程，其中，缬氨酸，亮氨酸和异亮氨酸的降解代谢通路同时出现在了基因和代谢物KEGG代谢通路富集Top 20中。
关键词：
金花葵 开花 基因 代谢物
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
周涛 付力立 罗正中 马莉 杜振隆 姚学萍 沈留红 余树民 严作廷 曹随忠
【目的】基于非靶向代谢组学技术,对荷斯坦奶牛初乳和常乳中的代谢物进行鉴定与分析。【方法】选择年龄、体况及预产期相近、胎次相同的健康围产期经产荷斯坦奶牛12头,分别于分娩后1 h和21 d采集乳汁,离心并收集乳清,依次记为初乳组(C＿0)和常乳组(C＿21)。采用代谢组学技术对初乳组和常乳组乳清进行分析,结合正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)和学生t检验,以变量投影重要度(variable importance in the projection,VIP)>1,P<0.05为标准筛选差异代谢物,并对筛选出的差异代谢物进行聚类分析、显著差异代谢物筛选和KEGG通路分析。【结果】在荷斯坦奶牛初乳组(C＿0)和常乳组(C＿21)共筛选到97种差异代谢物,通过聚类热图可以看出,大多数代谢物在初乳组的含量高于常乳组;差异代谢物随机森林图显示,排名靠前的9种显著差异代谢物分别为乌头酸、柠康酸、龙胆酸、泛酸、牛磺酸、氧戊二酸、柠檬酸、6’唾液酸乳糖和精胺。KEGG通路富集分析显示,8条主要的代谢通路分别为酮体的合成与降解、牛磺酸与次黄嘌呤代谢、丙酮酸代谢、嘌呤代谢、嘧啶代谢、氨基糖与核苷酸糖代谢、三羧酸循环和丁酸代谢。【结论】荷斯坦奶牛初乳中脂质、氨基酸和核苷酸代谢物的含量高于常乳,而常乳中糖类代谢物含量高于初乳,初乳与常乳中代谢物水平的差异为后续代谢物机制的研究奠定了理论基础。
关键词：
奶牛 代谢组学 牛初乳 牛常乳 代谢物
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
陶霞娟 赵艳玲 陈雪梅 王天华 蒋湘宁
该文建立了烟草木质素生物合成途径几个中间代谢物咖啡酸(CA)、4香豆酸(PA)和阿魏酸(FA)的RPHPLC分析方法.用ODSC18色谱柱分离、紫外波长扫描检测器检测,并确定320nm为最佳检测波长;V(甲醇)∶V(水)(含1.5%乙酸)为20∶80,是最理想的流动相.该方法对CA、PA和FA的回收率分别为95.59%、93.67%、97.32%,相关系数(R2)分别为0.9946、0.9946、0.9945,满足定量分析要求.经测定,发现转基因烟草CA、PA和FA含量分别为未转化烟草的2.6～3.0、3.4～4.1和7.1～8.2倍.
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