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[期刊] 淡水渔业
[作者]
佟广香 匡友谊 张超 尹家胜 孙效文
利用22个微卫星标记对野生哲罗鱼(Hucho taimen)F1代4个家系、176个个体的基因组进行分析。首先利用SPSS软件对体长、叉长、头长、吻长、口裂长、口裂宽和眼径等7个性状进行正态分布检验,7个性状都显示出连续变异的特点,属典型的数量性状或者多基因遗传,符合正态分布;其次用GLM程序对22个微卫星标记与性状进行相关性分析,并将与性状显著相关的标记进行基因型之间的多重比较,结果显示22个微卫星座位中,有10个标记至少与一种性状显著相关,其中与口裂长和眼径相关的标记最多的为7个;多重比较可知每个标记中同一性状均有部分基因型差异达到显著水平。这些标记为哲罗鱼进一步的分子标记辅助育种提供了基...
[期刊] 华北农学报
[作者]
佟广香 匡友谊 张超 尹家胜
利用22个微卫星标记对随机交配的野生哲罗鱼F1176个个体的生长速度相关性状(体质量、全长、体高、体宽、头长、头宽和眼间距)进行分析,22个微卫星标记共检测到67个等位基因,各座位的等位基因2～6个,片段大小为109～452 bp,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.583 5和0.564 0,22个位点均有不同程度的偏离Hardy-Weiberg平衡。利用SPSS软件对7个性状正态分布检测发现,7个性状都显示出连续变异的特点,属典型的数量性状或者多基因遗传,符合正态分布;同时用GLM程序对22个微卫星标记与生长速度相关性状进行相关性分析,并将与性状显著相关的标记进行基因型之间的多重比较,结果...
关键词：
哲罗鱼 微卫星标记 性状 标记辅助育种
[期刊] 水产学报
[作者]
刘福平 白俊杰 宋红梅 叶星 李胜杰 于凌云
为了筛选到与尼罗罗非鱼生长相关的分子标记,并对这些标记进行准确性鉴定,运用65个微卫星标记对鹭业和番禺2个尼罗罗非鱼群体进行了PCR扩增,再利用SPSS软件一般线性模型(GLM)对这些微卫星位点与尼罗罗非鱼体重等主要生长性状进行了标记性状连锁关联分析。结果表明,鹭业群体中有8个微卫星标记(UNH130,UNH183,UNH911,GM558,UNH211,UNH176,UNH914和UNH974)与主要生长性状显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01),其中有2个微卫星标记(UNH914和UNH974)与番禺群体的主要生长性状显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01),1个微卫星标记(...
[期刊] 水产学报
[作者]
刘磊 李健 刘萍 赵法箴 高保全 杜盈 马春艳
选用35个多态性微卫星标记,对三疣梭子蟹人工选育快速生长自交家系F2代(以2008年莱州湾群体雄蟹为父本和海洲湾群体雌蟹为母本交配产生F1代,随机选取F1代后代进行交配产生F2代自交家系)的110个个体进行遗传多样性研究。结果表明:35个位点共检测出87个等位基因,各位点等位基因数为2~4个不等,平均有效等位基因数为2.2个,观测杂合度平均值为0.646 5,期望杂合度平均值0.513 0,多态信息含量平均值0.449 1。经卡方检验,多数位点显著(P<0.05)或极显著(P
[期刊] 中国水产科学
[作者]
肖同乾 鲁翠云 李超 曹顶臣 程磊 孙效文
选用来源于鲤基因组中的鳞被相关基因(ant、eda、edar、fgfr)及其上下游序列中的155个微卫星标记,对德国镜鲤(Cyprinus carpio L.)与黑龙江野鲤(Cyprinus carpio haematopterus)杂交的F2 116尾个体的遗传多样性进行检测,以卡方检验估计群体Hardy-Weinberg平衡。结果表明,36个微卫星标记表现为多态,各标记的等位基因数在2~4个浮动,共检测到86个等位基因,平均每个标记2.388 9个;平均有效等位基因数为2.209 4;平均观测杂合度为0.624 5;平均期望杂合度为0.529 2;平均多态信息含量为0.432 1,其中23...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李建林 唐永凯 陈文华 俞菊华 董在杰 徐跑
根据罗非鱼微卫星遗传图谱,在不同的连锁群上随机选择30个微卫星位点,研究它们在192尾不同家系吉富罗非鱼(Genetically Improved Farmed Tilapia,GIFT)中的遗传多样性及这些位点与体质量、体形性状的相关性。结果表明,30个位点共检测出126个等位基因,片段长度124～310bp。各位点等位基因数为1～7个,平均等位基因数4.2个;多态信息含量(PIC)为0.2594～0.7167,平均0.5808;杂合度(H)为0.3064～0.7531,平均0.6322,表明该吉富罗非鱼群体遗传多样性比较丰富。最小二乘方差分析结果显示,位点GM041、GM542和GM304...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
顾颖 鲁翠云 张芹 李超 屈长义 王兆平 程磊 孙效文 冯建新
用３５个镜鲤微卫星ＱＴＬ标记评估了豫选黄河鲤（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ Ｃａｒｐｉｏ ｖａｒ．ｈａｅｍａＴｏｐＴｅｒｕｓ）群体的遗传结构，并评估了不同基因型与生长性状（体重、体长、体高和体厚）的相关性，筛选了在群体中具有性状优势的基因型。３５个微卫星标记在２８８个豫选黄河鲤个体中的扩增结果显示，各标记等位基因数为３～１３，平均每个标记６．８２８ ６个；平均有效等位基因数为４．５２０ ８；平均观测杂合度为０．６０３ ０；平均期望杂合度为０．７０１ ９；平均多态信息含量为０．６６５ ６，群体整体处于高度多态水平（ｐｉＣ＞０．５）。利用ｓｐｓｓ１９．０的ＧＬｍ模型分析标记与性状的相关性，共１７个微卫星标记与．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
安泉泉 刘海金 王桂兴 刘永新 刘奕 司飞
利用106对牙鲆微卫星标记,对62尾双单倍体牙鲆的基因组DNA进行检测;用X射线检测仪对其骨骼进行成像,以骨骼图片测量体高和体长;用SPSS 13.0软件对双单倍体牙鲆的体质量、体长、体高进行相关分析和回归分析;用最小二乘法对微卫星标记与体质量、体长、体高作相关性分析。结果获得17个与体质量、体长、体高显著相关的标记,其中,Poli162TUF与体质量、体长、体高显著相关(P<0.05);Poli72HFSM、Poli106TUF与体质量、体高显著相关(P<0.05);Poli2023TUF、Poli1013TUF与体长、体高显著相关(P<0.05);Po-li2042TUF、Poli1980...
关键词：
牙鲆 双单倍体 生长性状 骨骼 微卫星
[期刊] 水产学报
[作者]
梁利群 常玉梅 董崇智 孙效文
从网上查询获得鳟微卫星标记30对,并对乌苏里江哲罗鱼的基因组进行遗传多样性分析,结果筛选出10对具多态性的微卫星标记。并用其中6对微卫星引物对17尾乌苏里江哲罗鱼进行基因组DNA扫描检测。用2%的琼脂糖凝胶电泳检测微卫星标记的PCR扩增产物,并对扩增结果进行了统计分析,计算了6个基因座的等位基因频率、杂合度等。结果表明,乌苏里江哲罗鱼等位基因频率为0.0455～0.7857,多态信息含量(PIC)为0.2801～0.6351,杂合度(H)为0.3368～0.6563。统计结果初步表明乌苏里江哲罗鱼的遗传多样性程度处于中等偏下水平。同时,结合资源量下降的事实,建议在保护遗传多样性的前提下对其采取...
关键词：
哲罗鱼 微卫星标记 遗传多样性 乌苏里江
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘金亮 常玉梅 徐丽华 刘春雷 梁利群 韩国苍 高玉奎 柳玉海
通过磁珠富集法筛选东北雅罗鱼的微卫星分子标记。采用限制性内切酶Sau 3AI对东北雅罗鱼基因组DNA进行酶切,选取400～900 bp的片段进行PCR全基因组扩增,并利用生物素标记的(CAG)8、(TGA)8、(AGAT)6、(GATT)6 4个探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中,然后以SaulA为引物对长出的菌落进行PCR扩增,挑取扩增后片段大小符合条件的菌落送生物公司测序。结果表明:1 416个阳性克隆中有1 047个克隆含有重复次数大于5次的微卫星序列,完美型占67.99%,非完美型为15.31%;混合性标记占16.70%。从中选出160个微卫星序...
关键词：
东北雅罗鱼 微卫星 磁珠富集
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李成渤 王桂芝 纪志宾 戈新 李培培 王建华 王建民
【目的】探讨微卫星DNA作为崂山奶山羊泌乳性状遗传标记的可行性。【方法】根据比较基因组遗传图谱,选择奶牛6、14、15号染色体上与泌乳性状相关联的微卫星座位(BM1329、BM143、BM302、CSSM66和BMS0812),对175只崂山奶山羊泌乳母羊进行多态性检测,采用最小二乘方法分析微卫星座位与泌乳性状之间的关联效应。【结果】所选微卫星座位在崂山奶山羊群体中均表现出丰富的遗传多态性,有效等位基因、观察杂合度、多态信息含量和近交系数的平均值分别为3.9924、0.4667、0.6748和0.347。基因座CSSM66对乳脂率和300d泌乳量均有显著效应(P<0.05),最有利的基因型分别...
[期刊] 水产学报
[作者]
孙国华 杨建敏 孙孝德 宋志乐 王卫军 刘小静
运用单标记分析法分析了10个微卫星位点与控制体重、体长数量性状的QTL的连锁关系。10对微卫星引物在8月龄具有生长性状差异的60个刺参个体基因组DNA中扩增得到50个等位基因,每个微卫星位点等位基因数3～7个,平均有效等位基因个数5.0。10个微卫星位点的多态信息含量为0.268 0～0.825 6不等,观测杂合度为0.083 3～0.666 7。采用SPSS软件对刺参的体重、体长生长性状和微卫星位点相关性进行分析,结果显示,微卫星位点AjSSR02基因型AB、AD、CD与体重和体长相关,AjSSR04标记中等位基因A对生长性状有正面影响,位点AjSSR06基因型FF个体仅平均体重与其他基因型...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
赵海燕 李池陶 贾智英 石连玉 胡雪松
利用微卫星标记技术对形态差异较大的2个德国镜鲤(Cyprinus carpio L. mirror)群体的189尾个体进行研究。利用一般线性模型(general linear model,GLM)对15个微卫星位点与德国镜鲤的体重、体长、体高、尾柄长、尾柄高、头长和头高的关系进行方差分析和多重比较,结果表明微卫星引物MFW1与体重和体长显著相关,与体高极显著相关;引物MFW9与头长显著相关;引物MFW11与尾柄长和头高显著相关;引物MFW29与体长、体高和头高极显著相关,与尾柄高显著相关。利用引物MFW1检出10尾含有座位208/208的个体;利用引物MFW9检出25尾含有座位90/90的个体...
关键词：
德国镜鲤 微卫星标记 相关分析
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
马磊 张晓峰 张天奇 孙效文
利用41个SSRs标记对德国镜鲤抗寒品系F1代的68个个体基因组DNA进行检测,共检测到100个等位基因,各座位等位基因2～4个,片段长度91～376bp,有效等位基因1.4287～3.9454个,观察杂合度0.3676～1.0000,期望杂合度0.3023～0.7521,平均位点多态信息含量0.4059.利用统计软件SPSS的GLM程序,对41个微卫星标记与镜鲤体重、体高、头长和吻长的相关性进行分析.结果表明,标记hlj354与体重、体高、头长显著相关;标记hlj855与体重、体高和吻长显著相关;标记hlj919、hlj585与头长显著相关,标记hlj895、hlj704与吻长显著相关.
关键词：
微卫星标记 镜鲤 生长性状
[期刊] 中国水产科学
[作者]
邢新梅 张研 徐鹏 周盼 刘伟 孙婷 张保勇 蒋丽 孙效文
应用荧光标记的通用引物法,利用100对微卫星标记对高背镜鲤(Cyprinus carpio L.)和低背镜鲤杂交所得F1190个个体的基因组DNA进行分型。利用SPSS软件对100个微卫星标记与鲤的体长、体高、体厚、头长、尾柄长及尾柄高等体形性状进行相关性分析,结果显示有22个微卫星座位与体长、体高、体厚等体形性状显著性相关(P<0.05)。其中CAFS110、CAFS159、CAFS624、CAFS907、CAFS2320、CAFS2321、HLJE319与体长,CAFS254、CAFS1119、HLJE310与体高,CAFS159、CAFS907、CAFS1119、CAFS1737、CAF...
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