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[期刊] 中国农业科学
[作者]
陈从英 郭源梅 杨斌 任军 黄路生
【目的】通过全基因组扫描,鉴别影响猪四肢骨骨骼长度,股骨和肱骨的骨髓腔长度、骨髓腔直径以及股骨骨壁厚度的数量性状位点(QTL)。【方法】在白色杜洛克×二花脸资源群体中测定132头240日龄阉割公猪29类四肢骨骨骼的长度、6类四肢骨骨骼直径以及股骨和肱骨骨壁厚度、骨髓腔长度和骨髓腔直径等表型性状。选择多态信息含量丰富并覆盖猪全基因组19条染色体的183个微卫星标记,采用最小二乘区间定位法进行猪全基因组扫描,定位猪四肢骨骼各性状QTL。【结果】在39个表型性状中定位到14个基因组1%显著水平QTL,14个基因组5%显著水平QTL和47个染色体5%显著水平QTL。除SSC11没有检测到QTL外,其它...
关键词：
四肢骨骼 全基因组扫描 QTL定位 猪
[期刊] 中国农业科学
[作者]
兰旅涛 郭源梅 陈从英 杨斌 毛辉荣 任军 周利华
【目的】通过测量猪体长、体高、管围、胸围、胸宽、胸深、腹围和腿臀围等8个体尺性状,应用全基因组扫描定位影响猪体尺性状的数量性状位点(QTL)。【方法】在210日龄,活体测量白色杜洛克×二花脸资源群体129头F2个体的上述8个体尺性状,利用分布于猪18条常染色体和X染色体上的183个微卫星标记,对这129头F2个体及其父母和祖代亲本进行基因型检测。应用基于最小二乘线性回归分析的复合区间作图法在QTL Express进行在线QTL定位分析,并通过1000次的Permutation来确定不同显著水平的临界值。【结果】在8条染色体上共检测到19个影响猪体尺性状的QTL,其中位于4和7号染色体上的5个Q...
关键词：
猪 体尺 QTL定位
[期刊] 中国农业科学
[作者]
周利华 郭源梅 段艳宇 张志燕 杨凯旋 麻骏武
【目的】通过全基因组扫描,鉴别影响猪肉滴水损失数量性状位点(QTL)。【方法】采用EZ-滴水损失测定法和袋测定法,测定了白色杜洛克×二花脸资源群体884头F2代个体的背最长肌和半膜肌在采样后24和48 h的滴水损失。利用SAS软件分析了6个滴水损失性状间的相关性,以及滴水损失与其它肉质性状的相关性。检测了3个世代个体在19条染色体上194个微卫星的基因型。据此,应用QTL Express在线进行了影响滴水损失QTL的定位分析。【结果】滴水损失在两种肌肉间或两种测定方法间有较高的相关性(r=0.50—0.58,P<0.01)。滴水...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
陈从英 朱万成 李平华 魏娜 郭源梅 高军
【目的】研究PRL、PRLR基因在白色杜洛克×二花脸F2资源群体中的遗传变异及其与母猪杀婴行为和产仔数的关联性。【方法】PRL基因的g.1317T>A、g.8905C>T、g.9056C>T位点,PRLR基因的g.1217C>T、g.1283C>A、g.1439G>A、g.1528G>A和g.1600T>A位点采用SNaPshot法对资源群体所有F0、F1和288头F2母猪进行基因型判定,分别利用传递不平衡检测(TDT)和最小二乘法分析这些位点与母猪杀婴行为和产仔性状的关联性。【结果】TDT分析发现,PRL和PRLR基因所有检测SNP位点,无论基因型还是单倍型均与母猪杀婴行为无显著相关。与母猪...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
宿英 阮国荣 龙毅 杨斌 张志燕 邓玮芸 吴丽花 吕显山 艾华水 肖石军 任军 黄路生 丁能水
【目的】通过基于单倍型的病例-对照全基因组关联分析(GWAS)鉴别白色杜洛克×二花脸F2资源家系中影响猪阴囊疝的易感位点及位置功能候选基因,并在远缘纯种猪阴囊疝三联体核心家系(Trio)群体中进行重复验证。【方法】利用Illumina porcine 60K SNP芯片对1 020头白色杜洛克×二花脸F2资源家系阴囊疝群体(包含19个阴囊疝患病个体)进行扫描获取基因型。通过Plink v1.07软件对基因型数据进行质量控制;剔除个体基因型检出率<90%的个体,剔除SNP位点检出率<90%、哈迪温伯格平衡卡方检验P≤10-3和最小等位基因频率<0.05及性染色体上和无法定位的SNP位点。质控合格...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
吴延博 陈从英 张志燕 郭源梅 高军
【目的】猪精子黏合分子1(SPAM1)基因在精卵结合过程中发挥重要作用,是影响产仔数的重要候选基因。本试验分析SPAM1基因的遗传变异及其与母猪产仔数的相关性。【方法】以305头白色杜洛克×二花脸资源群体F2母猪为材料,记录连续3胎的产仔性状,利用PCR-RFLP检测intron1 g298C>T、intron1 g357C>T和intron3 g380C>T共3个SNP位点在F2群体中的多态性,构建单倍型,分析各SNP基因型和单倍型与母猪产仔数、产活仔数、产死胎数的相关性。【结果】intron1 g298C>T位点CC型母猪的总产仔数显著低于CT、TT型母猪(P<0.05),CT基因型母猪产...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
王海燕 贺佳玮 向安静 章程 朱猛进 赵书红 刘向东
为研究聚肌胞苷酸（ｐｏｌｙｉｎｏｓｉｎｉｃ：ｐｏｌｙｃｙｔｉｄｙｌｉｃ ａｃｉｄ，简称ｐｏｌｙ ｉ：ｃ）刺激对杜洛克×二花脸Ｆ２猪群血液参数的影响，选用杜洛克×二花脸Ｆ２猪３９３头，在３３ｄ时前腔静脉采血（对照组），在３５ｄ时用ｐｏｌｙ（ｉ：ｃ）刺激，４ｈ后采血（处理组），对刺激前后血液参数进行相关性和主成分等分析。研究结果表明，处理组与对照组相比，白细胞中的嗜中性粒细胞百分比（ｎＥ％）、淋巴细胞数（ｌｙ）和淋巴细胞百分比（ｌｙ％）这３项血液参数差异显著相关，红细胞中的红细胞压积（ｈｃｔ％）和红细胞数（ＲＢｃ）差异相关性显著，而血小板第一主成分中决定性指标血小板数（ｐｌｔ）和血小板压积（ｐｃｔ．．．
[期刊] 中国农业科学
[作者]
郭源梅 张勤 任军 周利华
【目的】研究猪F2代资源家系的群体结构对数量性状座位(quantitative trait loci,QTL)定位的影响,为QTL定位群体的构建提供参考。【方法】通过模拟的方法,模拟了18种不同的群体结构,研究F0代(亲本)、F1代和F2代群体大小、F0代和F1代公母比例以及祖代QTL基因频率等6种因素对QTL定位的影响。【结果】随着F2代群体的增大,QTL检测的效率明显提高,加性效应的估计值逐渐偏低,95%置信区间显著减小。造成加性效应降低的主要原因是QTL在两亲本群体中没有纯合。随着F0代母畜比例的增加,QTL 95%置信区间也明显降低;随着祖代QTL基因频率差异的增加,QTL检测的效率和...
关键词：
猪 资源家系 群体结构 QTL定位 模拟
[期刊] 水产学报
[作者]
崔国强 陈阿琴 吕为群
通过软骨-硬骨双染色的方法对日本鬼鲉从初孵仔鱼到35日龄的发育过程中脊柱和附肢骨骼的发育进行系统观察。结果显示,脊柱的发育以10日龄髓弓的出现和11日龄脉弓的发育为起点;其中,椎体、髓棘、脉棘在20日龄形成,至35日龄基本完成骨化并伴随着躯椎的弯曲,并且发育和骨化顺序均为从前向后。附肢骨骼的发育顺序依次为胸鳍、尾鳍、臀鳍、背鳍和腹鳍。胸鳍的发育以3日龄胸鳍的匙骨、支鳍骨原基的出现为起点,11日龄软骨质的胸鳍支鳍骨形成,35日龄胸鳍下端支鳍骨游离。腰带和腹鳍出现较晚,在18日龄开始发育,但发育较快。背鳍和臀鳍出现在20日龄,23日龄时出现完整背鳍和臀鳍形态,并伴随着鳍棘的发生;背鳍从身体中部出现...
关键词：
日本鬼鲉 脊柱 附肢骨骼 早期发育
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
陈渊戈 夏冬 钟俊生 赵盛龙 张宇
使用硬骨-软骨双染色技术,描述了刀鲚(Coilia nasus)仔稚鱼(体长范围为7.0～33.9 mm)脊柱及附肢骨骼的形态发育特征。骨骼形成的顺序依次为肩带,背鳍支鳍骨、臀鳍支鳍骨,脉弓,髓弓,尾下骨,椎体,腹鳍支鳍骨、尾上骨,背鳍前支鳍骨,肋骨。胸鳍支鳍骨无后匙骨,左右乌喙软骨在腹面联合。侧尾下骨和第1尾下骨基部产生短暂的软骨质连接(20.1 mm SL)。第1、2尾上骨联合形成棒状尾上骨1+2。第1髓弓与脑颅之间区域具1游离髓弓。脊柱以体前中部位置为起点向前后发育。髓弓、脉弓的发育方式与鲱形目其他鱼类不同。脉弓首先以体中部为中心向前后发育;髓弓随后亦以从体中部向前后发育,12.4 mm...
关键词：
刀鲚 脊柱 附肢骨胳 骨骼发育中
[期刊] 西南农业学报
[作者]
郝小静 韩丽娟 王彦平 赵雪艳 王继英
【目的】分析椎骨发育相关（Vertebrae development associated，VRTN）基因的1段291 bp短散在重复序列(Short interspersed repeated sequence， SINE)插入突变对杜洛克猪肋骨数、胴体和肉质性状的影响，为实施分子标记辅助育种，提高杜洛克的肋骨数奠定基础。【方法】屠宰48头杜洛克猪，按照标准方法测定肋骨数、胴体和肉质性状，利用PCR检测VRTN基因的基因型，分析SINE插入突变3种基因型与肋骨数、胴体和肉质性状的关联。【结果】杜洛克猪中VRTN基因ins位点存在插入型（ins/ins）、杂合性（ins/-）和缺失型（-/-）3种基因型，ins/ins基因型频率最高（0.5217），其次是ins/-基因型（0.3696），-/-基因型频率最低（0.1087）。-/-基因型的杜洛克猪肋骨数为14，ins/-基因型的杜洛克猪肋骨数为15，大多数ins/ins基因型的杜洛克猪肋骨为16根，少数杜洛克猪为15根，平均为15.82根。ins/ins基因型的杜洛克猪比-/-基因型的杜洛克猪的肋骨提高1.82根，差异极显著（P
关键词：
猪 肋骨数 VRTN 分子标记辅助选择
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘晨龙 杨慧 张慧 张志燕 段艳宇
【目的】利用全基因组关联分析定位影响杜长大猪（ＤＬＹ）、二花脸猪（ＥＨＬ）和莱芜猪（ＬＷ）３个群体２５种血液性状的染色体位点，为最后鉴定影响这些性状的因果基因提供前期基础，同时为猪抗病育种和生产提供参考。【方法】将６１０头杜长大三元杂猪在（１８０±５）日龄，３３６头二花脸猪和３３３头莱芜猪在（３００±５）日龄进行统一屠宰。收集２ ｍ Ｌ血液于抗凝管中，利用全自动生化分析仪进行２５种血液性状的血常规检测。采集猪耳组织提取ＤＮＡ并测浓度和质量。将质检合格的ＤＮＡ样品利用ＩＬＬｕｍＩＮＡ ６０Ｋ ＳＮＰ芯片进行基因型判定。运用ＰＬＩＮＫ软件对判型结果进行质量控制，将合格的ＳＮＰ标记用于后续的关联分析．．．
关键词：
猪 血液性状 全基因组关联分析 候选基因
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
王晓东 何鸣笛 曾娇 李联飞 钟俊生
2014年6月至2015年5月,在杭州湾北部水域设置10个采样点。于每月大潮期间使用大型仔稚鱼网进行仔稚鱼采集,共拖网120次,采集有明银鱼(Salanx ariakensis)仔稚鱼1 972尾。本研究使用硬骨-软骨双染色技术,观察了有明银鱼仔稚鱼(体长范围为9. 7～34. 2 mm)脊柱及附肢骨骼的形态发育特征。有明银鱼背鳍、臀鳍、胸鳍、腹鳍的支鳍骨,髓弓、脉弓维持为软骨。匙骨、上匙骨、后颞骨、尾下骨、尾杆骨与尾椎髓体为硬骨。骨骼形成的顺序依次为肩带,臀鳍支鳍骨和尾下骨,背鳍支鳍骨,脉弓和髓弓,腹鳍支鳍骨和尾上骨。胸鳍支鳍骨无后匙骨。髓弓数目为73,脉弓数目为22,尾下骨(包括侧尾下骨)数目为7,臀鳍支鳍骨数目为27,背鳍支鳍骨数目为13。本研究结果表明有明银鱼具有其他银鱼类似的骨骼系统骨化程度弱的"幼态持续"现象。
[期刊] 水产学报
[作者]
毛非凡 陈刚 马骞 周启苓 施钢 黄建盛 邝杰华
为探明军曹鱼仔稚鱼早期脊柱及附肢骨骼的发育特征，本研究采用软骨-硬骨双染色技术，分别利用阿利新兰、茜素红对软骨、硬骨进行染色，对1～33日龄军曹鱼仔稚鱼全骨骼进行染色，系统观察并描述其脊柱和附肢骨骼的发育特征。结果显示，军曹鱼脊柱开始发育的标志为7日龄仔鱼中脉弓和神经弓的出现；13日龄仔鱼椎骨、神经弓和脉弓开始骨化；背肋、腹肋分别于17、20日龄开始骨化；29日龄稚鱼脊柱骨化完成。附肢骨骼骨化起始顺序依次为胸鳍、尾鳍、腹鳍、背鳍、臀鳍。胸鳍匙骨于4日龄出现，肩胛骨孔于12日龄出现，同时上匙骨开始骨化；乌喙骨与肩胛骨于20日龄开始骨化；第1尾下骨于5日龄出现，15日龄仔鱼尾杆骨、侧尾下骨和尾鳍鳍条开始骨化，18日龄仔鱼尾下骨开始骨化；腹鳍支鳍骨于17日龄延伸至匙骨，同时腹鳍开始骨化；臀鳍和背鳍于17日龄由前向后开始骨化。研究表明，军曹鱼在22日龄进入稚鱼期，早期发育阶段的骨骼发育特征与其功能性适应密切相关。本研究结果对研究军曹鱼早期骨骼发育与功能适应、优化养殖条件有重要作用。
关键词：
军曹鱼 仔稚鱼 脊柱 附肢骨骼 发育特征
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
杨彤彤 张婷婷 赵族 徐银学
采用PCR-RFLP方法分析大约克猪和二花脸猪SLA-DRB外显子2的多态性。结果显示:RsaⅠ酶切后得到3种等位基因条带,分别为A(141/93/11 bp)、B(111/69/54/11 bp)、D(93/48/39/54/11 bp)。χ2检测表明:二花脸猪SLA-DRB基因外显子2处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而大约克猪处于非平衡状态(P<0.01)。两品种A等位基因均为优势等位基因,AA型为主要基因型,其频率在品种间无显著差异。首次发现等位基因B、D分别出现在二花脸猪和大约克猪中,有望用于区分两品种。
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