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[期刊] 淡水渔业
[作者]
耿瑞静 谢明辉 王卫民 刘寒
本试验选用8个高质量多态性的微卫星标记对团头鲂(Megalobrama amblycephala)选育世代F1、F2、F3、F4和团头鲂"浦江1号"的357个子代进行了亲子鉴定,主要方法是通过Cervus 3.0.7计算机模拟软件依次进行等位基因频率分析、模拟分析和亲子分析,根据LOD值大小判定亲子关系。结果表明在团头鲂混养家系中,微卫星位点的平均等位基因数为35,平均观测杂合度为0.867,平均期望杂合度为0.94,平均多态信息含量为0.935,最终所有子代准确地找出对应的父母本,亲子鉴定准确率为100%,证实微卫星标记在团头鲂亲子鉴定中的应用价值。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李绍戊 常玉梅 梁利群 孙效文
采用磁珠富集法与放射性杂交相结合开发团头鲂(Megalobrama amblycephala)基因组微卫星资源。以团头鲂基因组DNA为材料,经Sau3AⅠ限制性内切酶消化后,选取400~900 bp的片段进行PCR全基因组扩增,并利用生物素标记的(CA)15探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中,然后利用γ-32P标记的放射性同位素探针进行第二轮杂交。结果表明,共获得微卫星基因组文库2 000个菌,杂交前菌落PCR检测阳性克隆率为50%;杂交后得到的阳性克隆为230个,占11.5%。从得到的230个阳性克隆中挑出120个进行测序,有94个克隆含有重复次数大于...
关键词：
团头鲂 微卫星 磁珠富集
[期刊] 淡水渔业
[作者]
成为为 杨凯 高银爱 朱思华 李波 王青云 罗峰 夏儒龙 程颖红 邓国乔 郑翠华
利用９个多态性较高的微卫星标记对翘嘴鳜（Ｓｉｎｉｐｅｒｃａ ｃｈｕａｔＳｉ）进行亲子鉴定分析。结果显示，２２个家系翘嘴鳜个体中共观测到９５个等位基因，其观测杂合度和期望杂合度的平均值（范围）分别为０．５７８（０．２１９～０．８００）和０．６０７（０．２００～０．８０６），多态信息含量（范围）为０．５５２（０．１８７～０．７８７）。通过软件ｃｅｒｖｕＳ统计分析得到９个微卫星座位累计排除率为９９．９６５８％，在２７个可能的父母对条件下，混养养殖家系后代个体鉴定准确率为９１％，研究结果表明筛选的这些多态微卫星分子标记可以用于翘嘴鳜优势家系的鉴定和分离，通过验证的微卫星标记建立的亲子鉴定技术为基础选育．．．
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
孙昭宁 刘萍 李健 何玉英 张秀梅
在水产养殖中应用微卫星标记来确定亲缘关系已经得到认同和广泛使用。本研究通过控制交尾,利用微卫星标记确定中国对虾后代的亲缘关系,对微卫星标记应用于中国对虾的家系识别进行初步探讨。作者以4个谱系清晰的家系为基础,检测两对微卫星标记EN0033和RS062在中国对虾家系鉴别中的应用。结果表明,利用两对微卫星引物产生的DNA指纹图谱,能够有效地区分中国对虾4个家系。根据微卫星数据计算各家系之间的遗传距离,构建UPGMA图,得到的结果与各家系来源情况一致,进一步证明了微卫星技术在进行家系间的遗传分析中的可行性。EN0033和RS062两对微卫星标记的累积个体识别率高达0.989,属于高识别力的遗传标记系...
[期刊] 水产学报
[作者]
徐湛宁 李福贵 郑国栋 陈杰 蒋霞云 邹曙明
为了指导团头鲂耐低氧群体的后续选育工作开展,利用筛选出的20对微卫星引物,比较分析了团头鲂耐低氧群体(TN)及其减数分裂(TNM)、有丝分裂(TNDH)雌核发育后代群体的遗传结构;结果显示,团头鲂TN、TNM、TNDH及团头鲂"浦江1号"(TPJ1)对照的平均等位基因数(N_a)分别为3.90、3.55、3.45、4.25,平均观测杂合度(H_o)分别为0.7853、0.3934、0.2768、0.8075,平均期望杂合度(H_e)分别为0.6491、0.5563、0.4870、0.6855,平均多态信息
[期刊] 水产学报
[作者]
曾聪 张耀 曹小娟 罗伟 刘肖莲 高泽霞 钱雪桥 王卫民
利用12对微卫星(SSR)引物对采自梁子湖、鄱阳湖和淤泥湖3个地理种群团头鲂的遗传多样性、杂合度和遗传距离进行了分析,并以3个种群的团头鲂为亲本,用完全双列杂交方法建立全同胞家系,对F1个体体质量、全长进行了配合力分析,以期预测各种群间配组的杂交优势。在一般配合力分析中,父本全长和体质量配合力效应值大小依次为淤泥湖、鄱阳湖和梁子湖;母本全长的配合力效应值大小依次为鄱阳湖、淤泥湖和梁子湖,体质量的配合力效应值依次为梁子湖、鄱阳湖和淤泥湖。在特殊配合力分析中,鄱阳湖团头鲂种群内杂交组合相对效应值最大,其次为梁子湖作为母本与淤泥湖作为父本的组合,最小的为鄱阳湖作为母本与淤泥湖作为父本的组合。对3个种...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
张新辉 夏新民 罗伟 高泽霞 钱雪桥 王卫民
采用松浦镜鲤(Cyprinus carpio Songpu carp)的紫外线遗传灭活精子刺激团头鲂(Megalobrama amblycephala)卵子后冷休克抑制卵子第二极体释放方法,获得团头鲂雌核发育个体。流式细胞仪检测雌核发育个体的DNA含量与正常团头鲂二倍体的DNA含量并没有显著性差异,表明雌核发育个体为二倍体。通过引物优化,筛选父母本具有特异性的8对微卫星引物,对雌核发育后代进行检测,结果表明雌核发育个体的遗传物质均来自母本,没有父本的遗传物质渗入。筛选出母本为杂合的10对微卫星引物对子代的纯合性进行评价,结果显示雌核发育后代在TTF-EST46、TTF-EST61、TTF-ES...
关键词：
团头鲂 雌核发育 微卫星 纯合性
[期刊] 水产学报
[作者]
黄纬杰 郭向召 张子豪 董强 熊雪梅 高泽霞
为分析草鱼全基因组微卫星特征并开发高多态性微卫星标记亲子鉴定平台，实验利用已发布的草鱼全基因组序列，开发高度多态、准确度高、重复单元在4～6碱基范围的微卫星标记。结果显示，在草鱼900.51 Mb基因组序列中共筛选到微卫星序列677 363个，总长度12 835 407 bp，占全基因组长度的 1.425 4%，平均跨度为1 329.43bp。其中单碱基重复序列出现最多，占比52.85%；二碱基重复序列其次，占比31.44%；再次是四碱基重复，占比8.05%，三碱基重复序列占比6.47%，五碱基重复序列占比1.12%；六碱基重复出现最少，仅占比0.07%。1～6碱基重复类型中优势重复单位分别是A/T、AC/GT、AAT/ATT、AGAT/ATCT、AATAT/ATATT、AACCCT/AGGGTT。随机挑选重复序列为4～6个碱基的110个位点设计引物，在草鱼繁殖亲本群体中扩增，筛选出15对多态性引物，经CERVUS 3.0软件分析15个位点平均期望杂合度0.802～0.959，模拟分析结果鉴定准确率为100%，置信度为95%。通过对20个家系子代192个个体进行亲本来源鉴定，所有子代均成功匹配到正确父母本，鉴定准确率达到100%。本研究分析了草鱼全基因组微卫星特征，并利用多态性微卫星位点进行草鱼亲子鉴定，为草鱼微卫星的功能和应用研究以及草鱼的育种工作奠定基础。
关键词：
草鱼 全基因组 微卫星 亲子鉴定
[期刊] 淡水渔业
[作者]
辛苗苗 张书环 汪登强 汪珂 张磊 霍来江 危起伟
应用荧光引物和自动测序技术,检测了10个自主研发的微卫星分子标记在68个中华鲟(Acipenser sinensis)个体中的遗传多态性。结果表明,10个微卫星标记共检测到124个等位基因,等位基因数为7~22,期望杂合度为0.730 26~0.873 95,Shannon-Wiener多样性指数为1.561 61~2.219 60。基于亲子鉴定排除率不低于0.99的标准,最终确定Asi-75067、Asi-67648、Asi-67123、Asi-73843、Asi-72040、Asi-70421和Asi-56700等7个微卫星标记为中华鲟亲子鉴定的核心体系,其单亲、父权和双亲的累积排除率分别...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
王新华 俞小牧 冯建新 童金苟
本研究利用１１个高度多态的微卫星标记对２６个黄河鲤（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ Ｃａｒｐｉｏ ｈａｅｍａｔｏｐｅｒｕｓ）全同胞家系中的４１７尾体重较大的正常体色个体（黄河鲤较大个体）和５２尾红色个体（红鲤表型个体）进行了亲子鉴定。１１个微卫星座位的平均等位基因数、平均观测杂合度（ｈ＿ｏ）、平均期望杂合度（ｈ＿ｅ）和平均多态信息含量（ｐｉＣ）分别为８．２、０．７９２、０．７９２和０．７６。当双亲未知且置信度为９５％时，１１个座位的累积排除概率达９９．７９％。除２９尾黄河鲤较大个体以外，３８８尾黄河鲤较大个体和５２尾红鲤表型个体准确地找到了其父母本，实际鉴定率为９３．８２％。通过对子代数目超过２０尾的７个黄．．．
关键词：
黄河鲤 亲子鉴定 微卫星 鉴定率
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
王泽 杜文俊 陈氏娥 董志国 牛东红 沈和定 李家乐
利用磁珠富集法，构建了缢蛏（Ｓｉｎｏｎｏｖａｃｕｌａ ｃｏｎＳｔｒｉｃｔａ）微卫星富集文库。开发并筛选出１８对微卫星引物，其中８对微卫星引物亲缘排除率较高，选取这８对引物对家系进行了亲子鉴定。结果表明，１８对微卫星引物在１２个个体中等位基因为２～６，平均等位基因为３．００；观测杂合度在０～１．０００之间，平均值为０．５８１ ３；期望杂合度０．２９０～０．７７９，平均值为０．５２８ ４；多态信息含量为０．２３９～０．７０３，平均值为０．４３２ ２。当两个亲本基因型未知时，８对微卫星引物在整个家系中单个亲本排除率（Ｅ－１Ｐ）为０．５８３～０．９１６，平均值为０．７９０ ０；当一个亲本基因型已知时，．．．
关键词：
缢蛏 微卫星标记 亲子鉴定
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张彦锐 李宝玉 郑国栋 邹曙明
为获得团头鲂(Megalobramaamblycephala)的纯合品系,本研究以团头鲂“浦江2号”作为亲本,采用紫外线灭活的鲤鱼精子刺激团头鲂卵子,经冷休克抑制第二极体排出的方法获得异源雌核发育一代群体(Meio-G1)和雌核发育二代群体(Meio-G2)。利用筛选出的20对微卫星引物,研究分析了团头鲂“浦江2号”正常群体、雌核发育一代群体(Meio-G1)和雌核发育二代群体(Meio-G2)的遗传特征。结果表明,正常群体、Meio-G1和Meio-G2中,分别扩增出129、99、84个等位基因,平均等位基因数(N_a)分别为4.30、3.30、2.80,平均有效等位基因数(N_e)分别为3.23、2.24、1.76,平均观测杂合度(Ho)分别为0.8067、0.4067、0.1733,平均纯合度(H)分别为0.2035、0.6000、0.8263,平均多态信息含量(PIC)分别为0.6198、0.4701、0.3628,表明Meio-G1和Meio-G2相较于正常群体其遗传多样性下降,其中Meio-G2的遗传多样性最小。Hardy-Weinberg平衡遗传偏离指数表明Meio-G1和Meio-G2出现杂合子缺失的现象,而正常群体则表现为杂合子过剩。聚类分析显示,正常群体与Meio-G1共同汇聚成为一支,而Meio-G2单独成为一支,产生了一定程度的遗传分化。本研究结果表明,Meio-G2的纯合度高、遗传多样性低,是良好的育种材料,可为团头鲂的选育工作提供重要参考依据。
关键词：
团头鲂 雌核发育 微卫星标记 遗传结构
[期刊] 淡水渔业
[作者]
唐首杰 李思发 蔡完其
以普通团头鲂(Megalobrama amblycephala)选育系群体为对照组,利用17个多态性微卫星标记比较分析了团头鲂人工减数雌核发育一代群体(meio-G1)、二代群体(meio-G2)和三代群体(meio-G3)的遗传结构及其基因座位的纯合度,探讨了连续多代诱导减数分裂雌核发育对团头鲂基因纯化的效果。结果表明:17个微卫星座位在对照组、meio-G1、meio-G2和meio-G3中,分别扩增到102、77、45、27个等位基因,平均等位基因数分别为6.0、4.53、2.65、1.59,平均观测杂合度(Ho)分别为0.840 8、0.326 8、0.098 3、0.018 5。me...
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
杨成 朱新平 郝君 孙效文
利用磁珠富集法构建了鲮鱼的(CA)n微卫星富集文库,所建文库共包含252个阳性克隆,从中随机选取60个进行测序,得到56个(93.3%)含有微卫星序列的克隆。其中,完美型微卫星49个(87.5%),非完美型微卫星2个(3.6%),复合完美型微卫星5个(8.9%)。从所得序列中分离和鉴定了18对微卫星标记。采用20个鲮鱼养殖个体分析其多态性,发现其中12对为多态性标记,等位基因数变动范围为2~20,期望杂合度变动范围为0.261 5~0.950 0。本研究对以后鲮鱼基因组资源的开发利用起到一定的促进作用,并为鲮鱼养殖品系的优化、遗传多样性的检测及遗传图谱的构建等打下基础。
关键词：
鲮鱼 微卫星 富集法 多态性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
刘磊 李健 刘萍 高保全 陈萍 戴芳钰 王学忠
以定向交尾技术构建的4个谱系清晰的家系为材料,检测两对微卫星标记Pot17和Pot42在三疣梭子蟹家系鉴别中的应用效果。结果表明,两个位点在4个家系的5个已知父母本和98个后代中共检测出11个等位基因,其中Pot17位点6个,Pot42位点5个。分析显示,上述检出的等位基因频率在0.0291和0.3592之间,Pot17和Pot42位点的期望杂合度分别为0.7740和0.7577,观测杂合度分别为0.6214和0.6796,多态信息含量分别为0.7373和0.7129。根据已知亲本和子代基因型,推断出了4个家系全部亲本的基因型。Pot17和Pot42微卫星标记具有达0.995的较高累积个体识别...
关键词：
三疣梭子蟹 微卫星标记 家系 亲缘鉴定
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