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[期刊] 水产学报
[作者]
刘杨 栾生 刘绵宇 李旭鹏 孟宪红 罗坤 隋娟 谭建 代平 曹家旺 陈宝龙 孔杰
为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响，本实验对26个全同胞家系进行Vp AHPND侵染，收集686尾个体的存活时间数据，对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号”(55.0 K SNP)进行基因分型，基于A、G和H亲缘关系矩阵估计Vp AHPND侵染后存活时间的遗传参数；采用随机和等距抽取方式，基于55.0K SNP构建了8个低密度SNP面板(40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.1 K)，利用GBLUP和ssGBLUP等方法预测Vp AHPND侵染后存活时间的基因组育种值，利用交叉验证方法计算其预测准确性，并与BLUP方法进行对比分析。遗传参数估计结果显示，Vp AHPND侵染后存活时间表现为高遗传力水平，估计值为0.68～0.79。在55.0 K SNP密度下，针对242尾基因分型个体数据集(G242)，利用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.424、0.450和0.452,GBLUP和ssGBLUP比BLUP分别提升了6.13%和6.60%；针对686尾表型测定个体数据集(P686)，利用BLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.510和0.535，后者比前者提升了4.90%。对于8个低密度SNP面板，当SNP密度≥10.0 K时，基因组预测准确性变化幅度在G242和P686数据集中均较小(1.1%～1.8%)；随着SNP密度自10.0 K不断降低，基因组预测准确性在2个数据集中也不断降低，其中5.0 K密度降幅为0.6%～2.6%、1.0 K密度降幅为5.8%～11.0%、0.5 K密度降幅为11.4%～17.2%、0.1 K密度降幅为38.8%～41.6%。10.0 K与55.0 K SNP密度间基因组亲缘系数、GEBV的相关系数均高于0.99，表明利用10.0 K SNP面板可以准确地预测同胞个体间的亲缘关系及其GEBV。研究表明，使用10.0 K SNP面板对Vp AHPND侵染后存活时间进行基因组遗传评估可以得到与55.0 K SNP芯片近似的预测准确性，为低密度SNP分型芯片设计提供了参考。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
林雨浓 王泽昭 陈燕 朱波 高雪 张路培 高会江 徐凌洋 蔡文涛 李英豪 李俊雅 高树新
【目的】尝试通过在华西牛参考群高密度标记芯片位点中，使用两种标记筛选方法挑选具有代表性的且密度梯度不同的SNP位点集合，后利用基因组填充策略在相同填充参数下将低密度芯片数据填充至高密度继而进行后续基因组研究，从而达到降低华西牛基因型分型成本的目的。研究分别比较了不同标记集合填充准确性和填充一致性的差异，阐述了标记筛选方法、标记密度、最小等位基因频率和参考群体数量等4个因素对填充结果的影响，为华西牛低密度SNP填充芯片设计提供参考。【方法】将质控后剩余的1 233头华西牛群体随机分为参考群（986头）和验证群（247头）。使用等间距法（equidistance,EQ）和高MAF法（high MAF,HM）两种标记筛选方法分别从华西牛参考群体的Illumina Bovine HD芯片位点集合中筛选出16种不同密度的SNP集合，共生成32种不同SNP梯度密度集合。随后在验证群体中利用Beagle(v5.1)软件将各低密度集合填充至770 k密度水平，计算填充准确性和填充一致性并对填充性能影响因素进行分析。【结果】32种低密度SNP集合的标记数量在100—16 000之间，窗口最大为24 176 kb，最小151 kb。随着标记密度升高，EQ和HM两种筛选方法填充一致性和准确性不断提升，但填充准确性和填充一致性增加的幅度越来越小。当标记集合密度超过12 k后均趋于平稳。SNP密度在16 k时两种方法的填充准确性达到最高（r~2_(EQ)=0.8801,r~2_(MAF)=0.8696）。当标记密度低于11 k时，不同标记密度梯度下HM方法填充一致性均高于EQ方法。然而当SNP集合密度超过11 k时，EQ筛选方法较表现出填充优势。与填充一致性结果趋势相似，在SNP集合密度低于10 k时，HM方法仍然具有较高的填充准确性，但当SNP集合密度高于10 k时，EQ方法的填充准确性则较高，且在SNP密度集合大于12 k后，EQ填充准确性趋于稳定。同时研究发现与低MAF标记位点相比，高MAF位点的填充准确性更高。填充过程中发现，填充一致性和填充准确性随着参考群体增大而提高。当参考群体数量在600—800时，位点填充准确性和一致性较高。【结论】在华西牛群体中，填充一致性和填充准确性随标记密度递增而上升，在标记密度为10 k—12 k区间，可获得较好的填充效果。当标记密度小于10 k时优先选择HM方法，更高密度时EQ方法较好。高MAF标记位点填充准确性更高。采用填充策略进行低密度标记填充时，参考群体数量在400头以上时填充效果较为理想。
[期刊] 水产学报
[作者]
王佳佳 王琼 秦桢 陈耀辉 李健 李吉涛
基于SSR标记研究凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体遗传结构，为凡纳滨对虾种质资源的遗传改良提供基础信息。本研究利用MISA软件对凡纳滨对虾全基因组SSR位点进行搜索，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得多态性高的SSR标记，基于POPGENE 1.32、PIC-CALC和Mega 6.0软件分析6个不同来源的凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体结构特征。在凡纳滨对虾全基因组数据中共鉴定出10 453 975个微卫星，约占基因组序列总长度的18.56%，其中，二碱基微卫星最丰富，占总数的82.15%。利用具有多态性的14个SSR标记分析3个国内群体桂海1号（CG）、海兴农2号（CH）和山东养殖群体（CT），及3个国外群体厄瓜多尔1号（FO）、厄瓜多尔2号（FT）和墨西哥群体（FM）的遗传特征，结果表明，14个SSR标记在6个群体中共检测到208个等位基因变异，等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量的范围分别为6～25、0.112～0.994、0.234～0.925和0.226～0.918；遗传多样性丰富程度从高到低分别为CH > FO > FM > CT > FT > CG。桂海1号与山东养殖群体、3个国外群体间属于中等程度的遗传分化；聚类分析显示，国内群体桂海1号和海兴农2号聚为一大类，山东养殖群体与国外群体厄瓜多尔1号、厄瓜多尔2号和墨西哥群体聚为一大类。本研究结果表明，筛选的14个SSR标记可用于凡纳滨对虾群体遗传多样性的评估；3个国外群体的遗传多样性相对较高，且与国内群体桂海1号和海兴农2号的亲缘关系较远。本研究对凡纳滨对虾种质资源的开发利用与新品种选育具有十分重要的意义。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
朱墨 郑麦青 崔焕先 赵桂苹 刘杨
【目的】育种值估计是畜禽育种的核心内容,准确的育种值估计是提高选种准确性的重要手段。屠宰性状是肉鸡重要的经济性状,且无法活体测量,利用基因组信息进行育种值估计的基因组选择是十分有力的工具。文章通过比较GBLUP和BayesB方法对肉鸡屠宰性状的基因组预测的准确性,为肉鸡育种值估计的策略提供依据。【方法】用本课题组前期收集的3 362只白羽肉鸡的表型记录,性状包括胸肌率(BrR)、胸肌重(BrW)、屠体重(CW)、腿肌率(ThR)和腿肌重(ThW)。利用中国农业科学院自主研发的"京芯一号"鸡55 K SNP芯片对所有个体进行了基因分型,采用PLINK软件对芯片的基因型数据进行质量控制,基因组选择的GBLUP和BayesB方法分别由基于R语言的ASReml包和hibayes包实施,并采用世代验证法评估两种方法的基因组育种值的预测准确性。【结果】研究发现基因组选择的准确性与性状的遗传力大致呈正相关。结果显示,在使用GBLUP方法时,预测准确性最高的性状为胸肌率。胸肌率、胸肌重、屠体重、腿肌率和腿肌重的基因组预测的准确性分别为0.3262、0.2871、0.2780、0.2153、0.2126;在使用BayesB方法时,预测准确性最高的性状为胸肌率。5个性状的基因组预测的准确性分别为0.3765、0.2257、0.1376、0.2525、0.2844。结果表明,对于白羽肉鸡屠宰性状的基因组选择研究,BayesB方法的预测准确性略高于GBLUP方法。对于3000的样本量和55 K的标记密度,GBLUP方法的计算时间大约为1h,BayesB方法的计算时间大约为7h。【结论】对于胸肌率、腿肌率和腿肌重,BayesB方法的预测准确性高于GBLUP方法;对于屠体重和胸肌重,GBLUP方法的预测准确性高于BayesB。畜禽的育种工作注重实效性。在实际的育种工作中,需要综合考虑育种值估计的准确性和育种的时效性来决定用何种方式估计基因组育种值。
关键词：
鸡 基因组选择 世代验证 准确性
[期刊] 水产学报
[作者]
洪斌 牛犇 陈萍 李薇 刘海泉 潘迎捷 赵勇
探究凡纳滨对虾和罗氏沼虾肠道微生物及抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes, ARGs)种类的差异。通过高通量测序和变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE)技术分析2种虾肠道微生物群落结构差异和微生物多样性,并运用PCR方法检测了2种虾肠道细菌常见38种ARGs的携带情况。结果显示,获得凡纳滨对虾和罗氏沼虾肠道细菌有效序列分别为42 795和40 713条,物种注释单元(operational taxonomic unit, OTU)数目分别为124和82,分类地位明确的细菌种类分别隶属5个门、17个属和5个门、16个属。凡纳滨对虾肠道细菌的优势类群为变形菌门,所占比例为75.45%,优势菌属为副球菌属(25.83%)和不动杆菌属(25.24%);罗氏沼虾肠道细菌的优势类群是厚壁菌门(49.74%),优势菌属为乳球菌属(49.01%)和弧菌属(29.98%)。凡纳滨对虾肠道细菌(2.19)Shannon指数高于罗氏沼虾肠道细菌(1.78),表明前者肠道细菌多样性大于后者。DGGE图谱的分析结果与高通量测序一致,2种虾肠道细菌种类差异很大。PCR结果显示,凡纳滨对虾肠道细菌携带15种ARGs,罗氏沼虾肠道细菌携带14种ARGs。本实验表明凡纳滨对虾肠道细菌的群落种类多样性、OTU丰富度、物种总数和ARGs种类均高于罗氏沼虾肠道细菌,为后续肠道微生物资源的挖掘提供了理论依据。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
贾丹 史成银 黄倢 张庆利 万晓媛 许华 刘冉阳 王海波 郭程程 谢国驷
本研究从患急性肝胰腺坏死病(Acute hepatopancreatic necrosis disease,AHPND)的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肝胰腺中分离到一株优势菌,编号为20160303005-1,通过16S rRNA和分子伴侣蛋白groEL基因序列分析,并结合生理生化特征,将该细菌鉴定为副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus),其血清型为O1:KUT(K untypeable)。基因分析结果显示,该菌株携带可引起对虾AHPND的相关毒力蛋白基因pirA~(VP)和pirB~(VP),但不携带副溶血弧菌临床菌株毒力基因:耐热直接溶血毒素(Thenmostable direct hemolysin,tdh)和相对耐热直接溶血毒素(TDH-related hemolysin,trh)基因。菌株对凡纳滨对虾具有较强的致病性,浸泡感染的半数致死剂量(LD_(50))为7.96×10~3 CFU/ml。对虾急性感染后,6 h肝胰腺颜色变浅,肠胃变空;9 h肝胰腺呈浅白色,萎缩变小。9 h死亡数过半,24 h全部死亡。组织病理学分析显示,感染后对虾肝胰腺小管崩塌,上皮细胞严重脱落,呈现出典型的AHPND病理症状。药敏实验结果显示,该菌对庆大霉素、环丙沙星和头孢他啶等16种药物敏感,对阿莫西林、替卡西林和头孢噻吩等5种药物表现为耐药。上述研究可为该病原的流行病学及药物防控研究提供基本数据。
[期刊] 现代财经(天津财经大学学报)
[作者]
翟淑萍 袁克丽
女性高管在我国上市公司管理层所占比例逐年上升,越来越多的公司拥有女性高管。本文以2010—2016年深市A股上市公司为研究样本,考察上市公司女性高管对分析师预测准确性的影响。研究发现上市公司女性高管的存在显著提高了分析师盈余预测准确性,且上市公司女性高管比例越高,其分析师预测准确性越高。进一步通过中介效应检验对女性高管影响分析师预测准确性的内在机理进行研究发现,女性高管通过提高信息披露质量和降低盈余波动这两个路径来提高分析师预测准确性。本文拓展了女性高管治理的经济后果与分析师预测准确性影响因素的研究,同时也为上市公司高管团队的选拔以及资本市场中分析师预测准确性的提高提供了经验证据。
[期刊] 财经科学
[作者]
何熙琼 杨昌安
基于外部利益相关者角度,以中国A股公司2007—2018年数据为样本,实证检验公司多元化经营对分析师盈余预测的影响效应及作用路径。结果显示:行业多元化经营越高,分析师盈余预测误差和分歧度越小;行业非相关性越高、国际化程度越高,多元化经营对分析师盈余预测的影响越大。进一步检验发现,多元化投资组合的风险分散效应可以降低公司盈余波动性和现金流预测误差,降低分析师预测复杂度和提高分析师预测准确性。本研究拓展了多元化经营的研究视角和作用机制,丰富了多元化战略及类型对分析师的影响研究,为多元化战略实施和分析师预测行为提供更多理论依据。
关键词：
多元化经营 分析师预测 投资组合
[期刊] 外国经济与管理
[作者]
谢光华 郝颖 李思乐
本文选取2008—2015年A股上市公司为研究样本,以企业信息披露的专有性成本为研究视角,实证检验了不同行业集中度下,分析师行业专长对盈余预测准确性的影响及其潜在机制。研究发现:首先,分析师行业专长有助于提高其盈余预测的准确性。其次,行业集中度越高,行业专长对于提升分析师盈余预测准确性的促进作用越显著。第三,基于被分析公司异质性的进一步研究发现,行业集中度与行业专长对分析师盈余预测准确性的互补作用主要集中在信息披露水平较低、专有性成本较高和产品市场掠夺风险较高的企业中。本文的研究结论对于理解市场集中度高的行业中分析师行业专长的重要性具有意义,也拓宽了我们关于分析师预测准确性影响因素的认识。
[期刊] 世界经济研究
[作者]
张汉林 魏磊
本文首先考察1999～2007年期间IMF对世界经济和中国经济的预测数据,结果发现,IMF对世界经济的预测存在偏低倾向,对中国经济预测的悲观倾向更明显。其次,本文考察了世界银行的预测数据,结果发现,世界银行对世界经济的预测也存在偏低倾向,对中国经济的预测过于悲观。最后,本文比较了IMF和世界银行的预测,结果发现,二者在对世界经济的预测准确性上差别不大,IMF稍微优于世界银行的预测;二者对中国经济的预测均存在严重偏低倾向,世界银行对中国经济预测的悲观倾向更大。
关键词：
IMF 世界银行 世界经济预测
[期刊] 经济研究参考
[作者]
赵海利 吴明明
收入预测是对未来财政收入总量及其结构的推测,是财政部门编制预算的基础。准确的收入预测是形成一个优质预算的必要条件。我国财政收入预测的准确性(特别是税收收入预测的准确性)偏低、常年被低估的特征与发达国家的财政收入预测形成了较大的反差,除了在专业预测队伍、预测基础数据库建设方面需要加强外,还需要在制度上保证预测的独立性与竞争性,强化超收资金的管理,以进一步提高财政收入预测的质量。
关键词：
财政收入 收入预测 准确性 偏差率
[期刊] 国际商务(对外经济贸易大学学报)
[作者]
黄晓蓓
考察了上市公司业绩预告对分析师预测修正的影响，研究发现，业绩预告的准确性与精确性越高、及时性越强，分析师进行预测修正的概率越大；进一步通过公司层面与分析师层面的配对研究发现，业绩预告后分析师预测误差得到了显著降低，表明我国分析师在进行预测修正时，会使用业绩预告提供的信息来降低预测误差。本文的研究为进一步理解我国管理层与分析师的信息互动机制提供了经验证据。
关键词：
分析师预测 业绩预告 预测修正
[期刊] 会计之友
[作者]
胡运芝 程永波
业绩承诺是一种盈利预测补偿制度,现已成为上市公司并购重组中不可缺少的环节。文章选取宏达新材并购永乐影视为案例对象,通过构建灰色关联分析模型,对目标公司永乐影视2016—2018年的收益进行预测,并进行残差、关联度、后验差等检验,验证模型的预测精度,分析永乐影视业绩承诺的准确性。研究结果表明,永乐影视历年的业绩承诺额明显高于灰色关联预测值,从客观预测角度来看,永乐影视的业绩承诺存在不确定性风险。
关键词：
企业并购 业绩承诺 业绩预测 对赌协议
[期刊] 武汉金融
[作者]
刘贝贝 赵微微 方一卓
本文使用2006―2020年中国A股上市公司数据，研究QFII持股对分析师预测行为的影响和传导机制。研究发现：（1）QFII持股能够显著提高分析师预测当年、未来一年和未来两年的准确性，在使用工具变量法缓解内生性并进行一系列稳健性检验后，以上结论仍成立。（2）机制检验发现，QFII持股通过吸引更多的分析师跟踪、提高股票流动性、改善信息披露质量来提高分析师预测当年的准确性，并且可以通过改善信息披露质量来提高分析师预测未来一年和未来两年的准确性。本文结论表明，QFII持股可以为投资者的投资选择提供指引，对提高信息披露质量、促进资本市场平稳发展具有重要的理论与现实意义。
[期刊] 中国注册会计师
[作者]
周冬华 黄迎
本文以2007—2011年间证券分析师发布的现金流预测数据为研究样本,系统考察了证券分析师预测经验和历史预测准确性对现金流预测准确性的影响。研究发现,分析师公司层面经验与现金流预测准确性显著正相关,这表明分析师跟踪特定上市公司年限越长,分析师能够掌握更多的私有信息,对获取该特定公司的私有信息更能有效处理,作出准确判断的可能性越高。上年度现金流预测准确性与当期现金流预测准确性显著正相关,这说明分析师在进行现金流预测时会理性地根据自己的预测准确性记录来更新其现金流预测。
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