【目的】了解四川省炉霍县牦牛体表寄生蜱的种类及其斑点热群立克次体（Spotted fever group Rickettsia，SFGR）和无形体的感染情况。【方法】在炉霍县6个乡采集牦牛体表的蜱，经形态学初步鉴定后提取蜱基因组DNA，采用PCR技术分别扩增蜱ITS-2、SFGR OmpB和无形体16S rRNA基因部分片段，对阳性产物进行测序、比对及构建进化树，从而确定蜱的种类及其SFGR和无形体的感染情况。【结果】在820份蜱样本中，只包含青海血蜱（Haemaphysalis qinghaiensisus，29/820）和微小扇头蜱（Rhipicephalus microplus，791/820）。总共有408份蜱样本被检出SFGR，只检出了Candidatus Rickettsia longicornii 1种SFGR，总感染率为49.8%（408/820）。在本次调查的6个乡均检出SFGR，不同乡之间SFGR感染率的差异极显著（χ~(2) = 111.524，P = 0.000 < 0.01）。青海血蜱和微小扇头蜱的SFGR感染率分别为44.8%（13/29）和49.9%（395/791），差异不显著（χ~(2) = 0.292，P = 0.589 > 0.5）。有5个乡检出了无形体，共检出了Anaplasma bovis、A. marginale、A. platys和A. phagocytophilum 4种无形体，总感染率为30.9%（253/820），不同乡之间蜱样本无形体感染率差异极显著（χ~(2) = 139.825，P = 0.000 < 0.01）。青海血蜱和微小扇头蜱的无形体感染率分别为6.9%（2/29）和31.7%（251/791），差异极显著（χ~(2) = 8.087，P = 0.004 < 0.01）。SFGR与无形体混合感染率为18.8%（154/820）。【结论】炉霍县存在青海血蜱和微小扇头蜱，还携带SFGR和多种无形体，应做好当地蜱传斑点热群立克次体和无形体的防治工作。

为了确定牛体表寄生硬蜱的种类及其携带无形体的状况，从河南、湖南、海南、四川、贵州、广东和广西采集牛体表寄生硬蜱572只，通过形态学和分子生物学方法对硬蜱进行种类鉴定；同时用PCR方法检测硬蜱体中无形体感染情况。经形态学和分子生物学鉴定，结果 572只牛硬蜱均为微小扇头蜱，且存在A、B、C等3个分支。基于无形体的16S rRNA基因序列分析的结果表明，微小扇头蜱携带无形体，其阳性率为38.8%(222/572)，其中边缘无形体、山羊无形体、扁平无形体和嗜吞噬细胞无形体分别为23.6%(135/572)、7.3%(15/572)、5.3%(42/572)、2.6%(30/572)，仅在湖南的牛蜱中发现存在无形体混合感染情况。微小扇头蜱C分支的发现尚属首次，且以边缘无形体感染率最高。

为了确定牛体表寄生硬蜱的种类及其携带无形体的状况，从河南、湖南、海南、四川、贵州、广东和广西采集牛体表寄生硬蜱572只，通过形态学和分子生物学方法对硬蜱进行种类鉴定；同时用PCR方法检测硬蜱体中无形体感染情况。经形态学和分子生物学鉴定，结果 572只牛硬蜱均为微小扇头蜱，且存在A、B、C等3个分支。基于无形体的16S rRNA基因序列分析的结果表明，微小扇头蜱携带无形体，其阳性率为38.8%(222/572)，其中边缘无形体、山羊无形体、扁平无形体和嗜吞噬细胞无形体分别为23.6%(135/572)、7.3%(15/572)、5.3%(42/572)、2.6%(30/572)，仅在湖南的牛蜱中发现存在无形体混合感染情况。微小扇头蜱C分支的发现尚属首次，且以边缘无形体感染率最高。

采用AFLP(Amplified fragmentlength polymorphism)技术分析了来自四川14个不同水稻种植区和50个不同籼型杂交稻稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的遗传多样性。20对选择性扩增EcoRⅠ和MseⅠ引物组合稻曲病菌株可产生40～56条DNA带,75个菌株共产生192条清晰可见的DNA带型,其中多态性121条,占总数的63.02%。结果表明:不同地理来源稻曲病菌可能具有相同的遗传群体结构,也显示特异性的群体遗传特征;稻曲病菌遗传结构与寄主品种关系不大,没有表现明显的专化性互作;稻曲病菌不同的遗传群体之间菌株的致病性存在很大差异,即使同一遗传...

【目的】了解目前四川省猪圆环病毒２型（ＰＣＶ２）的分子流行病学特征和遗传变异情况，探讨ＰＣＶ２感染的控制对策。【方法】根据ＧｅｎＢａｎｋ中发表的ＰＣＶ２基因组序列设计２对特异性引物，对２０１２－２０１４年临床送检的ＰＣＶ２感染病例材料中的５株ＰＣＶ２全基因组序列进行扩增测序，并利用ＤｎａＳｔａｒ等生物信息分析软件对获得的ＰＣＶ２基因组序列进行分子特性与遗传演变分析。【结果】５株ＰＣＶ２四川株全基因组序列长度都为１ ７６７ＢＰ，均具有滚环复制起点（ＯｒＣ）典型结构。序列比对和进化分析显示，５株ＰＣＶ２四川株的基因序列同源性很高，基因组核苷酸序列及ＯｒＦ１、ＯｒＦ２和ＯｒＦ３基因序列同源性分别为９．．．

为研究西藏牦牛源大肠杆菌的致病性及其遗传进化情况,了解其与其他动物源大肠杆菌的亲缘关系,采集西藏牦牛腹泻粪便240份,采用微生物学方法对其进行细菌的分离培养、血清型鉴定和致病性研究,并运用分子生物学方法对其进行16SrRNA鉴定、测序和系统发育分析。结果表明:获得的16株牦牛致病性大肠杆菌分离株中:3株与猪源致病性大肠杆菌亲缘关系较近;5株与禽源致病性大肠杆菌亲缘关系较近;2株与犊牛源大肠杆菌亲缘关系较近;4株与牛源大肠杆菌亲缘关系较近;1株牦牛源致病性大肠杆菌单独形成一个较远的分支;1株与痢疾杆菌和人源出血性大肠杆菌亲缘关系较近,可能成为对人类造成潜在危险的病原菌。西藏牦牛源大肠杆菌与牛源、禽源、猪源、人源大肠杆菌的之间亲缘性很近,存在跨种间传播风险。该种西藏牦牛源大肠杆菌动物致病试验表明,致死率高达95%,应引起高度重视。

【目的】四川省河流众多，野生日本沼虾资源丰富，为深入了解四川省日本沼虾种质资源现状，开展不同流域日本沼虾遗传多样性评估具有重要意义。【方法】基于线粒体Cytb序列，对四川省巴河（BH）、涪江（FJ）、嘉陵江（JLJ）、岷江（MJ）和思蒙河（SMH）5个日本沼虾野生群体的遗传多样性进行分析。【结果】所有群体的201尾日本沼虾中共检测出36种单倍型，单倍型多样性（H_(d)）值在0.345～0.959之间，H_(d)均值为0.802，其中JLJ群体的H_(d)值最高（0.959），而MJ、SMH和BH群体的H_(d)值相对较低，H_(d)值均小于0.5。所有群体的核苷酸多样性（P_(i)）值在0.002 25～0.015 47之间，P_(i)均值为0.015 83，其中JLJ群体的P_(i)值最高（0.015 47），BH群体的P_(i)值最低（0.002 25）。日本沼虾的遗传变异主要来自群体间（68.20%），群体间存在显著的遗传分化，系统发育树分析显示所有群体呈现3个较明显分支。单倍型MJ网络图显示所有单倍型也呈现3个明显谱系，其中谱系A包含优势单倍型Hap 14，谱系B包含优势单倍型Hap 16，谱系C包含优势单倍型Hap 1。【结论】日本沼虾群体遗传多样性总体上处于较高水平，但不同流域的群体间遗传多样性水平差异较大，其中MJ、BH和SMH群体的遗传多样性相对较低，对这些流域内日本沼虾种质资源的保护有待进一步加强。本研究为四川省日本沼虾种质资源的保护与合理开发利用提供了参考依据，有利于促进四川省日本沼虾产业的可持续发展。

采用AFLP分子遗传标记技术,对来自福建和湖北的1984年引进的斑点叉尾(Ictalurus punctatus)养殖群体(P1984)、来自福建和辽宁的1997年引进的养殖群体(P1997)、来自湖南的2004年引进的养殖群体(P2004)和来自湖北的1984年与1997年引进养殖群体的杂交群体(P8497)的遗传多样性进行研究。用10对选择性引物共扩增出523个位点,其中,243个位点为多态位点,多态位点比例为46.46%;没有发现可以用于区分4个群体的特异性位点,但找到一些潜在的群体鉴别片段;P1984、P1997、P2004和P8497群体的多态位点比例(P)分别为28.93%、38...

为了解西藏牦牛的遗传多样性和群体分化情况,本研究测定了西藏15个牦牛类群的mtDNA ND5基因序列,分析其遗传多样性、亲缘关系及分类。结果表明:1西藏牦牛mtDNA ND5全序列长度在1821~1823 bp,无内含子,T、C、A和G 4种碱基的平均比例分别为32.9%、10.6%、27.5%、29.0%,存在一定的碱基组成偏倚性。2共发现变异位点36个,其中15个单态突变位点,13个简约信息位点;存在碱基缺失、插入、转换和颠换等,插入或缺失位点8个,T/C转换较多,G/C颠换较少。3西藏牦牛mtDNA ND5共有23种单倍型,平均单倍型数(H)、平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(...

旨在通过mtDNA ND1探究6个西藏特色牦牛群体的遗传多样性、系统进化及亲缘关系，为西藏牦牛的遗传多样性、历史演化以及遗传资源保护与利用等提供理论依据。利用PCR和直接测序法分别测定了西藏帕里牦牛、嘉黎牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、江达牦牛、类乌齐牦牛6个群体共95头个体ND1基因蛋白质编码区(CDS)序列，利用DNAMAN、DNASP 5.1、Mega 7.0、Arlequin 3.5.2等软件分析其序列多态性、单倍型多样性、遗传距离等，并构建单倍型网络图及系统发育树。结果表明，西藏牦牛群体ND1基因CDS区序列长度均为956 bp,共检测获得78个变异位点和16种单倍型，平均单倍型多样性(Hd)及核苷酸多样性(Pi)分别为0.670和0.004 21,Tajima′s D均为负值；根据群体遗传差异的分子方差分析可知，西藏牦牛群体内的变异程度大于群体间变异；斯布牦牛与嘉黎牦牛之间的分化程度较大，其余大部分群体间的分化程度为中等或较弱。此外，通过聚类分析发现，类乌齐牦牛单独聚为一类，而嘉黎牦牛、工布江达牦牛、斯布牦牛、江达牦牛先聚为一类，然后再与帕里牦牛聚为一大类；16种单倍型可分为2个聚类簇，说明西藏牦牛可能存在2个母系起源；与其他牛种进行聚类分析，发现家牦牛、爪哇野牛和普通牛可能是西藏牦牛的混合母系起源。西藏牦牛遗传多样性十分丰富，其中类乌齐牦牛遗传多样性最丰富，6个牦牛群体存在2个母系起源。

经克隆测序获得了我国5个批次引进的40尾斑点叉尾(Ictalurus punctatus)群体的线粒体控制区全序列,研究控制区序列结构和群体遗传变异。结果显示:比对长度包括906个位点,共有变异位点28个,简约信息位点21个。通过与GenBank中其它鱼类的mtDNA控制区序列进行结构分析,将斑点叉尾的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区3个区域;并找到了一系列保守序列:包括终止相关序列TAS,中央保守区的CSB-F、CSB-E、CSB-D和保守序列区的CSB-1、CSB-2、CSB-3。样本总体遗传多样性指数较高,40尾个体含有25个单倍型,其总体单倍型多样性指数(H)为0.920...

简单重复序列(SSR)是进行遗传多样性研究的一种有效分子标记。选用四川省现有及引进的马铃薯品系(种)42份,利用已发表的马铃薯SSR引物进行扩增,采用聚类分析方法对供试材料进行了遗传多样性分析。从110对SSR引物中筛选出16对多态性高、扩增稳定、重复性好的引物,16对SSR引物共扩增出130个位点,其中多态性位点116,占总扩增位点的89.2%。利用NTSYS软件进行聚类分析,结果显示四川省栽培的马铃薯品种遗传多样性水平较低,品种间的遗传差异较小。

中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)是我国海水养殖业中最具代表性的一项产业,优良种质和抗病力已成为对虾养殖业中迫切需要解决的问题。在遗传育种中若能筛选到与抗病、生长等数量性状紧密连锁的遗传标记,将为开展标记辅助育种工作和实现良种化奠定基础。对虾种质资源以及种群遗传学已成为研究热点,种群保护也已提到议事日程。这些研究工作的开展将为对虾良种选育提供理论依据,相信随着研究工作的继续深入,人们会更好、更有效地利用对虾资源。本文对目前已经在对虾遗传多样性和系统进化研究中进行应用的DNA标记技术方法进行分析总结,拟对今后其他物种开展相关工作提供借鉴。

对6年生四川省桤木15个种源51个家系在湖北、江西、福建3个试验点试验林的单株生物质产量进行了研究,结果表明:桤木种源3个地点6年生的平均单株生物质产量为6.15kg。单株生物质产量种源间、种源内家系间差异显著。单株生物质产量具有极显著的地点效应,单株生物质产量种源×地点、家系×地点交互作用显著。3个地点单株生物质产量种源遗传力为0.27～0.75,家系遗传力为0.17～0.83,表明单株生物质产量受到中度到强度的遗传控制。材积(直接通径系数0.791)对单株生物质产量控制作用最大,其次为树高(直接通径系数0.396)和木材基本密度(直接通径系数0.256)。树高、胸径和冠幅通过材积对单株生物...

为从分子水平上对青海省果洛藏族自治州牦牛遗传资源进行系统评估，分析其母系遗传多样性、群体遗传结构和群体遗传分化，本研究对甘德、班玛、久治和玛多牦牛群体共152头个体进行线粒体DNA(mtDNA)Dloop区测序，并从GenBank下载已公布的37条达日牦牛和32条玛沁牦牛的相应序列，对这6个牦牛群体mtDNA D-loop序列进行综合分析。结果表明：1)221条牦牛mtDNA D-loop序列（636～638 bp）比对分析共检测出57个变异位点，包括8个单一多态位点和49个简约信息位点。根据D-loop序列间核苷酸变异共确定了45种单倍型，其中班玛、达日、甘德、久治、玛多、玛沁牦牛群体分别拥有1、6、5、4、7、6种特有单倍型。2)6个牦牛群体总的单倍型多样度和核苷酸多样度为0.901和0.014，表明其母系遗传多样性丰富。其中，甘德牦牛的单倍型多样度最高（Hd=0.951），久治牦牛的单倍型多样度最低（Hd=0.818）。3）遗传分化和基因流分析表明，除久治牦牛与班玛、甘德、玛沁牦牛群体间分化程度均呈中等遗传分化水平（0.05≤FST<0.15），基因交流相对贫乏外，其他牦牛群体间FST值较小（0

关键词： 牦牛  mtDNA D-loop区  遗传多样性  遗传分化  群体结构  系统发育