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[期刊] 中国农业科学  [作者] 兰旅涛  郭源梅  陈从英  杨斌  毛辉荣  任军  周利华  
【目的】通过测量猪体长、体高、管围、胸围、胸宽、胸深、腹围和腿臀围等8个体尺性状,应用全基因组扫描定位影响猪体尺性状的数量性状位点(QTL)。【方法】在210日龄,活体测量白色杜洛克×二花脸资源群体129头F2个体的上述8个体尺性状,利用分布于猪18条常染色体和X染色体上的183个微卫星标记,对这129头F2个体及其父母和祖代亲本进行基因型检测。应用基于最小二乘线性回归分析的复合区间作图法在QTL Express进行在线QTL定位分析,并通过1000次的Permutation来确定不同显著水平的临界值。【结果】在8条染色体上共检测到19个影响猪体尺性状的QTL,其中位于4和7号染色体上的5个Q...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 周利华  郭源梅  段艳宇  张志燕  杨凯旋  麻骏武  
【目的】通过全基因组扫描,鉴别影响猪肉滴水损失数量性状位点(QTL)。【方法】采用EZ-滴水损失测定法和袋测定法,测定了白色杜洛克×二花脸资源群体884头F2代个体的背最长肌和半膜肌在采样后24和48 h的滴水损失。利用SAS软件分析了6个滴水损失性状间的相关性,以及滴水损失与其它肉质性状的相关性。检测了3个世代个体在19条染色体上194个微卫星的基因型。据此,应用QTL Express在线进行了影响滴水损失QTL的定位分析。【结果】滴水损失在两种肌肉间或两种测定方法间有较高的相关性(r=0.50—0.58,P<0.01)。滴水...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 陈从英  郭源梅  杨斌  任军  黄路生  
【目的】通过全基因组扫描,鉴别影响猪四肢骨骨骼长度,股骨和肱骨的骨髓腔长度、骨髓腔直径以及股骨骨壁厚度的数量性状位点(QTL)。【方法】在白色杜洛克×二花脸资源群体中测定132头240日龄阉割公猪29类四肢骨骨骼的长度、6类四肢骨骨骼直径以及股骨和肱骨骨壁厚度、骨髓腔长度和骨髓腔直径等表型性状。选择多态信息含量丰富并覆盖猪全基因组19条染色体的183个微卫星标记,采用最小二乘区间定位法进行猪全基因组扫描,定位猪四肢骨骼各性状QTL。【结果】在39个表型性状中定位到14个基因组1%显著水平QTL,14个基因组5%显著水平QTL和47个染色体5%显著水平QTL。除SSC11没有检测到QTL外,其它...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 宿英  阮国荣  龙毅  杨斌  张志燕  邓玮芸  吴丽花  吕显山  艾华水  肖石军  任军  黄路生  丁能水  
【目的】通过基于单倍型的病例-对照全基因组关联分析(GWAS)鉴别白色杜洛克×二花脸F2资源家系中影响猪阴囊疝的易感位点及位置功能候选基因,并在远缘纯种猪阴囊疝三联体核心家系(Trio)群体中进行重复验证。【方法】利用Illumina porcine 60K SNP芯片对1 020头白色杜洛克×二花脸F2资源家系阴囊疝群体(包含19个阴囊疝患病个体)进行扫描获取基因型。通过Plink v1.07软件对基因型数据进行质量控制;剔除个体基因型检出率<90%的个体,剔除SNP位点检出率<90%、哈迪温伯格平衡卡方检验P≤10-3和最小等位基因频率<0.05及性染色体上和无法定位的SNP位点。质控合格...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 吴延博  陈从英  张志燕  郭源梅  高军  
【目的】猪精子黏合分子1(SPAM1)基因在精卵结合过程中发挥重要作用,是影响产仔数的重要候选基因。本试验分析SPAM1基因的遗传变异及其与母猪产仔数的相关性。【方法】以305头白色杜洛克×二花脸资源群体F2母猪为材料,记录连续3胎的产仔性状,利用PCR-RFLP检测intron1 g298C>T、intron1 g357C>T和intron3 g380C>T共3个SNP位点在F2群体中的多态性,构建单倍型,分析各SNP基因型和单倍型与母猪产仔数、产活仔数、产死胎数的相关性。【结果】intron1 g298C>T位点CC型母猪的总产仔数显著低于CT、TT型母猪(P<0.05),CT基因型母猪产...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 陈从英  朱万成  李平华  魏娜  郭源梅  高军  
【目的】研究PRL、PRLR基因在白色杜洛克×二花脸F2资源群体中的遗传变异及其与母猪杀婴行为和产仔数的关联性。【方法】PRL基因的g.1317T>A、g.8905C>T、g.9056C>T位点,PRLR基因的g.1217C>T、g.1283C>A、g.1439G>A、g.1528G>A和g.1600T>A位点采用SNaPshot法对资源群体所有F0、F1和288头F2母猪进行基因型判定,分别利用传递不平衡检测(TDT)和最小二乘法分析这些位点与母猪杀婴行为和产仔性状的关联性。【结果】TDT分析发现,PRL和PRLR基因所有检测SNP位点,无论基因型还是单倍型均与母猪杀婴行为无显著相关。与母猪...
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 王海燕  贺佳玮  向安静  章程  朱猛进  赵书红  刘向东  
为研究聚肌胞苷酸(polyinosinic:polycytidylic acid,简称poly i:c)刺激对杜洛克×二花脸F2猪群血液参数的影响,选用杜洛克×二花脸F2猪393头,在33d时前腔静脉采血(对照组),在35d时用poly(i:c)刺激,4h后采血(处理组),对刺激前后血液参数进行相关性和主成分等分析。研究结果表明,处理组与对照组相比,白细胞中的嗜中性粒细胞百分比(nE%)、淋巴细胞数(ly)和淋巴细胞百分比(ly%)这3项血液参数差异显著相关,红细胞中的红细胞压积(hct%)和红细胞数(RBc)差异相关性显著,而血小板第一主成分中决定性指标血小板数(plt)和血小板压积(pct...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 郭源梅  张勤  任军  周利华  
【目的】研究猪F2代资源家系的群体结构对数量性状座位(quantitative trait loci,QTL)定位的影响,为QTL定位群体的构建提供参考。【方法】通过模拟的方法,模拟了18种不同的群体结构,研究F0代(亲本)、F1代和F2代群体大小、F0代和F1代公母比例以及祖代QTL基因频率等6种因素对QTL定位的影响。【结果】随着F2代群体的增大,QTL检测的效率明显提高,加性效应的估计值逐渐偏低,95%置信区间显著减小。造成加性效应降低的主要原因是QTL在两亲本群体中没有纯合。随着F0代母畜比例的增加,QTL 95%置信区间也明显降低;随着祖代QTL基因频率差异的增加,QTL检测的效率和...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 何余湧  李完波  张志燕  杨明  欧阳婧  杨杰  任军  肖石军  
【目的】利用二花脸×沙子岭家系定位影响仔猪45日龄断奶体重的数量性状位点(quantitative trait loci,QTL)并搜寻QTL区间内与表型相关的位置候选基因,为最终鉴别因果基因奠定前期工作基础。【方法】构建二花脸×沙子岭猪F2资源家系,利用Illumina porcine 60k DNA芯片判定F2个体的基因型,对45日龄断奶体重表型进行全基因组连锁分析,定位影响二花脸×沙子岭家系F2家系仔猪45日龄断奶体重的QTL。在Ensemble(EMBL-EBI)和NCBI(National Center for Biotechnology Information)网站基因组数据库中搜...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 刘晨龙  杨慧  张慧  张志燕  段艳宇  
【目的】利用全基因组关联分析定位影响杜长大猪(DLY)、二花脸猪(EHL)和莱芜猪(LW)3个群体25种血液性状的染色体位点,为最后鉴定影响这些性状的因果基因提供前期基础,同时为猪抗病育种和生产提供参考。【方法】将610头杜长大三元杂猪在(180±5)日龄,336头二花脸猪和333头莱芜猪在(300±5)日龄进行统一屠宰。收集2 m L血液于抗凝管中,利用全自动生化分析仪进行25种血液性状的血常规检测。采集猪耳组织提取DNA并测浓度和质量。将质检合格的DNA样品利用ILLumINA 60K SNP芯片进行基因型判定。运用PLINK软件对判型结果进行质量控制,将合格的SNP标记用于后续的关联分析...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 姜志华  牛树理  冯紫云  甘信德  刘焕芝  
利用二花脸、大约克及其F1、F2和回交世代的最小二乘均数,采用多元回归分析程序,对猪的产仔数主要组分性状的基因效应进行了研究。组分性状包括卵巢体积、总卵泡数、未成熟卵泡数、排卵数、卵泡成熟率和妊娠胚胎数。结果表明:加性效应是世代间遗传变异的主导因素。在卵巢体积、总卵泡数和未成熟卵泡数方面,大约克对二花脸加性效应值依次为5.3480cm3,5.3402枚和8.0539枚;在排卵数、卵泡成熟率和妊娠胚胎数方面,二花脸对大约克加性效应值依次为1.9746枚,6.8411%和2.6114个。大约克在4个性状上呈显性,即卵巢体积、总卵泡数、未成熟卵泡数和妊娠胚胎数,而二花脸仅在排卵数和卵泡成熟率方面呈显...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 姜志华  刘红林  李齐贤  胡秀义  
利用二花脸、大约克及其F1、F2和回交世代共8个猪群的最小二乘均数,采用多元回归分析程序,对猪的初生重、20日龄重和60日龄重的母体效应和基因效应进行了研究。结果表明,大约克猪初生重、20日龄重及60日龄重平均比二花脸猪依次高04613,13643和20890kg。初生重受母体效应影响最大,而到60日龄时加性基因效应则占主导地位。在总变异中,母体效应由初生时的8889%降至60日龄时的449%;而加性效应则由初生时的561%升至60日龄时的6547%。60日龄时的个体重,大约克对二花脸猪的加性效应为23184kg,显性效应为01128kg。
[期刊] 中国农业大学学报  [作者] 吕廷伟  王爱国  
本试验为研究以青刈黑麦为纤维原料的大体积日粮对母猪繁殖性能的影响而设计。以消化试验测定青刈黑麦草粉的数据为基础 ,配制粗纤维含量依次为 3.65% ,7.69%和 11.9% 3种日粮处理 ,其主要营养物质日采食量相同。不同日粮处理对总产仔数、产活仔数、出生窝重、2 1d窝重、断奶窝重和断奶仔数的影响均不显著。从仔猪 2 1d窝增重来看 ,处理 2组比对照组和处理 1组约高 10 %。处理 2组仔猪的生后生长速度相对提高。总之 ,青刈黑麦草粉大体积日粮粗纤维水平在 12 %左右时 ,对繁殖性能无不利影响
[期刊] 中国农业科学  [作者] 凌飞  张豪  蔡更元  陈瑶生  李加琪  王翀  
【目的】鉴定影响猪重要经济性状的QTL。【方法】利用中国地方猪种蓝塘猪(16头母猪)与外来品种长白猪(8头公猪)建立了资源家系,对257头F2代个体的11个活体性状进行测定。根据美国肉畜中心(USDA-MARC 2.0)公布的猪连锁图谱,在1、4和8号染色体上大约每间隔10—20 cM选择一个微卫星标记,共21个标记,采用ABI 377 DNA序列分析仪进行微卫星基因分型,运用QTL Express软件包在http://latte.cap.ed.ac.uk网站在线分析,进行QTL定位分析。【结果】体高(body height,BodyHh)的QTL定位于SSC1的68 cM处,与标记SW218...
[期刊] 西南农业学报  [作者] 郝小静  韩丽娟  王彦平  赵雪艳  王继英  
【目的】分析椎骨发育相关(Vertebrae development associated,VRTN)基因的1段291 bp短散在重复序列(Short interspersed repeated sequence, SINE)插入突变对杜洛克猪肋骨数、胴体和肉质性状的影响,为实施分子标记辅助育种,提高杜洛克的肋骨数奠定基础。【方法】屠宰48头杜洛克猪,按照标准方法测定肋骨数、胴体和肉质性状,利用PCR检测VRTN基因的基因型,分析SINE插入突变3种基因型与肋骨数、胴体和肉质性状的关联。【结果】杜洛克猪中VRTN基因ins位点存在插入型(ins/ins)、杂合性(ins/-)和缺失型(-/-)3种基因型,ins/ins基因型频率最高(0.5217),其次是ins/-基因型(0.3696),-/-基因型频率最低(0.1087)。-/-基因型的杜洛克猪肋骨数为14,ins/-基因型的杜洛克猪肋骨数为15,大多数ins/ins基因型的杜洛克猪肋骨为16根,少数杜洛克猪为15根,平均为15.82根。ins/ins基因型的杜洛克猪比-/-基因型的杜洛克猪的肋骨提高1.82根,差异极显著(P
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